收藏本站
《北京工业大学》 2005年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

分子对接方法及 HIV整合酶抑制剂的设计研究

马晓慧  
【摘要】:蛋白质分子是生命活动的重要物质,它与包括自身在内的生物分子的相互作用是生命自组织复杂体系得以正常调控运转的分子基础,一直备受生命科学领域的关注,是二十一世纪生命科学研究的前沿与热点。继人类基因组计划之后,生命科学已经进入功能基因组时代,以蛋白质聚集体间相互作用与识别为核心内容的蛋白质组学研究迅速兴起,已被广泛应用于生命科学的许多领域,具有举足轻重的战略地位。 随着计算机处理能力的不断增强,理论模拟方法也得到了迅速发展和广泛应用。采用分子对接方法进行蛋白质复合物结构预测,已成为蛋白质聚集体间相互作用和识别研究的有力手段,并可为实验工作提供有益的理论指导。如何得到更多正确的对接结构,然后如何有效快速地筛选出近天然结构,仍然是蛋白质-蛋白质对接方法学所面临的关键问题和挑战。所以,本论文的第一部分工作围绕蛋白质-蛋白质对接方法学研究上的两个主要难点,进行深入的研究和探讨。 在蛋白质结构和功能的研究中,发现许多蛋白与疾病的发生和防治相关,是新药研发的理想靶标。在艾滋病的病原体人体免疫缺陷病毒(HIV)复制过程中,有三种酶起着关键作用。其中,整合酶负责将病毒cDNA 整合到宿主细胞的DNA中,而且在人体正常细胞中并无其功能的类似物,是研发抗HIV 药物的一个非常有意义的靶点。由于整合酶蛋白的溶解度小,全酶的晶体结构一直没有获得,而且受整合酶体外抑制剂筛选实验的限制,使得整合酶靶向药物设计进展缓慢,到目前为止还没有整合酶抑制剂上市。因此,本论文的第二部分工作以HIV 整合酶为研究对象,采用计算机辅助药物设计方法进行了HIV-1 整合酶抑制剂的设计、改造和虚拟筛选。在此基础上,为了进一步获得有活性的HIV-1 整合酶抑制剂,积极筹建酶学测活方法平台,开展了HIV-1 整合酶的表达和纯化等生化实验工作(见论文第三部分)。
【学位授予单位】:北京工业大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2005
【分类号】:TQ464

手机知网App
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 马贯军;周晓红;;新型乙酰胆碱酯酶抑制剂的设计与虚拟筛选[J];广州化工;2011年14期
2 赵彩红;相玉红;张卓勇;;亲电酮类HDAC抑制剂的3D-QSAR和分子对接研究[J];化学研究与应用;2011年07期
3 杜志云;汤志恺;卢宇靖;涂增清;;姜黄素类似物与酪氨酸酶相互作用的分子对接研究及应用[J];计算机与应用化学;2011年05期
4 李亚军;陆文聪;杨晓燕;朱维良;;基于西他列汀及其衍生物的抗Ⅱ型糖尿病药物分子3D-QSAR和分子对接研究(英文)[J];计算机与应用化学;2011年06期
5 郑杰;赵斌;闫鸿鹏;张焜;张大鹏;赵肃清;;雪卡毒素毒性机理的分子对接及分子动力学研究[J];化学学报;2011年17期
6 黄统辉;涂海洋;刘名;侯昌健;张爱东;;5-嘧啶基-1,2,4-噁二唑衍生物的合成及生物活性研究[J];有机化学;2011年06期
7 申涛;杜凤沛;刘婷;姚广伟;吴峥;方萌萌;徐筱杰;路慧哲;;咪唑甘油磷酸酯脱水酶与含氮杂环磷酸酯类抑制剂作用方式的分子模拟[J];物理化学学报;2011年08期
8 杨华;李俊;冯素玲;张新迎;范学森;;吡喃并[3,2-c]吡啶酮-嘧啶核苷杂化体与白蛋白相互作用的光谱和分子模拟研究[J];分析试验室;2011年08期
9 张春丽;;整合素α_vβ_3受体配体的计算机辅助设计[J];计算机与应用化学;2011年06期
10 邓欣贤;沈庆;徐丽丽;熊子君;赵伟利;镇学初;付伟;;新型多巴胺D_3受体抑制剂的发现[J];高等学校化学学报;2011年08期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 庄绪静;曹雅忠;李克斌;尹姣;;同源建模和分子对接方法的应用与发展[A];植保科技创新与病虫防控专业化——中国植物保护学会2011年学术年会论文集[C];2011年
2 杨帆;刘艾林;;分子对接应用与研究进展[A];药学发展前沿论坛及药理学博士论坛论文集[C];2008年
3 张贤祚;田元新;张嘉杰;吴曙光;;基于分子对接研究Tie-2/VEGFR2与吲哚咔唑类双效抑制剂的作用模式[A];第十一届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2011年
4 李丽娜;苏莉;张晓昀;黄晓燕;单志杰;翟红林;;关于HIV-1非核苷类逆转录酶抑制剂药物的三维定量构效关系和分子对接研究[A];第十一届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2011年
5 王晓欢;李川勇;;基于分子对接的蒽醌类衍生物与c-Abl结合的比较研究[A];天津市生物医学工程学会2007年学术年会论文摘要集[C];2007年
6 尤秀丽;叶农钦;陈秀琴;姚碧霞;王庆华;翁文;;分子模拟法在手性识别机理研究中的应用[A];中国化学会全国第十三届大环化学暨第五届超分子化学学术讨论会论文选集[C];2006年
7 陈俊杰;于淼;黄姗姗;郑忠辉;张连茹;;酪氨酸酶与2个小分子抑制剂的分子对接[A];华东六省一市生物化学与分子生物学会2008年学术交流会论文摘要汇编[C];2008年
8 孙清;时国庆;邓乾民;;利用分子对接软件预测PFOA与人血清白蛋白的结合位点[A];中国毒理学会第五次全国学术大会论文集[C];2009年
9 吕茜茜;夏冬辉;李华;;分子模拟研究手性药物与人血清白蛋白相互作用机理[A];中国化学会第27届学术年会第15分会场摘要集[C];2010年
10 李正夫;郭权;王希诚;;新药研发网格下的一种药物分子对接并行程序[A];计算机技术与应用进展·2007——全国第18届计算机技术与应用(CACIS)学术会议论文集[C];2007年
中国重要报纸全文数据库 前6条
1 福建中医学院 李西海梁文娜;中药复方研究的虚拟空间[N];中国中医药报;2008年
2 白毅;我国研发出靶标发现新方法[N];中国医药报;2008年
3 白如珺 刘新泳;HIV-1转录反式激活抑制剂研究为艾滋病治疗拓新路[N];中国医药报;2006年
4 李和平;中国医科院药物所整合多学科研究抗炎新药[N];中国医药报;2005年
5 刘春英;掌握理论技术 推进源头创新[N];中国医药报;2009年
6 记者 白毅;一新型抗肿瘤活性物质被发现[N];中国医药报;2011年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 马晓慧;分子对接方法及 HIV整合酶抑制剂的设计研究[D];北京工业大学;2005年
2 李纯莲;药物设计中分子对接优化设计的算法和软件研究[D];大连理工大学;2004年
3 郑清川;蛋白质结构及分子对接的理论研究[D];吉林大学;2006年
4 张媛;几类蛋白的结构预测及分子对接的理论研究[D];吉林大学;2005年
5 郭菲;蛋白质结合位点和复合体构象预测方法的研究[D];山东大学;2012年
6 王晓奎;基于脂肪酸合成酶结构的减肥药物的设计、合成和筛选[D];中国人民解放军军事医学科学院;2005年
7 于红;基于脂肪酸合成酶FabH结构的抗菌药物的设计、合成与筛选[D];中国人民解放军军事医学科学院;2005年
8 张继龙;几类重要蛋白质的分子动力学模拟及相关抑制剂的改良[D];吉林大学;2010年
9 李洪林;药物发现及靶向虚拟筛选的算法与程序设计[D];大连理工大学;2005年
10 孙家英;神经氨酸酶抑制剂的分子对接、定量结构-活性关系及全新分子设计[D];重庆大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 郑喜亮;HIV-1IN与抑制剂的分子对接研究[D];吉林大学;2005年
2 洪渊;基质金属蛋白酶及其抑制剂的分子对接研究[D];吉林大学;2007年
3 于永辉;配体—受体相互作用与识别的研究[D];北京工业大学;2003年
4 乔静;血管紧张素转换酶抑制剂的分子设计[D];电子科技大学;2005年
5 赖琼;二吡啶并二氮杂卓酮类化合物分子设计及合成研究[D];大连理工大学;2006年
6 赵晓宇;药物分子对接的优化模型与算法[D];大连理工大学;2008年
7 刘燕茹;进化算法在分子对接中的研究与应用[D];天津师范大学;2009年
8 朱威;羟喜树碱结合肽的实验与模拟计算研究[D];江南大学;2008年
9 张伟;抗肿瘤药物discodermolide和dictyostatin的分子模拟研究[D];天津大学;2008年
10 陈军;全新VEGF受体抑制剂的计算机辅助设计与部分合成[D];第二军医大学;2004年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026