植物生长的结构—功能模型及其校准研究
【摘要】:
植物生长模拟模型是定量化研究植物的生长规律的重要手段,涉及到植物学、农学、
林学、应用数学、物理学和计算机信息科学等多学科领域。传统的基于生理生态过程的作
物生长模拟模型对植物的形态结构的处理过于简化,对植物的结构与生理生态功能的相互
作用考虑较少。Corner型植物结构简单,但是其生长过程遵从一般的植物生物学原理,并
且许多常见的经济作物属于此类。一些复杂结构的植物可以被看成Corner型植物结构的集
合。本文从植物个体和器官的宏观角度,以Corner型植物为对象,研究了一种植物生长的
结构-功能模型,分析了模型的数学行为,并依据实验数据对模型进行了参数校准。
1.依据植物生物学的基本原理,以生长单元周期为观察时间尺度,以植物器官的鲜质量和
几何特征作为模型变量,建立了一种植物生长的机理性的离散时间模型。该模型同时考虑
了植物结构与生理功能相互作用,能够并行地模拟植物拓扑结构和几何结构的发展变化。
植物建成的器官数目与环境积温关系密切。本文把这种关系从生长单元周期的角度扩
展到有限结构植物的纯粹扩展生长阶段。模型根据植物的水力结构和环境参数计算植物的
蒸腾耗水量,由水分利用效率计算生物量产量,依据植物器官的源-汇关系与扩展规律进行
生物量的分配,并利用器官的生长规则计算出它们的几何大小。植物拓扑结构和几何结构
的生长与变化同时也决定了植物水力结构的变化。这种周期性循环迭代的工作方式把植物
生长、结构和功能作用之间的反馈作用有机地结合在一起。这种结构-功能模型在单茎干的
棉花、冬小麦、玉米和向日葵等农作物上的应用取得了满意的效果。
2.本文研究分析了Corner型植物的结构-功能模型的数学行为,其中模型参数对植物生长
与结构的影响规律,为模型的校核提供了有效手段。
3.模型中关于植物生物量的分配采用了一种一次性的全局分配方案,把所有器官置于等同
的水平上进行考虑,克服了区隔型两级分配方式的缺点,更加适用于模拟植物拓扑结构动
态变化的情况。
4.用离散型Beta概率密度函数描述植物器官的扩展规律,可灵活地适应多种扩展曲线类
型。采用其积分形式产生的S状曲线模拟了冬小麦节间汇强参数的变异性。
5.模型参数的校准分两步进行:模型的外部参数,如叶片的厚度等几何造型参数,可由实
验测量数据直接确定,而模型的功能参数属于内部隐含参数,必须采用特殊的优化算法进
行估计。本文采用非线性最小二乘法估计模型的隐含参数,收敛性好,运算时间少,并提
出了对多目标数据实行标准化来自动计算权值的方案。在棉花、冬小麦、玉米和向日葵上
的应用实践证明上述方法是有效的。
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4二
博士学位论文 摘要
一
6.以MsualC-为工具,采用面向对象的程序设计方法,设计完成了集植物生长模拟和分
析功能于一体的植物生长模型软件Comeffit.工作于WindowsriNlndotvsNT操作系统下。
软件用户界面友好,提供图形、曲线和文本等方式显示植物生物量的生产与分配以及植物
结构的动态生长过程,可方便地调整模型隐含参数初值和目标顶目的选择。提出了对植物
在生长单元周期内部状态变化进行估计的插值方法。同时,编制了植物器官的平面造型软
____。,。_。。__.、.。。…_,__._….、、…。_,。__。_——
件PatZ,与Corneffit软件配合使用。上述软件已经在中国农业大学、中法联合实验室-
(u AMAMA)和法国农艺研究国际合作发展中心(口RA D)等单位应用于科研和教学工作。
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