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《中国农业大学》 2004年
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LPL作为鸡脂肪性状候选基因分析

刘锐  
【摘要】: 由于对鸡生长速度不断选择,脂肪沉积过多给养鸡业带来的负面效应越来越受到研究者的重视。鉴于鸡脂肪性状选择的特殊性,对该性状实施分子育种将成为一个很有前景的研究领域。本研究以检测鸡脂蛋白脂肪酶基因(lipoprotein lipase,LPL)的多态性为研究内容,分析该基因作为鸡脂肪性状候选基因的可能性。 以饲养在相同条件下的白莱航蛋鸡(White Leghorn,A)、丝羽乌骨鸡(Silkies,C)、农大褐蛋鸡(CAU Brown,D)和白洛克肉鸡(White Plymouth Rock,E)四个品种所组成的完全双列杂交(4 x 4)试验鸡群作为研究对象,应用PCR-SSCP方法对该群体的15个组合(缺AE组合)共545只鸡的试验动物群体进行LPL的SNP搜索。应用设计的15对引物进行PCR扩增,得到的DNA片段覆盖了LPL基因5′侧翼区和8个外显子,这些目的片段经SSCP分析显示:5′侧翼区的5个位点a、b、d、e、f和外显子3、6、7、8、9在群体中有存在态性。 对有多态的位点进行克隆测序,结果发现:LPL基因5′侧翼区上发现了18个SNP,分别为:A-1908G、-1864C插入、C-1810T、C-1668T、C-1086T、C-1634T、A-1078G、-982G缺失、C-774G、C-526T、C-435T、T-396C、A-363G、A-341G、C-297T、C-277G、G-276C和A-273G外显子发现5个SNP:T6731C、A10407G、G11382C、C12315T和A13644G,其中G11382C和A13644G是错义突变,分别使丙氨酸变为脯氨酸、天冬氨酸变为甘氨酸,其它3个为同义突变。 应用转录因子分析软件TFSEARCH ver1.3对5′侧翼区潜在的调控元件和蛋白结合因子进行预测发现:-1864插入C、C-1810T、A-1078G、-982缺失G、A-363G、C-277G和G-276C几个位点的碱基突变使转录因子的结合情况发生了变化,它们可能对LPL基因的表达发挥调节作用。 采用SAS软件对鸡脂肪性状与各多态位点的基因型进行关联分析,结果显示,个体活重对三个脂肪性状(肌间脂宽、皮下脂厚和腹脂重)有极显著影响(p<0.01),组合对脂肪性状的影响达到了极显著水平(p<0.01)。5′侧翼区两个位点d和e对皮下脂厚有显著影响(p<0.05),位点d的多态性对腹脂重有极显著影响(p<0.01)。多重比较结果表明,位点d的基因型EE与基因型EF和FF的皮下脂厚差异显著(p<0.05);基因型EE和EF的腹脂重极显著地大于基因型FF(p<0.01);位点e各基因型皮下脂厚差异不显著(p>0.05)。位点d和e的组合基因型对三个脂肪性状肌间脂宽、皮下脂厚和腹脂重影响显著(p<0.05,p<0.01,p<0.01),说明位点间的协作效应对性状表型有很大影响。外显子8基因型多态性显著的影响肌间脂宽(p<0.05),但各基因型之间差异不显著(p>0.05)。 本研究结果表明,LPL基因的5′侧翼区和外显子均存在丰富的变异,其中5′侧翼区d和e两个位点的基因型多态对鸡皮下脂厚和腹脂重有重要作用。
【学位授予单位】:中国农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2004
【分类号】:S831

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【引证文献】
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【参考文献】
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【同被引文献】
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【二级引证文献】
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