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《中国农业大学》 2004年
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基于数据挖掘的非编码RNA预测模型设计与实现

狐昱  
【摘要】: 生物计算是计算机科学在生命科学中形成的一个研究领域,通过用计算机科学的知识和相关的算法对生物学领域内的数据进行加工、存储、检索与分析。随着生物数据的快速增长,如何运用高效的算法来处理这些数据,已经得到了越来越多的关注。 本论文进行了生物计算的研究,主要是为了解决非编码核糖核酸(non-coding ribonucleic acid,ncRNA)的预测问题。研究方法采用数据挖掘的理论和技术,目的是为了找出能够区分ncRNA的计算方法,同时编写预测软件供用户使用。 论文的重点是运用数据挖掘方法中的主成分分析和人工神经网络LM(Levenberg-Marquardt)算法实现了ncRNA的预测。首先利用生物学实验数据总结出ncRNA的特征,作为数据挖掘方法的输入;然后在MATLAB环境下用统计工具箱和神经网络工具箱对输入的特征进行主成分分析和神经网络训练,用训练好的网络去预测ncRNA;最后,为了实现通用性,运用MATCOM接口与VC实现Windows下供用户实际使用的预测程序。 研究的难点在于ncRNA特征的提取和选用恰当的数据挖掘方法。论文运用生物学知识提取了相关特征并用于主成分分析和神经网络的训练中。实际的测试结果表明特征的选择比较恰当,训练结果可以用作ncRNA的预测。 论文主要创新点如下:①提出了一种ncRNA预测方法,并且设计出了进行预测的软件;②数据运用人工神经网络快速LM算法训练,使训练和预测结果更为准确;③实现了MATLAB与VC的混合编程,充分利用了两者的优点。
【学位授予单位】:中国农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2004
【分类号】:TP311.13

【引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 张超;基于GIS的县级林业区划方法研究[D];中国林业科学研究院;2006年
2 王洪彬;电力市场交易行为监管分析及监管系统设计[D];北京交通大学;2008年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 梁学斌;;离散Hopfield神经网络的统一描述[J];安徽大学学报(自然科学版);1993年02期
2 高志明,关岩,于洪梅,吴秀红,李井会;人工神经网络在化学中的应用进展[J];鞍山钢铁学院学报;2000年03期
3 黄民;刘秀丽;谢厚正;;高档数控机床刀具磨损故障监测方法及实验系统[J];北京信息科技大学学报(自然科学版);2012年01期
4 钟义信;;神经元网络——它的背景、进展和问题[J];北京邮电学院学报;1990年02期
5 钟义信;;人工智能理论:从分立到统一的奥秘[J];北京邮电大学学报;2006年03期
6 Claudio Moraga;;SPECTRAL TECHNIQUES AND SOFT COMPUTING[J];Approximation Theory and Its Applications;1998年04期
7 林和平;张秉正;乔幸娟;;回归分析人工神经网络[J];吉林大学学报(信息科学版);2010年02期
8 戴冰;张培茵;;基于改进的双并联动态过程神经网络的旅游需求预测[J];长春大学学报;2010年01期
9 张立升;廖旭红;弭元元;谷伟风;胡岗;;Oscillatory Dynamics and Oscillation Death in Complex Networks Consisting of Both Excitatory and Inhibitory Nodes[J];Communications in Theoretical Physics;2012年06期
10 贾伟宽;王慧;丁世飞;苏春阳;;基于因子分析与神经网络组合的害虫测报研究[J];长江大学学报(自然科学版)农学卷;2008年03期
中国重要会议论文全文数据库 前8条
1 严传魁;王如彬;;基于汉密尔顿原理的神经元模型[A];第十三届全国非线性振动暨第十届全国非线性动力学和运动稳定性学术会议摘要集[C];2011年
2 ;Synthesis of Boolean Networks Via Semi-tensor Product[A];中国自动化学会控制理论专业委员会A卷[C];2011年
3 ;Joint inversion of seismic data for acoustic impedance[A];中国科学院地质与地球物理研究所二○○四学术论文汇编·第一卷(地球深部)[C];2004年
4 杨智;杜海树;邱熔胜;;时变大时滞最优预报神经智能PID控制算法[A];1999中国控制与决策学术年会论文集[C];1999年
5 吴涛;许晓鸣;刘登瀛;张浙;;基于改进BP算法的人工神经网络建模及其在干燥过程中的应用[A];1998年中国控制会议论文集[C];1998年
6 赵轩;姬淑艳;李英民;董银峰;;基于神经网络的结构地震反应仿真研究综述[A];第14届全国结构工程学术会议论文集(第三册)[C];2005年
7 汤井田;任政勇;化希瑞;;地球物理学中的电磁场正演与反演[A];纪念中国地球物理学会成立60周年专辑[C];2007年
8 王宁;方勇纯;王树青;;神经控制[A];1999年中国智能自动化学术会议论文集(上册)[C];1999年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 孙明;基于小波和迟滞的混沌神经网络及其应用[D];哈尔滨工程大学;2010年
2 李桃迎;交通领域中的聚类分析方法研究[D];大连海事大学;2010年
3 郑大腾;柔性坐标测量机空间误差模型及最佳测量区研究[D];合肥工业大学;2010年
4 朱松;随机回归神经网络的动力学行为研究[D];华中科技大学;2010年
5 柴园园;普适的模糊推理系统理论及应用[D];北京交通大学;2011年
6 许伟;基于进化算法的复杂化工过程智能建模方法及其应用[D];华东理工大学;2011年
7 李曼荔;求解组合优化问题的神经计算方法[D];电子科技大学;2010年
8 陈国庆;荧光光谱技术在食品安全监控中的应用研究[D];江南大学;2010年
9 栾小丽;基于神经网络的复杂非线性系统鲁棒控制与滤波研究[D];江南大学;2010年
10 唐漾;复杂网络动力学及其应用的若干问题研究[D];东华大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 李连昌;新安煤田二_1煤层煤与瓦斯突出危险程度预测[D];河南理工大学;2010年
2 罗婷婷;飞机钣金叠板数控套裁下料软件系统的研究[D];南昌航空大学;2010年
3 徐小任;基于BP神经网络的城镇网络地价评估模型研究[D];广西师范学院;2010年
4 程慧;基于神经网络的两类问题研究[D];广西师范学院;2010年
5 吴家瑞;服装产品加工成本快速估算方法研究[D];浙江理工大学;2010年
6 王捷;数字图像边缘检测方法的若干改进与应用研究[D];浙江理工大学;2010年
7 雷明杰;神经网络和遗传算法在中厚板轧机中的应用研究[D];郑州大学;2010年
8 张华杰;模糊神经网络在肺癌诊断中的应用[D];郑州大学;2010年
9 赵振霞;基于神经网络的节水灌溉适宜技术优选模型研究及系统开发[D];山东农业大学;2010年
10 徐洪伟;数据挖掘中决策树分类算法的研究与改进[D];哈尔滨工程大学;2010年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 马晓群,王效瑞,徐敏,张家鼎;GIS在农业气候区划中的应用[J];安徽农业大学学报;2003年01期
2 唐季林,张晓丽;应用RS及GIS进行林业局森林火险区划的研究[J];北京林业大学学报;1996年01期
3 吴延熊;区域森林资源可持续发展动态评价的理论探讨[J];北京林业大学学报;1999年01期
4 洪军,蔡体久;基于GIS的森林分类经营区划[J];东北林业大学学报;2002年04期
5 蔡体久,潘紫文,朱德柱,姜东涛;黑龙江省林业生态经营区系与林种规划[J];东北林业大学学报;2002年05期
6 陈文宇;面向对象软件的测试[J];电子科技大学学报;2001年06期
7 郑振浩;王先甲;王建军;;发电市场寡头竞争综述[J];电力技术经济;2006年04期
8 陈建长;;电力市场监管理论与实践的探讨[J];电力技术经济;2007年01期
9 黎灿兵,康重庆,江健健,沈瑜,夏清,胡左浩;电力市场监管中的信息披露与市场评估[J];电力系统自动化;2003年21期
10 刘敦楠,李瑞庆,陈雪青,何光宇,周双喜;电力市场监管指标及市场评价体系[J];电力系统自动化;2004年09期
中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 兰国良;可持续发展指标体系建构及其应用研究[D];天津大学;2004年
2 童明光;我国电力市场中市场力的理论与实证研究[D];华北电力大学(北京);2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前3条
1 任鹏宇;构建和完善我国电力监管体系[D];中央民族大学;2005年
2 刘源;运用聚类数据挖掘技术预防电信业中的欺诈行为[D];吉林大学;2005年
3 欧家坤;发电侧电力市场中市场势力的辨识与监管[D];东南大学;2006年
【二级引证文献】
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1 王玉宝;节水型农业种植结构优化研究[D];西北农林科技大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 赵静;GIS在金沟岭林场森林多功能评价中的应用[D];北京林业大学;2011年
2 李思滢;成都市房地产市场监管机制研究[D];四川师范大学;2012年
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4 彭玉青,张红梅,何华,顾军华;数据挖掘技术及其在教学中的应用[J];河北科技大学学报;2001年04期
5 赵广社,张希仁;数据挖掘中的统计方法概述[J];计算机测量与控制;2003年12期
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3 孙迎;;医院信息的数据挖掘与方法研究[A];中华医学会第十次全国医学信息学术会议论文汇编[C];2004年
4 薛晓东;李海玲;;数据挖掘的客户关系管理应用[A];科技、工程与经济社会协调发展——河南省第四届青年学术年会论文集(下册)[C];2004年
5 郭建文;黄燕;印鉴;杨小波;梁兆辉;;建立中风病“阴阳类证”辨证规范的数据挖掘研究[A];中华医学会第十三次全国神经病学学术会议论文汇编[C];2010年
6 薛鲁华;张楠;;聚类分析在Web数据挖掘中的应用[A];北京市第十三次统计科学讨论会论文选编[C];2006年
7 沈勇;颜建军;王忆勤;许朝霞;刘国萍;夏春明;李福凤;燕海霞;郭睿;;基于数据挖掘的中医信息处理方法研究概述[A];中华中医药学会中医诊断学分会第十次学术研讨会论文集[C];2009年
8 朱扬勇;黄超;;基于多维模型的交互式数据挖掘框架[A];第二十届全国数据库学术会议论文集(技术报告篇)[C];2003年
9 陈涛;胡学钢;陈秀美;;基于数据挖掘的教学质量评价体系分析[A];全国第21届计算机技术与应用学术会议(CACIS·2010)暨全国第2届安全关键技术与应用学术会议论文集[C];2010年
10 王星;谢邦昌;戴稳胜;;数据挖掘在保险业中的应用[A];北京市第十二次统计科学讨论会论文选编[C];2003年
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1 李开宇 黄建军 田长春;把“数据挖掘”作用发挥出来[N];中国国防报;2009年
2 华莱士;“数据挖掘”让银行赢利更多[N];国际金融报;2003年
3 记者 晏燕;数据挖掘让决策者告别“拍脑袋”[N];科技日报;2006年
4 □中国电信股份有限公司北京研究院 张舒博 □北京邮电大学计算机科学与技术学院 牛琨;走出数据挖掘的误区[N];人民邮电;2006年
5 张立明;数据挖掘之道[N];网络世界;2003年
6 中圣信息技术有限公司 李辉;数据挖掘在CRM中的作用[N];中国计算机报;2001年
7 田红生;数据挖掘在CRM中的应用[N];中国经济时报;2002年
8 王广宇;数据挖掘 加速银行CRM一体化[N];中国计算机报;2004年
9 周蓉蓉;数据挖掘需要点想像力[N];计算机世界;2004年
10 张舒博;数据挖掘 提升品牌的好帮手[N];首都建设报;2009年
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9 刘东升;面向连锁零售企业的客户关系管理模型(R-CRM)研究[D];浙江工商大学;2008年
10 余红;网络时政论坛舆论领袖研究[D];华中科技大学;2007年
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1 狐昱;基于数据挖掘的非编码RNA预测模型设计与实现[D];中国农业大学;2004年
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7 徐路;基于决策树的数据挖掘算法的研究及其在实际中的应用[D];电子科技大学;2009年
8 梁小鸥;数据挖掘在高职教学管理中的应用[D];华南理工大学;2011年
9 王浩;数据挖掘在上海市职业能力考试院招录考试优化管理项目中的运用研究[D];华东理工大学;2012年
10 黎卫英;数据挖掘在中职幼教课程改革中的应用[D];福建师范大学;2009年
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