DNA条形码候选序列在百合科植物鉴定中的应用

【摘要】： 百合科(Liliaceae)植物是被子植物中单子叶植物类群之一,在世界范围内分布广泛,包括多种常用珍贵药用植物。本论文选取了百合科18个属的25个种共36个样品作为研究材料,运用DNA条形码技术对其进行区分与鉴定。实验共扩增了6条DNA条形码候选序列,包括叶绿体基因rpoC1序列、rpoB序列、rbcL序列、matK序列、psbA-trnH序列和核基因ITS 2序列。 实验从36个样品中成功提取了34个样品的DNA,并成功获得6条候选序列的PCR产物。不同序列的PCR扩增效率不同:psbA-trnH、matK与rpoC1均可以达到100%,ITS 2扩增效率为97%,rbcL为85%,rpoB为79%。测序发现,除rpoB序列与ITS 2序列测序效率很低外,其他四条序列均获得完成的碱基序列。 采用生物统计软件MEGA对测序结果较好的rbcL,psbA-trnH,rpoC1和matK序列进行分析并构建系统进化树。分析结果显示,单一序列不能完全鉴别所有的研究物种,通过psbA-trnH+matK或psbA-trnH+rbcL或rpoC1+rbcL三种形式的序列组合能够鉴别研究物种。这四条候选序列,可作为百合科DNA条形码的推荐序列。