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《中国协和医科大学》 2002年
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150天人胎脑海马基因表达信息的处理与分析

张焱  
【摘要】:发育过程中人脑海马的基因表达信息对致力于人脑发育和相关疾病研究的神经生物学家而言,一直是非常感兴趣和具有重要意义的研究领域。为了对海马的发育特征和相关的功能特征获得更多分子水平上的探索,本研究对发育中期人胎脑海马的基因表达情况进行了较为全面和深入的分析,建立了基因表达谱(Gene expression profile),发现了在海马发育中期可能起主要作用的一些侯选基因。本研究还在大规模测序数据分析的基础上发展并建立了一套更为准确地分析基因表达信息的策略方法,利用现代数学和统计学领域发展的先进观念和算法,对原始基因表达数据进行新的统计标准化处理,提高了结果的可信度,并籍此初步探讨了150天人胎脑海马发育时期的基因表达情况和重要的生物学意义。 本研究的主要创新之处如下: 1.建立了150天人胎脑海马的cDNA数据库系统(DBMS)及相应的管理分析软件系统(LIMS)。 2.建立了准确分析基因表达数据的新策略和新方法。其中包括: (1) 实现了基因表达模式标准化新算法,提高了分析结果的可靠性。 (2) 首次把聚类方法合理地引入到大规模测序数据分析中,在一定程度上解决了大规模测序缺乏有效深入分析的方法学问题。 3.发现了新的基因表达变化规律。对其中有意义的结果做了合理的生物学推论,初步揭示了海马发育中期基因表达的特点。主要如下: (1) 发现已知基因1343条(946种),占测序总数的29.35%,而新EST占了近一半。提示发育中的胎脑海马有大量已知基因与新基因的表达。
【学位授予单位】:中国协和医科大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2002
【分类号】:R318

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