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《首都师范大学》 2005年
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小立碗藓冷胁迫下表达序列标签分析及其相关基因Cor166的功能初探

李林辉  
【摘要】:低温是影响植物生长、发育及地理分布的一个重要生态因子,限制了冷敏感作物在低温季节的种植,导致光合效率低下,作物产量降低。但是一些温带植物在秋末冬初感受逐渐下降的外界温度,体内发生一系列生理生化变化,产生了适应性反应,提高了对冬季低温的抵抗能力,表明植物为抵御低温进化出了一套完善的应答机制。深入研究植物冷适应机理对于农业生产如改良作物、增加冷季节的作物品种等意义重大。 小立碗藓(Physcomitrella patens)是最近几年发展起来的模式植物系统。其分布广、极耐逆境、易培养、培养周期短,容易进行遗传转化和同源重组。小立碗藓长期处于单倍体世代,对于遗传学研究来讲,单倍体植物基因突变或敲除所产生的形态或生理生化变化容易被监测到,这些使研究植物抗逆基因的功能极为方便。 本实验构建了一个小立碗藓配子体冷胁迫的SSHcDNA双向文库。在正、反向文库中,分别随机挑选了384个阳性克隆,进行斑点杂交。根据斑点杂交的信息,分别在正、反向文库中挑选了240个和180个克隆单向测序,各获得232条和162条EST。通过BLSTx和BLSTxn与GenBank的数据库比较,在正向文库的232条EST中,有215条EST具有编码蛋白质功能,其余17条EST序列与已知蛋白质同源性较低或找不到任何同源序列。在反向文库的162条EST中,有134条EST具有编码蛋白质功能,其余28条EST序列与已知蛋白质同源性较低或找不到任何同源序列。在正向文库的215条具有编码蛋白质功能的EST中,120条EST序列的功能已知,95条EST与推测、假想或功能未知的蛋白质具有很高的同源性;在反向文库的134条具有编码蛋白质功能的EST中,104条EST序列的功能已知,30条EST与推测、假想或功能未知的蛋白质具有很高的同源性。这些已知的功能基因分别来自32个(正向文库)和27个物种(反向文库)。正向文库的已知功能基因30.3%来自拟南芥(Arabidopsis thaliana)、15.8%来自水稻(Oryza sativa)、7.9%来自小麦(Triticum aestivum)、1.3%来自于小立碗藓(physcomitrella patens);反向文库的已知功能基因19.8%来自拟南芥(Arabidopsis thaliana)、12.7%来自水稻(Oryza sativa)、11.6%来自于小立碗藓(Physcomitrella patens)、5.8%来自于烟草(Nicotiana tobacum. L)。对上述240条和180条EST片段进行重叠群分析分别有126条和106条非冗余EST,正向文库里有106条单一序列和20个重叠群;反向文库里有90条单一序列和16个重叠群。 对文库EST分析后表明,ABA、Ca~(2+)、一些蛋白激酶参与了小立碗藓的冷胁迫信号转导过程;热激转录因子、AP2结合结构域转录因子、MYC相关的DNA结合蛋白、MYB家族转录因子、bZIP转录因子等转录因子参与了冷胁迫下下游基因的表达调控;离子通道蛋白、水通道蛋白、膜通道蛋白、Rab蛋白等参与了物质和
【学位授予单位】:首都师范大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2005
【分类号】:Q943

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【引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 牟永潮;低温胁迫东农冬麦1号SSH文库构建及3个基因表达模式[D];东北农业大学;2011年
2 王文芳;冷诱导下柠条锦鸡儿SSH文库的构建[D];内蒙古农业大学;2010年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 李勇,马峙英;基因芯片技术及其应用[J];河北农业大学学报;2002年S1期
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5 刘翠华,马文丽,李凌,郑文岭;生物芯片在功能基因组学研究中的应用进展[J];国外医学.临床生物化学与检验学分册;2002年01期
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7 晏群;高通量的功能分析技术—蛋白质芯片[J];国外医学(免疫学分册);2001年04期
8 潘美辉,金虎林,袁建刚,强伯勤;基因差异表达的研究方法[J];基础医学与临床;1997年05期
9 刘强,张勇,陈受宜;干旱、高盐及低温诱导的植物蛋白激酶基因[J];科学通报;2000年06期
10 张雷,刁丰秋,杨志攀,黄美娟,吴乃虎;一种胡萝卜蔗糖转运蛋白基因家族新成员的分离及功能鉴定[J];科学通报;2001年14期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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2 刘鹏,李勃,刘庆忠,赵红军,孟庆伟;冷锻炼诱导甜椒抗冷力的生化机理研究[J];山东农业科学;2003年03期
3 刘鹏,刘庆忠,王勇,李新华;喜温作物的低温损伤及其抗冷性的研究进展[J];山东农业科学;2004年02期
4 张自坤;刘世琦;张强;王忠全;孟凡鲁;于晓丽;;根结线虫对不同砧木黄瓜嫁接苗生理生化指标的影响[J];山东农业科学;2009年07期
5 谢红英;郭春晓;田素波;郑成淑;;温光交叉胁迫对日本红枫叶片叶绿素荧光和叶黄素循环的影响[J];山东农业科学;2011年05期
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7 李光远;;水稻基因克隆技术及其应用[J];安徽农学通报;2007年01期
8 王晓玲;;水分胁迫对芝麻花期脯氨酸含量的影响[J];安徽农学通报;2007年20期
9 杨小兰;;一个葡萄抗逆相关转录因子VvPF1基因的in silico克隆及生物信息学分析[J];安徽农学通报;2007年22期
10 陈哲;孔祥翔;张斐斐;龚明;;植物抗逆性基因工程研究进展[J];安徽农学通报(上半月刊);2009年07期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 徐红霞;陈俊伟;;枇杷果实DHN基因克隆及其在低温胁迫下的表达分析[A];第五届全国枇杷学术研讨会论文(摘要)集[C];2011年
2 钱仁卷;刘洪见;林霞;黄建;张旭乐;;不同苗龄无柄小叶榕对低温胁迫的生理响应研究[A];中国观赏园艺研究进展2011[C];2011年
3 张建平;邹立坤;姜青珍;冯丽肖;;应用作物模拟模型技术确定冬麦北移安全北界[A];21世纪作物科技与生产发展学术讨论会论文集[C];2002年
4 徐兆师;马有志;;Isolation and Analysis of Two Genes Encoding Putative EREBP Transcription Factors in Triticum aestivum L.[A];2003年全国作物遗传育种学术研讨会论文集[C];2003年
5 马有志;;Isolation and Analysis of Three-type Genes Encoding putative CBF/DREB Transcription Factors in Triticum aestivum L.[A];2003年全国作物遗传育种学术研讨会论文集[C];2003年
6 郭江;李金才;郭程瑾;郭新宇;张风路;赵春江;肖凯;;不同株型玉米品种的光合特性和密度调控效应[A];作物逆境生理研究进展——中国作物生理第十次学术研讨会文集[C];2007年
7 马德华;庞金安;李淑菊;霍振荣;;温度逆境锻炼对高温下黄瓜幼苗生理的影响[A];中国园艺学会成立70周年纪念优秀论文选编[C];1999年
8 钱春梅;陈巧玲;庞学群;符武钊;;大白菜种子萌发的高温耐性诱导[A];中国园艺学会第五届青年学术讨论会论文集[C];2002年
9 张兴国;邵长文;孙涌栋;苏承刚;;基因Cor15A和CBF3导入黄瓜基因组[A];蔬菜分子育种研讨会论文集[C];2004年
10 张兴国;邓小燕;邵长文;孙涌栋;梅茜;苏承刚;;CBF3和Cor15A基因导入黄瓜[A];中国园艺学会第六届青年学术讨论会论文集[C];2004年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 韩英鹏;多环境、多遗传背景下不同发育时期大豆籽粒重的QTL分析[D];哈尔滨师范大学;2010年
2 杨江山;保护性耕作对旱区小麦—菘蓝轮作土壤生态及作物生理特性的影响[D];甘肃农业大学;2010年
3 李玉华;高山离子芥再生苗响应低温和干旱的生理机制研究[D];兰州大学;2010年
4 李笑一;拟南芥叶绿体LON4蛋白酶功能研究[D];兰州大学;2010年
5 许光辉;基于基因芯片技术的刺五加改善果蝇睡眠作用的机制研究[D];黑龙江中医药大学;2010年
6 田娜;农杆菌介导的猕猴桃遗传转化及AtNHX1转化植株抗盐性分析;拟南芥At4G12490基因对逆境的抗性功能研究[D];西北大学;2010年
7 李望丰;SsNHX1基因在紫花苜蓿中的表达及其耐盐性研究[D];东北师范大学;2010年
8 牛姗姗;MYB对杨梅果实花青素苷合成的调控及其机制[D];浙江大学;2011年
9 徐兆华;基因芯片数据统合分析方法的若干拓展[D];浙江大学;2010年
10 何影;引入甘氨酸甲基化合成甜菜碱途径提高黑麦草抗旱性研究[D];山东大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 刘红梅;农杆菌介导百子莲抗寒基因CBF1高效转化体系的建立[D];华中农业大学;2010年
2 魏礼玲;MYB转录因子家族相关EST干涉载体构建及遗传转化的研究[D];华中农业大学;2010年
3 张璜;水稻抗寒性分析评价及QTL初步定位[D];华中农业大学;2010年
4 罗蓓蓓;苎麻茎皮差减文库的构建及纤维发育相关基因的筛选[D];华中农业大学;2010年
5 吴建忠;甘蓝型油菜结实相关性状分析及QTL定位[D];华中农业大学;2010年
6 黄聪;花生中DREB、bZIP类转录因子耐逆性研究[D];哈尔滨师范大学;2010年
7 柴凌燕;植物角质膜蜡质转录因子基因SHN1/WIN1的表达载体构建[D];郑州大学;2010年
8 于丽萍;玉米种子胚特异性启动子emb5的功能分析[D];山东农业大学;2010年
9 林桂玉;菊花超微弱发光及生理生化代谢的研究[D];山东农业大学;2010年
10 潘海涛;小麦EST-SSR标记的开发和苗期养分吸收QTL定位[D];山东农业大学;2009年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 马文月;植物冷害和抗冷性的研究进展[J];安徽农业科学;2004年05期
2 宋国琦;胡银岗;林凡云;董普辉;何蓓如;;YS型小麦温敏不育系育性转换基因的cDNA-AFLP分析[J];西北植物学报;2006年04期
3 王凭青,吴明生,王远亮,朱久进;植物抗寒基因工程研究最新进展[J];重庆大学学报(自然科学版);2003年07期
4 张明生;戚金亮;杜建厂;杨春贤;杨永华;谈锋;;甘薯质膜相对透性和水分状况与品种抗旱性的关系[J];华南农业大学学报;2006年01期
5 唐万虎,张祖新,邹锡玲,陈旋,郑用琏;玉米耐渍功能基因组分析及相关基因Sicyp51的鉴定与克隆[J];中国科学C辑:生命科学;2005年01期
6 高福钊,霍建勇;低温逆境对黄瓜生长发育的影响[J];吉林蔬菜;2004年01期
7 王省芬;田海燕;马峙英;张桂寅;玄兆伶;王文生;孙艳香;;黄萎病菌诱导下陆地棉抗病品种SSH文库的构建[J];棉花学报;2008年01期
8 于晶;张林;苍晶;王兴;周子珊;郝再彬;李卓夫;;外源ABA对寒地冬小麦东农冬麦1号幼苗生长及抗冷性的影响[J];麦类作物学报;2008年05期
9 王兴;于晶;杨阳;苍晶;李卓夫;;低温条件下不同抗寒性冬小麦内源激素的变化[J];麦类作物学报;2009年05期
10 杨建国,姚元千;秋茄新品种“湘茄四号”[J];农村百事通;2000年07期
中国博士学位论文全文数据库 前6条
1 何涛;青稞差减cDNA文库的构建及冷诱导基因的克隆和转基因烟草表达研究[D];西北大学;2007年
2 刘德兵;低温胁迫对香蕉幼苗生理特性的影响及冷诱导相关基因的分离[D];华南热带农业大学;2007年
3 罗娅;低温胁迫与锻炼对草莓生理特性的影响和草莓几丁质酶基因的克隆[D];四川农业大学;2007年
4 龙桂友;柑橘低温诱导相关基因的克隆与表达分析[D];湖南农业大学;2007年
5 刘建;两种桉树对低温胁迫的响应机制研究[D];南京林业大学;2008年
6 岳桂东;玉米干旱胁迫相关基因的克隆与分析[D];山东大学;2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 林士杰;柽柳冷适应蛋白(CAP)基因的功能验证[D];东北林业大学;2007年
2 和红云;低温胁迫对甜瓜幼苗生长及生理生化的影响[D];石河子大学;2008年
【二级引证文献】
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 唐月异;花生耐低温种质筛选及相关差异表达基因鉴定[D];中国海洋大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前4条
1 岳荣;柠条锦鸡儿CBF/DREB1基因的克隆及其过表达对提高拟南芥抗旱、抗冻能力的影响[D];内蒙古农业大学;2011年
2 张烨;柠条锦鸡儿咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶基因cDNA和gDNA全长克隆及生物信息学分析[D];内蒙古农业大学;2011年
3 任爱琴;柠条锦鸡儿NCED1基因启动子及蛋白原核表达的初步分析[D];内蒙古农业大学;2012年
4 张涛;柠条锦鸡儿肉桂酸-4-羟基化酶基因的克隆及表达分析[D];内蒙古农业大学;2012年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 马宗仁;;短芒披碱草和老芒麦在水分胁迫下游离脯氨酸积累的研究 Ⅱ关于植物间脯氨酸积累差异原因[J];草业科学;1992年05期
2 马宗仁;陈宝书;;甘肃地方苜蓿农家品种脯氨酸积累能力与抗旱性的研究[J];甘肃农业大学学报;1992年02期
3 蔡立羽;人类基因组计划中的生物信息学[J];国外医学.生物医学工程分册;1998年01期
4 王剑利,杨章民;利用生物信息学技术研究蛋白功能的几种方法[J];国外医学(分子生物学分册);2001年04期
5 何龙飞,王爱勤,沈振国,刘友良;高等植物细胞的Ca~(2+)-ATP酶[J];广西农业生物科学;2000年01期
6 李美茹,刘鸿先,王以柔;低温下水稻幼苗叶片细胞膜膜脂过氧化和膜磷脂脱酯化反应[J];广西植物;1998年02期
7 萧浪涛;现代生物信息学及其主要研究领域[J];湖南农业大学学报(自然科学版);2000年06期
8 刁丰秋,张雷,黄美娟,吴乃虎;利用改进的cDNA RDA技术分离胡萝卜(Daucus carota L.)体细胞胚根发育相关的基因[J];中国科学C辑:生命科学;2000年01期
9 陈斌,袁建刚,潘美辉,俞耀庭,强伯勤;差异显示反转录PCR技术的建立和改进[J];基础医学与临床;1996年06期
10 李锋,李天杰;南极长城站地区西湖底沉积物化学元素分布规律及其环境意义[J];极地研究;1997年04期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 马长艳;郭豫杰;周开亚;;用cDNA芯片技术筛选中华绒鳌蟹卵巢发育相关基因[J];南京师大学报(自然科学版);2010年03期
2 周畅,李麓芸,卢光琇;一个新的人类锌指蛋白基因ZNF474的cDNA克隆和表达分析[J];生命科学研究;2004年04期
3 孙淼;赵茂林;;利用表达序列标签电子克隆cDNA全序列的策略[J];生物技术通报;2010年01期
4 杨菲菲;;基因差异表达的研究方法[J];现代农业科技;2007年17期
5 吕小东!100037北京市,刘迎龙!100037北京市,赵勇!100037北京市,刘玉清!100037北京市,刘宗正;8~10周龄胎儿心脏cDNA文库大规模表达序列标签分析[J];中国循环杂志;2000年06期
6 陈红歌,贾新成;表达序列标签及其应用[J];生物技术通讯;2003年01期
7 李柱刚,崔崇士,马荣才,曹鸣庆,王广金;芸薹属植物基因组学研究进展[J];中国生物工程杂志;2005年08期
8 刘媛;蔡嘉斌;蒋国松;童强松;;基于EST的新基因克隆策略[J];遗传;2008年03期
9 房学爽;徐刚标;;表达序列标签技术及其应用[J];经济林研究;2008年02期
10 钟华,谢婷婷,刘中来;EST的应用现状与前景[J];生物技术;2003年01期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
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2 王琦;李雪;刘彦;朱志兵;薛英威;傅松滨;;应用基因表达谱芯片研究胃癌基因表达谱[A];中国的遗传学研究——中国遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编[C];2003年
3 蔡彦宁;温玫;张愚;陈彪;;帕金森患者尾状核中基因表达谱研究[A];中华医学会第七次全国神经病学学术会议论文汇编[C];2004年
4 石文静;陈超;胡宝洋;龚红华;周国民;;新生小鼠视网膜病变的基因表达谱变化[A];2006(第三届)江浙沪儿科学术会议暨浙江省儿科学术年会论文汇编[C];2006年
5 于英男;洪源;李烨;成军;李燕;;刀豆素蛋白引起免疫性肝损伤小鼠肝脏基因表达谱变化[A];第十届全国生化与分子药理学术会议论文摘要汇编[C];2007年
6 孙开来;郝冬梅;孙秀菊;郑志红;富伟能;;胃癌发生发展过程中基因表达谱检测[A];中国的遗传学研究——中国遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编[C];2003年
7 高瑞兰;陈小红;林筱洁;钱煦岱;徐卫红;吴超群;;三七皂苷诱导造血细胞基因表达谱的研究[A];2005年华东六省一市血液病学学术会议暨浙江省血液病学学术年会论文汇编[C];2005年
8 刘培强;谢青松;朱大铭;;用于基因表达谱数据聚类分析的贪心图划分算法研究[A];2006年全国理论计算机科学学术年会论文集[C];2006年
9 胡仁明;彭永德;杨义生;宋怀东;顾彦杰;陈名道;许曼音;陈家伦;刘晓明;韩泽广;;肾上腺皮质腺瘤和嗜铬细胞瘤基因表达谱的建立及新基因的克隆[A];中华医学会第六次全国内分泌学术会议论文汇编[C];2001年
10 张进;肖波;吴志国;李国良;杨晓苏;李静;;颞叶癫痫大鼠模型海马基因表达谱和蛋白表达谱的研究[A];中华医学会第七次全国神经病学学术会议论文汇编[C];2004年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 记者 衣晓峰 通讯员 李小莲;探寻“证”的基因表达谱[N];中国中医药报;2009年
2 ;聚类分析在自身免疫病基因表达谱研究中的初步应用[N];中国医药报;2003年
3 记者 胡德荣 通讯员 汪敏;我国两项基因研究达国际先进[N];健康报;2000年
4 记者 张学全 张建松;我人类功能基因研究获重要进展[N];新华每日电讯;2000年
5 胡永忠;专家热论生物医药[N];医药经济报;2002年
6 通讯员吴志军 刘征云;咬定青山不放松[N];科技日报;2002年
7 秦红 冷明祥 王兴东;南医大汇集 群雄“抢”基因[N];新华日报;2001年
8 金亚斯;刘芝华:解读遗传与食管癌变[N];科技日报;2004年
9 新华社记者 李斌;基因冲击波[N];新华每日电讯;2000年
10 陈瑜;沈自尹;陈伟平;淫羊藿总黄酮重建衰老免疫稳态的分子机制[N];中国医药报;2005年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 李林辉;小立碗藓冷胁迫下表达序列标签分析及其相关基因Cor166的功能初探[D];首都师范大学;2005年
2 张骞;红色毛癣菌孢子EST构建及基因表达谱分析[D];吉林大学;2007年
3 田素礼;应用基因表达谱芯片探讨Oxaliplatin诱导人结肠癌细胞凋亡分子机制的实验研究[D];吉林大学;2005年
4 胡吉;垂体瘤组织基因表达谱及发病机制研究[D];复旦大学;2005年
5 黄志刚;应用肿瘤基因解剖工程数据库及RNA干扰技术检测大肠癌基因表达谱[D];复旦大学;2005年
6 黄静;扶正增效方对非小细胞肺癌放射增敏的临床及基因表达谱研究[D];北京中医药大学;2006年
7 姚实林;阳虚质理论及其外周血基因表达谱研究[D];北京中医药大学;2007年
8 马丽娟;利用激光捕获显微切割及基因芯片技术构建喉鳞状细胞癌基因组差异表达谱[D];中南大学;2008年
9 周美启;针刺心经与小肠经干预急性心肌缺血大鼠心脏和下丘脑基因表达谱比较研究[D];广州中医药大学;2005年
10 祝骥;人红白血病K562细胞基因表达谱芯片制作及应用研究[D];华南理工大学;2002年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 王爽;鼻咽低分化鳞状细胞癌分子分类的初步研究[D];第一军医大学;2004年
2 葛汝村;大鼠骨髓基质细胞诱导分化中相关基因表达谱的微阵列分析[D];山东大学;2005年
3 高婷;利用抑制差减杂交技术研究小麦幼苗水分胁迫诱导的基因表达谱[D];山西农业大学;2004年
4 申晓敏;人胃癌耐药细胞系的建立及相关基因研究[D];天津医科大学;2005年
5 高泓;一个糖尿病家系肾阴阳两虚证基因表达谱研究[D];成都中医药大学;2005年
6 黄丽俊;应用基因芯片筛选植物激活蛋白处理水稻相关差异基因及其验证[D];重庆大学;2005年
7 杨庆平;基于贝叶斯网络的基因调控网络构建算法的研究[D];哈尔滨工业大学;2006年
8 马群;胡杨根和叶基因表达谱的微阵列分析[D];北京林业大学;2007年
9 范莉;应用基因芯片技术筛查人子宫内膜容受性相关基因[D];华中科技大学;2006年
10 孟伟;Velcade(bortezomib)诱导K562细胞凋亡的基因表达谱研究[D];南方医科大学;2007年
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