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《天津大学》 2004年
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分子动力学模拟蛋白质在固液界面的吸附

钟成  
【摘要】:蛋白质在固体表面的吸附在许多工业和医药过程中具有重要的作用。近几十年来,尽管人们对蛋白质吸附的研究取得了很大进展,但对蛋白质吸附的机理仍缺乏深入的了解,现在仍然不能准确预测吸附后蛋白质分子的取向以及吸附过程引起的构象变化,而这些工作对于理解、控制和利用界面上蛋白质的生物过程是非常重要的。 分子动力学(MD)模拟是研究吸附等表面现象的强有力手段。在MD模拟过程中,所有原子的位置都可以知道,可以从分子水平上来研究吸附的机理和吸附动力学。 本文根据蛋白质分子结构的特点,采用刚体模型,对聚十赖氨酸分子在固液界面上的吸附过程进行了分子动力学模拟。模拟在NVT条件下进行,采用周期性边界条件,各分子初始速度按Maxwell分布。势能的计算采用球形截断法,结合最近邻象变换法,对模拟原胞内原子进行适当的分组,显著地提高了模拟速度。 分子动力学模拟的结果表明:在吸附过程中,主链二面角φ和ψ均发生了不同程度的变化,其中部分φ角超出了α螺旋的二面角范围,使聚十赖氨酸分子的螺旋结构受到了部分破坏;除此之外,侧链结构也发生了比较明显的变化。因此,蛋白质在吸附过程中,构象会发生变化,甚至导致失活。 聚十赖氨酸在纳米TiO2和纳米SiO2上吸附的实验结果表明,吸附后α螺旋含量减少,模拟结果为这一实验结果提供了理论依据。
【学位授予单位】:天津大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2004
【分类号】:O647.3

【引证文献】
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【参考文献】
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【共引文献】
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10 徐光年;乔学亮;邱小林;陈建国;;有机蒙脱石的制备新方法及性能表征[J];硅酸盐通报;2007年05期
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【二级参考文献】
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