6个油松种群遗传多样性的RAPD分析

高凤琴

【摘要】： 本研究以山西、陕西、河北和辽宁4省的6个油松种群为研究对象,采用RAPD标记,对其遗传多样性和遗传结构进行了研究。通过对油松RAPD反应体系的随机引物浓度、模板DNA用量、dNTP浓度、TaqDNA聚合酶浓度和Mg~(2+)浓度等进行梯度试验,建立了适合油松RAPD扩增的最佳反应体系,即在25μL反应液中,含10×Buffer 2.5μL,25 mmol/L的MgCl_2 3.0μL,10 mmol/L的dNTP0.5μL,0.5 U Taq酶,40 ng的模板DNA,10μmol/L的引物2.0μL,14.9μL ddH_2O。同时对60条引物进行筛选试验,从中筛选出扩增多态性片段较多且扩增产物稳定的RAPD引物19条。在此基础上,对6个油松种群的102个针叶样品的基因组DNA进行扩增,共检测到146个位点,其中多态位点122个,占83.56%。用POPGEN(1.31版)软件对数据进行分析,得到的Nei's基因多样性(h)与Shannon多样性指数(I)分别为0.2587和0.3786,表明遗传多样性水平较高。在6个种群中,灵空山种群(LK)(PPB=66.44%,h=0.2735,I=0.3965)和雾灵山种群(WL)(PPB=65.75%,h=0.2639,I=0.3855)的遗传多样性高于其他4个种群[千山种群(QM)、平泉种群(PQ)、黄陵种群(HL)和洛南种群(LN)]。就6个种群而言,RAPD检测结果显示,每个位点的等位基因数(na)为1.6518,有效等位基因数(ne)为1.4667,总遗传多样性(Ht)为0.3263,种群内遗传多样性(Hpop)为0.2587;基因分化系数(Gst)达0.2072,基因流(Nm)为1.9145。说明总遗传变异的20.72%存在于种群间,79.3%存在于种群内。表明油松的遗传变异大部分存在于种群内,种群之间基因交流亦较频繁。研究同时表明,6个油松种群之间的遗传距离的变化范围为0.0791～0.1380,平均值为0.10482。其中LK和PQ的遗传距离最大(0.1380),LK和WL的遗传距离最小(0.0791)。根据Nei's遗传距离,利用UPGMA法对6个油松种群进行聚类分析,结果表明,可将这些种群归为两组,即LK和WL这两个种群为第一组,QM、PQ、HL和LN这4个种群为第二组;或者LK、WL、QM和LN为一组,PQ和HL为另一组。通过对6个种群间的遗传距离和地理距离进行Mantel检验,证明6个种群间的遗传距离与地理距离之间没有显著相关性。基于以上研究结果,从油松种群遗传改良和油松种群遗传多样性保护两方面提出了相应的资源利用和保护策略。

【关键词】：油松 遗传多样性 RAPD 保护
【学位授予单位】：山西大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2008
【分类号】：Q943
【目录】：

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	【引证文献】
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前2条

1	巴山;辽宁省东北林蛙遗传多样性与环渤海地区林蛙系统发育研究[D];沈阳师范大学;2011年
2	张振;兴安落叶松基本群体遗传多样性分析[D];东北林业大学;2012年

	【参考文献】
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前10条

1	汪永庆,徐来祥,张知彬;RAPD技术的标准化问题[J];动物学杂志;2000年04期
2	李敏俐,郑彩霞;油松雌性不育系(28号无性系)的RAPD分析[J];北京林业大学学报;2002年04期
3	张冬梅;杨娅;沈熙环;茹广欣;;油松SSR-PCR引物筛选及反应体系的建立[J];北京林业大学学报;2007年02期
4	张春晓,李悦,沈熙环;林木同工酶遗传多样性研究进展[J];北京林业大学学报;1998年03期
5	杨传平,魏利,姜静,刘桂丰,赵光仪;应用ISSR-PCR对西伯利亚红松19个种源的遗传多样性分析[J];东北林业大学学报;2005年01期
6	曾明,李守汉,张继,曾爽,王平;兰州油松松皮挥发性成分分析[J];西北植物学报;2005年03期
7	汪小全,邹喻苹,张大明,洪德元,刘正宇;银杉遗传多样性的RAPD分析[J];中国科学C辑:生命科学;1996年05期
8	宋朝枢;;山西太岳山油松形态特征与类型的初步研究[J];林业科学;1979年02期
9	李毳;柴宝峰;王孟本;;华北地区油松种群遗传多样性分析[J];植物研究;2006年01期
10	王明庥;森林与生物多样性——遗传多样性的保护和利用[J];南京林业大学学报(自然科学版);1993年04期

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前1条

1	樊冬丽;山西省荞麦品种资源的遗传多样性研究[D];山西农业大学;2003年

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前10条

1	张晓红;张虎芳;王青;;百草枯对金鱼血清过氧化物酶和酯酶表达的影响[J];癌变·畸变·突变;2010年05期
2	颜廷进,李群,李汝玉,谭振馨;RAPD技术在玉米品种纯度鉴定中的应用研究[J];山东农业科学;2003年01期
3	张晗;高永超;沙伟;李汝玉;戴双;;紫萼藓科植物DNA提取及遗传多样性的分析[J];山东农业科学;2006年01期
4	董艳敏;卢金东;刘栓桃;;分子标记技术在葫芦科瓜类作物中的应用进展[J];山东农业科学;2008年02期
5	王际振;刘亚琼;杨兵;王献;;ISSR分子标记及其在园林植物遗传育种中的应用[J];山东农业科学;2008年08期
6	张庆华;赵新海;钟丽娟;徐冲;;酯酶同工酶分析鉴别生产用平菇菌种真实性研究[J];山东农业科学;2009年06期
7	王炜;郭卫华;庞绪贵;王仁卿;战金成;代杰瑞;;黄河下游流域土壤种子库生物多样性研究[J];山东农业科学;2010年02期
8	商伟;张彦军;魏海忠;孔晓民;蒋飞;刘保申;;玉米SSR连锁图谱构建和粗缩病抗性QTL的初步定位[J];山东农业科学;2011年12期
9	钱万英,谢惠安,赵帜平,王保洲,谢万树,邵民;扬子鳄肌肉的POX同工酶的测定研究[J];安徽大学学报(自然科学版);1996年03期
10	周忠泽,蒙仁宪;华东地区植被概况[J];安徽大学学报(自然科学版);1996年04期

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前10条

1	刘谞承;梁明易;张玉环;曾嘉强;;陇东董志塬生态环境保护建设方法探讨研究[A];2011中国环境科学学会学术年会论文集（第三卷）[C];2011年
2	朱利;;汉石桥湿地生态景观建设——以藕塘区域改造为例[A];2011北京园林绿化与生物多样性保护[C];2011年
3	李丹;程天印;欧迪军;王晓平;李福恒;杨志辉;宋一恒;;山莓研究现状及在动物生产中的前景分析[A];2010植物提取物与营养及应用技术交流研讨会论文集[C];2010年
4	韩晨霞;李旭光;沈洪国;;大板营自然保护区种子植物区系组成及地理分布特征研究[A];重庆市首届工程师大会论文集[C];2004年
5	钟建兴;方民杰;;菊黄东方鲀、双斑东方鲀及其种间杂交子代的ISSR分析[A];中国南方十六省（市、区）水产学会渔业学术论坛第二十六次学术交流大会论文集（上册）[C];2010年
6	吴谡琦;刘瑞玉;董金海;王可玲;;中国近海真鲷种群间的基因流及其分化[A];生命科学与生物技术：中国科协第三届青年学术年会论文集[C];1998年
7	张经炜;;再造一个山川秀美的大西北——保护环境，开拓资源，开展固沙保土的C_4植物研究利用[A];节能环保和谐发展——2007中国科协年会论文集（三）[C];2007年
8	胡艳;葛继稳;汪洋;;神农架长坊二级水库电站工程建设对生态环境的影响[A];节能环保和谐发展——2007中国科协年会论文集（三）[C];2007年
9	张经炜;;再造一个山川秀美的大西北——保护环境，开拓资源，开展固沙保土的C4(碳四)植物的选育、引种和推广的研究(西部大开发建议之三)[A];节能环保和谐发展——2007中国科协年会论文集（三）[C];2007年
10	吕厚远;刘东生;郭正堂;;黄土高原地质、历史时期古植被研究状况[A];中国科学院地质与地球物理研究所二○○三学术论文汇编·第三卷(地球环境·工程地质与灾害)[C];2003年

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1	韩英鹏;多环境、多遗传背景下不同发育时期大豆籽粒重的QTL分析[D];哈尔滨师范大学;2010年
2	张立楠;鲢遗传连锁图谱的构建及精子竞争对性别间重组率差异的影响[D];中国海洋大学;2010年
3	巴雅尔塔;青藏高原东缘高寒草甸群落花期物候研究[D];兰州大学;2010年
4	方克艳;近400年来西北地区气候变化的树轮记录研究[D];兰州大学;2010年
5	林荔辉;应用分子和常规技术通过籼粳交选育亲籼型水稻雄性不育系[D];福建农林大学;2010年
6	秦伟;新疆野苹果繁育特性及种质资源亲缘关系研究[D];新疆农业大学;2010年
7	李培英;新疆草坪用野生偃麦草种质资源评价[D];新疆农业大学;2010年
8	田晔林;北京百花山自然保护区苔藓植物多样性研究[D];北京林业大学;2011年
9	张彩英;小麦主要产量和品质性状的QTL鉴定及ZDS功能标记的开发[D];河北农业大学;2010年
10	刘成;多年生簇毛麦基因组新重复序列的分离及其在小麦抗病新种质鉴定中的应用[D];电子科技大学;2010年

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前10条

1	刘敏;基于SSR、ISSR和RAPD对大豆疫霉菌的遗传多样性研究[D];华中农业大学;2010年
2	李良;湖北省油茶优良单株遗传多样性及品质初步分析[D];华中农业大学;2010年
3	武欣;武汉城市乡村聚落植物物种组成与多样性研究[D];华中农业大学;2010年
4	曾毅;基于植物群落分析的武汉城市湖泊湿地植被恢复典型模式研究[D];华中农业大学;2010年
5	林兵;甘蓝型油菜A8连锁群种子含油量QTL簇解析及连锁累赘分析[D];华中农业大学;2010年
6	刘健;甘蓝型油菜C2连锁群种子含油量QTL簇及品质性状的分析[D];华中农业大学;2010年
7	郭一鸣;全球白菜型油菜遗传多样性分析[D];华中农业大学;2010年
8	石伟平;二倍体马铃薯遗传群体构建和抗低温糖化分析[D];华中农业大学;2010年
9	董巍;分子标记辅助选择改良光温敏核不育系的稻瘟病抗性和稻瘟病抗性基因的初步定位[D];华中农业大学;2010年
10	郑瑜;银杏核心种质构建初探[D];华中农业大学;2010年

	【同被引文献】
	【同被引文献】

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前10条

1	魏刚,陈服官;中国林蛙Rana chensinensis系统发育及物种形成和分化的研究[J];动物学报;1990年01期
2	徐广,方庆权,James E. KEIRANS,Lance A. DURDEN;分子系统进化关系分析的一种新方法——贝叶斯法在硬蜱属中的应用[J];动物学报;2003年03期
3	杨玉慧,张德兴,李义明,吉亚杰;中国黑斑蛙种群的线粒体DNA多样性和生物地理演化过程的初探[J];动物学报;2004年02期
4	张玉荣;罗菊春;喻锦秀;;资源冷杉遗传多样性的ISSR分析[J];北京林业大学学报;2007年06期
5	吕志华;;DNA分子标记在林木遗传育种中的应用及进展[J];楚雄师范学院学报;2006年09期
6	杨书文;长白落叶松种源选择的研究[J];东北林学院学报;1984年04期
7	詹静,杨传平;兴安落叶松种源试验的研究[J];东北林业大学学报;1989年06期
8	杨传平,张维,于秉君,秦泗华,桑作兴,张丽霞,盛喜东,董岐;中国兴安落叶松种源试验的研究(Ⅰ)——地理变异规律和模式[J];东北林业大学学报;1990年S2期
9	杨传平,杨书文,夏德安,刘桂丰,吕清友,张培杲;兴安落叶松种源试验研究(Ⅲ)——种源区划[J];东北林业大学学报;1991年S2期
10	张含国，高士新，张敏莉，周显昌，潘本立，原秀玲;长白落叶松天然群体遗传结构的研究[J];东北林业大学学报;1995年06期

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1	罗建勋;云杉天然群体遗传多样性研究[D];中国林业科学研究院;2004年
2	杨宝田;东北区狍遗传多样性及性别基因鉴定研究[D];东北林业大学;2005年
3	那冬晨;兴安落叶松地理种源遗传多样性与利用研究[D];东北林业大学;2005年
4	车静;现生蛙科动物部分物种的分子系统发育研究[D];四川大学;2006年
5	贯春雨;日本落叶松×兴安落叶松RAPD、SSR遗传图谱构建与QTL定位[D];东北林业大学;2010年

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前9条

1	贾俊玲;吉林天然红松林遗传多样性的ISSR分析[D];辽宁师范大学;2011年
2	徐小林;栓皮栎群体遗传结构研究[D];南京林业大学;2003年
3	魏利;应用ISSR分子标记对西伯利亚红松（Pinus sibirica Du Tour）遗传多样性研究[D];东北林业大学;2004年
4	张国强;ISSR分子标记揭示黑斑侧褶蛙中国种群的遗传结构和遗传多样性[D];南京师范大学;2005年
5	郝雨;大兴安岭北段天然山地樟子松分子生态学的研究[D];东北林业大学;2006年
6	李峰;兴安落叶松林分布及生产力对气候变化的响应研究[D];中国科学院研究生院（植物研究所）;2006年
7	王小芬;盐地碱蓬遗传多样性的RAPD和ISSR分析[D];山东师范大学;2007年
8	李雪峰;兴安落叶松种源、无性系遗传多样性的研究[D];东北林业大学;2009年
9	隋心;红松无性系种子园子代的父本分析及遗传多样性的研究[D];东北林业大学;2009年

	【二级参考文献】
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1	沈曦,周开亚,王义权;中国蝮属蛇类的RAPD分析[J];动物学报;1999年01期
2	宋林生,相建海,李晨曦,周令华,刘瑞玉,樊拥军;用RAPD标记研究对虾属六个种间的亲缘关系[J];动物学报;1998年03期
3	张志毅,朱之悌,G.Müller-Starck,H.H.Hattemer;毛白杨无性系同工酶基因标记的研究[J];北京林业大学学报;1992年03期
4	张德强,张志毅,杨凯;AFLP技术在林木遗传改良中的应用[J];北京林业大学学报;2000年06期
5	张德强,张志毅,杨凯;分子标记技术在杨树遗传变异及系统分类中的应用[J];北京林业大学学报;2001年01期
6	张海英,许勇,王永健;分子标记技术概述(上)[J];长江蔬菜;2001年02期
7	张敩方,李懋学;三种松属(Pinus)植物的核型研究[J];东北林学院学报;1984年S1期
8	杨一平,尹瑞雪,张军丽;长白山天然红松林同功酶遗传变异的研究——红松云冷杉林酯酶遗传及组成[J];东北林业大学学报;1986年02期
9	杨一平,尹瑞雪,张军丽;长白松自然群体同功酶遗传多样性的研究[J];东北林业大学学报;1991年05期
10	张含国，高士新，张敏莉，周显昌，潘本立，原秀玲;长白落叶松天然群体遗传结构的研究[J];东北林业大学学报;1995年06期

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1	陈纹;孙坤;张辉;苏雪;陈学林;马瑞君;;中国特有植物卧龙沙棘自然群体的RAPD分析[J];广西植物;2007年02期
2	李方祯;宛涛;伊卫东;蔡萍;;锡盟沙地榆(Ulmuspumila L.var.sabulosa)遗传多样性的RAPD研究[J];中国农业科技导报;2008年03期
3	宁婷婷,张再君,金诚赞,朱英国;早熟禾品种间遗传多样性分析[J];遗传;2005年04期
4	张海琪;丁雪燕;薛辉利;黄丽英;;南美白对虾两养殖群体遗传多样性的比较分析[J];宁波大学学报(理工版);2006年01期
5	叶功富,罗美娟,林益明,卢昌义;短枝木麻黄地理种源遗传多样性的RAPD分析[J];厦门大学学报(自然科学版);2005年06期
6	陈曦;汤庚国;郑玉红;王雷宏;;苹果属山荆子遗传多样性的RAPD分析[J];西北植物学报;2008年10期
7	李朝阳;李菁;田向荣;陈军;刘冰;;水分因子对尖叶拟船叶藓遗传多样性的影响[J];贵州师范大学学报(自然科学版);2010年04期
8	彭艳秋;邵剑文;张小平;张中信;朱国萍;;珍稀濒危植物安徽羽叶报春遗传多样性的RAPD分析[J];云南植物研究;2007年05期
9	李朝阳;李菁;田向荣;姜业芳;陈军;;梵净山尖叶拟船叶藓的遗传多样性分析[J];云南植物研究;2008年02期
10	左开井,孙济中,张金发,聂以春,刘金兰;用RAPD标记评估我国棉花品种遗传多样性[J];遗传学报;2000年09期

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1	陈永霞;张新全;马啸;谢文刚;;西南区扁牛鞭草遗传多样性RAPD分析[A];中国草学会牧草育种委员会第七届代表大会论文集[C];2009年
2	张舒;常向前;陈其志;吕亮;杨小林;喻大昭;黄俊斌;李阳;罗汉刚;张求东;王利兵;史艳云;;湖北省稻曲病菌Usitilaginoidea vriens遗传多样性的初步分析[A];植物保护与现代农业——中国植物保护学会2007年学术年会论文集[C];2007年
3	王宝金;代解杰;吕永青;;恒河猴(Macaca mulatta)的随机引物扩增多态性DNA(RAPD)与遗传多样性的初步分析[A];2002年灵长类实验动物学术交流会论文摘要集[C];2002年
4	李喜凤;杜云锋;张红梅;郝哲;;蒲公英属4种植物遗传关系与遗传多样性的RAPD分析[A];第十届全国中药和天然药物学术研讨会论文集[C];2009年
5	龚国淑;叶华智;张敏;刘萍;陈希芹;邵宝林;余霞;杨丹玲;;玉米新月弯孢菌(Curvularia lunata)的RAPD分析[A];中国植物病理学会2005年学术年会暨植物病理学报创刊50周年纪念会论文集[C];2005年
6	杨晓军;赵有璋;;藏系绵羊遗传多样性及其品种(系)分化的研究[A];中国畜牧兽医学会养羊学分会全国养羊生产与学术研讨会议论文集[C];2005年
7	尹彩霞;张继栋;李向阳;刘自珠;张华;张金艳;乔爱民;;西兰薹与芥兰遗传多样性的RAPD分析[A];中国园艺学会2010年学术年会论文摘要集[C];2010年
8	胡兴宜;宋丛文;张亚东;张新叶;;秃杉种质资源的遗传多样性研究[A];中国林学会2004年年会论文集[C];2004年
9	王志坤;丁国华;周秀艳;秦智伟;;黄瓜种质资源遗传多样性的RAPD分析[A];中国园艺学会第十届会员代表大会暨学术讨论会论文集[C];2005年
10	林郑和;陈常颂;陈荣冰;;我国39个茶树品种的RAPD分析[A];第二届热带亚热带植物资源的遗传多样性与基因发掘利用研讨会论文集[C];2006年

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1	记者胡德荣;亚洲人群遗传多样性研究获最新成果[N];健康报;2009年
2	胡云章;绚丽的民族文化丰富的遗传多样性[N];大众科技报;2008年
3	胡亦;南海所鲷科研究项目通过鉴定[N];中国渔业报;2009年
4	本报记者游雪晴;中国的人类遗传多样性研究成果丰硕[N];科技日报;2001年
5	记者刘欣陈云芬;保护和利用作物遗传多样性控制病虫害促进可持续农业发展国际执委会会议在昆举行[N];云南日报;2007年
6	记者耀辉;云南5成果喜获国家科技奖[N];云南经济日报;2006年
7	刘燕玲;深入研究珍稀濒危中药资源保护[N];健康报;2006年
8	李倩;我国永生细胞库初具规模[N];人民日报;2007年
9	中国科学院院士　张亚平;家养动物的起源、进化与遗传多样性[N];光明日报;2004年
10	陈云芬;云南珍稀濒危植物研究部分成果国际领先[N];云南日报;2008年

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前10条

1	薛建华;黑龙江流域野生莲的遗传多样性[D];东北林业大学;2006年
2	黄绍辉;珍稀濒危植物连香树的物种生物学研究[D];南京林业大学;2007年
3	邓传良;石蒜属植物系统学及长筒石蒜遗传多样性研究[D];南京林业大学;2005年
4	周兰英;杜鹃属植物亲缘关系及遗传多样性研究[D];四川农业大学;2008年
5	陈庆山;大豆灰斑病种质资源遗传多样性的RAPD和SSR分析[D];东北农业大学;2001年
6	王丽;珍稀濒危植物华山新麦草的胚胎学及其遗传多样性研究[D];西北大学;2005年
7	马朝芝;甘蓝型油菜遗传多样性和杂种优势的研究[D];华中农业大学;2002年
8	李锡香;黄瓜种质遗传多样性的形态和分子评价及其亲缘关系研究[D];中国农业科学院;2002年
9	宋廷宇;薹菜品质分析及种质资源的亲缘关系研究[D];南京农业大学;2009年
10	杨晓军;藏系绵羊遗传多样性及其品种（系）分化的研究[D];甘肃农业大学;2001年

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前10条

1	高凤琴;6个油松种群遗传多样性的RAPD分析[D];山西大学;2008年
2	张春晖;穿龙薯蓣微形态特征研究及生物多样性的RAPD分析[D];佳木斯大学;2007年
3	邱源;23个油橄榄品种的RAPD分析[D];四川农业大学;2007年
4	姜寒玉;麻黄亲缘关系分析及主要药用成分测定研究[D];甘肃农业大学;2006年
5	李超;4种鲇形目鱼类的RAPD研究[D];东北林业大学;2008年
6	孙爱花;橡胶树优良品种指纹图谱的构建[D];华南热带农业大学;2005年
7	朱海生;樱桃番茄种质资源遗传多样性及杂交种纯度鉴定RAPD分析[D];福建农林大学;2005年
8	张守锋;毛竹（Phyllostachys edulis）遗传多样性研究[D];南京林业大学;2005年
9	李岩;天然红松遗传多样性在时间尺度上变化的RAPD和ISSR分析[D];辽宁师范大学;2005年
10	董建芳;内蒙古黄柳遗传多样性的RAPD分析[D];内蒙古农业大学;2008年

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