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DNA甲基化应用于药物过敏性猝死法医学诊断的探索研究

郭华林  
【摘要】:目的:药物过敏性猝死的法医学诊断是法医病理学界的一大难题,寻找精准、客观的实验室诊断指标是法医病理学者目前亟待解决的问题。通过研究分析药物过敏死者与免疫正常人之间的DNA甲基化差异,寻找药物过敏相关DNA甲基化差异位点、为药物过敏性猝死的法医学鉴定提供精准、客观的实验室诊断指标。方法:1.免疫正常人(6例)和药物过敏性猝死者(18例),使用Illumina Methylation EPIC芯片检测全血DNA甲基化。2.芯片数据分析:R语言ChAMP包进行甲基化DMP、DMR差异分析、基因注释和基因关联分析;R语言R-topGO、R-KOBAS软件包进行GO及KEGG功能富集分析。3.基于基因组关联分析、GO及KEGG功能富集分析的基础上,进一步进行药物过敏相关DNA甲基化位点(区域)功能的研究。4.基于DMP、DMR差异分析和基因关联分析,进行选药物过敏性猝死DNA甲基化诊断指标的筛选。结果:1.HLA-DMA、HLA-DMB、HLA-DOB、HLA-DPA1、HLA-DPB1基因的甲基化水平与药物过敏猝死显著关联;2.头孢菌素类药物所致过敏性猝死与趋化因子CCL5基因启动子区域的DNA低甲基化、HLA-DOB基因甲基化有关;3.药物过敏死者在“趋化因子→PI3K-Art通路→蛋白激酶”途径上基因甲基化水平差异富集;4.筛选得到一批在正常人中甲基化水平稳定,药物过敏性猝死者具有显著差异的CpG位点及CpG岛。结论:药物过敏与DNA甲基化有关,不同类别药物所致过敏可能导致不同区域甲基化差异;法医学上,应用DNA甲基化差异基因进行药物过敏性猝死的法医学诊断可行;临床上,从DNA甲基化水平进行调控,预防和治疗药物过敏是可能的。


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