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《内蒙古大学》 2018年
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大肠杆菌DeaD蛋白影响mRNA水平

张冉  
【摘要】:大肠杆菌DeaD(曾用名CsdA)蛋白是RNA解旋酶DEAD-box家族中的一员,是一种冷激诱导蛋白,在低温条件下能与核糖核酸酶E组装成RNA降解体参与mRNA周转,并参与核糖体组装。我们实验室发现DeaD蛋白影响细胞周期,那么影响的机制是什么?本文测定ΔdeaD细胞总蛋白的变化,继而,利用Western blot和RT-PCR技术检测了复制起始蛋白DnaA的含量,发现单个ΔdeaD细胞DnaA含量有升高,说明删除deaD基因引起的DNA复制起始提前可能是DnaA含量提升所致。细菌双杂交实验结果显示DnaA与DeaD蛋白之间没有直接相互作用,说明DeaD并非直接通过与DnaA相互作用来影响DNA复制起始。为了进一步探讨DeaD影响复制起始的机制,本文检测了DeaD对细胞总RNA的影响,结果发现单个Δdead细胞总RNA含量提升,而且在25℃条件下,ATP存在时DeaD蛋白能够降解总RNA。结果表明DeaD蛋白可能影响转录组水平。利用RNA-seq技术测定利福平处理前和后的ΔdeaD和野生型细胞基因表达水平的变化,结果显示DeaD蛋白可能会降低DNA聚合酶、RNA聚合酶亚基,应激蛋白,糖代谢、氨基酸代谢相关基因的mRNA,因此,Δdead细胞中DNA复制起始提前可能与这些基因表达上调有关。此外,Δdead细胞中鞭毛、呼吸代谢相关基因,ABC转运蛋白表达下调,可能是因为低温条件下DeaD蛋白对其mRNA有保护作用。综上所述,DeaD蛋白可能作为RNA酶降解或保护mRNA,还有可能作为转录因子调控基因表达。
【学位授予单位】:内蒙古大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:Q78

【参考文献】
中国期刊全文数据库 前2条
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【共引文献】
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中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 张冉;大肠杆菌DeaD蛋白影响mRNA水平[D];内蒙古大学;2018年
2 王婧;大肠杆菌DeaD蛋白对DNA复制起始的影响[D];内蒙古大学;2016年
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