内蒙古黄柳遗传多样性的RAPD分析
【摘要】：
黄柳(Salix gordejevii)是杨柳科柳属的一种旱中生灌木,为沙地重要的固沙先锋植物,具有耐干旱、抗风蚀、耐沙埋的特点,它不仅是流动、半流动沙丘的建群种和优势种,同时还具有极高的遗传资源价值和生态价值。本项研究采用RAPD分子标记方法对黄柳的天然居群进行了遗传多样性等方面的研究。利用13个引物对黄柳的4个天然居群进行了RAPD分析,共检测到153个位点,其中128个是多态位点,多态位点比率达到83.66%。实验结果表明:各居群内多态位点百分比变化范围为88.24%～96.08%,其中多态位点百分比最高的是呼伦贝尔沙地居群,最低的是浑善达克沙地居群;应用Nei指数(h)和Shannon多样性指数(I)估算居群的遗传多样性,其大小顺序为:呼伦贝尔沙地居群、科尔沁沙地东部居群、科尔沁沙地西部居群和浑善达克沙地居群;通过Nei指数计算黄柳的遗传多样性,得出大部分的遗传变异存在于居群内(94.27%);各居群间有很大的基因流(Nm=11.31);遗传相似度在0.8961～0.9543之间,表明各居群之间的亲缘关系非常近;利用算术加权平均数法(UPGMA)对黄柳居群进行聚类分析,将4个居群聚为三类:科尔沁沙地东部居群和科尔沁沙地西部居群聚为第一类,和浑善达克沙地居群聚为第二类,最后与呼伦贝尔沙地居群聚为第三类(P0.01);通过相关性分析,表明地理距离和遗传距离有极显著正相关性,而其遗传多样性与海拔、年均温和年降水量等环境因子没有显著相关性。
【关键词】：黄柳天然居群 遗传多样性 RAPD 【学位授予单位】：内蒙古农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2008
【分类号】：Q943
【目录】：
- 摘要3-4
- Abstract4-8
- 1 引言8-18
- 1.1 生物多样性及遗传多样性的概念8-13
- 1.1.1 遗传多样性的研究意义9
- 1.1.2 遗传多样性的研究方法9-13
- 1.2 RAPD 分子标记技术的原理与应用13-14
- 1.3 柳属植物在遗传学方面的研究现状及黄柳研究现状14-18
- 1.3.1 柳属植物在遗传学方面的研究现状14-15
- 1.3.2 黄柳的生物生态学特性及其分布15-16
- 1.3.3 黄柳的研究现状16-18
- 1.4 本研究的目的和意义18
- 2 实验材料与研究方法18-25
- 2.1 实验材料18-20
- 2.2 实验条件与方法20-25
- 2.2.1 主要试剂及仪器20-21
- 2.2.2 黄柳的DNA 提取方法21-22
- 2.2.3 DNA 纯度和浓度的检测22
- 2.2.4 PCR 扩增22-23
- 2.2.5 RAPD 引物的筛选23
- 2.2.6 增产物的分离与检测23-24
- 2.2.7 RAPD 电泳谱带的记录24
- 2.2.8 RAPD 数据的统计分析方法24-25
- 3 结果与分析25-32
- 3.1 遗传多样性分析25-28
- 3.1.1 遗传多态性分析25
- 3.1.2 SHANNON 多样性指数25-27
- 3.1.3 NEI 指数27-28
- 3.2 遗传分化与基因流28-29
- 3.3 遗传相似度与遗传距离分析29-31
- 3.4 相关性分析31-32
- 3.4.1 遗传距离与地理距离的相关性分析31
- 3.4.2 遗传多样性参数与生态因子的相关性分析31-32
- 4 结论32-34
- 5 讨论34-39
- 5.1 遗传多样性评价34
- 5.2 遗传结构与基因流34-35
- 5.3 遗传距离、遗传相似度以及聚类分析35-36
- 5.4 相关性分析36-37
- 5.5 RAPD 分子标记存在的问题和解决办法37-39
- 致谢39-40
- 参考文献40-45
- 附录45-49
- 作者简介49
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