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《辽宁师范大学》 2006年
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利用ISSR和COI序列标记分析不同地理仿刺参群体的遗传多样性

闫晗  
【摘要】:仿刺参(Apostichopus japonicas Selenka),属棘皮动物门(Echinodermata)、游走亚门(Eleutherozoa),海参纲(Holothuroidea),楯手目(Aspidochirota),刺参科(Stichopodidae),仿刺参属(Apostichopus),主要分布在北太平洋沿岸浅海。虽然国内外对海参纲的遗传多样性有些研究,但仍未见有利用DNA分子标记研究仿刺参的遗传多样性相关方面的报道。本文采用ISSR和COⅠ两种分子标记方法对大连海域金州大魏家(JD)、金州七顶山(JQ)、长兴岛(CXD)、大刘家(DLJ)和皮口(PK)五个地理亚群的养殖群体的仿刺参的遗传多样性和种群遗传结构进行了研究。结果表明,ISSR揭示了这五个地理亚群的仿刺参具有很高的遗传多样性。筛选出的12个ISSR引物扩增出148条带子,其中多态条带为140条,总的多态位点比率为94.59%,平均多态位点11.67条,Nei指数为0.2756,Shannon指数为0.4224,群体间遗传分化指数Gst<0.5,说明这五个养殖群体的仿刺参群体的遗传多样性丰富。种群基因分化度Gst的变动范围不大,为0.0378~0.0706,平均为0.0507,说明种群间的分化较小。种内总的基因多样性为0.2756。表明:遗传多样性主要存在于亚群内,而不是亚群间,五个地理亚群显示出了较大的遗传相似性,这是由于基因流而造成的;通过计算五个亚群中任何两亚群之间的遗传多样性,发现任何组合的遗传多样性都很丰富,亚群之间的基因流水平也较高,遗传分化指数最大值仅为0.0706,同样说明了由于基因流的作用,亚群内的变异要远远大于亚群间的变异,而成为变异的主要方式。 从COⅠ序列的分析也可以证明这一点。经测序,比对和对位排列后,有377个碱基具有同源序列。每个群体随机选取5个个体进行测序,其中有17个个体具有变异位点。变异位点数为26个,其中15个为多态位点。在26个变异位点中,有22个发生转换的位点,2个发生颠换的位点,2个转换和颠换同时存在的位点。在17个具
【学位授予单位】:辽宁师范大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2006
【分类号】:Q953

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【引证文献】
中国博士学位论文全文数据库 前4条
1 赵欢;刺参Apostichopus japonicus (Selenka)对温度胁迫响应分子机理的基础研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2011年
2 彭薇;仿刺参(Apostichopus japonicus)微卫星标记的开发与应用[D];中国海洋大学;2011年
3 陈丽梅;刺参(Apostichopus japonicus)的遗传学研究[D];中国海洋大学;2008年
4 刘广斌;刺参Apostichopus japonicus耐高温品系选育的基础研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前3条
1 罗海燕;海南野生荔枝种质资源遗传多样性及与半野生、栽培荔枝亲缘关系的ISSR分析[D];华南热带农业大学;2007年
2 王海山;仿刺参优良品系的筛选及杂交育种的初步研究[D];辽宁师范大学;2009年
3 毕晓欣;黑帽悬猴(Cebus apella)线粒体基因组全序列分析和菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)群体遗传学研究[D];鲁东大学;2012年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 王芳,张斌,单雷,毕玉平,许泽永;一种从花生种子中提取RNA的改进方法[J];花生学报;2002年04期
2 李庆云,庄东红,胡忠,黄秀丽;花生不同部位对提取DNA的影响[J];花生学报;2003年02期
3 陈四龙;李玉荣;徐桂真;程增书;;花生微卫星DNA分子标记研究进展[J];花生学报;2007年03期
4 李双铃;王辉;任艳;石延茂;何国浩;禹山林;袁美;;利用荧光标记SSR技术鉴定花生F_1代杂交种[J];花生学报;2009年04期
5 王洁;李双铃;王辉;石延茂;任艳;何国浩;袁美;;利用AhMITE1转座子分子标记鉴定花生F_1代杂种[J];花生学报;2012年02期
6 冯蕾,古丽努尔,杨新平;含XJT-9503高温中性蛋白酶基因Gp1重组菌B-pGp1表达条件的研究[J];皮革科学与工程;2005年05期
7 宝全,胡祥;p27~(kip1)基因逆转录病毒载体的构建及其对人胃癌细胞系生长抑制作用的研究[J];中国现代普通外科进展;2002年03期
8 张秋,孙汶生,高丽芬,马春红,韩丽辉,梁晓红;3.0倍乙型肝炎病毒全基因真核表达载体的构建及表达[J];中国现代普通外科进展;2004年05期
9 夏铁骑;;荧光原位杂交技术及其在微生物生态学中的应用[J];新乡学院学报(自然科学版);2009年02期
10 汪靖超,赵驰,王波,杨宏,李荣贵;外源基因在噬夏孢欧文氏菌中的表达[J];青岛大学学报(工程技术版);2005年02期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 宋陈玲;李亮;王继文;;水禽乙酰辅酶A羧化酶α基因部分序列克隆及进化分析[A];安全优质的家禽生产——第十五次全国家禽学术讨论会论文集[C];2011年
2 方清茂;崔光红;黄璐琦;张美;周先建;;栽培与野生何首乌种质资源遗传多样性的ISSR分析[A];中药饮片质量分析与中药鉴别技术交流研讨会论文集[C];2009年
3 钟建兴;方民杰;;菊黄东方鲀、双斑东方鲀及其种间杂交子代的ISSR分析[A];中国南方十六省(市、区)水产学会渔业学术论坛第二十六次学术交流大会论文集(上册)[C];2010年
4 倪中福;张义荣;梁荣奇;刘广田;孙其信;;分子标记与小麦遗传多样性评价研究[A];21世纪作物科技与生产发展学术讨论会论文集[C];2002年
5 徐如宏;任明见;黄世全;张庆勤;;小麦抗病种质贵农775中抗白粉病基因的RAPD标记[A];2003年全国作物遗传育种学术研讨会论文集[C];2003年
6 曾祥艳;辛志勇;陈孝;林志珊;张增艳;;兼抗白粉病、黄矮病多基因聚合小麦新种质的分子标记检测[A];2004’中国作物学会学术年会文集[C];2004年
7 高海波;陈孝;陈明;徐兆师;李连城;马有志;;小麦-中间偃麦草异附加系Z4的外源染色质的分子标记[A];2005年全国作物遗传育种学术研讨会暨中国作物学会分子育种分会成立大会论文集(二)[C];2005年
8 刘爱峰;段友臣;郝元峰;刘海燕;王洪刚;;抗条锈病小偃麦种质系的创制及鉴定[A];中国作物学会2007年学术年会论文集[C];2007年
9 张华鹏;张剑峰;刘俊莹;王聪聪;;马铃薯病毒(PVY、PVS和PLRV)的三重RT-PCR检测[A];马铃薯产业与科技扶贫(2011)[C];2011年
10 黄家强;卜夏;李卓娅;龚非力;;人TNFα分泌型、跨膜型和跨膜稳定型重组体的构建表达及杀瘤效应[A];生命科学与生物技术:中国科协第三届青年学术年会论文集[C];1998年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 刘亚梅;人工倾斜树干应力木形成机理的研究[D];安徽农业大学;2010年
2 刘永刚;基于微卫星DNA标记的马铃薯桃蚜不同种群遗传分化研究[D];甘肃农业大学;2010年
3 姚小磊;基于TGF-β1与Bcl-2的抗干眼症中药高通量筛选体系的建立[D];湖南中医药大学;2010年
4 梁淼;刺参(Apostichopus japonicus)个体生长差异的实验研究[D];中国海洋大学;2010年
5 白洁;太平洋牡蛎分子标记的开发与应用研究[D];中国海洋大学;2010年
6 苗贵东;半滑舌鳎微卫星标记开发、应用及遗传连锁图谱的构建[D];中国海洋大学;2010年
7 郑小坚;家蚕类胰岛素基因BBX-B8的功能研究[D];苏州大学;2010年
8 梁勇;白念珠菌高铁还原酶基因表达调控及Aft2p转录因子的功能研究[D];南开大学;2010年
9 于双妮;胰腺癌差异表达microRNAs的鉴定及功能研究[D];北京协和医学院;2008年
10 何小勇;翅荚木种源遗传多样性及其抗低温胁迫能力研究[D];中南林业科技大学;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 杨丹;湖北省油菜菌核病病菌多样性研究[D];华中农业大学;2010年
2 潘慧;杏鲍菇优良杂交子的初步选育[D];华中农业大学;2010年
3 罗杨;柑橘变异材料的遗传鉴定与品质分析[D];华中农业大学;2010年
4 刘冉冉;枫香遗传转化体系的优化及转化PaFT基因的研究[D];华中农业大学;2010年
5 郑瑜;银杏核心种质构建初探[D];华中农业大学;2010年
6 胡佳;鲟形目部分种类基于线粒体COⅠ基因的分子进化研究[D];华中农业大学;2010年
7 刁百灵;湖北省粗梗水蕨种群、群落结构研究与保护建议[D];华中农业大学;2010年
8 卢小三;两个杨树无性系再生体系的建立及抗虫基因Cry1C+9C转化的初步研究[D];华中农业大学;2010年
9 朱晓娟;重组免疫毒素抗c-Met/PE38KDEL的构建、表达、纯化及初步鉴定[D];南京医科大学;2009年
10 王正茂;单纯疱疹病毒糖蛋白哺乳动物细胞表达系的建立、纯化鉴定及免疫原性分析[D];南京医科大学;2010年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 廖承义;刺参幼虫的变态和习性[J];山东海洋学院学报;1987年01期
2 董宝贤,林泰禧;马粪海胆的染色体制备和染色体数目[J];青岛海洋大学学报;1991年03期
3 包振民,万俊芬,王继业,汪小龙,王如才;海洋经济贝类育种研究进展[J];青岛海洋大学学报(自然科学版);2002年04期
4 郭天慧,孔晓瑜,陈四清,喻子牛;三疣梭子蟹线粒体DNA 16S rRNA和COI基因片段序列的比较研究[J];中国海洋大学学报(自然科学版);2004年01期
5 董云伟;董双林;纪婷婷;;水生动物热休克蛋白研究进展[J];中国海洋大学学报(自然科学版);2008年01期
6 朱春华,李广丽,黄荣莲;凡纳对虾个体发育早期的同工酶研究[J];热带海洋学报;2004年01期
7 张凤英,夏连军,马凌波,施兆鸿,马春艳;黄鲷线粒体COⅠ基因部分序列遗传变异研究[J];热带海洋学报;2005年05期
8 张海发;刘晓春;王云新;刘付永忠;黄国光;罗国武;王宏东;林浩然;;温度、盐度及pH对斜带石斑鱼受精卵孵化和仔鱼活力的影响[J];热带海洋学报;2006年02期
9 马凌波;马春艳;张凤英;蒋科技;;基于线粒体DNA三种基因序列探讨青蟹属的系统发育关系[J];热带海洋学报;2010年05期
10 王祥和,陈业光,华敏,何凡,韩剑,苗平生;几份荔枝种质材料的RAPD鉴定[J];热带农业科学;2003年02期
中国博士学位论文全文数据库 前7条
1 李明芳;荔枝SSR标记的研究及其对部分荔枝种质的遗传多样性分析[D];华南热带农业大学;2003年
2 袁秀堂;刺参Apostichopus japonicus(Selenka)生理生态学及其生物修复作用的研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2005年
3 战爱斌;栉孔扇贝(Chlamys farreri)微卫星标记的筛选及应用[D];中国海洋大学;2007年
4 孙业盈;半滑舌鳎性腺差异表达基因的克隆鉴定与表达分析[D];中国海洋大学;2008年
5 李宏俊;海湾扇贝微卫星标记的开发及遗传连锁图谱的构建[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2009年
6 庞震国;刺参遗传连锁图谱构建及卵母细胞成熟过程研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2009年
7 纪婷婷;刺参(Apostichopus Japonicus)对温度变化的生态生理学响应机制[D];中国海洋大学;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 林立亮;四种山雀线粒体基因组测序与雀形目线粒体谱系基因组学分析[D];陕西师范大学;2011年
2 白凡凡;浙江大学网络授课系统的设计和实现[D];浙江大学;2002年
3 孙博;海湾扇贝分子标记的研究及应用[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2003年
4 张雯;海湾扇贝不同养殖群体遗传多样性和遗传分化的研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2004年
5 吕红丽;四角蛤蜊遗传多样性分析[D];辽宁师范大学;2004年
6 姚庆荣;用SSR标记对中国荔枝(Litchi Chinensis Sonn)野生种质资源的遗传多样性分析[D];甘肃农业大学;2004年
7 李颖;仿刺参野生和养殖群体遗传多样性研究[D];中国海洋大学;2005年
8 路心平;青蟹属的系统进化及中国沿海拟穴青蟹的群体遗传结构研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2008年
9 赵勇;全基因组扩增方法的建立及其在法医学中的应用[D];兰州大学;2008年
10 董高华;藏酋猴线粒体基因组序列测定与进化分析[D];四川农业大学;2008年
【二级引证文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 王青林;董云伟;董双林;王芳;宋文华;于姗姗;;高温刺激对刺参浮游期幼体存活率及Hsp70表达量的影响[J];中国海洋大学学报(自然科学版);2011年03期
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1 孙清明;欧良喜;陈洁珍;向旭;蔡长河;;荔枝育种研究进展——分子育种[A];科技与创新——广东园艺科技论文集(广东省园艺学会第九次会员大会暨学术研讨会论文集)[C];2010年
中国博士学位论文全文数据库 前6条
1 王青林;温度驯化对刺参(Apostichopus japonicus)生长及耐热性的影响及生理生态学机制[D];中国海洋大学;2012年
2 关健;大菱鲆耐高温品系选育及生长相关数量性状的基础研究[D];中国海洋大学;2012年
3 陈业渊;海南荔枝种质资源考察收集、鉴定评价及分析[D];海南大学;2012年
4 刘忠;岷江下游荔枝资源与引种研究及其遗传多样性分析[D];四川农业大学;2012年
5 邱天龙;刺参生态苗种繁育关键技术原理研究与应用[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2013年
6 鄢婧婧;仿刺参(Apostichopus japonicus)分子标记开发及应用[D];中国海洋大学;2013年
中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 白临建;栉江珧形态性状对重量性状的影响及五个野生群体遗传多样性的微卫星分析[D];上海海洋大学;2012年
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