收藏本站
《吉林大学》 2012年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

联合分析HBV感染相关表达谱和DNA甲基化谱

金晶兰  
【摘要】:目前公认HBV感染肝脏疾病的发病机制是与宿主对于HBV发动的免疫应答相关。这种免疫应答由于宿主、病毒等因素影响下存在异质性,而这种异质性是导致HBV感染后不同病情转归和预后的最关键因素。至今为止,针对HBV感染后免疫应答异质性的研究数量巨大,但是针对于一些关键问题,如,急性HBV感染宿主免疫应答有无天然免疫应答成分起作用、成年期和婴幼儿期感染HBV不同病情转归、HBV如何逃逸宿主免疫应答等,还是给不出确切的答案。近10年来,表观遗传学于基因表达的调控作用备受关注,尤其是认为基因启动子区CpG岛甲基化状态与相关基因的表达密切相关。而且HBV可诱导宿主甲基化转移酶的表达而导致宿主和病毒本身DNA的甲基化状态改变。本研究针对HBV感染后处于不同病程的患者,利用全基因组表达芯片和全基因组启动子区CpG岛甲基化芯片方法,联合分析HBV感染相关免疫应答过程,还有其表观遗传学调控因素,试图找出受表观遗传学调控的免疫应答相关的基因、通路。因此本研究主要联合应用全基因组芯片技术和生物信息学分析方法: (1)应用人全基因组表达谱芯片研究HBV感染(急性、慢性和健康对照)相关表达谱。 (2)应用人全基因组CpG岛和启动子区甲基化芯片研究HBV感染(急性、慢性和健康对照)相关甲基化谱。 (3)联合分析上述表达谱和甲基化谱研究。 实验结果如下: (1)急性感染期显著富集Toll样受体通路,尤其在急性期和免疫耐受期比较显著富集,伴随着IFI27,IFI30,IFITM3等一组ISGs高表达。其中TLR6的表达在多个组间差异比较明显,如急性期分别和免疫耐受期、清除期和健康对照相比,其表达显著升高。 (2)急性期与慢性感染相比,显著富集白细胞跨内皮细胞通路,富集的基因包括ITGB1,ITGA4,ACTB,VCL,MYL9,NCF1,NCF4,PIK3R5和CDC42,这些基因在急性期的表达均高于慢性感染。 (3)FCGRs活化性受体(FCGR1A,FCGR1B,FCGR2A,FCGR3A)的表达在急性期显著高于免疫耐受期,同样免疫清除期也显著高于免疫耐受期。 (4)急性期与健康对照相比存在广泛甲基化状态差异,遍布整个基因组。与表达谱结果反向交联之后发现在低甲基化、高表达基因富集于免疫应答过程,其中NFKB2,CTLA4,CD3E,MAPK3和LCK属于T细胞受体通路。 (5)慢性期与健康对照间差异甲基化基因,富集了多个癌症相关的通路。在与表达谱结果反向交联之后发现在低表达、高甲基化基因包括尤其是在肝癌有报道的GSTP1、RASSF1A、CDKN2A等基因的异常甲基化。 (6)急性期和慢性期见差异甲基化基因主要包括免疫细胞表面抑制性受体、如CTLA4,LILRA1,LILRB1,NCF1等基因的低甲基化、高表达,提示了DNA甲基化有可能参与到免疫应答强度调节过程。 本论文是第一个应用全基因组表达谱芯片和全基因组启动子区CpG岛甲基化芯片联合研究HBV感染相关的表达谱和甲基化谱的特点的研究。我们的研究重点体现了HBV感染急性期确实存在天然免疫应答过程起作用,而其主要成分为Toll样受体通路介导的I型IFN通路和相关IFN刺激基因。广泛甲基化状态差异存在于HBV感染急、慢性各阶段,其中在一些反向交联基因的基因发现与癌症,T细胞受体应答过程相关。
【学位授予单位】:吉林大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:R512.62

手机知网App
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 李大文;王英俊;孟繁华;;精索静脉曲张对精子DNA完整率的影响[J];中国男科学杂志;2010年09期
2 张德彰;翟滇;;现场DNA生物检材的提取及注意事项[J];云南警官学院学报;2011年03期
3 唐隽;郝飞;;HPV逃避宫颈癌宿主免疫应答的机制[J];免疫学杂志;2011年07期
4 梁小虎;唐焕文;刘林华;;环境毒物对聚腺苷二磷酸核糖聚合酶表达影响[J];中国职业医学;2011年03期
5 刘杰;陶健;;抗肿瘤药物的现状及发展趋势[J];科技致富向导;2011年23期
6 王琦;曾学军;;树突状细胞在类风湿关节炎中的研究进展[J];基础医学与临床;2011年08期
7 王蕾;陈涛涌;;一个细胞内DNA的天然免疫识别受体——IFI16[J];中国肿瘤生物治疗杂志;2011年03期
8 范晶;;聚丙烯酰胺凝胶中DNA银染色检测方法的改进及其效果比较[J];中国医药导报;2011年19期
9 孔敏敏;李艳华;董宇辉;王文雅;袁其朋;;大肠杆菌DNA复制相关蛋白PriC的初步研究[J];中医学报;2011年06期
10 徐志文;蒋清蓉;郭万柱;朱玲;胡秋炅;陈扬;廖晓丹;;PPV VP2和PCV2 ORF2重组病毒样颗粒的获得及其免疫原性研究[J];高技术通讯;2010年12期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 方希修;乐国伟;王冬梅;施用辉;刘建文;;减毒沙门菌承载的质粒DNA在小鼠体内的组织代谢与免疫应答[A];2009山东饲料科学技术交流大会论文集[C];2009年
2 刘海英;陈刚;步宇翔;;碱基对的多铜修饰对DNA导电性的增强作用[A];中国化学会第28届学术年会第13分会场摘要集[C];2012年
3 赵宏远;李俊杰;桑润滋;;单细胞凝胶电泳技术检测不同处理山羊精子DNA损伤[A];中国畜牧兽医学会动物繁殖学分会第十五届学术研讨会论文集(下册)[C];2010年
4 刘玲;付强;朱化彬;彭秀丽;郝海生;杜卫华;赵学明;王栋;;牛毛囊基因组DNA制备方法的比较研究[A];中国畜牧兽医学会动物繁殖学分会第十五届学术研讨会论文集(上册)[C];2010年
5 梁春柳;;一个新的筛选化合物与DNA交互作用的简便方法[A];2010年全国药物毒理学学术会议论文集[C];2010年
6 张文众;李永宁;方瑾;梁春来;张倩男;;体外新评价方法——完整细胞核DNA检测板[A];全国生化/工业与卫生毒理学学术会议论文集[C];2010年
7 邹丹丹;汪海林;;基于DNA甲基化结合蛋白MBD的甲基化分析[A];中国化学会第28届学术年会第2分会场摘要集[C];2012年
8 张晔;杜智;杨斌;高英堂;;检测外周血中游离DNA的应用前景(综述)[A];天津市生物医学工程学会第29届学术年会暨首届生物医学工程前沿科学研讨会论文集[C];2009年
9 赵淑珍;刘光珍;;DNA免疫吸附治疗狼疮性肾炎的临床观察[A];第十一届全国中西医结合肾脏病学术会议论文汇编[C];2010年
10 陈士林;;中药DNA条形码鉴定体系[A];第十届全国药用植物及植物药学术研讨会论文摘要集[C];2011年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 记者 李含;“DNA之父”詹姆斯·沃森做客清华论坛[N];新清华;2008年
2 ;英国:含冤入狱27年,DNA助他洗脱罪名[N];新华每日电讯;2009年
3 李志晖 秦亚洲 曹国厂;我国大规模利用DNA技术“打拐”[N];中国改革报;2009年
4 本报驻特拉维夫记者 陈克勤;DNA伪造带来的震动[N];光明日报;2009年
5 本报记者 张巍巍;DNA样本也能作假[N];科技日报;2009年
6 记者 郑晓春;可区分真伪DNA的检测技术问世[N];科技日报;2009年
7 沈建民;企业公民DNA从何而来[N];21世纪经济报道;2009年
8 记者 魏萍;做DNA鉴定不用去外地[N];宁夏日报;2010年
9 日报记者 曾繁华 闫友明 通讯员 刘晓颖;DNA:我的应用很广泛[N];柳州日报;2010年
10 韦崇结 刘晓颖;DNA,让作恶之徒现原形[N];广西政协报;2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 沈美龙;基于DNA免疫的乙型肝炎病毒表面抗原大中小蛋白的免疫原性研究[D];南京医科大学;2010年
2 郭晓兰;端粒功能异常诱导的DNA损伤反应及其在肿瘤发生中的作用与分子机制[D];重庆医科大学;2010年
3 陈志健;1.8 GHz微波对X射线和阿霉素致淋巴细胞DNA损伤修复及对蛋白表达的影响[D];浙江大学;2010年
4 朱慧芳;Y家族DNA聚合酶对化学致癌物MNNG应答的转录调控研究[D];浙江大学;2009年
5 万超;抗猪瘟嵌合DNA疫苗及TRIF的DNA疫苗佐剂效应研究[D];武汉大学;2009年
6 赵丽霞;克隆绵羊印记相关基因的DNA甲基化研究[D];内蒙古农业大学;2010年
7 徐铁刚;细菌DNA磷硫酰化修饰与限制[D];上海交通大学;2008年
8 高鹏;特异性介导DNA转导的多结构域嵌合蛋白的构建、表达及鉴定[D];吉林大学;2011年
9 康大伟;DNA分子器件场效应理论研究[D];山东大学;2010年
10 高天;基于寡核苷酸芯片的地中海贫血特异性DNA甲基化的研究[D];第三军医大学;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 曹学智;分支链DNA技术在马传染性贫血弱毒疫苗诱导的免疫应答中的应用[D];中国农业科学院;2010年
2 李芳;基于磁性微粒的法医样本DNA纯化[D];西北大学;2011年
3 芦丽淦;柚皮素及聚乙二醇增强乙肝DNA疫苗免疫效果的研究[D];河南大学;2010年
4 杨锦艳;六种香豆素有效成分与DNA相互作用的研究[D];山西医科大学;2010年
5 林启凰;用于乳腺蛋白标志基因检测的DNA电化学生物传感器的研究[D];福建医科大学;2010年
6 于文静;亚麻韧皮部特异启动子克隆与26份种质DNA指纹图谱构建[D];中国农业科学院;2010年
7 Rebecca Simisola Agboola;硼(B)和氯化钠胁迫处理诱导高粱(Sorghum bicolor)自交系发生形态和DNA甲基化的变异[D];东北师范大学;2010年
8 石微;溴氰菊酯致大鼠DNA损伤及损伤后修复功能的影响[D];青岛大学;2010年
9 张诺;DNA-纳米羟基磷灰石修饰电极的制备及在生物分析中的应用[D];济南大学;2010年
10 郭珈辰;基于图形表示的DNA相似性分析及进化树构建算法研究[D];湖南大学;2010年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026