收藏本站
《吉林大学》 2006年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

基于克隆选择算法蛋白质联系图预测的研究

王荣兴  
【摘要】:蛋白质结构预测是生物信息学中的一个主要方向,而蛋白质联系图的预测是其中一个重要内容。本文第一章和第二章介绍蛋白质结构预测的意义和其生物学背景,以及在预测过程中使用的蛋白质折叠的诸多生物学特征。第三章简述了免疫算法的原理并着重讲解了本文所使用的克隆选择算法的流程和特性。第四章结合蛋白质折叠的生物学特征设计了克隆选择算法的适应度函数和多种变异操作,实现了基于此算法的蛋白质联系图的预测方法,通过对4组不同长度的非同源蛋白质的预测,测试了算法的有效性和高效性,并对不同阈值下的测试结果做了比较。最后对所做工作进行总结并展望了未来的工作重点。
【学位授予单位】:吉林大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2006
【分类号】:TP399

手机知网App
【引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 许良;后驱轻型客车ESP免疫PI控制及车速估算方法研究[D];吉林大学;2007年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 郑德玲,梁瑞鑫,付冬梅,李晓刚,方彤;人工免疫系统及人工免疫遗传算法在优化中的应用[J];北京科技大学学报;2003年03期
2 唐焕文,靳利霞,计明军;蛋白质结构预测的优化模型与方法[J];工程数学学报;2002年02期
3 卢本卓,王存新,王宝翰;用于真实蛋白质结构预测的一种新的优化方法[J];化学物理学报;2003年02期
4 公茂果;杜海峰;焦李成;;基于人工免疫响应的线性系统逼近[J];中国科学E辑:信息科学;2005年12期
5 肖人彬,王磊;人工免疫系统:原理、模型、分析及展望[J];计算机学报;2002年12期
6 张立震,唐焕文;一种基于子序列分布的蛋白质结构类预测方法[J];计算机与应用化学;2003年03期
7 孙之荣;蛋白质中频繁发生的超二级结构模式[J];科学通报;1994年24期
8 齐建勋,肖奕;基于小波方法的蛋白质非规则二级结构预测[J];科学通报;2002年06期
9 解伟,王翼飞;蛋白质折叠的计算机模拟[J];上海大学学报(自然科学版);2000年02期
10 倪红春,王翼飞,史定华;遗传算法在蛋白质结构预测中的应用[J];上海大学学报(自然科学版);2001年03期
中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 徐雪松;基于人工免疫系统的函数优化及其在复杂系统中的应用研究[D];浙江大学;2004年
2 孙勇智;人工免疫系统模型、算法及其应用研究[D];浙江大学;2005年
中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 张海霞;蛋白质二级结构预测方法研究[D];大连理工大学;2004年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 尹峰,邓小鹏,许四毛;生物免疫机理在计算机安全领域的应用与发展[J];安徽电子信息职业技术学院学报;2004年Z1期
2 刘赟,王存新,王宝翰,陈慰祖;非格子模型的蛋白质设计方法[J];北京工业大学学报;2004年01期
3 谢珺;郝伟;谢克明;;免疫群体网络算法及其在电站风机故障诊断中的应用[J];北京工业大学学报;2008年11期
4 孙学刚;贠超;崔一辉;;改进免疫算法在函数优化中的应用[J];北京航空航天大学学报;2010年10期
5 位耀光,郑德玲,周颖,王英,付冬梅;一种人工免疫应答模型的研究及应用[J];北京科技大学学报;2004年03期
6 周颖,郑德玲,位耀光,付冬梅;一种基于生物免疫原理的识别算法[J];北京科技大学学报;2004年04期
7 付冬梅,郑德玲,位耀光,周颖,鞠磊;人工免疫控制器的设计及其控制效果的仿真[J];北京科技大学学报;2004年04期
8 罗永军,王长松,曹建国,金丽娜,姚耕耘;兼顾板形的热连轧机负荷分配的优化[J];北京科技大学学报;2005年01期
9 位耀光,郑德玲,付冬梅,周颖;基于生物免疫系统克隆选择机理和免疫网络理论的免疫算法[J];北京科技大学学报;2005年02期
10 裴波,张衡,张宁,张毓森,徐小岩;基于生物免疫特性的主机免疫模型[J];吉林大学学报(信息科学版);2004年03期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 龚涛;杜常兴;;免疫计算研究的进展[A];中国自动化学会控制理论专业委员会A卷[C];2011年
2 覃毅延;;供应链管理研究的某些进展[A];第六届中国青年运筹与管理学者大会论文集[C];2004年
3 宋亮;张剑;王先明;温继敏;陈海波;姚端正;蒋昌忠;;人工神经网络预测蛋白质结构的探讨[A];湖北省物理学会、武汉物理学会成立70周年庆典暨2002年学术年会论文集[C];2002年
4 杨立才;贾磊;孔庆杰;;基于人工免疫系统的动态路径诱导算法研究[A];可持续发展的中国交通——2005全国博士生学术论坛(交通运输工程学科)论文集(下册)[C];2005年
5 裘之亮;周颖;毛一之;董国亚;;混沌与人工免疫结合算法的应用[A];2005中国控制与决策学术年会论文集(上)[C];2005年
6 周颖;裘之亮;赵红玉;张萍;;克隆选择算法在多峰值函数优化中的应用[A];2006中国控制与决策学术年会论文集[C];2006年
7 ;Threshold Image Segmentation Based on Granular Immune Algorithm[A];2009中国控制与决策会议论文集(3)[C];2009年
8 ;Fault Diagnosis Algorithm Based on Artificial Immune Mechanism[A];2009中国控制与决策会议论文集(3)[C];2009年
9 位耀光;郑德玲;周颖;王英;付冬梅;;克隆选择算法的研究及其在模式识别中的应用[A];第二十三届中国控制会议论文集(下册)[C];2004年
10 周颖;郑德玲;裘之亮;位耀光;;一种新的免疫识别算法及其收敛性研究[A];第二十三届中国控制会议论文集(下册)[C];2004年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 孙鹏飞;基于计算智能技术的蛋白质结构预测方法研究[D];哈尔滨工程大学;2010年
2 王大伟;基于免疫的入侵检测系统中检测器性能研究[D];哈尔滨理工大学;2010年
3 岑健;基于人工免疫系统的机组复合故障诊断技术研究[D];华南理工大学;2010年
4 魏建香;学科交叉知识发现及其可视化研究[D];南京大学;2010年
5 韩瑞丽;鸡visfatin和PRDM16基因遗传变异及其效应与表达研究[D];西北农林科技大学;2010年
6 张淑平;基于视觉的并联机器人位姿检测方法研究[D];东华大学;2010年
7 沈懿珍;基于协同智能的蛋白质相互作用及其网络研究[D];东华大学;2011年
8 何西利;模型蛋白与中药活性成分发光行为研究与应用[D];西北大学;2011年
9 陈聆;地球化学矿致异常非线性分析方法研究[D];成都理工大学;2011年
10 崔志华;微粒群算法的性能分析与优化[D];西安交通大学;2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 蒋慧;改进的遗传算法在电力系统无功优化中的应用[D];安徽工程大学;2010年
2 尹丽玲;基于人工免疫算法的Web文本挖掘研究[D];哈尔滨工程大学;2010年
3 牛园园;分布式数据库有关连接查询优化算法的研究[D];长沙理工大学;2010年
4 包晖;基于免疫算法的木马检测技术研究[D];河南工业大学;2010年
5 姚兴;免疫原理在大规模分布式入侵检测系统中的应用研究[D];江西师范大学;2010年
6 杭海梅;免疫算法及其在自适应滤波器中的应用[D];苏州大学;2010年
7 毛晨峰;基于人工免疫算法的电力系统最优潮流问题的研究[D];哈尔滨理工大学;2010年
8 刘鹏;多层免疫的入侵检测模型研究[D];哈尔滨理工大学;2010年
9 周轩;免疫混合算法及其在数据挖掘和优化中的应用研究[D];华东理工大学;2011年
10 李世娟;基于人工免疫算法的在线产品检测应用与研究[D];沈阳大学;2010年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 朱福根;;基于免疫机理的汽车故障检测技术研究[J];传感技术学报;2006年03期
2 焦李成,杜海峰;人工免疫系统进展与展望[J];电子学报;2003年10期
3 李刚,于学兵;Bosch VDC系统的控制原理及展望[J];公路交通科技;2004年07期
4 李洪斌;张承瑞;;重型汽车电控气动离合器的模糊免疫PSD控制[J];公路交通科技;2006年03期
5 宋晓琳;于德介;殷智宏;金耀;;基于矢量矩的汽车主动悬架免疫控制策略研究[J];湖南大学学报(自然科学版);2006年04期
6 贺岩松;车辆操纵稳定性电子控制模型与系统[J];机械与电子;2004年03期
7 王德平,郭孔辉,宗长富;车辆动力学稳定性控制的理论研究[J];汽车工程;2000年01期
8 李健,王国忠,付学增,管西强;滑模控制在车辆电控稳定系统中的应用[J];汽车工程;2004年03期
9 王德平,郭孔辉,宗长富;车辆动力学稳定性控制的仿真研究[J];汽车技术;1999年02期
10 马云杰;;第二代汽车电子稳定程序ESPII[J];上海汽车;2005年12期
中国硕士学位论文全文数据库 前4条
1 刘巍;驱动工况汽车稳定性控制算法研究[D];吉林大学;2004年
2 石桂花;依维柯汽车TCS神经PI自适应控制及车速估算算法研究[D];吉林大学;2005年
3 陆娟;吉林省共用物流信息平台系统设计与关键技术研究[D];吉林大学;2006年
4 王宪彬;用于ESP系统的车辆状态参数软测量方法研究[D];吉林大学;2006年
【二级引证文献】
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 刘巍;轻型汽车转向稳定性控制算法及硬件在环试验台研究[D];吉林大学;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前3条
1 时艳茹;基于UKF滤波的汽车纵向和侧向速度估计算法研究[D];吉林大学;2011年
2 沙宏亮;基于轮缸压力估算的轻型车ESP控制算法研究[D];吉林大学;2008年
3 傅丽贤;基于神经网络的轮式装载机防滑差速器的控制研究[D];浙江理工大学;2012年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 周伟良,何鲲,曹先彬,程慧霞;基于一种免疫遗传算法的BP网络设计[J];安徽大学学报(自然科学版);1999年01期
2 梁瑞鑫,郑德玲;基于区间套混沌搜索的混合优化方法[J];北京科技大学学报;2002年03期
3 王凤琴,高颖,赵军;基于遗传算法的神经网络优化[J];燕山大学学报;2001年03期
4 郭伟斌,唐焕文,马占新;神经网络预测系统中的输入输出指标研究[J];大连理工大学学报;1999年04期
5 李志民,李卫星,王永建;基于熵理论的最优潮流代理约束算法[J];电力系统自动化;2001年11期
6 李海峰,王海风,陈珩;免疫系统建模及其在电力系统电压调节中的应用[J];电力系统自动化;2001年23期
7 孙勇智,韦巍;基于人工免疫算法的电力系统最优潮流计算[J];电力系统自动化;2002年12期
8 张韵农,何振亚,蔚承建,裴文江;图像增强的自适应免疫算法[J];东南大学学报(自然科学版);2002年03期
9 石立宝,徐国禹;基于进化规划的最优潮流计算[J];电网技术;1998年02期
10 王磊,潘进,焦李成;免疫算法[J];电子学报;2000年07期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 靳利霞;唐焕文;;基于能量极小化的蛋白质结构预测[A];中国运筹学会第六届学术交流会论文集(上卷)[C];2000年
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 钟伟才;多智能体进化模型和算法研究[D];西安电子科技大学;2004年
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 刘丽珏;蔡自兴;;一种改进的克隆选择优化算法[J];计算机工程与应用;2006年13期
2 何珍梅;徐雪松;;人工免疫系统研究综述[J];华东交通大学学报;2007年04期
3 彭伟雄;蔡自兴;王勇;刘星宝;;基于差异进化的克隆选择算法[J];计算机工程与应用;2011年14期
4 林秋镇;胡庆彬;陈剑勇;;一种求解车间作业调度问题的免疫算法[J];计算机工程与应用;2009年31期
5 翟仲曦;钱锋;杜文莉;;基于定向突变的自适应并行免疫算法[J];华东理工大学学报(自然科学版);2010年01期
6 张启蕊;谭景华;;一种改进的免疫算法及其在文本分类中的应用[J];西华大学学报(自然科学版);2008年02期
7 王琼;全书海;徐化伟;黄亮;;基于克隆选择算法的FIR滤波器的设计[J];武汉理工大学学报;2007年08期
8 方贤进;李龙澍;钱海;;基于人工免疫的网络入侵检测中疫苗算子的作用研究[J];计算机科学;2010年01期
9 谭光兴;朱燕飞;毛宗源;;基于Hénon映射的自适应克隆选择优化算法[J];计算机工程与应用;2006年09期
10 高洪元;刁鸣;赵忠凯;;基于免疫克隆量子算法的多用户检测器[J];电子与信息学报;2008年07期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 洪露;;一种改进克隆选择算法的收敛速度方法研究[A];中国自动化学会控制理论专业委员会B卷[C];2011年
2 龚涛;杜常兴;;免疫计算研究的进展[A];中国自动化学会控制理论专业委员会A卷[C];2011年
3 沈冠町;徐本柱;刘晓平;;改进的免疫算法在作业车间调度中的应用[A];全国第21届计算机技术与应用学术会议(CACIS·2010)暨全国第2届安全关键技术与应用学术会议论文集[C];2010年
4 许殿;史小卫;;基于免疫算法的微波电路优化技术[A];2003'全国微波毫米波会议论文集[C];2003年
5 周德义;左春柽;李静;苗菲;张舟;;基于免疫算法的齿轮减速器区间优化研究[A];走中国特色农业机械化道路——中国农业机械学会2008年学术年会论文集(下册)[C];2008年
6 王玮;占荣辉;张军;;基于免疫算法的距离像长度估计[A];第十四届全国信号处理学术年会(CCSP-2009)论文集[C];2009年
7 苏兆品;蒋建国;尹翔;夏娜;李勇;;一种基于免疫的敏捷供应链形成算法[A];全国先进制造技术高层论坛暨制造业自动化、信息化技术研讨会论文集[C];2005年
8 孟科;李绍军;钱锋;;实数编码免疫算法在溶剂脱水塔软测量中的应用[A];'2006系统仿真技术及其应用学术交流会论文集[C];2006年
9 周颖;裘之亮;赵红玉;张萍;;克隆选择算法在多峰值函数优化中的应用[A];2006中国控制与决策学术年会论文集[C];2006年
10 张旭;郭晨;孙建波;;自适应多模态克隆选择算法[A];2007年中国智能自动化会议论文集[C];2007年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 勾轶;基于免疫算法和多传感器信息融合的电机故障综合诊断方法研究[D];沈阳工业大学;2010年
2 叶莲;基于免疫算法的分类方法及其应用研究[D];重庆大学;2012年
3 刘星宝;人工免疫系统的若干关键问题研究[D];中南大学;2010年
4 朱虎明;基于集群计算的免疫优化算法及其应用研究[D];西安电子科技大学;2010年
5 韩旭明;若干改进的人工免疫算法及其在大气环境领域中的应用[D];吉林大学;2010年
6 王炼红;人工免疫优化与分类算法及其应用研究[D];湖南大学;2009年
7 吕岗;免疫算法及其应用研究[D];中国矿业大学(北京);2003年
8 叶剑锋;基于免疫优化算法的阵列天线综合的研究[D];哈尔滨工程大学;2009年
9 葛红;免疫算法及核聚类人工免疫网络应用研究[D];华南理工大学;2003年
10 何广杰;克隆选择算法及其在地基工程若干问题中的应用[D];西南交通大学;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 王荣兴;基于克隆选择算法蛋白质联系图预测的研究[D];吉林大学;2006年
2 竹小明;克隆选择原理在入侵检测中的应用[D];电子科技大学;2007年
3 李子韵;基于免疫算法的配电网电容器优化配置[D];河海大学;2003年
4 东方;基于免疫算法的物流配送VRP研究[D];大连海事大学;2006年
5 杨翼嘉;差分变异克隆选择算法及其应用[D];中南大学;2012年
6 林力;基于免疫算法的化工过程优化[D];北京化工大学;2012年
7 张志伟;仿生算法在第三代移动通信多用户检测中的应用[D];哈尔滨工程大学;2005年
8 原进凯;制造车间生产调度及其算法研究[D];武汉理工大学;2008年
9 张征杰;基于量子免疫算法的文本分类算法的研究[D];河南工业大学;2012年
10 贾凡;混合语音信号盲分离的算法研究[D];西安电子科技大学;2004年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026