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《吉林大学》 2010年
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变形链球菌耐氟菌株和亲代菌株蛋白质组表达谱及其数据库的初步构建

张志民  
【摘要】: 龋病是牙体硬组织的细菌感染性疾病,又不等同于一般的细菌感染性疾病,其发病过程具有极其独特的规律。变形链球菌是主要的致病菌,长期广泛使用氟制剂可导致变形链球菌耐氟菌株的产生。本课题组前期研究变形链球菌耐氟菌株的ffh、fhs、dgk和dltc耐酸相关基因发现,变形链球菌耐氟菌株的耐酸相关基因较亲代菌株均有不同程度的突变,但还缺乏对基因编码蛋白的研究。目前,大部分通过基因测序新发现的基因编码的蛋白质的功能都是未知的,而对那些已知功能的蛋白而言,它们的功能也大多是通过同源基因功能类推等方法推测出来的。从基因组和蛋白质组的特性上来看,基因组呈均一性,蛋白质组则具有多样性,基因组较稳定,不易发生改变,而蛋白质组则是动态的,随时发生着变化。因此,从基因中得到的蛋白质的信息是不完整的。遗传信息的携带者是基因,基因的表达产物蛋白质却是生命活动的执行者。获得的全部基因序列,仅解决了遗传信息库的问题。若要揭示生命活动的规律,就必须研究基因的产物蛋白质。 对变形链球菌的全基因组测序发现,其和化脓链球菌基因有高度同源性,约有一半的变形链球菌的蛋白质与化脓链球菌的某些蛋白质功能类似。现已证明,一个基因并不只存在一个相应的蛋白质,基因也不能直接决定一个功能蛋白。针对这个问题,在吉林省自然基金项目资金支持下,本课题组着重从直接获得蛋白质的信息入手,利用Shotgun技术分离鉴定出变形链球菌耐氟菌株和亲代菌株的全部蛋白质组。通过质谱分析和生物信息学搜索,分析高可信度的蛋白质及其差异。最后归纳梳理全部蛋白质,构建变形链球菌耐氟菌株和亲代菌株蛋白质组数据库。从而为分析变形链球菌和变形链球菌耐氟菌株致龋毒力因子相关基因编码的蛋白质的功能打下理论基础、技术基础和实验基础。
【学位授予单位】:吉林大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2010
【分类号】:R781.1

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【参考文献】
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