G-四链体的三维结构及其与小分子相互作用的理论研究

【摘要】： 本文结合分子模建,分子动力学模拟方法,对G-四链体结构及其与药物小分子之间的相互作用进行了深入的研究,主要内容归纳如下: 1.应用分子模建和分子动力学模拟方法研究了d(GGGTGGGTGGGTGGGT)和d(GTGGTGGGTGGGTGGGT)序列形成的G-四链体的三维结构。 2.应用分子模建和分子动力学模拟方法研究了由d(GGGTGGGTGGGTGGGT)序列形成的G-四链体二聚体结构以及它和二萘嵌苯派生物Tel03之间的相互作用。 3.应用分子动力学模拟方法研究了由d[(GGGTTA)3GGG]序列形成的两个反平行的篮式G-四链体结构的稳定性以及它们与卟啉类化合物TMPyP4的作用模式。 4.分别在parm99和parmbsc0力场下应用分子动力学模拟研究了G-四链体的基本结构参数的变化,找到了G-四链体结构,尤其对于环区,在现有力场下不能被精确模拟的原因。

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