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《吉林大学》 2010年
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基于H1N1的RNA二级结构的相似性比较研究

崔广迪  
【摘要】: 随着生物领域技术的发展,RNA分子已经不是只有从前人们眼中的从DNA到蛋白质过程的过渡作用。由于RNA分子具有使某些基因打开或关闭、催化等许多重要的功能,人们已经视RNA分子与DNA分子、蛋白质具有同等重要的地位。由于功能与结构又是密切相关,所以要想认清RNA分子的功能必须先要研究其结构。用生物学方法来鉴定RNA分子结构的手段有磁共振和用X射线等方法,但是RNA分子有快速降解的特点,这就给得到实验结果增加了难度,而且耗费大量时间和金钱,代价高昂,虽然测试结果精确,但是面对巨量的数据没有可行性,所以预测RNA二级结构就成为RNA分子结构研究的主要手段。RNA二级结构预测指的是利用计算机、数学、热力学等理论来预测RNA空间结构。利用这种方法可以节省大量的人力物力,并且高效、准确,因此完善已有的RNA二级结构预测算法和开发新的算法已经成为生物信息学研究领域中的一个重要组成部分。在生物信息学研究领域中另一重要的热点问题就是RNA二级结构相似性比较,通过比对RNA二级结构,可以发现其结构和功能间的关系等一些信息,并且可以对二级结构预测起到一定的指导作用。 本文在甲型H1N1流感病毒爆发之际收集了大量的流感病毒样本,以八个基因片段中的HA、NA片段为基本进行二级结构预测和比较。得到了较好的结果。
【学位授予单位】:吉林大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2010
【分类号】:R341

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【引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 何懿菡;胡颓子科nrDNAITS序列的生物信息学分析[D];西北师范大学;2012年
2 李超;甲型流感病毒二级结构分析及基于RNA三矢量曲线表示的多尺度比较的WEB实现[D];吉林大学;2013年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前6条
1 宁正元;林世强;;RNA二级结构预测方法[J];福建农林大学学报(自然科学版);2007年01期
2 白凤兰;姚玉华;孙立波;;RNA二级结构的6-D表示及相似性分析[J];黑龙江大学自然科学学报;2006年01期
3 刘琦;张引;叶修梓;俞荣栋;;基于离散Hopfield网络求解极大独立集的茎区选择算法以及在RNA二级结构预测中的应用[J];计算机学报;2008年01期
4 唐焕文,靳利霞;生物信息学的产生、发展及应用前景[J];洛阳师范学院学报;2001年02期
5 黄科,曹家树,吴秋云,温庆放;生物信息学[J];情报学报;2002年04期
6 黄一伟;张红;刘运芝;黄凰;夏昕;;2009年甲型H1N1流感研究进展[J];实用预防医学;2009年06期
中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 刘海军;RNA二级结构预测的建模及其应用研究[D];上海大学;2005年
2 刘忠钰;登革病毒C基因RNA二级结构及编码蛋白在病毒复制中的作用[D];中国人民解放军军事医学科学院;2009年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 孙琳琳;蒋继志;李丽;;生物信息学及在农作物抗性基因研究中的应用[J];安徽农学通报;2006年10期
2 於剑;艾必燕;樵星芳;陈建康;杨扬;黄家政;;16S rRNA的高级结构分析在细菌分类鉴定上的应用[J];重庆中草药研究;2010年01期
3 白凤兰;徐丽;;RNA二级结构的数学表示及其应用[J];大连交通大学学报;2010年06期
4 山丹,贲继红,郭燕燕;雌激素受体基因PvuⅡ和XbaⅠ酶切多态性及其上游TA重复序列多态性与子宫内膜癌关系的研究[J];中国妇产科临床;2003年03期
5 高明;吕永添;;结直肠癌组织中β-Catenin的异常表达及其意义[J];广东医学;2007年09期
6 余业东,孙彦伟,卢受昇;禽流感分子生物学快速诊断方法的研究进展[J];广东畜牧兽医科技;2004年04期
7 熊莲洁,朱家壁;脂质体及其类似物在基因治疗中的应用[J];国外医药(合成药 生化药 制剂分册);2000年04期
8 许丹;王爱荣;李金铭;;基于茎区的神经网络方法预测RNA二级结构[J];广西师范大学学报(自然科学版);2011年03期
9 张红;黄一伟;刘运芝;李芳彩;陈长;李文超;邓志红;胡世雄;高立冬;;湖南省2009~2011年甲型H1N1流感哨点监测病原学结果及病毒基因特性分析[J];病毒学报;2013年02期
10 聂小佳;郑建东;姜慧;向妮娟;许真;怀扬;陈辉;黄继贵;肖林;余宏杰;;住院严重急性呼吸道感染监测项目病例定义修改的可行性探索[J];甘肃科技;2013年12期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 孙琳琳;蒋继志;;生物信息学及其在作物抗性基因研究中的应用[A];中国植物病理学会2006年学术年会论文集[C];2006年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 董浩;RNA二级结构预测方法研究[D];吉林大学;2011年
2 林峰;枯草杆菌生物素操纵子基因的克隆、序列改造及功能表达研究[D];西北农林科技大学;2003年
3 陈新;银杏苯丙氨酸解氨酶(PAL)的基因克隆和生物信息学分析[D];成都中医药大学;2003年
4 张建军;pCDNA3.1/BMP-4的构建与家兔骨干缺损的基因治疗[D];第三军医大学;2002年
5 何清义;软骨组织工程的种子细胞研究—人关节软骨细胞的永生化及其生物学特性[D];第三军医大学;2002年
6 卫华;变形链球菌耐酸性相关基因的研究[D];武汉大学;2004年
7 宋江宁;蛋白质二硫键结构特征与序列关系的生物信息学研究[D];江南大学;2005年
8 徐祥;靶向NF-κB p65亚基穿膜拮抗肽的分子设计及其抗炎功能鉴定[D];第三军医大学;2006年
9 符庆瑛;大肠杆菌双杂交筛选AMPKα2相互作用蛋白[D];第三军医大学;2007年
10 刘琦;RNA二级结构的若干计算生物学问题研究[D];浙江大学;2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 谢彦广;钝顶节旋藻品系ZJU0137不同螺旋手性藻丝的构建与纯培养及形貌与生理生化特性比较研究[D];浙江大学;2011年
2 徐丽;RNA二级结构和蛋白质序列的数学表示及其应用[D];大连交通大学;2010年
3 段学青;基于图像处理的RNA二级结构比较算法[D];吉林大学;2011年
4 李杰;RNA二级结构表示及相似性分析研究[D];吉林大学;2011年
5 许丹;神经网络在RNA二级结构预测上的研究[D];福建农林大学;2011年
6 闫艳艳;p53基因的代数结构及其应用研究[D];江南大学;2011年
7 魏若岩;基于PCA+LLE组合降维的基因组进化研究[D];石家庄铁道大学;2011年
8 李阳;基于条件随机场的RNA二级结构预测算法[D];北京理工大学;2011年
9 王佩东;基于BP神经网络的水稻干燥智能控制研究[D];哈尔滨工程大学;2011年
10 傅全胜;Bcl-2基因表达与人肾细胞癌株多药耐药关系的体外实验研究[D];暨南大学;2000年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 于玮玮;阎国荣;;大果沙枣和尖果沙枣的核型分析[J];北方园艺;2010年06期
2 陈学林,马瑞君,孙坤,廉永善;中国沙棘属种质资源及其生境类型的研究[J];西北植物学报;2003年03期
3 肖龙骞;朱华;;植物nrDNA ITS致同进化不完全现象及其进化意义[J];西北植物学报;2009年08期
4 谢强,卜文俊;RNA的二级结构在动物分子系统学研究中的应用[J];动物分类学报;2003年04期
5 宁正元;林世强;;RNA二级结构预测方法[J];福建农林大学学报(自然科学版);2007年01期
6 贺光;生物信息学在蛋白质研究中的应用[J];国外医学.遗传学分册;2002年03期
7 林世强;宁正元;;生物信息学及其在农业科学中的应用[J];亚热带农业研究;2007年02期
8 王彬;;中国沙棘染色体核型及进化研究[J];湖北农业科学;2011年08期
9 阚显照;乔才元;朱国萍;杨福生;;长苞铁杉nrDNA ITS区假基因化拷贝的克隆及序列分析研究[J];激光生物学报;2007年02期
10 史军伟;徐阳;徐玲玲;廖亮;;RNA二级结构分析方法及在植物系统学研究上的应用[J];九江学院学报;2008年03期
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 刘琦;RNA二级结构的若干计算生物学问题研究[D];浙江大学;2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前6条
1 周道姗;中国沙棘和云南沙棘的遗传多样性研究[D];中国林业科学研究院;2005年
2 赵同领;广西扇棘单睾吸虫5.8S rRNA序列和二级结构研究[D];广西医科大学;2007年
3 程凯;江孜沙棘与云南沙棘遗传多样性分析及其保护评价[D];四川农业大学;2008年
4 于丹;RNA二级结构预测算法分析与比较[D];吉林大学;2009年
5 刘腾靓;西藏沙棘的谱系地理学研究[D];兰州大学;2009年
6 廖莎;赖草属物种的ITS序列变异及其系统推断[D];四川农业大学;2010年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 李兢,刘长林,申石虎;关于图的极大独立集的理论及生成方法[J];电子学报;1995年08期
2 付微,黄竞伟,徐丽;RNA二级结构表示方法及其转换算法[J];计算机工程与应用;2004年14期
3 李有梅,徐宗本,孙建永;一类求解最大独立集问题的混合神经演化算法[J];计算机学报;2003年11期
4 吴旻;生物信息学的发展[J];中国科学院院刊;1998年03期
5 李有梅;徐宗本;苗夺谦;;用神经网络启发式算法求解最大独立集问题[J];模式识别与人工智能;2003年01期
6 代俊萍,蔡民华,张飞雄;植物miRNA研究进展[J];首都师范大学学报(自然科学版);2004年S1期
7 石夏荣,俞吉安;MicroRNA特征与功能[J];上海交通大学学报;2004年05期
8 黄伟华,潘俊松,蔡润;MicroRNA参与植物发育调控的研究进展[J];上海交通大学学报(农业科学版);2004年02期
9 叶茂,陈跃磊,明镇寰;miRNA(microRNA)家族的研究进展[J];生物化学与生物物理进展;2003年03期
10 李维忠,王任小,林大威,毛凤楼,韩玉真,来鲁华;国内外生物信息学数据库服务新进展[J];生物化学与生物物理进展;1999年01期
【相似文献】
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1 杨明夏,朱昌亮;RNA干涉及其在寄生虫学研究中的应用[J];中国寄生虫学与寄生虫病杂志;2002年06期
2 刘宁;;“RNA干扰”的功能调控机制[J];国外医学情报;2004年02期
3 袁成福;;RNA干扰及其实验方法[J];湖北民族学院学报(医学版);2005年04期
4 ;第四届全国RNA学术研讨会讯息[J];国际医药卫生导报;2005年02期
5 纪虹;孙开来;;小RNA的研究现状[J];国际遗传学杂志;2006年01期
6 陈柳青;曾学思;孙建方;;石蜡包埋皮肤组织标本中提取RNA进行逆转录PCR的研究[J];中国麻风皮肤病杂志;2006年01期
7 ;重组RNA的表达——tRNA支架的巧妙运用[J];生物医学工程研究;2007年03期
8 张义玲;魏旭斌;蔡荣;钱程;;抑制RNA沉默现象的机理及其在生物医学领域内的应用[J];生物化学与生物物理进展;2007年12期
9 赵轶卓;孙妙囡;孙德军;;牛胰脏RNA Ⅱ的制备[J];吉林大学学报(医学版);2007年06期
10 万春鹏;周寿然;左爱仁;;RNA干扰机制及其应用研究进展[J];现代生物医学进展;2008年02期
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1 王蕾;王秦虎;单卫星;;大豆疫霉菌小RNA通路核心组件的识别分析及突变体筛选[A];2010年中国菌物学会学术年会论文摘要集[C];2010年
2 蒋锋;王传跃;陈晓岗;;RNA干扰技术及其应用[A];中国神经科学学会精神神经专业委员会成立大会暨第一届学术会议论文集[C];2004年
3 李艳;严明;;RNA干扰[A];第一届全国化学工程与生物化工年会论文摘要集(下)[C];2004年
4 宋尔卫;;RNA干扰疗法的开发应用:靶点选择和靶向导入[A];第四届全国RNA进展研讨会论文集[C];2005年
5 ;RNA-interference-based functional research on rat epididymis-specific gene 16 and human paternally expressed gene PEG10 and the therapeutic applications of RNA interference in HBV,SARS,liver cancer,liver fibrosis and keloid fibroblast[A];第四届全国RNA进展研讨会论文集[C];2005年
6 郭晓红;周忠孝;吴明煜;;RNA干涉的分子机制及技术研究进展[A];中国生理学会论文汇编2005年第一期[C];2005年
7 李涛;李前忠;;Prediction of RNA binding sites in proteins from sequence[A];第四届全国生物信息学与系统生物学学术大会论文集[C];2010年
8 Jian-Hua Yang;Liang-Hu Qu;;ChIPBase:decoding transcriptional regulation of long non-coding RNA and microRNA genes from ChIP-Seq data[A];生命的分子机器及其调控网络——2012年全国生物化学与分子生物学学术大会摘要集[C];2012年
9 戚益军;;植物小RNA和长非编码RNA[A];生命的分子机器及其调控网络——2012年全国生物化学与分子生物学学术大会摘要集[C];2012年
10 陈润生;;非编码RNA和RNA组学[A];第11届全国脂质与脂蛋白学术会议论文汇编[C];2012年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 记者 冯卫东;研究人员发现可破坏肿瘤抑制基因的小RNA[N];科技日报;2009年
2 记者 储笑抒 通讯员 盛伟;人体微小RNA有望提前发出癌症预警[N];南京日报;2011年
3 泸州医学院副教授、科普作家 周志远;“大头儿子”与环状RNA[N];第一财经日报;2014年
4 麦迪信;小分子RNA可能有大作用[N];医药经济报;2003年
5 董映璧;美发现基因调控可回应“RNA世界”[N];科技日报;2006年
6 张忠霞;特制RNA轻推一下,就能“唤醒”基因[N];新华每日电讯;2007年
7 聂翠蓉;RNA:纵是配角也精彩[N];科技日报;2009年
8 冯卫东;RNA干扰机制首次在人体中获得证实[N];科技日报;2010年
9 冯卫东 王小龙;英在地球早期环境模拟条件下合成类RNA[N];科技日报;2009年
10 记者 常丽君;新技术让研究进入单细胞内RNA的世界[N];科技日报;2011年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 邬开朗;RNA干扰在抑制病毒基因表达与复制中的作用研究[D];武汉大学;2005年
2 王立坤;RNA-seq数据的处理与应用[D];吉林大学;2012年
3 高爱保;重金属诱导长江华溪蟹RNA差异显示及定量分析[D];山西大学;2011年
4 沈梅;RNA沉默抑制子的生化和结构研究[D];北京协和医学院;2009年
5 陈祖玉;水稻内源非编码小RNA的多样性[D];武汉大学;2005年
6 刘振栋;包含假结的RNA结构预测算法研究[D];山东大学;2014年
7 李振亚;人肝脏特异性表达的小RNA-miR-122表达调控机制与功能的研究[D];中国协和医科大学;2010年
8 吕欣;嵌合型重组HCV cDNA的构建及体外转录RNA的感染特性研究[D];第四军医大学;2005年
9 赵阳洋;对具有复杂结构的伪扭结RNA的组合分析[D];南开大学;2012年
10 林美娟;茶尺蠖小RNA病毒RNA依赖的RNA聚合酶功能研究及全长cDNA克隆构建[D];武汉大学;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 孙晓娜;针对HIV-1 vpr基因的RNA干扰作用研究[D];北京工业大学;2010年
2 樊梅娜;几种RNA沉默抑制蛋白的表达纯化及沉默抑制特性分析[D];山东农业大学;2012年
3 侯继业;RNA干扰技术用于流感病毒防治的探索研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2010年
4 林园园;乙型肝炎病毒RNA上La protein结合位点的缺失对其自身稳定性影响的实验研究[D];华中科技大学;2006年
5 周芳;家蚕细胞中RISC复合物结合小RNA的分离、鉴定与分析[D];浙江理工大学;2013年
6 黄守均;鸡的小RNA文库构建和非编码RNA的规模筛选[D];中国协和医科大学;2008年
7 陈志强;二甲亚砜通过作用于靶标RNA聚合酶提高转录活性[D];武汉大学;2005年
8 苏杨;LMW RNA分离方法改进及与人类胚胎发育相关miRNA的克隆表达[D];暨南大学;2007年
9 丁月芹;五种鼠基因组中4.5S RNA基因拷贝数的鉴定与分析[D];曲阜师范大学;2011年
10 刘中成;枣总RNA提取及mRNA差异显示技术体系的建立[D];河北农业大学;2005年
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