收藏本站
《吉林大学》 2010年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

基于递归神经网络构建基因调控网络的研究

苏兰莹  
【摘要】: 分子生物学的深入研究揭示了复杂生命现象是基因相互调控的结果,但是至今为止人们尚未完全清楚基因调控的机制,为理解生物系统的内在模式和机制,有效构建基因调控网络是当前功能基因组学研究的重要内容。 本文在分析了现有各基因调控网络模型的优缺点的基础上,针对当前构建基因调控网络现有模型的局限,提出采用递归神经网络模型,设计新的优化策略实现了基因调控网络的重构,这是本文的主要工作。 本文重点介绍了递归神经网络模型的相关知识,以及其应用于基因调控网络的优势,即不仅能利用基因数据的时序性,而且可以近似地模拟基因表达数据的非线性特征。此外针对基因调控网络权值矩阵为稀疏矩阵的特点,本文采用了结构与参数相结合的方法训练网络权值。采用全局寻优算法模拟退火算法来训练网络结构,以得到最优网络结构,同时采用引入免疫思想的粒子群算法进行网络权值参数优化,得到可以表达基因调控关系的网络权值,进而完全理解基因间的相互作用关系。由于现有基因数据存在噪声高、数据量少、验证难等缺点,本文先通过对通用模拟数据进行实验,很好的验证了算法的有效性。然后本文将该方法应用于大肠杆菌DNA修复系统进行实验,成功的识别出了其基因间的相互作用关系,实验结果验证了本文所提出的方法对基因调控网络构建的可行性和有效性。
【学位授予单位】:吉林大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2010
【分类号】:Q75

手机知网App
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 闫建俊;白云凤;张忠梁;冯瑞云;张维锋;;合成生物学研究进展及应用前景[J];山西农业科学;2011年09期
2 张春涛;应宏;向瑞银;徐家良;郭皎;;基于联合熵的多变量混沌时间序列相空间重构[J];西南师范大学学报(自然科学版);2011年04期
3 李迪;陈向坚;续志军;杨帆;牛文达;;自组织递归区间二型模糊神经网络在动态时变系统辨识中的应用[J];光学精密工程;2011年06期
4 ;[J];;年期
5 ;[J];;年期
6 ;[J];;年期
7 ;[J];;年期
8 ;[J];;年期
9 ;[J];;年期
10 ;[J];;年期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 王亚丽;周彤;;大规模基因调控网络因果关系的辨识[A];第二十九届中国控制会议论文集[C];2010年
2 蔡德培;;环境内分泌干扰物对垂体-性腺轴相关的基因调控网络的不良影响及其中药治疗的拮抗作用[A];中国生理学会消化内分泌生殖代谢生理专业委员会2011年消化内分泌生殖学术会议论文摘要汇编[C];2011年
3 杨仲南;;拟南芥绒毡层发育和功能基因调控网络[A];植物分子生物学与现代农业——全国植物生物学研讨会论文摘要集[C];2010年
4 苏彩红;曾永发;张志飞;吴菁;;一种突触后抑制递归神经网络结构及其在模式识别中的应用[A];第二十六届中国控制会议论文集[C];2007年
5 武新华;张义凤;高晶波;;转子—轴承系统非线性参数辨识研究[A];2003大型发电机组振动和转子动力学学术会议论文集[C];2003年
6 刘勇;沈毅;胡恒章;;递归神经网络自适应滤波器[A];1998年中国智能自动化学术会议论文集(上册)[C];1998年
7 王继泉;左学胜;;基于递归神经网络的坦克车辆故障诊断系统[A];2006中国控制与决策学术年会论文集[C];2006年
8 张燕;杨鹏;郭欣;张雪萍;颜威利;;基于递归神经网络的下肢表面肌电信号分类研究[A];2005中国控制与决策学术年会论文集(下)[C];2005年
9 蒲兴成;;时变时滞不确定递归神经网络渐近稳定的一个充分条件[A];2008’“先进集成技术”院士论坛暨第二届仪表、自动化与先进集成技术大会论文集[C];2008年
10 李鸿儒;邓长辉;顾树生;温馨;;递归神经网络快速学习算法的研究[A];2000中国控制与决策学术年会论文集[C];2000年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 张建松 张学全;我国科学家揭示白血病治疗的基因调控网络[N];中国医药报;2000年
2 任海军;中国科学家发现稻米食用品质基因调控网络[N];粮油市场报;2009年
3 通讯员 戴世勇 记者 张孔生;稻米口味有望“调控”[N];扬州日报;2010年
4 记者 王宝琳;我首次采用基因组学技术研究中药[N];科技日报;2009年
5 秦岭;我国科研人员发现决定稻米食用品质的基因调控网络[N];中国知识产权报;2009年
6 游雪晴 实习生 刘晓倩;寻找埋在“垃圾”中的财富[N];科技日报;2005年
7 新华;我国发现稻米品质控制基因调控网络[N];中国食品报;2009年
8 ;春去花不落风静月长明[N];科技日报;2003年
9 记者 柳悦;“速效救心丸基因组”研究启动[N];天津日报;2009年
10 包含飞;中医学属于复杂性科学的6个理由[N];中国中医药报;2005年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 张律文;基因调控网络的数值研究[D];上海大学;2010年
2 赵永昌;一类时滞静态递归神经网络的动力学行为研究[D];中国海洋大学;2010年
3 徐红林;基因调控网络的建模及其结构分解方法研究[D];江南大学;2010年
4 王政霞;时滞基因调控网络的稳定性研究[D];重庆大学;2009年
5 周到;基因调控网络的构建及其动态性与稳定性研究[D];华中科技大学;2009年
6 张文兵;基因调控网络的随机动力学分析[D];东华大学;2012年
7 缑葵香;基于贝叶斯理论的基因调控网络建模研究[D];天津大学;2010年
8 王芬;递归神经网络的动力学行为分析[D];武汉科技大学;2011年
9 张云俊;统计模型在基因调控网络结构学习和被动传感器目标定位中的应用[D];北京大学;2012年
10 张相华;基因网络分析的统计模型研究[D];中国科学技术大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 苏兰莹;基于递归神经网络构建基因调控网络的研究[D];吉林大学;2010年
2 焦清局;拟南芥花药基因调控网络的构建[D];上海师范大学;2010年
3 郑明;用时滞微分方程模型重构基因调控网络[D];吉林大学;2010年
4 章国升;基于递归神经网络的非线性系统辨识研究[D];兰州大学;2010年
5 张闻;隐马尔可夫模型在基因调控网络建模中的应用[D];西安理工大学;2010年
6 刘博瑞;两类时滞递归神经网络的全局稳定性分析[D];中国海洋大学;2010年
7 罗嘉;一类基因调控网络的定性分析[D];武汉科技大学;2010年
8 杨斌;微分方程系统在基因调控网络和代谢途径中的应用研究[D];济南大学;2010年
9 王雯;动静态基因调控网络构建方法研究与分析[D];电子科技大学;2010年
10 葛玲玲;基于动态贝叶斯模型的基因调控网络构建方法研究[D];合肥工业大学;2010年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026