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草原红牛初生公牛与成年公牛背最长肌基因表达差异分析

秦立红  
【摘要】: 本实验通过基因芯片技术,在建立了1月龄和24月龄中国草原红牛背最长肌组织基因表达谱的基础上对中国草原红牛初生公牛和成年公牛间基因表达差异进行了分析,并以此为基础对与肉质性状、生长发育性状以及抗病性状相关的差异表达基因通路进行了深入分析,为进一步以基因通路为基础寻找生产性状相关候选基因奠定基础,同时也为牛生产性状基因表达机制研究及如何用于改变生产性状、满足需求提供了理论依据。 本实验采用高通量基因芯片技术,对1月龄和24月龄中国草原红牛背最长肌基因表达差异进行了比较研究。结果显示:具有显著性差异的探针共计1282个(占可检出探针总数的5.6%)。运用博奥生物分子功能注释系统获得差异基因的注解共1008个转录本。对基因片段进行BLAST搜索,探针中1001个基因与已知功能基因具有较高的氨基酸相似性,占78.1%(截止到2009年6月)。结合GO和KEGG分析,得到可能对肉质性状基因表达差异具有显著影响的基因共126个,其中上调96个,下调30个;可能对生长发育性状基因表达差异具有显著影响的基因共71个,其中上调47个,下调24个;可能对抗病性状基因表达差异具有显著影响的基因共18个,其中上调13个,下调5个。对现阶段已知的KEGG通路分析结果显示:肉质性状相关基因通路共63个,涉及基因73个;生长发育性状相关基因通路共20个,涉及基因69个;抗病性状相关基因通路共42个,涉及基因109个。


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