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七个猪种Pit-1基因部分cDNA序列的SNPs分析

杨甲芳  
【摘要】: 生长速度是猪育种中选择的主要目标性状之一,鉴定影响猪生长速度的基因具有重要的实践意义和理论价值。Pit-1是POU结构域基因家族的成员之一,它是已知的几种哺乳动物生长激素、催乳素和促甲状腺激素β亚基的正调节因子,在调控动物生长发育中有重要作用。 本研究以民猪、三江白猪、军牧Ⅰ号、长白、大白、杜洛克和双肌臀大白猪7个品种共计483个个体为实验材料,采用4对引物分别扩增Pit-1基因编码区的不同区域,经SSCP电泳检测发现只有第二对引物(XF2、XR2)扩增的片段有多态,并检测到三种基因型:TT、TC和CC。对两种纯合子片段进行克隆测序,并与Genebank上发布的cDNA序列进行比较,发现TT型在Pit-1基因的第600位(第200位氨基酸,缬氨酸),即第4外显子的44位碱基处发生一个C→T的点突变,该突变属于沉默突变。 经基因型及基因频率的计算和统计分析表明,除军牧Ⅰ号以外,民猪、三江白猪、长白、大白、杜洛克和双肌臀大白猪的T等位基因频率呈现依次上升的趋势,即,0.264→0.622→0.828→0.888→0.919→0.971,而品种平均日增重也完全按此顺序呈上升趋势;军牧Ⅰ号的例外可能是由于样本含量(29头)较少所致,不能代表品种的实际情况。X~2检验也表明品种之间基因型频率差异极显著(P<0.01)。t检验表明,民猪、三江白猪与其它5个品种差异极显著(P<0.01);长白与大白、杜洛克差异显著(0.05<P<0.01);大白、杜洛克、双肌臀大白猪之间差异不显著(P>0.05)。民猪是我国的地方品种,三江白猪是民猪与长白杂交再与长白回交育成的品种,它们的生长速度一般比从国外引入的瘦肉型猪——大白、长白、杜洛克、双肌臀大白猪的生长速度缓慢。由此本研究得出一个趋势性结论,即C等位基因可能来源于我国的地方猪种,T等位基因与高的生长速度呈正相关。所以在猪的育种中可以把Pit-1基因的T等位基因作为高生长速度的标记基因之一,为实施标记辅助选择育种提供依据。


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