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《东北林业大学》 2011年
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禽流感野鸭源分离株H2N2亚型和H3N8亚型基因特征及遗传进化分析

王建琪  
【摘要】:禽流感(Avian Influenza, AI)是一种从呼吸系统到全身性败血症的传染性疾病,是由A型流感病毒引起。其感染禽类后,会造成很高的死亡率,使养禽业受到很大的经济损失。野鸟中广泛分布着禽流感病毒,研究表明禽流感病毒的天然储库是野生水禽,其迁徙的习性对病毒的传播起重要作用。东北林业大学野生动物疾病教研室分别在2006年和2007年从经由三江自然保护区迁徙的绿头鸭体内分离出两株低致病性禽流感病毒A/Mallard/SanJiang/137/2006(H2N2)和A/mallard/SanJiang/359/2007(H3N8),测定了以上两个毒株的全基因组,并对其生物学特性进行了分析。 本研究采用无特定病原体(SPF)鸡胚增殖禽流感病毒野鸭源分离株A/Mallard/SanJiang/137/2006(H2N2)和A/mallard/SanJiang/359/2007(H3N8),从鸡胚尿囊液中提取病毒基因组,再参考Genbank中已知的基因序列合成以上两个毒株8个片段的特异性全序列引物,并通过反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术将其全部序列片段扩增,其中PB1、PB2两段基因均分为两段扩增。将其分别克隆到pMD18-T载体后进行序列测定。序列测定正确后,与国内外H2N2和H3N8亚型的部分分离株的相应基因及其推导的氨基酸序列进行同源性比较和遗传进化分析,并绘制了H2及H3亚型AIV全景进化树。结果表明:所得到的两株AIV的8个节段均含有完整的开放阅读框架以及5’端和3’端的非编码区序列。通过对分离株A/Mallard/SanJiang/137/2006(H2N2)和A/mallard/SanJiang/359/2007(H3N8)与世界各地H2N2和H3N8代表株的核苷酸和氨基酸同源性以及遗传演化结果的分析,证实分离株A/Mallard/SanJiang/137/2006(H2N2)和A/mallard/SanJiang/359/2007(H3N8)起源于欧亚系,本研究中的AIV分离株均有基因重组的现象发生,可以推测与迁徙过程中携带各种不同亚型AIV的野鸟密切接触及各种不同亚型AIV的频繁感染有关。 从野禽中分离出H2N2和H3N8亚型禽流感病毒在我国尚无报道或报道很少,因此本研究的H2N2和H3N8亚型禽流感病毒全基因序列分析结果对于禽流感的深入研究,特别是对野生水禽禽流感病毒的携带状况和分子流行病学的研究具有重要的参考价值。
【学位授予单位】:东北林业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2011
【分类号】:S852.65

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【引证文献】
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 柴洪亮;黑龙江地区野生鸟类禽流感的分子流行病学调查研究[D];东北林业大学;2012年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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中国重要会议论文全文数据库 前3条
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3 王泽霖;柴丽娜;赵军;;1998~2008年不同毒力H9N2亚型AIV分离毒株HA基因的进化分析[A];中国畜牧兽医学会禽病学分会第十五次学术研讨会论文集[C];2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
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2 冯强;H9N2亚型流感病毒HA基因变异分析及对鸡免疫机能的影响[D];山东农业大学;2010年
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5 胡思顺;禽流感病毒H9N2亚型和鸡毒霉形体HS株主要抗原性基因的克隆与表达研究[D];华中农业大学;2005年
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8 王伟利;不同源性禽流感病毒株的分离鉴定及其主要基因信息的研究[D];吉林农业大学;2006年
9 徐一鸣;流感病毒多亚型检测方法的研制和应用[D];吉林大学;2009年
10 罗凤山;封闭连续细胞培养生产流感病毒工艺过程关键技术的研究[D];上海交通大学;2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
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【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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中国博士学位论文全文数据库 前3条
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中国硕士学位论文全文数据库 前5条
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【二级参考文献】
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