收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

盐胁迫下紫杆柽柳cDNA文库构建及表达序列标签(EST)分析

武金华  
【摘要】:柽柳抗旱、耐盐能力强,因此是进行耐盐碱机理研究的良好材料,但目前,有关柽柳耐盐碱的分子机理研究国内外尚未见报道。本文为了研究柽柳的耐盐机理构建了0.4 mmol/L NaHCO_3胁迫处理的柽柳cDNA文库,随机选取重组克隆测序,用表达序列标签(EST)方法研究NaHCO_3胁迫下柽柳基因的表达。 cDNA初始文库滴度为1.2×10~6pfu/mL,蓝白斑检验结果表明,文库重组率为96%,PCR检测表明插入片段的平均长度1 200bp左右。 随机挑选文库中的克隆进行测序。将获得序列去除5’端载体序列、文库接头序列和poly(A)序列。共获得2 328条读序较好的序列。 以获得的2 328条序列建立本地核酸数据库。本地BLAST获得642个与其它序列无同源区的序列,其余的1 686条序列依照同源性聚为281个序列集,对每个序列集通过序列联配获得359个contig。用于网上进行BLAST分析的独立序列共有1 001个。文库的冗余度为57%。 1 001个序列的BLASTX分析表明,有428个与已知功能的基因序列相似,234个与未知功能的基因相似,339个未能发现相似序列。将428个代表独立已知功能基因的EST,按功能分为11个类,其中防御基因、新陈代谢和蛋白合成及分拣的表达丰度最高,分别为25.26%、20.65%和15.37%。对与耐盐有关基因EST分析结果表明,信号元件、转录调控、应激蛋白和活性氧清除剂所包含的表达的基因比较多,这些基因的表达丰度也较高,分别为4.1%、1.9%、3.3%和0.9%,这说明这四种过程在柽柳抗盐胁迫时起到了重要作用。此外,跨膜运输及质子平衡、蛋白质代谢和新陈代谢类所包含的表达的基因种类相对较少,但是其表达丰度也较高分别为0.9%、0.9%和2.3%,可能在盐胁迫中也起到了重要的作用。 以上研究说明,柽柳的抗盐过程是一个复杂的多基因协同作用体系,涉及到防御反应、基因调控、信号传导、离子转运、活性氧清除、渗透调节、应激反应等多方面的综合作用,从而为系统阐明柽柳抗盐分子机理研究奠定坚实基础。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 张忠民,马如池;栽培柽柳改善重盐碱地生态环境[J];河北林业科技;1995年02期
2 闻杰,于文华;浅谈柽柳盆景制作[J];河南农业;2003年06期
3 张淼,胡芝芳,王林;柽柳育苗技术[J];林业实用技术;2004年09期
4 孟玲,李保平,刘小宁;新疆柽柳瘤瘿螨调查[J];中国生物防治;2004年04期
5 王奎武,王文安,穆荣霞,崔方贤,李洪芹,刘海波,刘国利,张奎良;盐碱荒滩荒地柽柳造林技术[J];林业科技;2000年05期
6 刘发民,金燕,张小军;荒漠地区柽柳人工固沙林土壤水分动态研究[J];西北植物学报;2001年05期
7 王淳,张侬;柽柳的简易种植和接种肉苁蓉方法[J];林业实用技术;2003年06期
8 李鹏;山东省柽柳资源现状与开发利用探讨[J];山东林业科技;2003年04期
9 孟玲,李保平,Jack DeLoach,James Tracy;新疆柽柳上的植食性昆虫种类调查[J];中国生物防治;2005年01期
10 李义福;孙欣;;黄骅市柽柳资源大面积减少的原因及对策[J];河北林业;2010年02期
11 王霞,侯平,尹林克,冯大千,潘伯荣;水分胁迫对柽柳组织含水量和膜透性的影响[J];干旱区研究;1999年02期
12 曾凡江,张希明,李小明;柽柳的水分生理特性研究进展[J];应用生态学报;2002年05期
13 杨传平,王玉成,刘桂丰,姜静;应用SSH技术研究NaHCO_3胁迫下柽柳基因的表达[J];遗传学报;2004年09期
14 李慧玉;刘桂丰;刘菲菲;王珊;;柽柳cDNA文库的构建及ThAQP基因的表达[J];西北农林科技大学学报(自然科学版);2010年07期
15 王景志;柽柳育苗栽培技术[J];林业科技通讯;1997年01期
16 赵延茂,刘月良,郑秀社;滨海盐碱地柽柳扦插育苗试验报告[J];山东林业科技;1997年03期
17 王霞,侯平,尹林克,冯大千,潘伯荣;水分胁迫对柽柳植物可溶性物质的影响[J];干旱区研究;1999年02期
18 刘新君;柽柳扦插繁殖技术[J];新疆林业;1984年02期
19 沙丁;流沙上的无叶柽柳[J];新疆林业;1998年05期
20 辛有俊,石蒙沂;共和盆地营造柽柳林因沙技术的研究[J];青海草业;1999年04期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 严顺平;苏维埃;汤章城;孙卫宁;;水稻根中盐胁迫响应蛋白的蛋白质组学的分析[A];中国蛋白质组学第二届学术大会论文摘要论文集[C];2004年
2 叶武威;喻树迅;王俊娟;樊宝相;赵云雷;;盐胁迫下棉花耐盐相关基因差异表达分析[A];中国棉花学会2008年年会论文汇编[C];2008年
3 赵福庚;刘友良;;盐胁迫下大麦根系多胺含量变化与耐盐性的关系[A];中国青年农业科学学术年报[C];2002年
4 孙健;王美娟;丁明全;邓澍荣;陈少良;;盐胁迫下胡杨调控细胞内K~+/Na~+平衡的生理和信号机制[A];第六届中国植物逆境生理学与分子生物学学术研讨会论文摘要汇编[C];2010年
5 华春;王仁雷;刘友良;;外源AsA对盐胁迫下水稻叶绿体活性氧清除系统的保护作用[A];中国植物生理学会全国学术年会暨成立40周年庆祝大会学术论文摘要汇编[C];2003年
6 杨俊诚;姜慧敏;张建峰;梅勇;;盐胁迫下植物对磷的吸收的研究[A];2004年全国学术年会农业分会场论文专集[C];2004年
7 高青海;王秀峰;杨凤娟;魏珉;任志雨;;LaCl_3对硝酸盐胁迫下黄瓜幼苗光合特性的影响[A];中国园艺学会十届二次理事会暨学术研讨会论文摘要集[C];2007年
8 陈静波;刘建秀;;4种暖季型草坪草对盐胁迫的生长生理反应[A];中国草学会牧草育种专业委员会2007年学术研讨会论文集[C];2007年
9 张润花;郭世荣;李军;;外源腐胺对盐胁迫黄瓜幼苗生长,光合及叶绿素荧光参数的影响[A];中国园艺学会十届二次理事会暨学术研讨会论文摘要集[C];2007年
10 杨帆;丁菲;杜天真;;盐胁迫下构树幼苗各器官中K~+、Ca~(2+)、Na~+和Cl~-含量分布及吸收特征[A];第九届全国植物结构与生殖生物学学术研讨会论文摘要集[C];2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 陆一鸣;短芒大麦盐胁迫相关基因的克隆及其功能分析[D];中国人民解放军军需大学;2003年
2 严顺平;水稻响应盐胁迫和低温胁迫的蛋白质组研究[D];中国科学院研究生院(上海生命科学研究院);2006年
3 刘永霞;硅对金丝小枣盐胁迫的缓解效应及其机理[D];南京林业大学;2007年
4 吴雪霞;外源一氧化氮对盐胁迫下番茄幼苗生理特性影响的研究[D];南京农业大学;2007年
5 于中连;烟草NADPH氧化酶在Na~+、Cu~(2+)胁迫中的活性变化及其作用[D];中国农业大学;2005年
6 杜伟;诱导型激活拟南芥突变体库的构建以及AtCRK3生化、表达分析[D];武汉大学;2005年
7 史仁玖;多枝赖草(Leymus multicaulis)盐胁迫应答相关基因的克隆及表达分析[D];南京农业大学;2005年
8 王俊生;延迟荧光检测技术及其在光合能力与胁迫检测中的应用[D];哈尔滨工业大学;2007年
9 何奇江;盐胁迫下雷竹的离子响应及生理生态变化[D];中国林业科学研究院;2011年
10 刘杰;向日葵对碱胁迫和盐胁迫适应机制比较[D];东北师范大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 武金华;盐胁迫下紫杆柽柳cDNA文库构建及表达序列标签(EST)分析[D];东北林业大学;2004年
2 于影;转柽柳LEA基因烟草耐盐性分析[D];东北林业大学;2006年
3 李艳霞;柽柳eIF1A基因植物表达载体的构建及功能验证[D];东北林业大学;2006年
4 吴东东;桧柽柳在不同盐胁迫下生理变化规律的研究[D];吉林农业大学;2011年
5 杨涓;盐胁迫下枸杞糖蛋白及糖代谢变化的研究[D];宁夏大学;2004年
6 黄丽;槲寄生与寄主红树植物之间水分和营养研究[D];厦门大学;2009年
7 聂晶;五个垂直绿化树种的耐盐特性及耐盐性评价[D];山东农业大学;2004年
8 孙丽娜;水杨酸对盐胁迫下黄瓜生长发育及超微结构影响的研究[D];东北农业大学;2005年
9 周志文;葡萄种质资源的耐盐性鉴定及其生理基础的研究[D];山东农业大学;2003年
10 麻德平;外源NO和精胺提高高羊茅草耐盐性研究[D];郑州大学;2007年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 周兴民 吴玉虎 夏连琪;青海发现野生古柽柳树王[N];中国环境报;2011年
2 本报记者 郭泽莉;枝红叶绿相映成趣 柽柳造景四季可赏[N];中国花卉报;2009年
3 商金杰;山东东营 城市绿化引种柽柳[N];中国花卉报;2008年
4 嘉禾;强耐盐树种——柽柳[N];中国花卉报;2007年
5 沈慧;柽柳盆景修剪枝巧[N];中国花卉报;2005年
6 商洛市商州区蚕桑站 刘更虎 柳林;园林生态建设树种——柽柳[N];陕西科技报;2002年
7 马文其;柽柳盆景的制作养护[N];中国花卉报;2004年
8 马文其;柽柳盆景的制作养护[N];中国花卉报;2004年
9 卢林华 张桂兰;黄河入海口封育50万亩耐盐碱天然柽柳林[N];黄河报;2005年
10 宋全政刘天东;我愿做黄河滩边的一株柽柳[N];中国教育报;2008年
中国知网广告投放
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978