收藏本站
《东北林业大学》 2010年 硕士论文
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

柴胡全长cDNA文库和遗传图谱的构建及蚕豆病毒属病毒的鉴定

战晴晴  
【摘要】: 柴胡为伞形科(Umbelliferae)柴胡属(Bupleurum L.)植物,具有解表合里、疏肝解郁、升举阳气之功效,是我国重要的药用植物。本研究构建柴胡(B. chinense DC.)全长cDNA文库,并从cDNA文库中随机挑选了3902个单克隆进行5'端测序,挖掘SSR位点,并在对文库测定序列的分析研究过程中,发现了与蚕豆萎蔫病毒2(Broad bean will virus2, BBWV-2)同源性很高的克隆,推测构建柴胡文库的试料可能被BBWV-2侵染。因此,利用RT-PCR和指示植物接种方法,鉴定了侵染柴胡的病毒。最后,利用ISSR和开发的SSR分子标记构建柴胡分子遗传图谱。为进一步开展柴胡功能基因组学及柴胡分子标记辅助育种等研究奠定基础。试验主要结果如下: (1)利用SMART技术构建了柴胡根全长cDNA文库。从文库中随机选择了3902个克隆进行5'端单反应测序,获得了3111个高质量cDNA序列,包括377个序列重叠群和1273个单一序列共1650个独立基因。文库插入片段平均长度约1.1 kb,全长比率约51.5%。 (2)利用BlastX分析结果表明949(57.5%)个独立基因和已鉴定基因同源,680(41.2%)个独立基因与GenBank中未知、未命名或推测的蛋白基因同源,21个独立基因没有找到同源基因。 (3)在1650个独立基因中82个含有SSR位点,其中4个独立基因有两个SSR位点,共挖掘了86个SSR位点,为柴胡遗传图谱的构建,遗传多样性的分析及种质鉴定提供有效的分子标记。 (4)在对文库测定序列的分析研究过程中,发现重叠群45与BBWV-2病毒的核酸序列有很高的同源性,推测构建柴胡文库的试料可能被BBWV-2侵染。 (5)首次在柴胡上发现了蚕豆萎蔫病毒2的侵染,利用检测蚕豆病毒属不同种的特异引物对染病柴胡进行了RT-PCR鉴定。并将染病柴胡上的病毒机械接种到苋色藜(Chenopodium Amaranticolor)指示植物上。结果证实了侵染柴胡的病毒为BBWV-2。 (6) ISSR和SSR分子标记的多态性:经父母本多态性筛选,从30条ISSR和44对SSR引物中筛选出28条ISSR和14对SSR多态性引物,扩增出168条多态性条带,其中有36个位点表现偏分离,频率为21.4%。 (7)遗传图谱的构建:通过对F1代进行基因型和连锁分析,初步构建了包含13个连锁群,80个(72个ISSR和8个SSR)位点的首张北柴胡遗传图谱。该图谱覆盖长度2633.9cM,平均图距33.4 cM,13个连锁群包含2-31个标记不等,连锁群遗传距离15.4 cM-1295.7 cM。 本研究旨在为进一步开展柴胡功能基因组学及柴胡性状基因定位、分子标记辅助选择育种等研究奠定了基础育种的研究奠定基础。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 苏晓华,张绮纹;林木遗传图谱研究的现状与展望[J];林业科技通讯;1995年05期
2 安泽伟,黄华孙;林木遗传图谱的构建及应用[J];热带农业科学;2003年05期
3 夏文财;鲁绍雄;;牛遗传图谱的研究进展[J];吉林畜牧兽医;2008年05期
4 任羽;尹俊梅;潘红兵;徐世松;黄少华;;园艺植物遗传图谱的研究进展[J];中国农学通报;2012年07期
5 朱德威;陈庆富;;普通小麦遗传图谱研究现状与展望[J];种子;2010年03期
6 D.格拉塔佩格利阿;贝托鲁西;沈中瀚;;桉树遗传图谱的最新进展[J];桉树科技;1994年02期
7 张玥颖;刘兵强;刘立伟;闫龙;;冀豆12遗传图谱初步构建[J];华北农学报;2009年02期
8 李明丽;鲁绍雄;刘学洪;;畜禽遗传图谱及其在动物育种中的应用[J];畜牧兽医杂志;2008年04期
9 张乐;郭政阳;刘玉林;陈曦;杨靖;;大豆分子标记遗传图谱研究进展[J];科技信息;2012年17期
10 牛宝龙,翁宏飙,孟智启,吕顺霖;家蚕基因组中的分子标记遗传图谱[J];蚕桑通报;2002年03期
11 宗洪霞;周坤华;方荣;陈学军;;辣椒遗传图谱的构建与QTL定位研究进展[J];江西农业大学学报;2013年02期
12 陈浩东;刘方;M.K.R.Khan;蔡小彦;王为;王春英;王玉红;李育强;王坤波;;试剂选用及带型读取方式对遗传图谱数据SSR的影响[J];湖南农业科学;2013年09期
13 许占友,常汝镇,邱丽娟,李向华;大豆遗传图谱研究进展及对应的几个问题[J];大豆科学;2001年02期
14 陈争;童再康;;林木遗传连锁图谱构建研究进展[J];世界林业研究;2012年03期
15 安静;胡勇胜;张宝玺;毛胜利;王立浩;;辣椒分子连锁遗传图谱的构建及抗疫病QTL定位[J];中国蔬菜;2007年10期
16 黄昆;;大豆遗传图谱的构建[J];现代农业科技;2008年07期
17 王永军,吴晓雷,贺超英,张劲松,陈受宜,盖钧镒;大豆作图群体检验与调整后构建的遗传图谱[J];中国农业科学;2003年11期
18 万江虹;张武学;;用遗传连锁分析构建畜禽遗传图谱方法简介[J];青海畜牧兽医学院学报;1995年02期
19 张启军,叶少平,虞德容,李平,吕川根,邹江石;六张水稻遗传连锁图谱的比较分析[J];西南农业学报;2005年05期
20 师翠兰;郑菲菲;陈建省;韩淑晓;王永瑞;田纪春;;山农01-35×藁城9411重组自交系遗传图谱构建及粒重QTL分析[J];作物学报;2012年08期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 黄敏仁;张博;;林木遗传图谱研究现状及发展趋势[A];中国的遗传学研究——中国遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编[C];2003年
2 张博;杜生明;黄敏仁;;林木遗传图谱研究现状及发展趋势[A];全国作物细胞工程与分子技术育种学术研讨会论文集[C];2003年
3 梅丽宏;段霞瑜;周益林;;植物病原真菌遗传图谱研究进展[A];农业生物灾害预防与控制研究[C];2005年
4 崔世友;;大豆分子标记研究的现状及展望——Ⅰ 遗传图谱的构建[A];’2003中国作物学会学术年会文集[C];2003年
5 王晓娟;杨晓莉;孙月华;卓仁英;;苜蓿(Medicago sativa L.)遗传图谱构建及其应用[A];中国草学会牧草育种专业委员会2007年学术研讨会论文集[C];2007年
6 张启军;叶少平;虞德容;李平;吕川根;邹江石;;六张水稻遗传连锁图谱的比较分析[A];2005年全国作物遗传育种学术研讨会暨中国作物学会分子育种分会成立大会论文集(二)[C];2005年
7 刘玉林;李英慧;李慧慧;刘章雄;刘波;宣晶;张姗姗;常汝镇;邱丽娟;;大豆遗传图谱的构建及重要农艺性状的QTL定位[A];第23届全国大豆科研生产研讨会论文摘要集[C];2012年
8 王婧菲;王英;高和琼;庄南生;李开绵;;木薯遗传图谱15号连锁群的物理定位[A];中国作物学会2013年学术年会论文摘要集[C];2013年
9 张俊卫;黄翠娟;张金波;包满珠;;梅花分子框架遗传图谱的构建[A];中国园艺学会十届二次理事会暨学术研讨会论文摘要集[C];2007年
10 于雪梅;江汉民;王春国;陈成彬;孙德岭;宋文芹;;花椰菜遗传图谱的构建及重要农艺性状的定位[A];中国的遗传学研究——遗传学进步推动中国西部经济与社会发展——2011年中国遗传学会大会论文摘要汇编[C];2011年
中国博士学位论文全文数据库 前5条
1 王凯;异源四倍体棉花遗传图谱的构建与分子细胞遗传学研究[D];南京农业大学;2006年
2 李玮;白菜型油菜超高密度遗传图谱的构建和Solexa序列的整合[D];西北农林科技大学;2011年
3 黄银花;鸭遗传图谱的构建及重要经济性状基因座的初步定位[D];中国农业大学;2004年
4 张丽;利用新型DH群体构建小麦遗传图谱与SDG8和FT基因对拟南芥开花和分枝的协同调控[D];四川农业大学;2012年
5 王贤磊;甜瓜遗传图谱的构建与抗病基因遗传分析[D];新疆大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 李博;甜菜分子标记遗传图谱的初步构建[D];黑龙江大学;2012年
2 战晴晴;柴胡全长cDNA文库和遗传图谱的构建及蚕豆病毒属病毒的鉴定[D];东北林业大学;2010年
3 张蕴哲;毛白杨杂交群体AFLP遗传图谱的构建[D];中国林业科学研究院;2001年
4 耿雷跃;大豆遗传图谱加密及磷效率相关性状基因定位[D];南京农业大学;2007年
5 华亚鹏;三个水稻电子遗传图谱的构建及水稻品种指纹图谱库的初步研究[D];福建农林大学;2008年
6 郭勇;利用EST-CAPS标记构建桉树遗传图谱[D];中国林业科学研究院;2008年
7 周长品;一组新的桉树EST-SSR标记开发及遗传图谱的整合[D];中国林业科学研究院;2011年
8 郑云峰;基于粒重差异品系的甘蓝型油菜遗传图谱的初步构建[D];郑州大学;2011年
9 付远志;陆地棉遗传图谱的丰富及其与海陆种间图谱的比较作图[D];华中农业大学;2009年
10 汪骞;白菜BIL群体和DH群体的遗传图谱构建及其比较[D];云南农业大学;2009年
中国重要报纸全文数据库 前2条
1 记者 胡其峰;首张苎麻分子标记遗传图谱绘制成功[N];光明日报;2014年
2 本报记者 吴清海;解码“优异基因”[N];东方烟草报;2014年
中国知网广告投放
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978