药用植物茉莉酸合成途径关键酶基因的克隆与研究
【摘要】:
植物次生代谢产物是一大类的小分子化合物,在植物体中的基础含量一般都很低。然而在生物和非生物的压力胁迫下,或者在一定的诱导条件下,次生代谢产物的产量通常有一定的提高。近年来,为了提高特定的次生代谢产物的含量,代谢工程被广泛应用。随着次生代谢产物生物合成途径中已克隆基因的增多以及代谢途径的进一步阐明,已经有一些行之有效的方法取得了令人欣喜的进展。
在外界生物或非生物的压力胁迫下,一些植物激素,如脱落酸、水杨酸、乙烯以及茉莉酸酮酯(JAs)等在植物中大量积累,通过相互作用,调控植物的信号传递、胁迫耐受以及次生代谢等过程,形成植物的应激系统。其中,茉莉酸酮酯在植物应激反应和次生代谢调控中起着至关重要的作用。此外,茉莉酸酮酯在植物发育的各个阶段也具有重大的意义。
在植物的茉莉酸生物合成途径中,丙二烯氧化物环化酶(AOC,allene oxidecycalse,EC 5.3.99.6)和丙二烯氧化物合成酶(AOS,allene oxide synthase,EC4.2.1.9)的催化是最重要的酶促步骤。
为了研究药用植物茉莉酸合成途径基因的功能以及它们在次生代谢工程中的应用价值,选取了莨菪和金银花为研究对象。
莨宕是一种重要的药用植物,会产生一类受甲基茉莉酸诱导的色胺类生物碱。我们从中克隆了JA合成途径的基因AOC和AOS,并把AOC基因转入烟草验证了其对次生代谢产物(尼古丁)合成的促进作用。金银花是一种常用的中草药,含有多种次生代谢产物,其中绿原酸是最重要的活性成分,也是衡量金银花质量的指标化合物,我们从中克隆了AOS基因,并发现其组织表达同绿原酸的组织分布有一定的相似性。
1)莨宕丙二烯氧化物环化酶基因(HnAOC)
丙二烯氧化物环化酶(AOC)的催化作用是JA合成途径中最关键的步骤。采用RACE的方法,从莨菪中克隆了AOC基因(HnAOC,GenBank登录号:AY708383),该基因与其他物种中的AOC基因具有较高的同源性。其cDNA全长为1044 bp,包括5'和3'非翻译区(UTR)、polyA尾和一个长747 bp的开放阅读框(ORF)。HnAOC基因组内含有两个内含子,分别为94 bp和402 bp。HnAOC基因编码的蛋白质共有248个氨基酸,分子量为27.0 kDa,理论等电点8.74。Southern杂交结果显示HnAOC在莨菪中是一个多拷贝基因;RT-PCR分析结果表明,HnAOC基因可被多种不同的诱导因素所诱导表达,从而可以借此调控AOC基因的表达和JA合成。
2)莨宕丙二烯氧化物合成酶基因(HnAOS)
丙二烯氧化物合成酶(AOS)是JA合成途径中的第一个特异性的酶。采用RACE的方法,从莨菪中克隆了AOS基因(HnAOS,GenBank登录号:EF532599),其cDNA全长为1652 bp,包括5'和3'非翻译区(UTR),polyA尾和一个长1485 bp的开放阅读框(ORF),基因组内不含有内含子。HnAOS基因编码的蛋白质含494个氨基酸,分子量为55.8 kDa,理论等电点8.82,属于细胞色素P450大家族。实时荧光定量PCR分析结果显示,在正常生长的植株中,HnAOS基因在茎中表达水平最高。另外,HnAOS基因受伤、甲基茉莉酸的诱导而上调表达,直接的甲基茉莉酸处理比伤诱导的效果在时间上出现得更早,从而佐证了伤诱导的作用是通过茉莉酸合成途径来实现的。
3)转基因烟草中HnAOC的过量表达提高了其抗逆性及尼古丁含量
丙二烯氧化物环化酶的催化是植物JA合成途径中最关键的步骤,而且烟草中尼古丁的代谢受JA的诱导,为了验证JA生物合成途径的基因工程能否使受其诱导的次生代谢产物的含量增加,因此我们将最莨菪的AOC基因转入烟草,以尼古丁含量为代表来验证HnAOC过量表达对次生代谢产物含量的影响。RT-PCR分析结果显示,在转基因烟草中HnAOC均有表达,而烟草AOC基因的表达也增强了;电导率测定结果显示,转基因烟草的叶片在低温条件下离子泄漏程度低于野生型烟草,表现出对低温伤害的耐受性。实时荧光定量PCR(RT-QPCR)结果表明,转基因烟草中尼古丁合成途径的关键酶基因PMT和QPT的表达水平也大幅度提高,HPLC分析结果显示其尼古丁含量也相应提高了。因而,本研究证明了JA生物合成途径的基因操作可以代替繁琐的外源激素处理来提高目的产物的含量,从而为生产受JA诱导的次生代谢产物提供了一个有效的基因工程策略。
4)金银花丙二烯氧化物合成酶基因(LjAOS)
金银花是一种被广泛应用的重要的中草药材料,具有清热解毒,消炎杀菌的功效。绿原酸是金银花的主要功效成分,也是金银花质量监控的指标性化合物,它的含量在不同的组织和花周期中差异较大,其中在花蕾中的含量最高。对于药农和制药厂家来说,药材的质量监控是非常关键的问题,因此金银花采收部位的绿原酸含量备受关注。JA作为一类调控植物发育和次生代谢的植物激素,可能在其中起着重要的作用。在JA的生物合成途径中,AOS是第一个特异性的酶,属于细胞色素P450大家族。为了研究JA合成途径的遗传操作是否可以对绿原酸的合成进行调控,我们首先从金银花中克隆出来一个全新的AOS基因(LjAOS,GenBank登录号:DQ303120)。其cDNA全长为1942 bp,包括5'和3'非翻译区(UTR),polyA尾和一个长1584 bp的开放阅读框(ORF)。LjAOS基因编码的蛋白质含527个氨基酸,分子量为59.2 kDa,理论等电点为8.41,其基因组中不含有内含子。多重比对表明LjAOS蛋白与其他的AOS蛋白具有较高的同源性,LjAOS蛋白序列中含有AOS家族应有的保守氨基酸残基。Southern杂交结果显示LjAOS基因在金银花中为多拷贝基因;有趣的是,RT-QPCR结果显示LjAOS基因在各个组织中表达量也是在花蕾中最高,这与绿原酸的分布规律具有一定的相似性,揭示了JA的生物合成可能与花的发育以及绿原酸的合成有关。本研究为提高金银花中绿原酸含量提供了一个可供试验的靶点。
综上所述,莨菪和金银花JA合成途径关键酶基因的研究使我们对JA生物合成途径和其在上述两种药用植物中的调控作用有了一定的了解,对于进一步阐明植物JA合成途径及其作用机制和进化有一定的帮助。同时,对转基因烟草抗逆性能和尼古丁含量的研究将有利于JA合成途径基因在植物次生代谢工程中的应用。
【关键词】:丙二烯氧化物合成酶(AOS) 丙二烯氧化物环化酶(AOC) 绿原酸 金银花 莨菪 甲基茉莉酸 茉莉酸酮酯生物合成途径 代谢工程 烟草 次生代谢 尼古丁 转化 RACE RT-PCR RT-QPCR
【学位授予单位】:复旦大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2007
【分类号】:S567
【目录】:
【学位授予单位】:复旦大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2007
【分类号】:S567
【目录】:
- 摘要8-12
- 缩略词12-14
- Abstract14-18
- 引言18-19
- 第一章 文献综述19-36
- 前言19
- 第一节 植物次生代谢产物与次生代谢工程19-23
- 第二节 茉莉酸类物质的生物合成途径及生物学意义23-34
- 1.2.1 a-亚麻酸的释放25
- 1.2.2 脂氧合酶(Lipoxygenase,LOX)及LOX代谢途径25-27
- 1.2.3 丙二烯氧化物合成酶(AOS)及其所属的酶家族27-30
- 1.2.4 丙二烯氧化物环化酶(AOC)及其作用30-31
- 1.2.5 OPDA还原酶31-32
- 1.2.6 β-氧化酶32
- 1.2.7 茉莉酸的甲基化酶32
- 1.2.8 JA合成的调控特征32-33
- 1.2.9 茉莉酸途径各个产物的生理意义33
- 1.2.10 展望33-34
- 第三节 茉莉酸类物质对次生代谢的作用,以及其合成途径基因的遗传操作在次生代谢工程中应用的可行性34-36
- 第二章 莨菪茉莉酸生物合成途径AOC基因的克隆与分析36-80
- 引言36
- 第一节 实验材料36-40
- 2.1.1 植物材料36
- 2.1.2 菌株和载体36
- 2.1.3 仪器和设备36-37
- 2.1.4.试剂盒及购买的试剂37-38
- 2.1.5.自配的主要标准试剂38-40
- 2.1.6.自配的其它试剂40
- 第二节 实验方法与步骤40-59
- 2.2.1 莨菪材料的准备40
- 2.2.2 莨菪植株叶片的诱导处理40
- 2.2.3 诱导处理莨菪叶片总RNA的抽提与质量检测40-41
- 2.2.4 莨菪叶片基因组DNA的提取41-42
- 2.2.5 从莨菪总RNA合成第一链3'-cDNA42-43
- 2.2.6 HnAOC基因3'-cDNA片段的获得43-44
- 2.2.7 莨菪RACE-Ready5'-cDNA的合成44-45
- 2.2.8 HnAOC的5'-RACE45-46
- 2.2.9 HnAOC全长cDNA的克隆46-47
- 2.2.10 HnAOC基因组全长的克隆47-48
- 2.2.11 HnAOC的Southern blot分析48-52
- 2.2.12 HnAOC基因表达分析52-54
- 2.2.13 本章涉及的DNA片段的回收、连接、克隆和测序54-57
- 2.2.14 生物信息学分析57
- 2.2.15 HnAOC的原核表达57-59
- 第三节 结果与讨论59-76
- 2.3.1 HnAOC cDNA的全长克隆和性质分析59
- 2.3.2 HnAOC基因组序列59-61
- 2.3.3 HnAOC推导的蛋白质序列的性质分析61-66
- 2.3.4 HnAOC蛋白的分子进化分析66
- 2.3.5 HnAOC蛋白的二级结构66-69
- 2.3.6 HnAOC蛋白的三级结构预测69
- 2.3.7 HnAOC蛋白的叶绿体前导肽预测69
- 2.3.8 HnAOC的Southern杂交结果69
- 2.3.9 HnAOC基因的诱导表达分析69-76
- 2.3.10 HnAOC蛋白的原核表达76
- 第四节 小结与讨论76-80
- 第三章 莨菪茉莉酸生物合成途径AOS基因的克隆与分析80-106
- 引言80
- 第一节 实验材料80
- 第二节 实验方法与步骤80-89
- 3.2.1 莨菪材料的准备80
- 3.2.2 莨菪植株叶片的诱导处理80
- 3.2.3 诱导处理莨菪叶片总RNA的抽提、检测与浓度测定80-81
- 3.2.4 莨菪叶片基因组DNA的提取81
- 3.2.5 从莨菪总RNA合成第一链3'-cDNA81
- 3.2.6 HnAOS基因核心片段的获得81
- 3.2.7 莨菪RACE-Ready 5'-cDNA的合成81-82
- 3.2.8 HnAOS基因的5'RACE-82-83
- 3.2.9 HnAOS全长cDNA的克隆83-84
- 3.2.10 HnAOS基因组全长的克隆84-85
- 3.2.11 HnAOS的Southern blot分析85-86
- 3.2.12 HnAOS基因表达分析86-89
- 3.2.13 本章涉及的DNA片段的回收、连接、克隆和测序89
- 3.2.14 生物信息学分析89
- 第三节 结果与讨论89-105
- 3.3.1 HnAOS cDNA的全长克隆和性质分析89-90
- 3.3.2 HnAOS推导的蛋白质序列的性质分析90
- 3.3.3 HnAOS的分子进化分析90-100
- 3.3.4 HnAOS蛋白的二级结构分析100-101
- 3.3.5 HnAOS蛋白的三级结构预测101-102
- 3.3.6 HnAOS蛋白的叶绿体前导肽预测102
- 3.3.7 HnAOS的Southern杂交结果102-103
- 3.3.8 HnAOS基因的组织特异性表达分析103
- 3.3.9 HnAOS基因的诱导表达分析103-105
- 第四节 小结与讨论105-106
- 第四章 应用HnAOC基因进行烟草中尼古丁的代谢工程106-127
- 引言106
- 第一节 实验材料与试剂106
- 第二节 试验方法与步骤106-117
- 4.2.1 植物表达载体pCAMBIA1304+HnAOC的构建106-109
- 4.2.2 表达载体转化到根癌农杆菌EHA105109
- 4.2.3 叶盘法转化烟草109-110
- 4.2.4 转基因烟草PCR检测110-111
- 4.2.5 转基因烟草的Southern blot分析111-112
- 4.2.6 转基因烟草中HnAOC与NtAOC的RT-PCR检测112-113
- 4.2.7 转基因烟草在低温处理后叶片电导率的测定113
- 4.2.8 转基因烟草中尼古丁合成途径两个关键酶基因的表达水平RT-QPCR测定113-114
- 4.2.9 烟草的甲基茉莉酸处理114
- 4.2.10 尼古丁含量的测定114-116
- 4.2.11 莨菪发根的转化116-117
- 第三节 结果和讨论117-126
- 4.3.1 转基因烟草的获得117-118
- 4.3.2 转基因烟草的分子检测118-119
- 4.3.3 转基因烟草的Southern杂交检测119-120
- 4.3.4 转基因烟草中NtAOC与HnAOC表达的RT-PCR分析120-121
- 4.3.5 转基因烟草对低温处理的耐受性121-122
- 4.3.6 转基因烟草中尼古丁合成途径两个关键酶的表达水平122-123
- 4.3.7 转基因烟草中的尼古丁含量以及甲基茉莉酸处理对尼古丁含量的影响123-125
- 4.3.8 转基因莨菪发根的获得125-126
- 第四节 小结126-127
- 第五章 金银花茉莉酸合成途径AOS基因的克隆与分析127-150
- 引言127-128
- 第一节 实验材料与试剂128
- 第二节 实验方法与步骤128-135
- 5.2.1.植物材料128
- 5.2.2 金银花叶片总RNA的抽提及RNA质量检测128
- 5.2.3 从金银花总RNA合成第一链3'-cDNA-128
- 5.2.4 LjAOS基因核心片段的获得128-129
- 5.2.5 LjAOS基因3'-端序列的扩增129-130
- 5.2.6 金银花RACE-Ready-5'-cDNA的合成130
- 5.2.7 LjAOS基因的5'-RACE130-131
- 5.2.8 LjAOS全长cDNA的克隆131-132
- 5.2.9 LjAOS基因组全长的克隆132-133
- 5.2.10 LjAOS的Southern blot分析133-134
- 5.2.11 LiAOS基因组织表达分析134-135
- 5.2.12 本章涉及的DNA片段的回收、连接、克隆和测序135
- 5.2.13 生物信息学分析135
- 第三节 结果与讨论135-149
- 5.3.1 LjAOS cDNA的全长克隆和性质分析135-136
- 5.3.2 LjAOS推导的蛋白质序列的性质分析136-139
- 5.3.3 LiAOS的分子进化分析139-145
- 5.3.4 LiAOS蛋白的二级结构分析145
- 5.3.5 LiAOS蛋白的三级结构预测145-146
- 5.3.6 LjAOS蛋白的叶绿体前导肽预测146-147
- 5.3.7 LjAOS的Southern杂交结果147-148
- 5.3.8 LjAOS基因的组织特异性表达分析148-149
- 第四节 LjAOS小结149-150
- 参考文献150-165
- 参考书165-166
- 附录166-167
- 创新点167-168
- 在读期间从事和参与的其他研究工作168
- 在读期间获得和参与的基金项目168
- 学术活动168-169
- 论文发表情况169-171
- 致谢171-174
| 【参考文献】 | ||
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| 【共引文献】 | ||
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| 【二级参考文献】 | ||
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| 【相似文献】 | ||
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