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《复旦大学》 2010年
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上海地区人甲型流感病毒基因变异与季节性流行关系的研究

施强  
【摘要】: 流感长期以来一直是威胁人类健康的重要呼吸道病原体之一,流感的基因变异及重组所导致的抗原漂移和抗原转换是流感出现流行或者暴发的基础,虽然已有很多研究对流感的基因变异进行探讨,但是对流感病毒的进化情况和流行动力学的许多方面的认识仍然是未知的,特别对流感病毒的跨时空的变异缺乏精确的测量。在北半球流感发病存在如时钟般准确的流行季节高峰,是什么因素驱使流感出现明显的季节性高峰却众说纷纭,特别是关于基因变异和流感季节性高峰间的关系研究基本缺乏。本研究采用合理的流行病学和生物信息学方法,对流感的基因变异情况和流感季节性发病高峰的关系进行探讨,主要包括以下5个方面内容: 1.在上海地区建立合适的流感监测点和网络,长期收集监测网络医院的类流感病例发病情况,利用时间序列分析流感的季节性发病高峰分布特征。结果显示:上海地区的流感监测病例每年存在2次季节高峰,两次高峰间的距离为6个月,和中国北方地区只有1次流行高峰且间隔为12个月不同。 2.从研究现场的监测系统采集标本并分离流感病毒后并按照一定条件选择甲型流感病毒株进行HA、NA和PB2基因的全基因测序。利用基于MCMC抽样技术的Bayesian分析分别完成流感病毒HA, NA和PB2基因的跨时间变异情况分析,结合已有的流行病学资料,对人甲型流感3种重要基因变异情况进行全面的分析。结果显示甲型流感2个不同亚型的基因变异速度是不一致的,总的说来,H3N2亚型进化速度比较快,而H1N1的进化速度相对较慢。在同一个亚型中,一般是HA的进化速度比NA快,PB2最慢,这和病毒为了逃避宿主的免疫清除而进行的适应性变异紧密相关。在大部分时间中,H3N2亚型基因变异的程度相对较高,而H1N1亚型的基因变异程度相对较低,即使在占据优势的2004和2005年,其变异高峰也只有H3N2最高峰的三分之一不到。这从另外一方面证实H1N1亚型保存相对稳定,不容易突破人体的免疫屏障和H3N2亚型对其的压制。病毒基因变异程度高,并不意味着其传播能力的提高,需结合基因对流感发病造成的理论感染人数数据等数据进行综合的评估才能得到更准确的结果。 3.选择典型的病毒株测试其对流感最有效药物是否出现耐受,间接证明病毒的基因变异是否有产生明显的抗原变异。发现基因变异并没有导致病毒出现抗原根本性的转变,以点突变和适应性变异为主要特点。 4.对禽类相关从业人员血清进行检测,探索某些其他宿主病毒感染人可能的途径和人群对流感的易感性情况。结果表明人群对其他宿主来源的流感病毒普遍易感,一般人群和接触人群中均存在H9亚型流感病毒HAI抗体,接触人群H9抗体阳性率是17.9%,普通人群也达到2.6%。接触人群感染H9的危险性是普通人群的3.392倍。此外两个人群的H3N2和H1N1的抗体滴度并没有差别。在大部分受调查人群都没有接种疫苗的情况下,但是抗体滴度都相对较高,特别是变异速度比较快的H3N2亚型,抗体阳性率都为30%左右。 5.探索甲型流感季节高峰分布和病毒主要基因变异间的关联情况,为流感的科学有效防治提供可靠的依据。甲型流感的基因变异在每个观察年的冬季出现一个明显的高峰,与监测病例每年2个高峰且冬春季高峰跨年不同,基因变异的高峰只有一个,且在流感监测病例的2个高峰间。结果表明,在一个相对稳定的环境中,病毒主要是在宿主的免疫压力驱动下产生适应性突变后造成一个新的流行。 综合上述结果,可以认为上海地区存在流感发病的季节性高峰,流感的基因变异在短期内主要以基因的点突变和适应性变异为主,并没有出现明显的表型改变从而导致产生耐药的情形。在人群对流感普遍易感,其人口构成、生活状态和免疫水平也基本保存稳定、气候条件也没有很大的变化的情况下,流感的季节性高峰主要是受到甲型流感病毒适应性变异的影响。
【学位授予单位】:复旦大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2010
【分类号】:R181.3

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【参考文献】
中国期刊全文数据库 前6条
1 梁庆,李景东,陈煜生,禤婉玲,宁晶娜,韦一,李康生;潮汕地区健康青年H9、H6、H5亚型甲型流感病毒血清抗体调查[J];汕头大学医学院学报;2003年02期
2 孙虹,马洪波,杨卫路,鲁恩洁,叶立青,陈琨,赖子平,王岩;禽类养殖场人员禽流感病毒抗体水平调查[J];中国公共卫生;2004年08期
3 李燕婷;张宏伟;任宏;陈健;王晔;;上海市流感样病例发病趋势的时间序列分析和预测模型研究[J];中华预防医学杂志;2007年06期
4 邓伟吾,李庆云,钟南山;流感季节磷酸奥司他韦治疗临床诊断的流感疑似患者的疗效与安全性研究[J];中华医学杂志;2004年24期
5 于康震,付朝阳,崔尚金,步志高,唐秀英;我国禽流感防制研究进展[J];中国兽医学报;2001年01期
6 张敬平,尤凤兴,董美华,钱燕华,吉杏生,缪小兰;无锡地区家禽接触人群与一般人群中甲型流感病毒H1、H3、H5、H7、H9抗体血清学调查[J];中国卫生检验杂志;2004年05期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 王朝霞;生物信息学:一门前沿交叉学科[J];安徽教育学院学报;2002年06期
2 张秀美,艾武,王莉莉,宋敏训,牟建青,徐苏云,杨奎,陈溥言;鸡传染性喉气管炎的诊断与病毒分离鉴定[J];山东农业科学;1997年06期
3 张艳,李京培,明亮,李文芳;银杏叶提取物的体外抗病毒作用[J];安徽中医临床杂志;2000年03期
4 张任娜;覃志初;帅领;刘晓燕;王豪举;;鸭瘟病毒的分离与鉴定[J];安徽农学通报;2007年20期
5 程钢;;生物信息学课程教学改革和实践[J];安徽农学通报(上半月刊);2011年13期
6 魏磊;高致病力禽流感流行新特点及预防控制对策[J];安徽农业科学;2004年02期
7 朱美霞,刘海清,张月永;应用RAPD-PCR分析棉花A基因组的起源与进化[J];安徽农业科学;2004年06期
8 张煜;苏建青;褚秀玲;成军;高丰;;水泡性口炎的发病机理与防制[J];安徽农业科学;2007年24期
9 温洪宇;韩宝平;周玉楼;吕爱军;杨柳;;嗜盐菌HBCC-3的培养特性及系统发育学分析[J];安徽农业科学;2008年14期
10 王晓波;解天然;潘陈陈;华宿南;;大豆质膜内在水孔蛋白的生物学功能预测[J];安徽农业科学;2010年34期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 栾德琴;常国斌;陈国宏;;隐性白鸡不同时期肌肉组织生长相关基因的表达谱分析[A];安全优质的家禽生产——第十五次全国家禽学术讨论会论文集[C];2011年
2 韩金乐;贾继宗;李川;杨亮;何德磊;李娟;叶祥忠;李益民;;肠道病毒71抗原ELISA定量检测方法构建及其应用[A];第五次全国免疫诊断暨疫苗学术研讨会论文汇编[C];2011年
3 薛梦林;;冬枣采后黑斑病拮抗菌的筛选与鉴定[A];微生物实用技术生态环境应用学术研讨会论文集[C];2008年
4 崔光照;曹祥红;张华;;基于小波变换的基因表达数据去噪聚类分析[A];第十二届全国信号处理学术年会(CCSP-2005)论文集[C];2005年
5 何源;冯燕;;重庆市2003年乙脑疫情血清学监测分析[A];重庆市预防医学会2005年学术交流会论文集[C];2005年
6 苏智慧;;大步甲虫亚科的平行进化和快速形态分化(英文)[A];生命科学与生物技术:中国科协第三届青年学术年会论文集[C];1998年
7 ;Species Discrimination of Four Crabs (Genus Scylla) by Mitochondrial COI Gene[A];经济发展方式转变与自主创新——第十二届中国科学技术协会年会(第三卷)[C];2010年
8 蔡旭;方伟武;;基于极大似然估计的分子序列修正Kimura双参数距离[A];中国运筹学会第七届学术交流会论文集(中卷)[C];2004年
9 黄祖星;陈抒豪;梁自勉;陈爱贞;刘洁群;王晓东;;佛山市人禽流感预警监测系统监测结果分析[A];第八届粤港澳台预防医学学术交流会议论文汇编[C];2008年
10 方美玉;任瑞文;刘建伟;;我国甲病毒的研究进展及其预防[A];新发和再发传染病防治热点研讨会论文集[C];2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 郑毅;利用酵母双杂交技术研究流感病毒NS2蛋白与宿主蛋白的相互作用[D];华中农业大学;2010年
2 胡佳;鲟形目部分种类基于线粒体COⅠ基因的分子进化研究[D];华中农业大学;2010年
3 陈卫卫;耐高温水稻资源高温诱导表达蛋白鉴定与分析[D];华中农业大学;2010年
4 卢士强;甲型H1N1流感病毒NS1蛋白在大肠杆菌中的表达、抗体制备及在血清学检测中的应用[D];南京医科大学;2009年
5 张艳萍;蛋白质序列的数学描述及其应用[D];浙江理工大学;2010年
6 张绍丽;河南省2008年手足口病病原体(EV71)分离株全基因组序列[D];郑州大学;2010年
7 于贺娟;肠道病毒71型荧光RT-PCR检测方法的建立及评价[D];郑州大学;2010年
8 李悦;中国莴苣属及其近缘属植物系统学关系的初步研究[D];郑州大学;2010年
9 王伟;微流控芯片技术对禽流感病毒的快速检测[D];山东农业大学;2010年
10 胡浩;兰科槽舌兰属DNA条形码研究及其系统发育分析[D];甘肃农业大学;2010年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 董时军,李军;全球几种主要传染病的流行及研究动态(2)[J];国外医学(流行病学传染病学分册);2001年02期
2 孔利群,高烨,蒋杰辰,李燕婷;上海市人群甲型流感病毒H1、H3、H5、H9抗体血清学监测[J];上海预防医学杂志;2003年01期
3 梁庆,李景东,陈煜生,禤婉玲,宁晶娜,韦一,李康生;潮汕地区健康青年H9、H6、H5亚型甲型流感病毒血清抗体调查[J];汕头大学医学院学报;2003年02期
4 辛朝安,杨佩琼;“2号药”对鸡禽流感的防治试验[J];养禽与禽病防治;1998年05期
5 吴家兵;叶临湘;尤尔科;;时间序列模型在传染病发病率预测中的应用[J];中国卫生统计;2006年03期
6 李来英,张小平;起伏型时间序列分析方法在流行性出血热预测中的应用[J];中国卫生统计;1997年03期
7 李海燕,辛晓光,田国斌,张晶,于康震;禽流感抗体斑点-ELISA诊断技术的研究[J];中国预防兽医学报;1999年05期
8 唐秀英,田国斌,于康震,冯菊艳;禽流感油乳剂灭活疫苗的研究[J];中国预防兽医学报;1999年06期
9 贾永清,陈化兰,邓国华,唐秀英,田国斌,于康震,刘保全;禽流感病毒分离株A/Goose/Guangdong/3/96(H5N1)HA基因序列分析[J];中国预防兽医学报;2000年01期
10 李海燕,于康震,辛晓光,邓国华;禽流感病毒重组核蛋白ELISA诊断技术的研究[J];中国预防兽医学报;2000年03期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 高维新;流感劫后忧思录[J];开卷有益.求医问药;1999年03期
2 马锐;流感病毒在四个肿瘤传代细胞系中增殖情况的比较[J];遵义医学院学报;2001年04期
3 常曼丽,李洪源,杨迎春,佟奎明,周昆;抗病毒1号中药有效部位体外对流感病毒A_3的抑制作用[J];哈尔滨医科大学学报;2002年03期
4 毛国强 ,马爽;今冬明春流感再来 未雨绸缪提早预防[J];质量天地;2002年10期
5 冀衡;活跃的甲型流感病毒[J];开卷有益.求医问药;2002年03期
6 戚凤春,王敏文,薄洪,郭桥,范宇红,王志刚,张玉辉,阎长太,盛军;去氧胆酸钠裂解流感病毒的效果研究[J];中国生物制品学杂志;2003年02期
7 王一凡;一次流行夺人性命最多的传染病——流感[J];知识就是力量;2003年06期
8 林江涛;流感——不容忽视的杀手[J];中老年保健;2003年11期
9 刘钊,杨占秋,肖红,文利,王征;清热消炎复方制剂抗流感病毒作用的研究[J];中国病毒学;2003年06期
10 颜淑芹,刘建华,舒适,王敏文,王志刚,赵晓青,张玉辉,袁延宝,盛军;流感病毒裂解过程中的形态变化规律[J];中国公共卫生;2004年07期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 George F.Gao;;猪与人H1N1亚型流感病毒遗传相关性研究[A];中国畜牧兽医学会兽医公共卫生学分会第二次学术研讨会论文集[C];2010年
2 曹颖莉;杨森;李英霞;陈虹;郭颖;;应用假病毒模型寻找H5N1高致病流感病毒侵入抑制剂[A];全国第十一届生化与分子药理学学术会议论文集[C];2009年
3 李金楠;刘超;王丽君;郭宇;陈卫强;杨诚;饶子和;;H5N1流感病毒聚合酶的天然抑制剂研究[A];中国化学会第28届学术年会第3分会场摘要集[C];2012年
4 晏文君;马志永;;流感病毒RNPs核输出机制研究[A];中国畜牧兽医学会兽医公共卫生学分会第二次学术研讨会论文集[C];2010年
5 王玉娟;杨婧;王嘉榕;毕允晨;王俊峰;;西班牙流感病毒膜蛋白PB1-F2的溶液结构研究[A];第十六届全国波谱学学术会议论文摘要集[C];2010年
6 鲁梦婷;孙莎莎;杜宏超;郭健;迟万怡;施尧;林德贵;;H3N2亚型流感病毒犬的病例分析[A];中国畜牧兽医学会2010年学术年会——第二届中国兽医临床大会论文集(上册)[C];2010年
7 侯韶毅;张民秀;卢桂娟;高永锐;刘芳;陆增荣;黄伟坚;;猪流感病毒分离及表面抗原基因序列分析[A];中国畜牧兽医学会兽医公共卫生学分会第二次学术研讨会论文集[C];2010年
8 李叶;廖明;辛朝安;;A型流感病毒对小鼠致病机制的研究进展[A];人畜共患传染病防治研究新成果汇编[C];2004年
9 王广美;丛彦龙;丁壮;常爽;张泉鹏;孙玉章;王晓莉;;类人猪H3N2流感病毒与禽H5流感重组——一个潜在的公共威胁[A];中国畜牧兽医学会兽医公共卫生学分会第二次学术研讨会论文集[C];2010年
10 李琳;张陆明;张誌;曹健荣;;人工RNA假病毒技术在甲型H1N1流感病毒(2009)RNA检测试剂盒中的应用研究[A];第五次全国免疫诊断暨疫苗学术研讨会论文汇编[C];2011年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 记者 何屹;流感病毒基因存在大量变异[N];科技日报;2005年
2 ;健康习惯比疫苗更能抵挡流感病毒[N];农村医药报(汉);2004年
3 张忠霞;美完成2000多种流感病毒基因组测序工作[N];医药经济报;2007年
4 刘英;我市采取措施积极防范[N];张家界日报;2009年
5 特约记者吴志军 通讯员郝成涛;病毒检测试剂形成配套体系[N];健康报;2009年
6 张忠霞;2000多种流感病毒基因组测序工作完成[N];人民日报;2007年
7 记者 陈芳 通讯员 贺黎;市疾控中心分离出3株A1型流感病毒[N];三峡日报;2006年
8 本报记者 刘霞;抱着“枪”睡大觉[N];科技日报;2009年
9 记者 冯海波 通讯员 刘慧婵 钟萱;三分钟便可筛查病毒[N];广东科技报;2009年
10 高原 黎藜 (记者 高原);美研究称人对甲流免疫力超出预想[N];新华每日电讯;2009年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 施强;上海地区人甲型流感病毒基因变异与季节性流行关系的研究[D];复旦大学;2010年
2 戴新宪;PI3K/Akt信号通路下游关键分子对甲型流感病毒增殖的影响[D];北京交通大学;2011年
3 汪照国;2005~2011年青岛地区流感病毒监测与分子流行病学研究[D];山东大学;2011年
4 刘洪波;流感病毒核酸测定分析前变量和生物危害暴露风险评估[D];华中科技大学;2012年
5 万玉立;甲型流感病毒感染A549细胞的表达谱分析及相关基因功能研究[D];北京协和医学院;2009年
6 范克伟;Itk信号转导通路在A型流感病毒与T细胞相互作用中的功能研究[D];福建农林大学;2012年
7 刘瑜;新型流感病毒神经氨酸酶抑制剂的设计、合成与初步活性研究[D];山东大学;2011年
8 王晓杜;猪流感病毒感染细胞内p53活性变化机制解析[D];中国农业科学院;2010年
9 李青;流感病毒神经氨酸酶的结构、耐药及新型抑制剂作用的机制研究[D];中国科学技术大学;2012年
10 冯强;H9N2亚型流感病毒HA基因变异分析及对鸡免疫机能的影响[D];山东农业大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 王海静;应用SPR生物传感器快速检测A型流感病毒研究[D];河北师范大学;2010年
2 高蕾;中国部分地区猪血清对甲型H1N1流感病毒的交叉免疫研究分析[D];山东农业大学;2011年
3 田石华;重配制备B型流感病毒Vero细胞适应毒株及无血清微载体培养流感病毒的研究[D];中国协和医科大学;2010年
4 郭莹莹;A型流感病毒NS1抑制剂的计算机辅助设计[D];中国农业科学院;2010年
5 展光建;犬H5N2流感病毒的分离鉴定及其分子生物学特征研究[D];山东农业大学;2011年
6 吴昊;抗菌肽及纳米二氧化钛喷液对甲型H1N1流感病毒抑制作用研究[D];吉林大学;2011年
7 孟静;甲型H1N1流感病毒毒株的分子特征及功能分析预测[D];山东大学;2010年
8 向冬喜;纳米银抗流感病毒(H3N2)作用及机制研究[D];大连大学;2011年
9 闫朝武;华南地区小种群禽类中H9N2亚型流感病毒特性研究[D];汕头大学;2003年
10 李鑫;调控流感病毒基因片段的人编码miRNA的发现算法研究[D];吉林大学;2011年
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