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《同济大学》 2006年
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基因芯片检测肺栓塞—深静脉血栓形成相关基因群的研究

程克斌  
【摘要】: 背景肺栓塞(Pulmonary embolism,PE)是临床常见病,严重威胁着患者的健康和生命。肺栓塞和深静脉血栓形成(Deep Venous thrombosis,DVT)是一种疾病的两个不同阶段,它是由于遗传和/或环境异常造成的多基因、多因素疾病。现己证实人体中存在着大量的基因突变、基因多态性、基因的差异表达与之有关。 目的应用基因芯片技术研究PE患者和正常对照者的基因表达谱,分析PE相关基因,探讨PE发生的分子遗传学机制。 方法收集9例PE患者和33例正常对照的新鲜血样,抽提、纯化血样总RNA。分别合成9个Cy3标记的PE患者cRNA探针和1个Cy5标记的标准对照探针,标准对照探针为所有正常对照者血样混合cRNA组成。将9个PE患者Cy3-cRNA探针和1个标准对照Cy5-cRNA探针分别与44K Agilent人全基因组oligo芯片杂交。杂交后进行图像扫描和数据分析,得到两者间差异表达信息。并使用FQ-PCR对芯片实验结果进行验证。 结果9张芯片共筛选出共同差异表达基因434条。在Genebank登录的有345条,其中表达上调基因286条,表达下调基因59条。这些基因涉及血液凝固相关基因、免疫炎症相关基因、细胞分化凋亡相关基因、细胞生长维持相关基因、细胞信号和传递类相关基因、细胞骨架和运动基因、离子通道和运输蛋白类基因、转录相关基因、RNA/DNA结合相关基因等。选取其中11条基因进行FQ-PCR扩增,结果证实所选基因在PE中均有差异表达,且与基因芯片的表达情况一致。 结论表达谱基因芯片是筛选PE相关基因群的一种有效方法;FQ-PCR验证结果显示芯片筛查基因表达异常是可靠的;机体凝血系统和纤溶系统平衡破坏、凝血功能亢进是PE的主要发病机制;炎症、细胞分化/凋亡、代谢紊乱可能也参与了PE的发病过程。
【学位授予单位】:同济大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2006
【分类号】:R450

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【引证文献】
中国博士学位论文全文数据库 前1条
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【参考文献】
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【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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中国博士学位论文全文数据库 前10条
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中国硕士学位论文全文数据库 前10条
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【同被引文献】
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【相似文献】
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