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《苏州大学》 2017年
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基于网络结构分析脓毒血症诊断标志物的特征和功能

乔思雨  
【摘要】:脓毒血症发病迅速,死亡率高,致病机理的复杂性和临床表现的差异性导致其早期诊断十分困难。因此,脓毒血症诊断标志物的特征和功能研究具有重要意义。本研究将研究对象分为成人和新生儿两类,分别收集相应的诊断标志物。寻找脓毒血症患者和健康者的基因表达数据,进行差异表达分析。整合基因表达数据与蛋白质相互作用网络构建成人和新生儿脓毒血症特异性网络。分析诊断标志物与差异表达基因的位置关系,探究诊断标志物的网络拓扑结构特征。通过GO分析、IPA疾病与生物功能注释、通路富集分析、生物功能分类等方法,研究诊断标志物的生物功能。本研究找到46个成人和45个新生儿诊断标志物,其中多为细胞因子/趋化因子。成人和新生儿有13个共同的诊断标志物。27%的成人和54%的新生儿诊断标志物在脓毒血症中差异表达(p-value0.05)。在脓毒血症特异性网络中,52%的成人和53%新生儿诊断标志物位于差异表达基因的一阶“邻居”上,成人诊断标志物显著分布于连通度仅次于Hub点的“次中心”和紧密度低的位置(p-value0.05),新生儿诊断标志物显著分布于连通度仅次于Hub点的“次中心”、紧密度低和脆弱性低的位置(pvalue0.05)。根据文献分析,成人和新生儿诊断标志物富集到的KEGG和IPA通路与脓毒血症相关,相关差异有待进一步深入研究。本研究在网络层面,系统研究了成人和新生儿脓毒血症诊断标志物的特征和生物功能,以期为成人和新生儿脓毒血症诊断标志物的寻找与临床转化提供帮助,具有一定的理论价值和实践意义。
【学位授予单位】:苏州大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2017
【分类号】:R459.7

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