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《苏州大学》 2005年
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暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)线粒体DNA的分离纯化及其几个重要基因的克隆与序列分析

邵爱华  
【摘要】:线粒体DNA(mtDNA)是分子生物学研究的一个热门领域,已成为鱼类进化生物学和群体遗传学研究的重要遗传标志,mtDNA 分析技术在国外已被遗传学家用于鱼类种群遗传结构及品系鉴定的研究。暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)是具有极高经济价值的特种水产养殖对象,有关暗纹东方鲀mtDNA 的研究迄今未见报道。 本论文在改进鱼类mtDNA 分离纯化方法的基础上,利用JGB(Janus Green B)能特异地对线粒体进行超活染色的特性来跟踪线粒体的提取,研究离心速度与线粒体回收率的关系。同时对常用的方法和技术进行了探索和改进,利用暗纹东方鲀组织较少取样,获取纯度好、得率高的mtDNA。 利用分离纯化的暗纹东方鲀肝脏mtDNA 为模板,按照红鳍东方鲀(Takifugu rubripes ) mtDNA 序列设计合成特异引物进行PCR 扩增,首次克隆并测定了暗纹东方鲀mtDNA 的Cytb、COI 、COII、COIII、D-loop 基因及其侧翼的tRNA 基因。上述基因已在GenBank 登录。 运用DNA 分析软件,对暗纹东方鲀mtDNA 测定的基因进行序列和结构分析,并选取GenBank 中十多个目近20 种鱼类的相应序列进行比较分析,结果显示暗纹东方鲀与这些鱼类具有较高的核苷酸和氨基酸同源性。利用分子生物学相关软件,对暗纹东方鲀与其他种类鱼的相关基因序列建立进化树,并与传统的分类地位进行比较,结果表明与传统的分类地位基本吻合。我们认为,对于鱼类,在采用线粒体基因序列进行分子进化分析时,应该综合考虑其繁殖模式及生态特点,将分子与形态、生态行为等多方面的证据结合起来,对生物多样性作出更客观的描述和解释。暗纹东方鲀线粒体的几个编码基因可能成为东方鲀属不同种间聚类分析与分子系统进化学研究的合适基因。 推定的8 个tRNA 的二级结构表明:它们都具有典型的三叶草型结构,各臂的碱基配对率大多较高,稳定性较好。
【学位授予单位】:苏州大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2005
【分类号】:S917.4

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【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 曾青兰,刘焕章;大口胭脂鱼线粒体DNA控制区序列的研究[J];湖北大学学报(自然科学版);2001年03期
2 柳淑芳,杜立新;基因图谱的构建及其在动物遗传育种中的应用[J];黄牛杂志;2000年01期
3 成庆泰,王存信,田明诚,李春生,王玉纲,王奇;中国东方鲀属鱼类分类研究[J];动物学报;1975年04期
4 廖顺尧,刘运强,鲁成,周泽扬,向仲怀;家蚕线粒体ND2、COⅠ和若干tRNA基因的克隆及序列分析[J];动物学报;2002年03期
5 沈兴家,赵巧玲,张志芳,李奕仁,何家禄,韦波;蓖麻蚕线粒体基因组中nd1及其侧翼tRNA基因的克隆与结构分析[J];蚕业科学;2002年04期
6 陈复生,魏兆军,李庆宝,鲍先巡,汪泰初;蓖麻蚕线粒体cox2基因的克隆、序列测定和分子系统学分析[J];蚕业科学;2004年01期
7 刘运强,廖顺尧,鲁成,周泽扬;家蚕(Bombyx mori)线粒体DNA的经济快速提取方法[J];蚕学通讯;2000年03期
8 鲍蕾,牛翠娟,马蕊,李庆芬;四种臂尾轮虫线粒体COⅠ基因部分序列及系统发育关系[J];动物学研究;2003年03期
9 张亚平,施立明;动物线粒体DNA多态性的研究概况[J];动物学研究;1992年03期
10 戴纪刚,吴宇格,魏泓,肖颖彬;一种简单快速制备动物线粒体DNA的方法[J];第三军医大学学报;2000年04期
【共引文献】
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1 陈复生,付承玉,汪泰初;动物线粒体基因分子系统学研究进展[J];安徽农业科学;2003年04期
2 兰宏,施立明;四种犬科(Canidae)动物线粒体DNA分子进化[J];动物学报;1996年01期
3 邱高峰,徐巧婷,王丽卿,范浄,陈雪菁;四种绒螯蟹分子分类与系统发育[J];动物学报;2001年06期
4 王宏伟,王安利,王维娜,王军霞;鱼类同工酶研究进展[J];动物学报;2001年S1期
5 朱世华;杨迎春;沈锡权;邹记兴;郑文娟;余红卫;黄勃;;从细胞色素b基因序列探讨笛鲷属的分子系统发生关系[J];动物学报;2006年03期
6 项贤领;席贻龙;胡好远;;基于rDNAITS 1序列探讨臂尾轮属轮虫的系统发生关系(英文)[J];动物学报;2006年06期
7 龚大洁,周开亚;DNA分子系统学在爬行动物中的应用[J];动物学杂志;2000年04期
8 李馨,杨隽;三江白猪线粒体DNA的多态性[J];动物学杂志;2003年05期
9 胡文革,段子渊,王金富,盛金良;新疆3种雅罗鱼线粒体DNA细胞色素b序列的差异与系统进化[J];动物学杂志;2005年03期
10 邵爱华;朱江;陈葵;史全良;李新平;沈颂东;;暗纹东方鲀线粒体COⅡ及两侧tRNA基因的克隆和序列分析[J];动物学杂志;2005年06期
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1 郭昱嵩;王中铎;刘楚吾;陈志明;刘筠;;勒氏笛鲷(Lutjanus russellii)线粒体DNA全序列的测定与分析[A];中国海洋学会2007年学术年会论文集(下册)[C];2007年
2 魏兆军;赵巧玲;张志芳;肖庆利;王章娥;何家禄;;蓖麻蚕线粒体基因组EcoRI-XbaI3.0kb片段的克隆及序列分析[A];中国蚕学会第三届青年学术研讨会暨浙江省第二届青年学术论坛——蚕桑分论坛论文集(上册)[C];2001年
3 孔晓瑜;刘亚军;喻子牛;宋林生;;栉孔扇贝和海湾扇贝线粒体16S rRNA基因片段的比较研究[A];贝类学论文集(第Ⅸ辑)[C];1999年
4 杨宝田;;东北区狍的遗传多样性研究[A];中国生态学会2006学术年会论文荟萃[C];2006年
5 王继文;;鹅分子系统进化研究进展[A];家禽研究最新进展——第十一次全国家禽学术讨论会论文集[C];2003年
6 王德成;高洪;范泉水;;喹乙醇致线粒体DNA基因损伤的的SSCP检测[A];中国畜牧兽医学会兽医病理学分会第十四次学术研讨会、中国病理生理学会动物病理生理专业委员会第十三次学术研讨会论文集[C];2006年
7 董捷;孙丽萍;王瑞武;;不同地区中华蜜蜂线粒体DNA多态性的研究[A];第五届生物多样性保护与利用高新科学技术国际研讨会暨昆虫保护、利用与产业化国际研讨会论文集[C];2005年
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1 刘晓梅;氯化镉诱导SMMC-7721细胞线粒体损伤及细胞凋亡的实验研究[D];吉林大学;2007年
2 魏朝明;中国螽(虫斯)总科昆虫的RAPD分析研究[D];陕西师范大学;2000年
3 蒋国芳;蚱总科昆虫线粒体细胞色素b基因序列及系统进化研究[D];陕西师范大学;2000年
4 徐成;牙鲆雌核发育分析鉴定与性别决定机制研究[D];中国科学院海洋研究所;2000年
5 潘庆杰;五龙鹅经济性状的标记及其分子系统发育关系的研究[D];东北农业大学;2001年
6 杨晓军;藏系绵羊遗传多样性及其品种(系)分化的研究[D];甘肃农业大学;2001年
7 尤锋;牙鲆群体遗传多样性及鲽形目鱼类分子系统学初步研究[D];中国科学院海洋研究所;2001年
8 徐艳春;虎(Panthera tigris)微卫星位点多态性及其在圈养种群管理中的应用[D];东北林业大学;2001年
9 白素英;豹猫(Felis bengalensis)的遗传多样性及系统发育研究[D];东北林业大学;2001年
10 龙继蓉;中国家兔遗传多样性研究[D];四川农业大学;2001年
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1 张勇;阿尔金山野生双峰驼和新疆北鲵的分子演化分析[D];浙江大学;2007年
2 周慧;藏羚羊的保护遗传学研究[D];湖南农业大学;2005年
3 刘强;从线粒体细胞色素b基因和D-LOOP控制区序列差异研究野牦牛和家牦牛的系统进化关系[D];浙江大学;2005年
4 陈志娟;卤虫Hox基因家族abdA基因与Dfd基因序列差异及其系统进化关系的研究[D];辽宁师范大学;2005年
5 邓雯;河南大尾寒羊的生物学特性研究[D];南京农业大学;2005年
6 刘玲玲;蓖麻蚕和天蚕线粒体DNA部分序列的测定和系统发生研究[D];西南农业大学;2005年
7 马勇华;达赉湖鲶鱼的种质特征研究[D];内蒙古农业大学;2005年
8 陈茹冰;中国斑腿蝗科部分种类线粒体ND2基因及其相邻tRNAs基因的分子进化与系统学研究[D];陕西师范大学;2005年
9 杨华;控制绵羊毛囊发育相关基因的筛选[D];石河子大学;2005年
10 田首元;丙泊酚对外源性Ca~(2+)致鼠心肌线粒体损伤的保护作用[D];山西医科大学;2005年
【同被引文献】
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1 龚金波;苏天凤;夏军红;龚世园;江世贵;;中国近海黑鲷线粒体DNA控制区序列多态性分析[J];南方水产;2006年04期
2 汪桂玲;袁一鸣;李家乐;;中国五大湖三角帆蚌群体遗传多样性及亲缘关系的SSR分析[J];水产学报;2007年02期
3 周慧;李迪强;张于光;易湘蓉;刘毅;;藏羚羊mtDNA D-loop区遗传多样性研究[J];遗传;2006年03期
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1 陈锐;失血性休克大鼠心肌和肠上皮线粒体呼吸链ND1、ND2编码基因表达改变的初步研究[D];第三军医大学;2003年
【二级参考文献】
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1 陈复生,付承玉,汪泰初;动物线粒体基因分子系统学研究进展[J];安徽农业科学;2003年04期
2 成庆泰,王存信,田明诚,李春生,王玉纲,王奇;中国东方鲀属鱼类分类研究[J];动物学报;1975年04期
3 刘如笋,钦俊德;鸭属中几种鸭卵蛋白质的比较——对北京鸭起源的探讨[J];动物学报;1979年03期
4 武云飞,谭齐佳;青藏高原鱼类区系特征及其形成的地史原因分析[J];动物学报;1991年02期
5 张四明,吴清江,张亚平;从线粒体DNA控制区核苷酸序列论达式鲟、亚洲和北美洲中吻鲟的分类地位(英文)[J];动物学报;2001年06期
6 廖顺尧,刘运强,鲁成,周泽扬,向仲怀;家蚕线粒体ND2、COⅠ和若干tRNA基因的克隆及序列分析[J];动物学报;2002年03期
7 汪永庆,王新国,徐来祥,张知彬;一种动物基因组DNA提取方法的改进[J];动物学杂志;2001年01期
8 沈兴家,赵巧玲,张志芳,李奕仁,何家禄;家蚕蛹线粒体DNA EcoRⅠ 1.9kb片段的克隆及序列分析[J];蚕业科学;2000年02期
9 沈兴家,赵巧玲,张志芳,李奕仁,何家禄;家蚕线粒体基因组EcoRⅠ2.0kb片段的克隆及序列分析[J];蚕业科学;2000年04期
10 廖顺尧,刘运强,鲁成,周泽扬,向仲怀;家蚕线粒体基因组1.8kb片段的克隆及序列分析[J];蚕业科学;2002年01期
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1 戴伟,王晓梅,杨华;线粒体DNA在动物分子系统学研究中的应用[J];天津农学院学报;2005年02期
2 王存芳,曾勇庆,杜立新,高秀华;线粒体DNA(m tDNA)的研究进展[J];动物科学与动物医学;2001年01期
3 李菁菁,彭统序,温硕洋,谢以权;褐家鼠线粒体DNA遗传多态性的研究[J];动物学研究;1999年04期
4 罗静,张亚平,朱春玲,肖武汉;鲫鱼遗传多样性的初步研究[J];遗传学报;1999年01期
5 许生成,李太平,李均祥,赵凯,朱世海;青海湖裸鲤线粒体DNA多态性研究[J];黑龙江畜牧兽医;2003年01期
6 夏玉玲,张春霖,鲁成;不同处理对动物线粒体DNA提取的影响[J];蚕学通讯;2003年01期
7 张战凤;张鲁刚;王绮;张明科;惠麦侠;;大白菜线粒体DNA有效、快速提取方法[J];生物技术;2006年03期
8 张战凤;张鲁刚;王绮;惠麦侠;张明科;;大白菜胞质雄性不育系育性相关线粒体DNA片断的克隆及*序列分析[J];西北农业学报;2006年03期
9 邓晓辉;邱正明;聂启军;朱凤娟;;红菜薹胞质雄性不育系线粒体DNA的RAPD分析[J];湖北农业科学;2008年11期
10 舒友菊;王贵学;郑家奎;蔡平钟;张志勇;;K型和冈型水稻线粒体DNA的AFLP分析[J];重庆大学学报(自然科学版);2007年12期
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1 唐霄雯;杨爱芬;吕建新;李智渊;朱翌;管敏鑫;;1642例中国汉族非综合征性耳聋和氨基糖甙类药物性耳聋患者线粒体12S rRNA基因的突变频谱分析和分子流行病学调查[A];第八次全国医学遗传学学术会议(中华医学会2009年医学遗传学年会)论文摘要汇编[C];2009年
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6 张大治;蜻蜓目差翅亚目部分种类线粒体Cyt b基因序列及分子系统学研究[D];陕西师范大学;2005年
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8 周维;人、猪鞭虫核糖体DNA及线粒体DNA遗传多样性的研究[D];福建农林大学;2008年
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