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《南京林业大学》 2007年
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柽柳SSR标记开发及群体遗传结构分析

李锐  
【摘要】: 本文采用微卫星(EST-SSR)分子标记技术,研究了6个柽柳(Tamarix chinensis)群体的遗传多样性,揭示其群体遗传结构,并在遗传多样性研究的基础上,探讨柽柳种质资源的保存方法。主要结果如下: 从来源于柽柳科的22713条EST序列中,检索出包含SSR的EST序列546条。其中含二核苷酸重复单元和三核苷酸重复单元的SSR-ESTs分别为(30.9%)和(31.6%)。共合成75条设计引物用于柽柳的扩增,结果40对引物得到清晰的扩增条带,其中17对引物表现明显的多态性。为柽柳的遗传学研究提供一些高效的分子标记。 17对SSR引物在6个群体中共扩增出的等位基因(A)平均有7.1765个,有效等位基因数(Ne)平均为4.7267个,平均期望杂合度(He)为0.4713, Nei多样性指数(h)为0.4560,Shannon多样性指数(I)平均为1.7760。6个群体遗传多样性高低顺序为:山东昌邑群体山东河口群体山东利津群体山东垦利群体内蒙达茂群体辽宁盘锦群体。6个群体中,前5个群体遗传多样性差别不大,只有辽宁双台群体明显较低,这可能是由于该群体为当地起源的人工林有关。 6个群体的变异主要存在于群体内,仅有8.04%的变异(Fst=0.0804)存在于群体间,而GST平均为0.0539,群体的遗传分化水平在林木中属中等水平。研究发现了一些特异的等位基因仅在某一个群体中出现,在某种程度反映了群体间的分化;其中引物Estssr-15等位基因丰富,一对引物就能分别将内蒙达茂群体和辽宁双台群体与起源山东的群体区分开来。 群体平均观察杂合度(Ho)为0.5364,明显高于期望杂合度(He =0.4835),表明群体中杂合子过量,经检验显著显著偏离Hardy-Weinberg平衡,这可能与采样时选择表型优良的单株有一定关系。 针对遗传变异主要存在于群体内,群体间差异与地理距离呈正相关的特点,在进行遗传多样性保护时,应充分重视对于大群体内不同类型个体的保存,重点要放在自然分布中心地区的群体。同时随着地理距离的增大,应在不同区域收集资源进行异地保存。在利用方面,一方面充分利用种内变异,同时应通过种间杂交等方式创造变异加以利用。
【学位授予单位】:南京林业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2007
【分类号】:S793.5

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【引证文献】
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【参考文献】
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【共引文献】
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10 董健;尤文忠;陆爱君;吴锈钢;赵杰;;胡枝子种—种源苗期生长和越冬的初步分析[A];北方省区《灌木暨山杏选育、栽培及开发利用》研讨会论文集[C];2004年
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1 李秀霞;榛子杂交后代的遗传分析与良种选育研究[D];哈尔滨师范大学;2010年
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5 张忠华;喀斯特森林植被种群生态学与群落稳定性分析[D];华东师范大学;2011年
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10 刘宾;小麦主要农艺性状的条件和非条件QTL定位[D];山东农业大学;2011年
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1 刘冉冉;枫香遗传转化体系的优化及转化PaFT基因的研究[D];华中农业大学;2010年
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3 高伟;四倍体棉种的遗传多样性分析[D];华中农业大学;2010年
4 黎兰献;芸薹属主要蔬菜遗传特异性和多样性的快速鉴定[D];华中农业大学;2010年
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10 王庆专;小麦骨干亲本碧蚂4号及其姊妹系遗传差异分析[D];山东农业大学;2010年
【同被引文献】
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2 黄磊;唐光绪;田东;何庆元;;新型分子标记的开发和利用[J];安徽农学通报(上半月刊);2010年23期
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6 易琼;殷海滨;龚丽琼;陈丽梅;舒群;李昆志;;8个云南主要栽培梨品种亲缘关系的ISSR分析[J];安徽农业科学;2009年02期
7 吴晓刚;李文远;张昱;;毛樱桃作砧木嫁接大樱桃初探[J];安徽农业科学;2009年08期
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【二级引证文献】
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9 张飞;BMY牛、婆罗门牛及云南黄牛的群体遗传结构及生长发育性状的分子标记研究[D];西北农林科技大学;2007年
10 路心平;青蟹属的系统进化及中国沿海拟穴青蟹的群体遗传结构研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2008年
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