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《南京林业大学》 2008年
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杉木木材形成过程中差异表达基因的鉴定与功能分析

王桂凤  
【摘要】: 木材是自然界最为重要的可再生能源,是化石燃料的潜在替代品。同时还具有重要的生态价值,它是大气碳元素长期的沉淀池,是实现生物圈各种物质循环的关键环节。木材是需求快速增长的全球性的重要工业原材料。它是林木的主要产品。正因为木本植物重要的经济和生态价值,植物学家已经开始致力于该方面的研究。木材形成是一个关键的发育过程,具有重要的科学研究意义与应用价值。它起源于一个高度特化的组织——维管形成层,包括以下5个步骤:细胞分裂、细胞增大、细胞壁加厚、木质化及细胞程序性死亡。 随着各种新的基因组技术在林木研究中的应用,以及模式植物中不断完善的进化上保守的机制,对木材形成的分子和遗传调控机理已有了较广泛的认识。但是,这仍然是十分有限的。大部分关于木材形成的研究进展是对形成木材的组织进行EST测序分析、蛋白质组学分析以及芯片分析。 一杉木木材形成差异表达基因文库的构建和分析 为了获得杉木木材形成过程中特异表达基因,本研究利用抑制差减杂交技术,以杉木突变体独干杉无性系为测试方(Tester),正常的句容0号无性系为驱动方(Driver),构建了正向差减文库;以杉木突变体独干杉无性系为驱动方(Driver),正常的句容0号无性系为测试方(Tester),构建了反向差减文库。利用macroarray技术,以正向差减、反向差减及未差减的测试方(Tester)、驱动方(Driver)四种探针,进一步筛选了差异表达克隆,从正、反向文库中分别获得了618和409个克隆。 序列测定及分析后,共获得405个uniESTs。其中40%的与已知蛋白具有显著同源性,可分为4个主要类别:新陈代谢、细胞生成和结构重构、信号传导和胁迫。定量PCR对选择的11个参与木材形成的ESTs进一步的验证,结果与macroarray数据一致。本研究系统分析了参与杉木木材形成的基因,对了解木质部分化的分子机制具有重要意义,也是了解木材形成遗传控制的直接信息来源,为改良材性和纤维性质提供了潜在候选基因。 二细胞壁扩展相关基因的克隆和功能分析 细胞壁蛋白在调控细胞壁延展性中起重要作用,而细胞壁的延展性是决定细胞扩展的关键因子。在这些壁蛋白中扩展蛋白(expansins)最为独特,它在一定的pH值下无需任何激活蛋白就能诱导体外细胞壁的伸长和体内细胞的扩展。 以杉木木材形成的特异表达基因文库中获得的扩展蛋白ESTs序列为基础,通过RLM-RACE技术成功克隆到3条全长扩展蛋白基因。其中ClEXP1 cDNA全长1033bp,包括247个氨基酸的开放阅读框(ORF)区;ClEXP2 cDNA全长1374bp,包括268个氨基酸的开放阅读框(ORF)区; ClELP1 cDNA全长1023bp,包括272个氨基酸的开放阅读框。在GenBank中的登录号分别为:EF102108、EF158813和EF192940。进化树重建结果表明,ClEXP1和ClEXP2属于α-expansi(nEXPA);ClELP1属于γ-expansi(nEXLA)。内含子—外显子结构分析发现:ClEXP1与拟南芥α-expansins(EXPA)相似,含有内含子A和B;ClEXP2含有3个内含子(A、C和F),与拟南芥β-expansins(EXPB)更类似。 实时定量PCR显示,ClEXP1和ClEXP2具有较为相同的表达模式,在形成层区域表达最高,在针叶及茎尖中度表达,成熟木质部表达较低,而根和花粉中几乎不表达;ClELP1在形成层及针叶中均有较高的表达,在木质部及茎尖中度表达,花粉中表达较低,而根中几乎检测不到。该组基因的成功克隆,将为系统研究扩展蛋白在木材形成过程中的表达情况、功能及调控机制奠定基础。 时空表达模式表明ClEXP1和ClEXP2均在木材形成的组织形成层区域特异性表达。为了研究expansins基因在次生生长中的功能,以期获得其在木材形成过程中作用机制的生物学证据,实验在克隆了杉木木材形成组织特异表达ClEXP1和ClEXP2的基础上,利用转基因技术在烟草中分别过量表达这2个基因。35S::ClEXP1和35S::ClEXP2转基因烟草均呈现多效的(pleiotropic)表型:花形、花色及蒴果均有不同程度的变化;叶片变大、且比野生型至少多2片;节间伸长;高生长和粗生长显著增加。与野生型烟草植株相比,35S::ClEXP1和35S::ClEXP2转基因植株的纤维素含量分别增加约50%和30%。扫描电镜分析发现:髓薄壁细胞显著增大;木质部及韧皮部细胞壁局部有所加厚。 总结,ClEXP1和ClEXP2作为α-expansin(EXPA)基因家族的成员可能存在功能部分冗余现象;ClEXP1属于C亚组,可能主要参与初生生长;ClEXP2的特征序列显示其为木材形成特异表达基因,可能主要参与次生生长;ClEXP1和ClEXP2可能通过细胞壁局部加厚的方式,直接或间接参与纤维素的合成或沉积;但二者作用方式或位置可能不同,ClEXP1可能比ClEXP2的作用强。
【学位授予单位】:南京林业大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2008
【分类号】:S791.27

【引证文献】
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【参考文献】
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9 安丽华;尤瑞麟;;一种用于DAPI染色的方法——Steedman's wax包埋切片法[A];2004年北方七省市植物学年会论文集[C];2004年
10 赵冰;沈学静;;飞行时间质谱分析技术的发展[A];第三届科学仪器前沿技术及应用学术研讨会论文集(一)[C];2006年
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9 赵美荣;扩展蛋白与植物激素调节的干旱胁迫下小麦细胞生长的关系研究[D];山东农业大学;2011年
10 王杉;计算模拟解析P450单加氧酶结构功能和植物细胞壁合成相关基因识别[D];吉林大学;2011年
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【同被引文献】
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【二级引证文献】
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10 杨宇飞;邬冬华;;中药抗癌症恶病变基因芯片研究[A];2002中医药博士论坛——中医药的继承、创新与发展[C];2002年
中国重要报纸全文数据库 前10条
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4 林峥嵘;订单订到两年后[N];闽北日报;2006年
5 本报记者 赵欢;宋怡先:辛勤劳动才能创造财富[N];团结报;2008年
6 徐世芬 林茂;缓解杉木连茬“僵苗”有良方[N];湖北科技报;2000年
7 本报记者 林侃徐树才 通讯员 林峥嵘;山角落,他们引领“杉木之乡”崛起[N];福建日报;2008年
8 记者 曾宇;李稳石到杉木村指导扶贫工作[N];益阳日报;2006年
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10 梁仰贞;杉木更新——萌条加栽苗[N];江苏科技报;2000年
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7 赵建;α-amanitin的分离鉴定及其致病机理研究[D];四川大学;2004年
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中国硕士学位论文全文数据库 前10条
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5 吴扬;应用cDNA-AFLP技术分离安吉白茶阶段性返白过程的差异表达基因[D];湖南农业大学;2010年
6 谢文娟;泡球蚴感染小鼠肝脏基因表达谱的分析[D];新疆大学;2010年
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8 林凯;正加速度(+Gz)重复暴露致大鼠脑损伤差异表达基因的筛选[D];第三军医大学;2002年
9 王玉鹏;基于基因芯片的基因表达模式分析[D];厦门大学;2007年
10 王宇;大鼠脊髓损伤与修复相关基因:生物信息学分析及SCIRR10分子特性[D];吉林大学;2005年
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