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《南京师范大学》 2006年
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江豚MHC-DQB座位第二外元序列变异分析

孙鹏  
【摘要】:本文分析了195头江豚(Neophocaena phocaenoides)的主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)基因DQB座位第二外元的序列变异,其中包括部分假定的肽段结合区域(peptide-binding region,PBR)。所分析的江豚样品来自于中国水域的三个种群,即长江种群、黄海种群和南海种群。目的DNA经聚合酶链式反应扩增,扩增产物进行SSCP(single-stranded conformation polymorphism)分型然后克隆测序。共从200个克隆中获得了长度为172bp的目的基因序列。在这些序列中发现了19个可变位点,定义了11个等位基因。在所有序列中都没有发现序列的插入、缺失或终止密码子,猜测这些序列在体内是具有功能的基因片段。经过等位基因碱基对间的比较发现其中非同义替换和同义替换的比值(d_N/d_S)为4.101:1,替换导致了16个氨基酸的改变,其中有8个存在于假定的肽段结合位点,通常情况下,d_N/d_S的比值是小于1的,较多的氨基酸替换对生物体可能是致死的,而在假定的肽段结合位点,这种氨基酸的替换可以导致其结合的肽段的不同,从而产生肽段结合的多样性,使其应答于多种多肽序列,因此非同义替换远大于同义替换暗示江豚DQB座位在细胞内免疫识别中具有重要的作用。与其它海洋哺乳动物相比,本研究发现江豚的MHC-DQB座位中存在较高的序列多样性,可能与长江江豚生活在病原微生物更多样化的淡水环境中,从而面临着较高的平衡选择压力有关。 不同的生物,甚至在进化上相距甚远的生物,如果生活在条件相同的环境中,在同样选择压的作用下,有可能产生功能相同或十分相似的形态结构和生理适应,以适应相同的条件。此种现象称为趋同进化(convergent evolution)。
【学位授予单位】:南京师范大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2006
【分类号】:Q953

【引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 张婷;辽东湾斑海豹MHC-DQB基因的遗传多样性分析[D];山东大学;2010年
【参考文献】
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【同被引文献】
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【二级参考文献】
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4 本版编辑 记者 艾拜·司马义 牛欣民 杨明剑;我区加快地方性艾滋病病毒序列变异研究进程[N];新疆科技报(汉);2007年
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