收藏本站
《浙江大学》 2012年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

基于线粒体控制区探讨红腹锦鸡种群进化历史

吴少英  
【摘要】:红腹锦鸡(Chrysolophus pictus),又名金鸡,我国特有物种,国家二级保护动物。利用线粒体DNA分子标记研究红腹锦鸡种内及种间的群体遗传结构和系统发生关系,将对该物种的有效保护起到重要作用。本研究以线粒体DNA控制区的448bp高变区序列为分子标记,利用PCR和直接测序方法,采用序列分析技术,对红腹锦鸡的12个种群的212个个体进行了实验,探讨各群体间与个体间的遗传变异、系统发育及种群进化关系和种群历史动态,研究结果如下: 1)所分析的序列有57个变异位点(12.93%),其中单可变位点15个,简约信息位点42个,有插入和缺失现象。57个变异位点定义了38种单倍型,出现频率最高的为单倍型H2(73/212),并存在于11个种群中。单倍型多样性和核苷酸多样性水平均较高,分别为0.907和9.115%。陕西秦岭个体的单倍型多样性和核苷酸多样性水平在12个种群中是相对最高的,其单倍型种类也最丰富,由此推断,秦岭种群是较为原始的种群。 2)根据种群不同群体划分模式下的分子变异分析,结合遗传距离的远近,将本研究的12个种群分为3大群体是比较合理的,令为QL群体、中部地区群体和SC群体。 3) NETWORK图显示单倍型并没有依采样地区域形成各自的分支(clade), QL种群的单倍型遍布整个网络图。以单倍型H2作为中心向其他单倍型发散,推断H2是这些单倍型的历史基因流,视为古老单倍型。单倍型H1也形成一个小的中心,含有个体数也较多。表明H1也是古老单倍型之一。在中部地区的种群里,H1和H2单倍型保留最多,分布最广。中部地区群体的独享单倍型与QL、SC群体,QL与SC群体的单倍型之间相互连接,表明了三大群体存在连续的系统进化关系,群体内个体之间发生相互迁移和扩散。 4)AMOVA分析显示红腹锦鸡种群的分子变异主要来自于种群内变异(87.13%)。种群内分化程度要大于地理区内群体间的分化,地理区间分化指数FCT很低,表明红腹锦鸡的地理区间分化并不明显,地理区间群体间存在着较高水平的基因交流,亦暗示红腹锦鸡种群能够快速地扩张。各种群遗传多样性不存在显著的地理差异,个体呈现出混杂的分布格局。 5)红腹锦鸡所有种群的中性检验和错配分布曲线显示,种群整体处于动态平衡,趋向稳定,并未发生扩张和明显数量增长。各群体内积累了较多的基因突变,主要为中、低频率的变异,QL和JG种群在历史上曾发生过扩张历史事件,中部地区群体可能存在较多基因搭载现象或经历了自然选择。 6)综合分析12个种群的遗传多样性和系统发育,QL种群为较原始种群,单倍型H1和H2是主导单倍型,并在中部地区群体广泛分布,需施以更加合理的保护和管理措施。
【学位授予单位】:浙江大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:Q951

【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 马纲;张敏;;中国雉科鸟类特有种分布的研究[J];西南民族大学学报(自然科学版);2008年03期
2 朱井丽;;长白山东部山区越冬期花尾榛鸡种群密度及分布[J];黑龙江生态工程职业学院学报;2011年03期
3 张玲;王晓明;刘永金;;深圳梧桐山风景区桫椤种群现状及其生态保护对策[J];中山大学学报论丛;2006年09期
4 欧阳平,王加斌;阿坝州牛的种群分布与气候生态环境的关系[J];西南民族学院学报(自然科学版);1994年02期
5 欧阳平;王加斌;;阿坝州羊的种群分布与气候生态环境的关系探讨[J];西南民族大学学报(自然科学版);1993年01期
6 方元平;王志飞;项俊;;湖北黄州龙王山渐尖毛蕨种群分布格局研究[J];亚热带植物科学;2007年02期
7 侯元生;何玉邦;星智;崔鹏;尹祚华;雷富民;;青海湖国家级自然保护区水鸟的多样性及分布[J];动物分类学报;2009年01期
8 李妍;;东昌湖轮虫群落结构及种群分布[J];南阳师范学院学报;2005年12期
9 金杰锋;刘观华;金志芳;吴建东;曾南京;高翔;;鄱阳湖保护区白琵鹭越冬种群分布[J];动物学杂志;2011年02期
10 张金良;太白山植物撷趣(2)[J];现代种业;2003年04期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 吴瑾;徐来祥;张知彬;;黑线姬鼠线粒体控制区的序列测定与分析[A];第二届全国野生动物生态与资源保护学术讨论会论文摘要集[C];2005年
2 王电杰;温国胜;童再康;许基全;邬金;刘婷霞;;浙江大鹿岛木麻黄种群的分布格局[A];第十三届中国科协年会第16分会场-沿海生态建设与城乡人居环境学术研讨会论文集[C];2011年
3 冯利民;张立;刀建红;罗爱东;郭贤明;赵建伟;;中国亚洲象种群分布和栖息地现状[A];第二届全国野生动物生态与资源保护学术讨论会论文摘要集[C];2005年
4 袁娟;张其中;李飞;朱成科;罗芬;;长江中上游铜鱼线粒体控制区的序列变异和遗传多样性[A];中国鱼类学会2008学术研讨会论文摘要汇编[C];2008年
5 涂剑锋;杨福合;邢秀梅;李一清;;鹿亚科动物线粒体控制区序列分析与系统进化[A];低碳经济与科学发展——吉林省第六届科学技术学术年会论文集[C];2010年
6 金崑;;中国蒙原羚种群分布及数量现状[A];中国动物学会兽类学分会第六届会员代表大会暨学术讨论会论文摘要集[C];2004年
7 张黎黎;周立志;代艳丽;;基于线粒体控制区D-loop序列的越冬白头鹤种群遗传多样性及遗传结构的研究[A];第七届全国野生动物生态与资源保护学术研讨会论文摘要集[C];2011年
8 万方浩;;物种引进——生态学理论对生物防治实践的启示[A];青年生态学者论丛(一)[C];1991年
9 陈素传;肖斌;肖正东;;大别山山核桃调查初报[A];第二届中国林业学术大会——S9 木本粮油产业化论文集[C];2009年
10 杨金权;胡雪莲;林弘都;唐文乔;;长江口邻近水域刀鲚的线粒体控制区序列变异与遗传多样性[A];中国海洋湖沼学会第九次全国会员代表大会暨学术研讨会论文摘要汇编[C];2007年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 胡亦;南海所鲷科研究项目通过鉴定[N];中国渔业报;2009年
2 记者 钟文;建生命走廊 让岷山熊猫走婚[N];成都日报;2007年
3 李忠将;贵州黑叶猴数量持续增长[N];西部时报;2008年
4 刘世祥本报记者 王晶;天台山发现萤火虫种群[N];成都日报;2007年
5 范南虹 苏晓杰;海南特有濒危植物五唇兰生境严峻[N];海南日报;2007年
6 常建;“常熟港啮齿动物和医学媒介生物调查和研究分析”荣获科技进步奖[N];江苏科技报;2006年
7 记者 闫友明 通讯员 黄菲菲;严防疾病“飞”入龙城[N];柳州日报;2008年
8 记者  张玉玲;“四川大熊猫栖息地”申遗成功[N];光明日报;2006年
9 铁铮;尹伟伦院士呼吁加大杨树研究力度[N];中国绿色时报;2007年
10 本报记者 缪翼 通讯员 陈惠;黑龙江鲫鱼引种摆脱盲目性[N];中国渔业报;2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 李建辉;濒危植物长叶榧不同尺度遗传结构及种群历史动态[D];华东师范大学;2013年
2 马立祥;东北地区松属双维管束树种地理种群分异及其生态适应特征[D];东北林业大学;2011年
3 李荣;近自然经营强度对辽东栎种群与群落恢复影响[D];西北农林科技大学;2012年
4 刘若余;中国山羊、黄牛线粒体DNA遗传多样性与起源进化[D];西北农林科技大学;2005年
5 刘森;三种蝙蝠表观遗传多样性及其影响因素研究[D];东北师范大学;2012年
6 杨金权;鮈亚科鱼类分子系统发育、演化过程及生物地理学研究[D];中国科学院研究生院(水生生物研究所);2005年
7 张建民;石荠苧属物种的生态分化研究[D];浙江大学;2008年
8 胡杰;獐保护遗传学及其繁殖行为研究[D];浙江大学;2006年
9 李友邦;广西黑叶猴分布数量和行为生态学初步研究[D];浙江大学;2008年
10 陈骁;中国南部沿海条纹斑竹鲨和尖头斜齿鲨种群遗传学研究[D];厦门大学;2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 吴少英;基于线粒体控制区探讨红腹锦鸡种群进化历史[D];浙江大学;2012年
2 崔敏燕;濒危物种水杉种群的引种和生存力分析[D];华东师范大学;2011年
3 张健;我国东部薜荔种群的遗传格局与扩散模式[D];华东师范大学;2012年
4 孙召红;五种棒束孢在不同森林生态系中的遗传多样性[D];安徽农业大学;2011年
5 陈勃言;金川沼泽湿地油桦种群分布格局机理初步探讨[D];东北师范大学;2010年
6 贾俊玲;吉林天然红松林遗传多样性的ISSR分析[D];辽宁师范大学;2011年
7 于志辉;秦岭地区橄榄秦岭蝗的谱系地理学研究[D];陕西师范大学;2010年
8 熊飞宇;雅连的品质与其种群生态效应的研究[D];成都中医药大学;2011年
9 陶娟;基于线粒体基因序列探讨广义花臭蛙种群遗传结构[D];河南师范大学;2010年
10 王萌;大连沿海鼠尾藻野生种群遗传多样性的ISSR研究[D];辽宁师范大学;2010年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026