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《浙江大学》 2012年
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基于线粒体控制区探讨红腹锦鸡种群进化历史

吴少英  
【摘要】:红腹锦鸡(Chrysolophus pictus),又名金鸡,我国特有物种,国家二级保护动物。利用线粒体DNA分子标记研究红腹锦鸡种内及种间的群体遗传结构和系统发生关系,将对该物种的有效保护起到重要作用。本研究以线粒体DNA控制区的448bp高变区序列为分子标记,利用PCR和直接测序方法,采用序列分析技术,对红腹锦鸡的12个种群的212个个体进行了实验,探讨各群体间与个体间的遗传变异、系统发育及种群进化关系和种群历史动态,研究结果如下: 1)所分析的序列有57个变异位点(12.93%),其中单可变位点15个,简约信息位点42个,有插入和缺失现象。57个变异位点定义了38种单倍型,出现频率最高的为单倍型H2(73/212),并存在于11个种群中。单倍型多样性和核苷酸多样性水平均较高,分别为0.907和9.115%。陕西秦岭个体的单倍型多样性和核苷酸多样性水平在12个种群中是相对最高的,其单倍型种类也最丰富,由此推断,秦岭种群是较为原始的种群。 2)根据种群不同群体划分模式下的分子变异分析,结合遗传距离的远近,将本研究的12个种群分为3大群体是比较合理的,令为QL群体、中部地区群体和SC群体。 3) NETWORK图显示单倍型并没有依采样地区域形成各自的分支(clade), QL种群的单倍型遍布整个网络图。以单倍型H2作为中心向其他单倍型发散,推断H2是这些单倍型的历史基因流,视为古老单倍型。单倍型H1也形成一个小的中心,含有个体数也较多。表明H1也是古老单倍型之一。在中部地区的种群里,H1和H2单倍型保留最多,分布最广。中部地区群体的独享单倍型与QL、SC群体,QL与SC群体的单倍型之间相互连接,表明了三大群体存在连续的系统进化关系,群体内个体之间发生相互迁移和扩散。 4)AMOVA分析显示红腹锦鸡种群的分子变异主要来自于种群内变异(87.13%)。种群内分化程度要大于地理区内群体间的分化,地理区间分化指数FCT很低,表明红腹锦鸡的地理区间分化并不明显,地理区间群体间存在着较高水平的基因交流,亦暗示红腹锦鸡种群能够快速地扩张。各种群遗传多样性不存在显著的地理差异,个体呈现出混杂的分布格局。 5)红腹锦鸡所有种群的中性检验和错配分布曲线显示,种群整体处于动态平衡,趋向稳定,并未发生扩张和明显数量增长。各群体内积累了较多的基因突变,主要为中、低频率的变异,QL和JG种群在历史上曾发生过扩张历史事件,中部地区群体可能存在较多基因搭载现象或经历了自然选择。 6)综合分析12个种群的遗传多样性和系统发育,QL种群为较原始种群,单倍型H1和H2是主导单倍型,并在中部地区群体广泛分布,需施以更加合理的保护和管理措施。
【学位授予单位】:浙江大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:Q951

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【引证文献】
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 曾倩倩;红腹锦鸡MHC I类座位的分离及其适应性进化研究[D];浙江大学;2013年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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【同被引文献】
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中国博士学位论文全文数据库 前2条
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中国博士学位论文全文数据库 前5条
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中国硕士学位论文全文数据库 前2条
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【相似文献】
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2 丁长青;巩会生;赵雷刚;向定乾;袁朝晖;郑松峰;;秦岭南麓不同地区红腹锦鸡繁殖密度的比较研究[A];中国鸟类学研究——第四届海峡两岸鸟类学术研讨会文集[C];2000年
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中国重要报纸全文数据库 前10条
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7 张炜;红腹锦鸡育雏七法[N];山西科技报;2002年
8 梁新江;特禽家庭新成员——红腹锦鸡[N];中国特产报;2001年
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10 郑亚平;红腹锦鸡育雏期的管理要点[N];山西科技报;2001年
中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 曾倩倩;红腹锦鸡MHC I类座位的分离及其适应性进化研究[D];浙江大学;2013年
2 何珂;红腹锦鸡SSR和Ⅱ类MHC位点的分离及种群遗传结构分析[D];浙江大学;2012年
中国硕士学位论文全文数据库 前4条
1 孙丹丹;红腹锦鸡的形态特征与分子标记MHC和SSR的关联分析[D];浙江大学;2013年
2 吴少英;基于线粒体控制区探讨红腹锦鸡种群进化历史[D];浙江大学;2012年
3 吕向辉;珍稀野生动物肠道寄生虫感染及其形态观察[D];西北大学;2010年
4 蔡晓淇;花尾榛鸡的系统地位与BLB基因多态性研究[D];东北林业大学;2013年
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