收藏本站
《浙江大学》 2004年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

生物芯片图象分析方法的研究与应用

邓宁  
【摘要】: 随着人类基因组计划的提出与开展,生物信息学在近20年内得到了迅猛的发展,作为生物信息学领域一个新分支的生物芯片技术由于能够同时对成千上万的基因和蛋白质片断进行表达分析,已经得到了越来越广泛的应用。 图象分析是生物芯片技术的重要组成部分,分析过程中需要处理大量的数据信息。由于图象分析的性能优劣将对生物芯片分析造成潜在的巨大影响,因此如何建立高效、准确、快速的生物芯片图象分析方法已成为当前亟需解决的首要问题。 本文通过分析当前生物芯片图象分析领域的发展现状认为建立全自动化的图象分析方法,是生物芯片图象分析的关键问题。本文对生物芯片图象的分析方法进行了具体的研究,包括: 研究并建立了生物芯片图象分析和数据处理的工作流程。 对生物芯片图象样品点阵列的定位方法进行了具体的分析,建立了基于投影的生物芯片图象样品点阵列自动定位算法。 针对生物芯片扫描图象普遍存在的倾斜问题,利用图象投影的能量谱密度,实现对倾斜图象的自动校正。 在分析并比较了现有生物芯片图象分割方法的基础上,采用自适应圆形分割法,结合邻域搜索算法,实现了对生物芯片图象的分割。 对生物芯片图象数据处理中的两大问题,数据提取和数据分析,进行了研究,实现了蛋白质生物芯片数据处理的解决方案。 对生物芯片图象自动分析软件和工作站进行了具体的设计,实现了基于PC机的生物芯片自动分析工作站和基于嵌入式系统自动分析软件的图象分析模块。 经临床实验后的结果表明,本文的生物芯片图象分析方法不仅具有高效、准确、快速的特点,而且由于自动化的分析模式,使得实现流水化式的生物芯片分析成为可能。
【学位授予单位】:浙江大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2004
【分类号】:Q819

手机知网App
【引证文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 胡翔宇;唐小萍;;生物芯片图像样点的自动识别[J];光电工程;2006年03期
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 杨景涛;肽核酸型SPR基因芯片检测系统的研究[D];重庆大学;2006年
2 尹宁;基因芯片识别系统研究[D];吉林大学;2012年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前8条
1 宋慧营,王文生,王洪尊,梁翠萍;相关探测中目标旋转、比例变化的研究[J];长春理工大学学报;2003年01期
2 余国彬,姚汉民,胡松;激光共聚焦生物芯片扫描仪的光学特性[J];光电工程;2002年03期
3 李渊;人类基因组DNA单核苷酸多态性的检测方法[J];国外医学(分子生物学分册);2002年02期
4 王立强,陆祖康,林斌;生物芯片及其荧光信号检测[J];光学仪器;2002年Z1期
5 齐名,甄国亮,熊华,刘新钰,吴引伟,袁春伟,武建国;HCV基因型检测芯片的设计与研制初报[J];临床检验杂志;2002年06期
6 白春英;生物芯片技术研究进展及其应用[J];内蒙古民族大学学报(自然科学版);2002年02期
7 肖家全,谭建明,李成涛,李瑶,沈瑾,康敏华,方燕红;HLA-DRB1基因芯片与PCR-SSP分型的比较[J];复旦学报(医学版);2003年01期
8 张明敏;图形图象文件格式解码实用程序[J];中国图象图形学报;1998年05期
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 陈碧;生物芯片扫描分析系统的DSP软件设计[D];浙江大学;2003年
2 张兴明;生物芯片扫描分析系统——嵌入式系统软件设计[D];浙江大学;2003年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 毕超;江波;;往复式单螺杆销钉挤出机停留时间分布研究[J];工程塑料应用;2007年12期
2 王明吉;张勇;李玉爽;曹文;;单主机高精度周界入侵探测报警系统[J];安防科技;2007年02期
3 杨凡;李祥;涂军;;基于DSP的远程视频监控系统的研究和实现[J];安防科技;2008年01期
4 王贵竹,李婕;有公共连接点的耦合电感的去耦等效[J];安徽大学学报(自然科学版);1999年03期
5 石玉军;马永杰;侯文静;;共射极电路在S域中的处理与仿真[J];安徽职业技术学院学报;2009年03期
6 许秀英;;网络冲激变量的映射法[J];安徽建筑工业学院学报(自然科学版);2008年06期
7 朱建飞;差动放大器的信号流图分析法[J];安康师专学报;2003年02期
8 丁蕾;;关于系统稳定性判别方法的讨论[J];安庆师范学院学报(自然科学版);2007年04期
9 杨福涛;孙鹏;;关于求解功率问题时非周期函数用傅立叶级数展开的探讨[J];鞍山师范学院学报;2009年02期
10 佟首峰,阮锦,郝志航;几种相关双采样拓扑电路分析[J];半导体光电;2000年05期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 陈光明;姚力;张家才;;图像非均匀像素技术[A];图像图形技术与应用进展——第三届图像图形技术与应用学术会议论文集[C];2008年
2 葛荣尚;胡家为;徐剑;;电网谐波对数字式继电保护的影响[A];2007中国继电保护及自动化行业年会论文集[C];2007年
3 严朝军;向柳;;GMSK调制器的一种有效实现[A];中国电子学会第十五届信息论学术年会暨第一届全国网络编码学术年会论文集(下册)[C];2008年
4 李宝忠;程引会;李进玺;吴伟;马良;周辉;;脉冲电流注入方法进行干扰传输函数测试[A];第十四届全国核电子学与核探测技术学术年会论文集(下册)[C];2008年
5 严晓兰;;基于Simulink的信号与系统仿真实验研究[A];第十九届电工理论学术年会论文集[C];2007年
6 李宝忠;程引会;李进玺;吴伟;马良;周辉;;脉冲电流注入方法进行干扰传输函数测试[A];第十四届全国核电子学与核探测技术学术年会论文集(2)[C];2008年
7 胡涛;;信号与系统中MATLAB的应用方法研究[A];教育部中南地区高等学校电子电气基础课教学研究会第二十届学术年会会议论文集(下册)[C];2010年
8 倪振文;刘祖润;沈洪远;刘昆山;;“信号与系统”、“数字信号处理”课程教学改革的探讨[A];第二届全国高校电气工程及其自动化专业教学改革研讨会论文集(下册)[C];2004年
9 高诺;姚庆梅;谢秀颖;耿淑娟;;信号与系统实验教学改革探讨[A];第6届全国高等学校电气工程及其自动化专业教学改革研讨会论文集(下册)[C];2009年
10 蒲杰;肖灵;吴文焘;李小雪;;维纳滤波在超声物位计中的应用[A];中国声学学会2009年青年学术会议[CYCA’09]论文集[C];2009年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 付江志;直扩测控系统中的窄带干扰抑制技术研究[D];哈尔滨工程大学;2010年
2 宫宇;基于STBC-OFDM技术的海上移动通信新框架体系的研究[D];大连海事大学;2010年
3 周俐娜;高Q值微波光子学滤波器的理论和实验研究[D];华中科技大学;2010年
4 周新刚;基于模糊函数切割法的典型无线电引信抗干扰性能测度[D];南京理工大学;2010年
5 丁建军;目标电磁散射的快速预估和基于多分辨基函数的高效算法[D];南京理工大学;2011年
6 张培俭;重叠复用技术的理论分析与应用[D];北京邮电大学;2011年
7 丁北斗;基于环境激励网架结构的模态分析与损伤识别研究[D];中国矿业大学;2010年
8 陈宏;MIMO-OFDM关键技术研究[D];天津大学;2010年
9 李尚远;光控微波波束形成器中的调制技术及性能研究[D];清华大学;2010年
10 高军哲;多频涡流无损检测的干扰抑制和缺陷检测方法研究[D];国防科学技术大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 赵永辉;多通道参量阵信号源及功放电路设计[D];哈尔滨工程大学;2010年
2 邓阳;高精度数字式电能表的研制[D];大连理工大学;2010年
3 陈光辉;分数延迟FIR数字滤波器设计及其FPGA实现[D];湘潭大学;2010年
4 丁宁;小麦碰撞音频信号预处理方法研究[D];河南工业大学;2010年
5 刘宪涛;新一代卫星导航信号高效直捕方法的研究[D];沈阳理工大学;2010年
6 张子敬;OFDM无线通信系统中降低PAPR技术的研究[D];沈阳理工大学;2010年
7 王海娥;基于LabVIEW虚拟示波器的设计及远程控制[D];青海师范大学;2010年
8 梁祖薪;开关电源自动测试生产线的设计[D];江西理工大学;2010年
9 艾中进;RFID时延估计算法的研究[D];南昌大学;2010年
10 冉娜娜;基于Cortex-M3的25Hz相敏轨道电路信号采集板的研究与实现[D];北京交通大学;2011年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 李红卫;苑伟政;叶芳;;基于数学形态学的微阵列芯片荧光图像处理与分析[J];传感技术学报;2007年02期
2 段立晶,高汉宝,梁德群;基于方向信息测度的约束最小二乘图像恢复方法[J];大连海事大学学报;2005年03期
3 马帅营;;基于回归分析的基因芯片图像倾斜校正方法[J];大连民族学院学报;2010年01期
4 孙啸,王晔,张晓莉,谢建明,陆祖宏;基因芯片设计及数据分析软件系统[J];东南大学学报(自然科学版);2000年05期
5 龙清;;直方图图像增强技术[J];电脑知识与技术;2011年04期
6 胡翔宇;唐小萍;;生物芯片图像样点的自动识别[J];光电工程;2006年03期
7 严伟;胡松;吴钦章;唐小萍;佟军民;;生物芯片图像微阵列偏转角度计算及样点分割算法[J];光电工程;2007年10期
8 吴维明,蔡强,陈裕泉;纳米金在生物检测中的应用[J];国外医学.生物医学工程分册;2003年05期
9 顾大勇,鲁卫平,周元国;纳米级金颗粒在基因芯片检测技术中的研究进展[J];国外医学.生物医学工程分册;2005年02期
10 张晶;王黎;高晓蓉;王泽勇;周小红;彭建平;;数字图像处理中的图像分割技术及其应用[J];信息技术;2010年11期
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 蔡浩原;一种新型表面等离子体谐振(SPR)生化分析系统的研究[D];中国科学院研究生院(电子学研究所);2003年
中国硕士学位论文全文数据库 前6条
1 丁胜;基因芯片扫描仪软件设计[D];南京理工大学;2003年
2 杨波;基于蛋白质分子相互作用分析的SPR生物传感器的研究[D];华中科技大学;2004年
3 高茹;数字图像混合噪声的滤除方法研究[D];吉林大学;2007年
4 张丽新;数字图像高密度脉冲噪声的中值滤波算法研究[D];上海交通大学;2009年
5 刘艳;微阵列图像自动分析方法的研究[D];中国医科大学;2009年
6 陈光磊;基因微阵列图像数据自动化提取[D];厦门大学;2009年
【二级引证文献】
中国期刊全文数据库 前6条
1 胡翔宇;唐小萍;;基于提升格形态小波的生物芯片图像增强[J];光电工程;2007年12期
2 胡翔宇;唐小萍;严伟;罗正全;;嵌入式生物芯片检测分析系统设计[J];计算机应用研究;2008年04期
3 郑斌;万遂人;何农跃;;基于微处理器和现场可编程门阵列生物芯片数据采集系统的设计[J];中国组织工程研究与临床康复;2010年48期
4 陆琳;孙福军;侯明;;基因芯片图像去噪方法研究进展[J];检验检疫科学;2007年Z1期
5 刘艳;张勇德;;含弱信号点微阵列图像的自动网格划分[J];中国医学工程;2008年03期
6 刘国传;伯晓晨;王升启;陆琳;;生物芯片图像分析的研究进展[J];中国医疗器械杂志;2007年02期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 刘军;赵吉宾;刘伟军;王天然;;基因芯片荧光靶点图像检测识别算法改进研究[A];2009中国仪器仪表与测控技术大会论文集[C];2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前6条
1 汪德暖;基于嵌入式气体检测系统软件控制及算法研究[D];重庆大学;2011年
2 李知瑶;基于粒子群优化的Fuzzy c-mean聚类算法的基因芯片图像处理[D];苏州大学;2011年
3 白志军;检测型基因芯片信息处理关键技术及应用系统研究[D];国防科学技术大学;2006年
4 苏建;基于EM算法的基因芯片图像信号检测与分析[D];苏州大学;2009年
5 刘艳;微阵列图像自动分析方法的研究[D];中国医科大学;2009年
6 尹宁;基因芯片识别系统研究[D];吉林大学;2012年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 刘国福,张玘,张连超;DSP与海量存储器的接口技术[J];单片机与嵌入式系统应用;2001年09期
2 刘伟庭,郭希山,王钟,陈裕泉,王立人;生物芯片及其在生物医学工程中的应用[J];国外医学.生物医学工程分册;2002年04期
3 孙开来,吴东宁;DNA芯片的发展和意义[J];国外医学.遗传学分册;1998年06期
4 宋建中;;旋转、比例、平移不变的图形识别系统[J];光学机械;1987年02期
5 陈耀文,林珏龙,赖效莹,梅品超;激光扫描共聚焦显微镜系统及其在细胞生物学中的应用[J];激光生物学报;1998年02期
6 翟俊辉,郭兆彪,宋亚军,王津,张敏丽,杨瑞馥,韩俊;16SrDNA基因芯片检测临床常见感染性细菌[J];临床检验杂志;2002年03期
7 李成涛,李瑶,张红发,康敏华,谢毅,毛裕民;寡核苷酸DNA芯片用于ABO血型基因分型的研究[J];临床检验杂志;2002年03期
8 张效萌,韩金祥,鲁艳芹,黄海燕;肽核酸芯片技术初探[J];临床检验杂志;2002年03期
9 吴月平,华文久;丙型肝炎基因型与临床的关系[J];临床检验杂志;1996年04期
10 袁小珍,唐小平;丙型肝炎病毒血清型特异抗体与基因分型方法的比较[J];临床检验杂志;1998年02期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 ;封面故事[J];生物工程进展;2001年05期
2 芮瑞琦;;生物芯片[J];世界发明;2002年10期
3 王子路;学会把DNA卖出去[J];知识就是力量;2003年03期
4 ;生物芯片概述[J];生命科学仪器;2004年01期
5 ;“生物芯片仪器研制”取得突破性进展[J];生命科学仪器;2004年03期
6 杜金伟,朱平;生物芯片及其应用进展[J];肿瘤防治研究;2004年06期
7 是兆雄;生物芯片和有机计算机[J];自然杂志;1986年03期
8 ;美国科学家牵头研制生物芯片[J];世界科技研究与发展;1998年06期
9 周建军;生物芯片[J];国外医学.分子生物学分册;2000年01期
10 ;2000年中国十大知本风暴之十 基因大战未息 生物芯片看好[J];金秋科苑;2001年Z1期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 李创;陈天宁;梁恒;;生物芯片中的微流体特性[A];中国生物工程学会第三次全国会员代表大会暨学术讨论会论文摘要集[C];2001年
2 杨宪斌;;以硫代寡核苷酸分子为材料的生物芯片和蛋白质组学研究[A];科技、工程与经济社会协调发展——中国科协第五届青年学术年会论文集[C];2004年
3 周雷激;王柯敏;左新兵;文建辉;刘斌;陈韵晴;王炜;谭蔚泓;黄杉生;;一维生物芯片蛋白质检测技术平台[A];第二届全国微全分析系统学术会议论文摘要集[C];2004年
4 季旭;刘理天;;一种集成PCR反应室与CE的生物芯片的研究[A];首届信息获取与处理学术会议论文集[C];2003年
5 周强;宗光华;毕树生;;CCD生物芯片扫描仪像素大小研究[A];首届信息获取与处理学术会议论文集[C];2003年
6 林兴兵;唐秋艳;刘丽;宋惠娟;王长江;胡兵;马新民;曹友声;;国内外生物芯片技术研究现状[A];科技、工程与经济社会协调发展——河南省第四届青年学术年会论文集(下册)[C];2004年
7 李岭;孙向青;计宏凯;胡驰峰;樊晓丹;孙应飞;李衍达;;生物芯片分析结果判读中存在的若干问题及解决思路[A];第九次全国生物物理大会学术会议论文摘要集[C];2002年
8 陆祖宏;;高密度基因芯片的研究和发展[A];面向21世纪的科技进步与社会经济发展(上册)[C];1999年
9 王妍;徐春祥;曹岷;陆祖宏;任超世;;红细胞在生物芯片上的电介质电泳[A];21世纪医学工程学术研讨会论文摘要汇编[C];2001年
10 祁恒;陈涛;;两种高聚物生物芯片材料的光学透过及激光加工性能分析[A];第二届全国微全分析系统学术会议论文摘要集[C];2004年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 记者 胡德荣;生物芯片检测肿瘤[N];健康报;2002年
2 陈高明;生物芯片[N];学习时报;2000年
3 梁斑;习近平视察博奥生物芯片中心[N];新清华;2010年
4 陈国东;全球生物芯片产值增长迅速[N];医药经济报;2003年
5 记者 李韶辉;生物芯片北京国家工程研究中心通过验收[N];中国改革报;2007年
6 ;生物芯片必须突破价格障碍[N];中国计算机报;2000年
7 人民日报记者贾西平;生物芯片 迎面走来的新朋友[N];人民日报;2000年
8 胡文华;生物芯片北京国家工研中心通过验收[N];中国医药报;2007年
9 副主任医师 李水银;何谓“生物芯片”[N];大众卫生报;2000年
10 孟为;生物芯片北京国家工程研究中心通过验收[N];北京日报;2007年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 王娟;生物芯片的微制备技术研究[D];吉林大学;2012年
2 王立强;双激光共聚焦生物芯片荧光分析仪的研究与开发[D];浙江大学;2004年
3 杨敬松;数字微流控生物芯片的布局及调度问题研究[D];吉林大学;2008年
4 董红宇;冶铸轧一体化柔性生产计划及其仿真系统研究[D];东北大学;2009年
5 朱前勇;无创性产前诊断遗传性疾病的生物芯片的研究[D];第三军医大学;2004年
6 赵湛;基于MEMS技术的PCR芯片的研究[D];中国科学院研究生院(电子学研究所);2003年
7 王刚;基于无机/聚合物复合微球的液相悬浮式生物芯片体系的构建及应用[D];上海交通大学;2013年
8 张凤月;0-1规划和排课表问题的DNA计算模型研究[D];华中科技大学;2004年
9 王于杰;SPR生化分析系统在SARS病毒检测中的应用研究[D];中国科学院研究生院(电子学研究所);2007年
10 王洪敏;霍乱弧菌检测芯片的研制[D];第一军医大学;2004年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 邓宁;生物芯片图象分析方法的研究与应用[D];浙江大学;2004年
2 路秀利;生物芯片电化学检测仪嵌入式系统设计[D];上海交通大学;2010年
3 何文波;基于MEMS技术的PCR生物芯片的研究[D];大连理工大学;2003年
4 李倩;面向生物芯片荧光检测的微体积高强度多LED集成技术与工艺设备研究[D];北京工业大学;2012年
5 叶芳;基于生物芯片的中药作用机理研究[D];西北工业大学;2004年
6 刘大震;硅基单反应腔PCR生物芯片的设计与制作[D];大连理工大学;2004年
7 肖丁;生物芯片图像分析与处理方法的研究[D];华东理工大学;2011年
8 董伟;变邻域搜索算法研究及在组合优化中的应用[D];辽宁工程技术大学;2011年
9 王仁民;改进变邻域搜索算法在动态车辆路径问题中的研究[D];广西师范学院;2013年
10 张兴明;生物芯片扫描分析系统——嵌入式系统软件设计[D];浙江大学;2003年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026