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《浙江理工大学》 2010年
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马铃薯保守性miRNAs的预测与验证

杨文征  
【摘要】: MicroRNA (miRNA)是一类大小约22个碱基左右的内源性小分子调控RNA,它们基于与靶mRNA的序列互补,可以对靶mRNA进行降解或抑制蛋白质翻译。越来越多的研究表明,miRNA倾向于靶向转录因子家族基因,特别是涉及到已知或推测的在动植物的生长发育过程、细胞分化中起着重要调控作用的转录因子。在植物体内,miRNA的功能更是涉及到了叶的形态发育、花的形成、组织分化和根的形成、水分及矿物质的转运、调节植物激素介导的信号转导途径、小RNA的代谢调控以及环境胁迫应答等多个方面。 马铃薯是一种世界范围内的重要农作物,是人类生产生活的重要原料之一,随着功能基因组等测序工作进程的加快,目前马铃薯已有大约16%的基因组完成测序。但由于目前对植物中保守性miRNA的预测及验证大部分仍集中在几种模式植物上,例如:拟南芥、水稻、玉米、大豆等。对于马铃薯中的miRNA的研究目前在国内外只有两篇报道,且由于基因组数据库的限制,所报道条数也有限。鉴定潜在的马铃薯miRNA及其靶基因对进一步研究各miRNA在调控植物体生长发育、新陈代谢中的作用及培育高产、抗逆性强的转基因品种都具有指导意义。 本研究通过在马铃薯的EST核酸数据库中检索其他20种植物中已报道的miRNA,预测出了71条潜在miRNAs,其中65条为首次被预测到。大部分被预测到的马铃薯miRNA家族含有一到三条miRNA,序列分析显示,候选的前体miRNA序列长度分布于48-224bp。 为进一步验证所预测到的miRNAs,采用茎环状RT引物及荧光定量RT-PCR来分析出芽30天左右时期的马铃薯不同组织中的7条miRNA及其中5条靶标mRNA的表达水平。结果显示,所有选定的miRNA都被成功检测到。除了miR159和miR164呈现出不同的表达模式外,7条miRNA中大多数成员的最高表达水平都出现在叶片中,最低表达水平出现在茎组织中。这几种不同miRNA在根、茎、叶、茎尖组织中的特定表达水平可能与其在马铃薯营养生长及器官形成中的特殊调控作用相关。此外,靶基因检测结果显示,各靶标mRNA在马铃薯各组织中也呈现出差异性表达模式。其中对靶标MYB、ARF8、AGO1的mRNA扩增效果较好,且表达水平经分析比较符合目前对各靶基因在模式植物如拟南芥中功能的报道,说明各miRNA对该阶段马铃薯的营养生长也起着相似的调节作用。
【学位授予单位】:浙江理工大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2010
【分类号】:S532

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【引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 徐艳;人工miR159介导的番茄抗黄瓜花叶病毒遗传转化研究[D];浙江理工大学;2011年
2 牛继平;马铃薯SGAs合成代谢途径末端酶基因克隆及相关miRNA筛选[D];甘肃农业大学;2012年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前3条
1 郭强;项安玲;杨清;邱承祥;杨志敏;;利用EST及生物信息学方法挖掘马铃薯中miRNA及其靶基因[J];科学通报;2007年14期
2 George P.COBB1,Todd A.ANDERSON;Identification and characterization of new plant microRNAs using EST analysis[J];Cell Research;2005年05期
3 侯妍妍;应晓敏;李伍举;;microRNA计算发现方法的研究进展[J];遗传;2008年06期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 李亚男;冯霞;陈大清;;ARF、Aux/IAA和生长素受体对基因表达的调控[J];安徽农学通报;2008年07期
2 于颢;闫旭;辛德东;;植物microRNA计算识别的研究进展[J];安徽农业科学;2011年19期
3 江海洋;魏巍;刘艳;朱苏文;程备久;;高粱生长素反应因子(ARF)基因的全基因组分析与进化研究[J];安徽农业大学学报;2010年03期
4 于淑惠;左曼曼;闫辉;郎庆雯;樊金会;;毛白杨PtAUX1超表达对光照反应的影响[J];北方园艺;2012年13期
5 ;Roles of ABA Signal Transduction during Higher Plant Seed Development and Germination[J];Forestry Studies in China;2003年04期
6 冯霞;李亚男;陈大清;;生长素基因家族及其启动子、反应因子的研究进展[J];长江大学学报(自然科学版)农学卷;2008年01期
7 穆松;钟金城;陈智华;徐利娟;;牛基因组中新的microRNA预测及分析[J];中国草食动物;2010年01期
8 刘永鑫;韩英鹏;常玮;邹权;郭茂祖;李文滨;;一种适合大豆MicroRNA鉴定的RT-PCR方法[J];大豆科学;2009年04期
9 张计育;渠慎春;郭忠仁;杜小丽;都贝贝;章镇;;植物bZIP转录因子的生物学功能[J];西北植物学报;2011年05期
10 郭韬;李广林;魏强;梁永宏;;植物MicroRNA功能的研究进展[J];西北植物学报;2011年11期
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 李惠华;龙眼体胚发生过程中激素代谢和信号转导相关基因的克隆与表达[D];福建农林大学;2010年
2 芦娟娟;短命植物异果芥异形果实与种子的生态适应对策[D];新疆农业大学;2010年
3 王晓飞;水稻不定根发育调控基因OsDARE1克隆和功能研究[D];浙江大学;2010年
4 陈哲皓;拟南芥microRNA393的表达模式、调控机制和功能研究[D];浙江大学;2010年
5 阴祖军;胁迫诱导棉花microRNA的差异表达分析[D];山东农业大学;2011年
6 刘玉博;细胞分裂素和生长素调控拟南芥体细胞胚根端分生组织建立的分子基础[D];山东农业大学;2011年
7 孙正龙;低温胁迫下高山离子芥差异蛋白质组学研究[D];兰州大学;2011年
8 王新超;茶树越冬芽休眠与萌发相关基因的分离与表达分析[D];中国农业科学院;2011年
9 林玉玲;龙眼体胚发生过程中SOD基因家族的克隆及表达调控研究[D];福建农林大学;2011年
10 罗茂;玉米抗纹枯病相关miRNA鉴定及功能分析[D];四川农业大学;2011年
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1 冯雪梅;棉花隐性核雄性不育系“21A”的遗传和不育机理研究[D];山东农业大学;2010年
2 李世风;马铃薯microRNA及其靶基因的预测与功能分析[D];甘肃农业大学;2010年
3 王飞燕;番茄SlARF6基因的分离、表达特征分析及遗传转化[D];浙江大学;2011年
4 汪高航;利用点突变研究水稻OsARF的功能[D];浙江大学;2010年
5 朱宇斌;拟南芥中一个SAUR基因的功能研究[D];浙江大学;2010年
6 黄飞飞;苹果microRNA的检测鉴定及前体结构预测[D];沈阳农业大学;2010年
7 左鲜红;钙对番茄花柄脱落过程中生长素反应基因的调控作用[D];沈阳农业大学;2010年
8 李鑫;调控流感病毒基因片段的人编码miRNA的发现算法研究[D];吉林大学;2011年
9 覃玉蓉;胡杨microRNAs的克隆及其功能研究[D];北京林业大学;2011年
10 吴丽丽;小黑杨茎和叶的基因差异表达分析[D];东北林业大学;2011年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 张磊;刘志鹏;张吉宇;张妙青;王彦荣;;箭筈豌豆甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因片段的克隆及序列分析[J];草业科学;2011年05期
2 郑轶琦;刘建秀;;草坪草分子遗传图谱的构建与应用研究进展[J];草业学报;2009年01期
3 尚以顺;杨春燕;钟理;;贵州野生匍匐剪股颖种质资源遗传多样性的ISSR分析[J];草业学报;2009年03期
4 李立芹;黄玉碧;王西瑶;;马铃薯WRKY6基因的克隆、序列分析与原核表达研究[J];草业学报;2011年02期
5 李新玲;吴姝菊;王全伟;;羊草乙醛脱氢酶基因LcALDH的克隆与表达分析[J];草业学报;2011年04期
6 黄粤,柯遐义,李宝健;通过基因枪轰击转化获得转基因小麦植株的研究[J];西北植物学报;1997年02期
7 邱礽;陶刚;李奇科;邱又彬;刘作易;;农杆菌渗入法介导的基因瞬时表达技术及应用[J];分子植物育种;2009年05期
8 李世风;张宁;刘柏林;杜宏辉;司怀军;王蒂;;马铃薯microRNA及其靶基因的预测与功能分析[J];甘肃农业大学学报;2010年06期
9 曾君祉,王东江,吴有强,张健,周文娟,朱小平,徐乃正;用花粉管途径获得小麦转基因植株[J];中国科学(B辑 化学 生命科学 地学);1993年03期
10 黄国存,董越梅,孙敬三;以GFP为标记用花粉管通道途径导入外源DNA[J];科学通报;1998年23期
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 陈洁云;葫芦科植物病毒研究[D];浙江大学;2003年
2 刘小花;Micro-Tom番茄高效遗传转化体系建立[D];浙江大学;2008年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前2条
1 George P.COBB1,Todd A.ANDERSON;Identification and characterization of new plant microRNAs using EST analysis[J];Cell Research;2005年05期
2 盛熙晖;杜立新;;MicroRNA及其在人和动物上的研究进展[J];遗传;2007年06期
【相似文献】
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1 杨文凯,杨文月;马铃薯营养生长期对温度及水分的需求分析[J];中国农村科技;2005年06期
2 王明清;;冬种马铃薯高产栽培技术[J];现代农业科技(下半月刊);2006年10期
3 庞淑敏;方贯娜;李建欣;;中原地区地膜覆盖冬种马铃薯栽培技术关键[J];长江蔬菜;2009年01期
4 潘秀娟;;马铃薯中耕施肥机的研制与试验[J];农业机械;2010年S3期
5 伍壮生;张西露;刘明月;;南方冬作马铃薯产业发展与对策建议[J];辣椒杂志;2010年04期
6 刘伟莉;李季花;何玉琼;;芸豆-马铃薯间作栽培技术[J];云南农业科技;2011年01期
7 暴成光;滕丽伟;曹淑敏;;提高我省马铃薯产量的途径的探讨[J];中国马铃薯;1990年03期
8 朱汉武;;对加快定西马铃薯良繁体系建设的建议[J];种子科技;2006年05期
9 董张姓;;民和县马铃薯机械化种植、收获技术的探讨[J];青海农技推广;2007年04期
10 齐国华;邢作山;;早春拱棚马铃薯标准化栽培技术[J];陕西农业科学;2008年03期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 王桂梅;赵长凯;;山东省夏津棉花—马铃薯间作高产栽培技术[A];中国棉花学会2011年年会论文汇编[C];2011年
2 李彩霞;吴焕章;李志敏;皇甫廷;王俊璞;;商丘马铃薯双膜覆盖早熟高产高效栽培技术[A];马铃薯产业与科技扶贫(2011)[C];2011年
3 王子平;;宁夏中部干旱带马铃薯芽栽技术[A];马铃薯产业与粮食安全(2009)[C];2009年
4 蔺琰东;秦舒浩;王丽;刘玉汇;余斌;张俊莲;王蒂;;外源邻苯二甲酸二甲酯和苯甲酸对马铃薯组培苗生长的化感效应[A];马铃薯产业与科技扶贫(2011)[C];2011年
5 李虎林;刘小林;胡晓燕;;塑料大棚马铃薯复种辣椒高产高效栽培技术[A];马铃薯产业与粮食安全(2009)[C];2009年
6 栾运芳;;西藏马铃薯生产现状与对策[A];中国作物学会马铃薯专业委员会2000年年会论文集[C];2000年
7 lr.W.凡德汉姆;杨毅;;欧洲马铃薯淀粉工业综述[A];中国作物学会马铃薯专业委员会2001年年会论文集[C];2001年
8 刘宏胜;;半干旱地区马铃薯增产栽培措施[A];马铃薯产业与粮食安全(2009)[C];2009年
9 ;加工型马铃薯地膜覆盖栽培技术初探[A];加速发展云南马铃薯优势产业研讨会论文集[C];2003年
10 杜珍;孙振;韩忻燕;谷利民;;山西省马铃薯专家系统的研究开发[A];中国作物学会马铃薯专业委员会2001年年会论文集[C];2001年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 杨红峰;马铃薯防病提质增产的技术途径[N];农民日报;2011年
2 记者 李化民 通讯员 安玉坤;天镇十五万亩马铃薯获国家绿色认证[N];山西日报;2011年
3 赵秀琴;马铃薯高效种植中的几项关键技术[N];太行日报;2011年
4 戴自弦 张丹平 记者 王云;昭觉做“大”马铃薯[N];四川日报;2006年
5 通讯员 刘玉国;新开地乡5.5万亩马铃薯助民增收[N];赤峰日报;2010年
6 毛兴华;“媒人”穿梭省内外销土豆[N];红河日报;2011年
7 程枫;围场“塞罕坝”牌马铃薯热销全国[N];承德日报;2010年
8 记者 杨春莲 通讯员 吴丽梅;免耕马铃薯成浦北农民灾后增收重要来源[N];钦州日报;2008年
9 省农科院经作所 张培通 徐立华;棉花、马铃薯套种模式[N];江苏农业科技报;2006年
10 保定市顺平县农业技术服务站 王福利;马铃薯高产栽培5关键[N];河北农民报;2008年
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1 王密恰;抗病基因在野生马铃薯种中的多态性和进化[D];中国农业科学院;2007年
2 李晓静;增施CO_2对马铃薯生长及氮素营养的影响[D];内蒙古农业大学;2010年
3 张子义;旱作微垄覆膜沟播马铃薯生长发育及营养规律[D];内蒙古农业大学;2011年
4 范士杰;[D];甘肃农业大学;2012年
5 何天久;SbTRXh1和Sb14-3-3基因对马铃薯块茎低温糖化的作用[D];华中农业大学;2012年
6 赵鸿;黄土高原(定西)旱作农田垄沟覆膜对马铃薯产量和水分利用效率影响[D];兰州大学;2012年
7 张磊;植物生长营养液对马铃薯抗旱增产生理调控机制[D];内蒙古农业大学;2013年
8 李倩;马铃薯对水分胁迫的生理响应及抗旱调控措施研究[D];内蒙古农业大学;2011年
9 焦峰;马铃薯氮素吸收分配特性及高效利用生理机制研究[D];黑龙江八一农垦大学;2012年
10 井涛;膜下滴灌马铃薯生长发育规律及其对水氮的响应[D];内蒙古农业大学;2012年
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1 周爽;重金属Cd及施肥对马铃薯生长发育的影响[D];内蒙古农业大学;2012年
2 张海勃;四种改良剂对Cd胁迫下马铃薯生长发育的影响[D];内蒙古农业大学;2013年
3 胡大伟;基于LINTUL3模型的马铃薯生长与氮肥利用研究[D];沈阳农业大学;2013年
4 王彦宏;硫酸镁对马铃薯生长发育及淀粉合成积累作用效应的研究[D];黑龙江八一农垦大学;2010年
5 沈丽珍;马铃薯内生细菌StC01的鉴定及其促生作用初步研究[D];南京农业大学;2007年
6 贾琼;水分胁迫对马铃薯生长与生理特性的影响[D];内蒙古农业大学;2009年
7 周婷;TRV介导的马铃薯基因瞬时沉默体系建立及部分抗病相关基因功能初步鉴定[D];华中农业大学;2010年
8 张国君;陇中半干旱区旱地马铃薯高产高效栽培技术体系的研究[D];甘肃农业大学;2007年
9 章文蔚;马铃薯microRNA的鉴定及分析[D];南昌大学;2007年
10 王鹏飞;甘肃省陇西县马铃薯产业化经营研究[D];甘肃农业大学;2006年
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