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《浙江农林大学》 2016年
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竹亚科En/Spm类转座子系统进化分析及MLE转座子标签的构建

杨潮锋  
【摘要】:转座子(Transposable elements)是指在基因组上能从一染色体的一个位置转移到另一个位置的一段DNA序列,是大多数真核生物基因组的重要组成部分。竹亚科植物中也广泛分布着各类转座子。本研究从竹亚科植物2类DNA转座子入手,成功从竹亚科中克隆到En/Spm类转座子转座酶序列,并较系统地分析了其分类、相似性和系统进化等;探索构建了毛竹MLE双元转座子标签,并进行了有效性测试,为开发应用这2类转座子奠定一定基础,主要取得了结果:(1)从竹亚科单轴型竹种毛竹、龟甲竹,合轴型竹种梨竹、孝顺竹中成功扩增到En/Spm类转座子转座酶核苷酸序列186条,序列长度为609~661bp,相似性范围为52.9%~100%,并具有Motif1、Motif 2和Motif 3三个保守基序,推测En/Spm类转座子普遍存在于竹亚科植物中。另外,聚类分析结果显示所得的竹亚科En/Spm类转座子转座酶可分为5个组,并将其分别命名为Ba_Enspm 1、Ba_Enspm 2、Ba_Enspm 3、Ba_Enspm 4和Ba_Enspm 5。(2)En/Spm类转座子在竹亚科植物进化过程中出现了分化,具有多态性;在竹亚科植物的进化过程中受到自然选择作用的影响,同时其转座活性活性也受到了抑制;在竹亚科植物进化过程中出现了以垂直传递为主、横向传递或可存在的现象。(3)成功开发了基于毛竹MLE转座子Phmar1和Phmar2的MLE双元转座子标签:E2/Mini3-1,Xc/Mini S-1-20。这2个MLE双元转座子标签:具有GFP荧光蛋白报告基因有利于转座子转座事件的检测;可通过共转化、二次转化、杂交等方法构建含这2个标签植株,这利于人工调控该转座子标签的使用。
【学位授予单位】:浙江农林大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:Q943.2

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