葛属植物RAPD分析
【摘要】:
从72个随机引物中筛选出了18个引物在13个不同的种和类型的葛资源中具有RAPD多态性。扩增出的片段分子量在0.3~3kb之间,条带数在1~16条之间,共扩增出171个标记,样品间相同的标记有20个,多态性标记有151个,多态性标记达80%。计算了它们之间的遗传距离,用类平均法进行了聚类,并讨论了它们之间的亲缘关系。
从聚类图可以看出,在遗传距离0.53处,可以明确聚成5组,即Ⅰ组:材料1,3,12,13,7,2;Ⅱ组:材料8,9,10;Ⅲ组:材料5,6;Ⅳ组:材料4;Ⅴ组:材料11。其中,组Ⅰ和组Ⅱ又可分为亚组。
材料1和3均为野葛(P.lobata)且分别来自美国的不同州,材料12和13为野葛(P.lobata)且均产于安徽潜山县,材料5和6也同为野葛(P.lobata)且均产于陕西宝鸡市。它们首先分别聚到了同一亚组或组中。材料8,9和10均来自广东的不同地区,亲缘关系较近而聚到了同一组中,同时材料8和9均为粉葛(P.thomsonii),所以在更近的遗传距离处又聚到了同一亚组。材料11为越南葛(P.montana),它与其它材料间的亲缘关系较远,故单独成组且在较远的遗传距离处与其它材料聚在一起。材料4为从美国引进的野葛(P.lobata),在中国安徽栽培,它与同一个种的其它美国葛亲缘关系相距较远,我们认为在很大程度上是由于受安徽当地生态环境的影响较大,基因型改变较大,因而在聚类图上也单独成组。材料7原产地在陕西,为野葛(P.lobata),它与原产地为其它地区的野葛聚在同一组,所以它们很可能是起源较早时期的某一相同地区。
总之,不仅葛属植物不同种之间具有丰富的遗传多样性,而且葛种质资源的各种各样的变异还与地理上的分布呈一定的相关性。我们发现,外界环境条件和长期的自然选择作用对葛资源的基因组成和遗传变异影响较大。
【关键词】:葛属 RAPD 类平均聚类法 茶园生物防治
【学位授予单位】:安徽农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2002
【分类号】:Q943
【目录】:
【学位授予单位】:安徽农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2002
【分类号】:Q943
【目录】:
- 中文摘要4-5
- 英文摘要5-7
- 前言7-15
- 1. 国内外研究进展7-13
- 1.1 葛属植物研究概况7-8
- 1.2 RAPD技术8-13
- 1.2.1 RAPD技术的原理9
- 1.2.2 RAPD的应用9-13
- 1.3 聚类分析13
- 2. 研究目的和意义13-14
- 3. 研究内容14-15
- 材料与方法15-23
- 1. 材料15
- 2. 仪器与试剂15-16
- 2.1 主要仪器设备15-16
- 2.2 主要试剂16
- 3. 方法16-23
- 3.1 葛叶片基因组DNA的提取、纯化及检测16-18
- 3.1.1 基因组DNA的提取16-17
- 3.1.2 基因组DNA浓度的检测17
- 3.1.3 基因组DNA纯度和分子量大小的鉴定17
- 3.1.4 基因组DNA的纯化17-18
- 3.2 基因组DNA的扩增18-23
- 3.2.1 引物的选择18-20
- 3.2.2 RAPD条件的优化20-21
- 3.2.3 扩增反应体系的建立21
- 3.2.4 扩增产物的电泳21-22
- 3.2.5 凝胶的拍照22
- 3.2.6 数据统计与处理22-23
- 结果与分析23-42
- 1. 葛叶基因组DNA的提取23
- 2. RAPD扩增产物的电泳23-33
- 3. 原始数据的记录33-37
- 4. 数据统计37-39
- 5. 样品间遗传距离的计算39
- 6. 聚类分析39-42
- 讨论42-46
- 1. 基因组DNA的提取42
- 2. 基因组DNA的纯化42-43
- 3. 基因组DNA的定量43
- 4. RAPD的优点43
- 5. RAPD的可靠性研究及扩增体系的优化43-46
- 5.1 模板DNA纯度43
- 5.2 模板DNA浓度43-44
- 5.3 MgCl_2浓度,dNTP浓度和引物浓度44
- 5.4 Taq聚合酶44
- 5.5 PCR反应体积44
- 5.6 扩增反应循环数44-45
- 5.7 预变性时间45
- 5.8 变性温度和退火温度45-46
- 结论46-47
- 参考文献47-51
- 致谢51-52
- 作者简介52
| 【引证文献】 | ||
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| 【参考文献】 | ||
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| 【共引文献】 | ||
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| 【同被引文献】 | ||
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| 【二级引证文献】 | ||
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| 【二级参考文献】 | ||
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| 【相似文献】 | ||
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