收藏本站
《华侨大学》 2013年
加入收藏

高通量筛选促进重组腺相关病毒载体表达的microRNA

朱尧  
【摘要】:近年来,基因治疗已取得长足的进展,全世界已有上千例基因治疗研究进入临床试验,涉及的疾病类型不仅有先天性遗传疾病如血友病,也有许多人类高危高发性疾病,目前基因治疗的范围已从遗传病领域扩展到肿瘤、癌症、心血管疾病、神经系统疾病、传染病(包括AIDS)等领域。但无论基因治疗对人类健康的潜力如何,基因药物载体的局限性使得基因治疗无法完美实现。 基因药物载体从裸露DNA载体、非病毒载体到病毒载体发展而来,rAAV基因药物载体这一后起之秀格外引人注目,腺相关病毒(Adeno-associated virus,AAV)属于细小病毒家族,是一种单链无包膜的病毒,具有宿主范围广、非致病性、能长期稳定表达外源基因等优点,AAV被开发成为基因治疗载体——重组腺相关病毒(Recombinant adeno-associated virus,rAAV)载体,被认为是最有前景的基因治疗载体之一。大量有关腺相关病毒的临床试验仍在进行或准备中,主要用于治疗肌肉和眼部疾病。 长期以来研究人员一致认为重组腺相关病毒载体具有无致病性、低免疫原性,前期涉及啮齿类及灵长类动物的大量临床前研究也从未发现会引起严重不良反应。然而最近的血友病基因治疗临床试验表明,AAV2外壳启动了CD8+T细胞介导的免疫反应,对转导载体的肝细胞产生细胞毒性导致治疗失败。由美国宾州大学主持的治疗血友病的rAAV基因药物I/II期临床研究也发生了严重的细胞免疫反应,临床研究被迫终止。除了免疫反应之外,rAAV基因药物治疗AAT基因缺陷、帕金森病的临床试验被证明基本无效。更多临床研究出现的安全性和有效性问题,对rAAV载体的表达效率提出了更高的要求。 如何提高rAAV载体的表达效率是一项紧迫而又艰巨的任务,用于治疗基因的RNAi给rAAV载体表达效率的提高带来了新希望。由于载体和治疗基因是基因药物中的两个关键,目前基因药物设计思路中,载体只是单纯的用来运载治疗基因,而很少考虑治疗基因对载体本身的影响。 一些治疗基因,在发挥抗肿瘤作用的同时,还可提高载体的基因表达效率。2009年Johnson团队研究发现,siRNA介导的沉默核仁磷酸蛋白和抑制核仁蛋白,能分别使rAAV载体的基因表达效率最高可提高15倍和30倍。2011年Wallen团队从5520个siRNA文库中,筛选出50个能明显促进rAAV基因表达的siRNA(rAAV基因表达高于8倍)。 以上研究不但证明了利用RNAi技术可显著提高rAAV载体的表达效率,也为本论文提供了良好的借鉴。同样具有RNAi作用的miRNA可能也可以提高rAAV载体基因表达效率。本论文将探索miRNA与rAAV之间的关系,用近2000个miRNA文库,在人脐静脉内皮细胞(human umbilical vein endothelial cell,HUVEC)中筛选促进rAAV表达效率的miRNA,并对其中的明星miRNA进行下一步验证,分析其可能的靶基因以及涉及的信号通路,从而探索rAAV的机理,为基因治疗的突破打开一扇门。
【关键词】:重组腺相关病毒 microRNA 基因表达效率 基因治疗
【学位授予单位】:华侨大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2013
【分类号】:R450;Q78
【目录】:
  • 摘要3-5
  • Abstract5-11
  • 第1章 引言11-19
  • 1.1 基因治疗的研究现状11-13
  • 1.1.1 基因治疗概况11-12
  • 1.1.2 基因载体12
  • 1.1.3 基因疗法药物12-13
  • 1.2 rAAV 与基因治疗13-15
  • 1.2.1 rAAV 概况13-14
  • 1.2.2 rAAV 基因药物临床试验进展14-15
  • 1.2.3 rAAV 基因药物存在的问题及隐患15
  • 1.3 RNAi 与基因治疗15-18
  • 1.3.1 RNAi15-16
  • 1.3.2 RNAi 临床实验进展16-17
  • 1.3.3 RNAi 基因药物存在的问题17-18
  • 1.4 RNAi 与 AAV18-19
  • 第2章 促进 rAAV 表达效率的 microRNA 的筛选与验证19-38
  • 2.1 引言19
  • 2.2 实验材料、试剂和仪器19-22
  • 2.2.1 实验材料19-20
  • 2.2.2 实验试剂20
  • 2.2.3 实验仪器20-21
  • 2.2.4 试剂配制21-22
  • 2.3 实验方法22-27
  • 2.3.1 实验过程中无菌操作的要求22-23
  • 2.3.2 细胞复苏、培养、传代和冻存23-25
  • 2.3.3 转染细胞25-26
  • 2.3.4 加 rAAV-GLUC 病毒26-27
  • 2.3.5 rAAV-GLUC 荧光检测27
  • 2.3.6 MTT27
  • 2.4 实验结果及分析27-37
  • 2.4.1 促进 rAAV 载体表达的 miRNA 的筛选27-31
  • 2.4.2 促进 rAAV 载体表达的 miRNA 的验证31-37
  • 2.5 小结37-38
  • 第3章 miRNA 生物信息学预测38-56
  • 3.1 引言38-39
  • 3.2 miRNA 靶基因的预测生物信息学原理与方法39-44
  • 3.3 实验结果与分析44-55
  • 3.3.1 miRNA 靶基因的预测44-49
  • 3.3.2 miRNA 信号通路的预测49-55
  • 3.4 小结55-56
  • 第4章 结论与展望56-57
  • 4.1 结论56
  • 4.2 展望56-57
  • 参考文献57-64
  • 致谢64-65
  • 附录 A65-112
  • 附录 B112-113
  • 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果113

【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 黄文涛;郭向前;戴甲培;陈润生;;MicroRNA,lncRNA与神经退行性疾病[J];生物化学与生物物理进展;2010年08期
2 陈伟丹;花中东;杨克明;孟强;张浩;张瑛;潘湘斌;王德;李岩;李守军;;microRNA在先天性心脏病继发性肺动脉高压肺组织内变化的实验研究[J];中国细胞生物学学报;2010年04期
3 李国喜;宁小敏;康相涛;杨公社;;MicroRNA调控动物脂肪细胞的分化[J];中国生物化学与分子生物学报;2009年04期
4 叶守东;宋后燕;;微RNA在胚胎干细胞自我更新和分化中的作用[J];生命的化学;2009年04期
5 马宁;高旭;;转基因动物在microRNA研究中的应用[J];生物化学与生物物理进展;2009年09期
6 王羽欧;桑伟伟;张红胜;;microRNA在人类免疫缺陷病毒感染中的作用[J];生物技术通讯;2011年01期
7 贾万忠;李志;伦照荣;;病毒微小RNA的发现及其功能[J];科学通报;2007年23期
8 刘晓曼;许鹏;胡火珍;;MicroRNA对干细胞生物学行为的调控[J];四川生理科学杂志;2008年04期
9 张艳;徐广贤;贾浩;李娟;王玉炯;;microRNA对肿瘤细胞增殖与分化的调控[J];科技导报;2009年02期
10 徐广贤;张艳;贾浩;周萍;王玉炯;;牛肺泡巨噬细胞微小RNA的克隆与鉴定[J];畜牧兽医学报;2009年09期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 李炯;段德民;郑克孝;;新型非标记高通量microRNA芯片技术[A];第一届全国生物物理化学会议暨生物物理化学发展战略研讨会论文摘要集[C];2010年
2 王俊峰;李巍;吴小江;阮康成;;大鼠附睾microRNA表达谱的研究[A];第十一次中国生物物理学术大会暨第九届全国会员代表大会摘要集[C];2009年
3 蒋义国;刘斌斌;;毒理学中的microRNA研究[A];广东省环境诱变剂学会、广东省预防医学会卫生毒理专业委员会2010年学术会议资料汇编[C];2010年
4 巩丽颖;孙开来;;两种microRNA在先心病心肌组织中的表达[A];中国的遗传学研究——遗传学进步推动中国西部经济与社会发展——2011年中国遗传学会大会论文摘要汇编[C];2011年
5 李梦龙;;Systematically analyze and select key features to microRNA precursors identification based on random forests[A];第十一届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2011年
6 徐晨;鲍坚强;李定;郭强苏;;microRNA-449在小鼠精子发生过程中的作用研究[A];中国解剖学会2011年年会论文文摘汇编[C];2011年
7 江建霞;蒋晶晶;曹家树;;白菜花粉发育及授粉受精过程相关microRNA筛选及验证[A];中国园艺学会2011年学术年会论文摘要集[C];2011年
8 刘娜;杨景华;张明方;;嫁接西瓜microRNA的鉴定以及表达差异研究[A];中国园艺学会2011年学术年会论文摘要集[C];2011年
9 李鸿;屈晶晶;王睿;盛春君;程晓芸;王吉影;苏斌;柴尚玉;曲伸;;体外培养胰岛的microRNA表达谱及功能研究[A];中华医学会第十次全国内分泌学学术会议论文汇编[C];2011年
10 王国坤;朱嘉琦;荆清;秦永文;;缺氧刺激影响心肌细胞释放microRNA[A];第十三次全国心血管病学术会议论文集[C];2011年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 陈英云 乔蕤琳;哈医大成功研发国内首例microRNA转基因及敲减小鼠模型[N];黑龙江经济报;2010年
2 记者 朱敏丽;医药城创新牛奶检测技术[N];泰州日报;2010年
3 记者 许晓惠;乳品中微小核糖核酸科研成果公布[N];中国食品质量报;2010年
4 衣晓峰;哈医大发现心肌肥厚发生发展新机制[N];中国医药报;2010年
5 蔡敏黎昌政;用“病毒搭载因子”打开“脑栓塞”[N];科技日报;2002年
6 本报记者 何屹;你到底打了几份工?[N];科技日报;2010年
7 特约记者 肖鑫 记者 唐先武;我科学家提出肝癌预防判断与治疗新的潜在靶标[N];科技日报;2011年
8 通讯员 肖鑫 记者 陈青;发现肝癌预防判断潜在靶标[N];文汇报;2011年
9 吴一福;eGFP基因可用于神经前体细胞体内移植[N];中国医药报;2006年
10 记者 魏公铭;科技为乳品质量再设防线[N];中国食品报;2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 王雷;胰管内乳头状粘液性肿瘤:临床特征与microRNA的差异表达[D];第二军医大学;2010年
2 崔熠;microRNA在砷致胚胎发育毒性中的作用机制研究[D];北京协和医学院;2011年
3 王镇;食管黏膜鳞状上皮癌变相关microRNA的研究[D];北京协和医学院;2011年
4 侯晋;microRNA在病毒感染和肝细胞癌中的作用及相关机制研究[D];清华大学;2010年
5 骆黎静;人卵巢癌干细胞的分离、鉴定及其特异性microRNA的筛选[D];北京协和医学院;2011年
6 于曼丽;Let-7d对血管平滑肌细胞增殖调控的研究[D];第二军医大学;2011年
7 陈勇;microRNA-200c在胃癌SGC7901/CDDP细胞中的作用及其机制的研究[D];河北医科大学;2011年
8 于琦;雄激素受体在乳腺癌中表达意义和相关microRNA筛选的研究[D];天津医科大学;2010年
9 翁春华;血管生成素特异microRNAs的鉴定与功能分析[D];浙江大学;2010年
10 袁圆;全脑缺血再灌注后大鼠海马microRNA的变化及Let-7e调控Caspase-3表达和机制研究[D];浙江大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 宋永站;microRNA-200c对ZEB1表达影响及对肿瘤细胞侵袭迁移作用[D];江苏大学;2010年
2 胡德亮;microRNA-19b在P19细胞向心肌细胞分化中的作用[D];南京医科大学;2011年
3 曲婷;基于生物信息学方法的H1N1流感病毒致病及传播特性研究[D];吉林大学;2010年
4 吕赛群;基于microRNA调控靶向肿瘤细胞的溶瘤腺病毒的研究[D];浙江理工大学;2010年
5 张秀梅;韧带成纤维细胞成骨分化过程microRNA、mRNA和蛋白表达谱分析[D];济南大学;2011年
6 孙佃臣;低磷胁迫响应microRNA及靶基因的克隆和大豆遗传转化研究[D];中国农业科学院;2011年
7 吉娜;自发性高血压大鼠肥厚心肌和纤维化肾脏组织中microRNA-21的表达[D];中国医科大学;2010年
8 陈娟;靶向Livin的microRNA干扰对人卵巢癌细胞SKOV3体外作用的研究[D];河北医科大学;2010年
9 梅林;卡氏肺孢子菌MSG-UCS基因microRNA表达载体的构建和鉴定[D];重庆医科大学;2010年
10 孔飞飞;靶向YB-1基因的MicroRNA对乳腺癌MDA-MB-231细胞恶性生物学行为的影响[D];重庆医科大学;2011年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026