黄麻遗传多样性的RAPD和ISSR分析
【摘要】:
以来自中国、印度、非洲等地方的黄麻属(Corchorus)8个野生种、7
个近缘野生种、8个圆果黄麻栽培种、4个长果黄麻栽培种为供试材料,应
用RAPD(随机扩增多态DNA)和ISSR(简单重复序列间隔区)分析技术,
探讨黄麻属内种间的遗传多样性和栽培种的起源演化。所得结果如下:
1.建立了黄麻RAPD分析的技术体系:25μl反应体系中,含10mmol/l
tris-HCl(PH8.0),50mmol/l KCl,2.5mmol/l MgCl_2,150μmol/l dNTP,
0.2μmol/l随机引物,30~60ng模板DNA,1.5U TaqDNA聚合酶。反应程
序为:94℃预变性5min;94℃ 30s,37℃ 1min30s,72℃ 1min,41个循
环;72℃,7min;4℃ 20hrs.
2.在27个供试材料中,25个RAPD引物共扩增出329条带,多态条带比率
(PPB)为89.36%。25个ISSR引物共扩增出283条带,多态条带比率(PPB)
为92.58%。
3.分别依据RAPD标记和ISSR标记数据,对黄麻属供试材料进行了聚类分
析,结果表明:分别应用RAPD和ISSR资料所构建的树状聚类图,第一次
等级划分(取值水平D=0.785),可将黄麻栽培种(包括长果种、圆果种和其
近缘野生种)和野生种分成不同的两大类,反映出来自东南亚的两个栽培种
及其近缘野生种与来自非洲的其它野生种间有明显的遗传差异。第二次等级
划分(D=0.850和D=0.885),可将供试材料分成10个类群,突出了种间的
遗传差异,可将不同的种区别开来。两个栽培种(圆果种和长果种)的遗传
相似系数较高,亲缘关系较近,从构建的树状聚类图可以推测两者具有共同
的祖先。
4.由RAPD和ISSR算得的两组相似系数之间的相关系数,г=0.9547>г_0.01
(n=349),达到极显著水平,表明应用这两种技术对黄麻遗传多样性的分析
具有较高的一致性和可信度。
5.根据RAPD和ISSR标记聚类分析结果,确立C.trilocularis21C是
摘 要·2·
c.aMM的一个亚种;粘粘菜、漳浦假黄麻、开远假黄麻三者是同种异
名,建议统一使用双名法定名为CaestUanS
本研究还对黄麻属种间和种内材料的DNA提取质量、RAI,D和ISSR标
记的一致性、遗传多样性、甜麻和尊麻叶种的分类学地位等作了讨论。并结
合现代种的分布、考古学、历史学及植物地理学等对黄麻栽培种的起源与演
化进行了探讨,可以基本确立圆果种黄麻起源于中国的观点。
【关键词】:黄麻 RAPD ISSR 遗传多样性 起源 【学位授予单位】:福建农林大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2001
【分类号】:S563.4
【目录】:
- 中文摘要6-8
- 英文摘要8-10
- 1 前言10-12
- 2 文献综述12-23
- 2.1 黄麻的遗传多样性与起源演化研究进展12-17
- 2.1.1 黄麻野生种的地理分布13
- 2.1.2 黄麻栽培种的起源演化13-14
- 2.1.3 黄麻属的分类研究14-17
- 2.2 分子标记技术及其发展17-23
- 2.2.1 RFLP17-18
- 2.2.2 AFLP18
- 2.2.3 RAPD18-19
- 2.2.4 SSR19-20
- 2.2.5 ISSR20-21
- 2.2.6 SCAR21-22
- 2.2.7 SNP22-23
- 3 材料与方法23-28
- 3.1 材料23-24
- 3.1.1 植物材料23-24
- 3.1.2 RAPD和ISSR引物24
- 3.2 方法24-28
- 3.2.1 实验设计24
- 3.2.2 黄麻基因组DNA的提取24-25
- 3.2.3 RAPD实验程序25-26
- 3.2.4 ISSR实验程序26-28
- 4 结果与分析28-41
- 4.1 黄麻属植物的RAPD分析28-36
- 4.1.1 RAPD反应条件的优化28-30
- 4.1.2 RAPD引物筛选30-31
- 4.1.3 遗传多样性分析31-36
- 4.2 黄麻属植物的ISSR分析36-40
- 4.2.1 ISSR引物筛选36
- 4.2.2 遗传多样性分析36-40
- 4.3 RAPD和ISSR分析结果的相似性40-41
- 5 讨论41-48
- 5.1 黄麻DNA提取质量41
- 5.2 技术体系的建立41-43
- 5.3 遗传多样性43-44
- 5.4 RAPD和ISSR的一致性44
- 5.5 黄麻的同种异名和亚种的确立44-45
- 5.6 黄麻栽培种起源的探讨45-47
- 5.7 甜麻与荨麻叶种的分类学地位47-48
- 参考文献48-53
- 附录53-57
- 致谢57