收藏本站
《山东大学》 2010年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

DNA分子器件场效应理论研究

康大伟  
【摘要】: DNA分子是一种由核苷酸重复排列组成的长链聚合物,全称脱氧核糖核酸(Deoxyribo Nucleic Acid)。DNA是重要的生物大分子,它是生物的遗传基因的载体。DNA分子的主要组成元素是C、H、O、N、P等。通过DNA生物可以把父代的特征复制传递到子代中,从而完成生物性状的传递,因此DNA又被称为遗传物质。1953年Watson和Crick提出了著名的DNA双螺旋结构,DNA分子包含两条由糖类和磷酸分子组成的核苷链,每个糖分子都与四种碱基里的一种相连接,这两条链反向平行的互相缠绕,其上悬挂的碱基通过互补配对的原则结合。其中,腺嘌呤(Adenine)只与胸腺嘧啶(Thymine)结合,而鸟嘌呤(Guanine)只与胞啼啶(Cytosine)结合。自从Watson和Crick发现了DNA的双螺旋结构以来,关于其生物基因方面的研究开创了生物学的新时代。在另一方面,DNA的导电性引起了其他领域的关注。早在1 962年,Eley和Spivey就提出DNA分子可能具有导电性。在相邻的DNA碱基对间,存在垂直于碱基平面的π电子轨道。这些轨道的交叠就导致了可能的导电性。这就引起了生物、物理和化学多学科领域的关注,一方面,研究DNA分子的电荷输运性质对生物基因的损伤以及修复、DNA的测序有重要意义;另一方面,因为DNA分子的特殊性,它可以在溶液中自动的按照配对原则组装成完整的分子,从而完成自下而上的组装电路。如果DNA分子可以导电,它将是分子电子学良好的备选材料。传统的集成电路的基本单元是硅基晶体管,它们可以实现导通和不导通两种状态。通常的微处理器含有超过百万个晶体管,而面积在几个平方厘米。所以需要将晶体管做的很小,从而实现较高的集成度来提高运算速度。但是普通的硅基半导体在小型化的过程中遇到了瓶颈,继续小型化会造成器件不稳定。分子电子学就是用单个分子来代替硅基的半导体来制作电路,实现器件的高集成度和小型化。随着近年来纳米技术的发展,已经可以将单分子或分子束连接在电极间测量它的导电特性。DNA分子由于特殊的自组装性质,可以进行高精度的制作电路,在工程技术上具有很高的价值。 随着纳米技术的发展,近年来有很多实验直接将单个或一束DNA分子连接到金属电极间,来测量它的电导。这些实验可以更直接的揭示DNA的导电性质,也为DNA作为分子器件的可能性进行了直接的验证。这类实验的结果比较复杂,揭示的DNA的导电性有绝缘性,半导体性,导体甚至超导体。导电性的多样结果一是源于DNA本身的性质,DNA有多种序列,分子形态;二是来源于外界环境的影响,温度,溶液中的离子,电极与DNA分子的接触等。 由于实验结果的多样性,许多理论工作致力于解释DNA中电荷输运的各种现象。现阶段大致有两类理论方法用以研究DNA分子中电荷输运:第一性原理计算和模型化计算。第一性原理计算方法可以将分子的复杂结构和各类相互作用考虑在内,在进行计算的时候仅需要给出原子的种类及其位置,不需要其他的实验的、经验的或者半经验的参量,可以准确的描述DNA分子的电子态和结构特性。模型化计算方法可以抓住研究对象的一些主要特征,通过模型化参数的调控,直观的反映研究对象的物理图像和本质,很多情况下甚至可以得到解析解。同时,模型化方法可以大大降低计算量,适合扩展系统的计算,其计算结果可直接与实验测量进行比较。这两类方法相互联系,又互为补充。 在半导体晶体管中,我们可以通过外加电场和磁场来调节通过晶体管的电流,从而实现电路的开关,放大等功能。在DNA分子器件里,是否可以通过外加电场或磁场来调控体系的输运性质,这将是我们感兴趣的问题。那么,综合前人的相关研究,我们研究了外电场和外磁场对DNA分子器件电荷输运的调控。目的是通过这些研究可以指导实验,拓展DNA分子器件的应用范围。 1.电场对DNA分子器件磁阻的调控研究 磁隧道结在磁性调控器件的应用中占有重要的地位。传统的磁隧道结是把-层薄的非磁材料夹在两层铁磁材料中间,它的电阻对于两边铁磁电极的磁化方向的排列很敏感。可以通过施加一个外磁场来控制铁磁电极磁化方向成平行或者反平行排列,从而控制通过磁隧道结的电流。 因为有机物具有弱的自旋轨道耦合和超精细相互作用,有机自旋电子学成为最近的研究热点,DNA作为有机物也被用来研究自旋相关的输运。Zwolak和Ventra首先研究了DNA作为自旋阀的可能性,他们分别研究了Fe和Ni作为电极的DNA分子器件中的磁电阻,发现Ni做电极时磁电阻可以达到26%,而Fe做电极时磁电阻可以达到16%。最近,Malyshev报道了横向电场对于DNA中电荷输运的影响,他选取人工合成的Ploy(G)-Poly(C)DNA分子为研究对象,发现横向电场压制了通过DNA分子的电流。这是一个非常有意思的结论,由于DNA分子固有的双螺旋结构,横向电场引发了一个螺旋势,这个螺旋势改变了DNA分子的电子结构,从而调整了DNA分子中的导电通道。 在DNA分子器件中,横向电场和铁磁电极的加入扩展了它可能的应用范围。所以我们尝试将横向电场引入“铁磁/DNA/铁磁”分子器件中,来研究横向电场对于DNA分子器件的自旋相关输运的影响。我们的目的是想得到一个增强或者可以调节的磁阻。 1.1基于晶格格林函数和Landauer-Buttiker公式,我们首先计算了“铁磁/DNA/铁磁”分子器件在两边铁磁电极磁化方向平行和反平行排列时的电流电压特性曲线。发现平行排列时的电流要大于反平行时的电流,而且根据此电流计算得到的磁阻与Zwolak和Ventra得到的磁阻相当。 1.2施加横向电场时,我们又模拟了普通金属作为电极的“金属/DNA/金属”分子器件中的电流电压特性曲线。发现在短链DNA分子中,横向电场对于电流的压制作用与横向电场相对于DNA分子的方向有密切关系。通过体系的电流随横向电场方向的改变出现了震荡的行为,随着横向电场的增强,震荡幅度变大。 1.3我们研究了“铁磁/DNA/铁磁”分子器件中的自旋相关输运。我们探讨了利用横向电场来调控该器件磁阻的可能性。发现横向电场的方向和大小都可以有效调控体系的磁阻。在某个特定的方向和大小的横向电场下,体系的磁阻增大。这个磁阻的调制是由于横向电场改变了DNA分子的电子结构,所以这种调制是DNA分子特有的性质。 2.磁场对DNA分子器件电荷输运的调控研究 Aharonov-Bohm效应反映了电子的量子相干性,由于电子的波动性,电子在磁场中获得了一个磁场相关的相位,所以电子不同波束间的相干性就会被改变。在传统的介观器件中,通过施加磁场来改变体系的电导是一种非常有效的手段。当电子通过一个圆环形状的介观导体时,如果在环内施加一磁场,那么电导将随着介观环所包括的磁通量发生周期性的震荡。在实验上,这种类型的震荡已经在微米量级的金属圆柱体和刻蚀成的环中观测到。对于分子级别的纳米器件,最近的研究表明可以通过施加磁场来有效调控体系的电导。 除了双链的DNA分子,还存在多条链组成的DNA分子。G4-DNA分子含有四条链,其中只含有碱基G,相邻的碱基G之间由两个氢键相连接,4个碱基G连接成正方形,然后一层层堆垛成中空的管状结构。由于G4-DNA只含有一种碱基G,是一种非常有序的结构,而且有四条螺旋通道,所以G4-DNA有可能有较好的导电特性。G4-DNA拥有特殊的管状中空结构,管径为2nm,这与Hod等人所研究的原子环的直径相当。所以,G4-DNA的电导有可能具有类似的磁场响应。在本文中我就研究了利用磁场来调控G4-DNA电导的可能性。 2.1选取适当的参数,我们首先计算了“金属/G4-DNA/金属”分子器件中的基本输运性质。发现体系的电导跟费米面处的分子能级和电极与G4-DNA间的连接方式密切相关。当连接方式处于干涉加强时,体系电导处于较大值,而当连接方式处于干涉相消时,体系电导处于较小值。体系的电导还会随着G4-DNA的链长出现周期性的奇偶震荡。 2.2施加上一个平行于G4-DNA轴向的磁场时,体系的电导会受磁场的调制。通过计算电子的透射率曲线,可以看出加磁场后透射峰会发生劈裂。检查G4-DNA的能级,发现原本处于费米面处二重简并的能级在磁场下简并解除,并且关于费米面对称分布。随着磁场的增大,简并解除的能级间距离越来越大。 2.3如果体系处于干涉加强的连接方式,那么施加1T左右的磁场时,体系的电导会下降。相反,如果体系处于干涉相消的连接方式,施加磁场后,体系的电导会增加。在有限偏压和有限温度下,我们仍然可以利用量级为1T的磁场来有效调控“金属/G4-DNA/金属”体系的电导。 2.4界面耦合越弱,则体系对磁阻的响应越敏感。我们还计算了普通双链DNA分子中的磁场响应,发现磁场的作用可以忽略。
【学位授予单位】:山东大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2010
【分类号】:O469

手机知网App
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前3条
1 梁辉;;物理学与科技[J];滁州学院学报;2006年03期
2 史晶;;反式聚乙炔元激发的实坐标空间研究[J];山东教育学院学报;2007年06期
3 史晶;高琨;雷杰;解士杰;;基态非简并导电聚合物——坐标空间研究[J];物理学报;2009年01期
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 聂正新;锂离子电池正极材料LiMPO_4(M=Mn,Fe)的第一性原理研究[D];江西师范大学;2010年
2 吴洋;采用Lennard-Jones原子间势研究(C_(60))_N分子团簇的结构演化行为[D];新疆大学;2011年
3 蒋元祺;Cu_n(n=2-12,55)团簇的中性及其带电体系的密度泛函研究[D];新疆大学;2011年
4 艾合买提江·司地克;利用遗传算法和密度泛函理论研究“Cu_(13)”~±团簇的几何结构和电子性质[D];新疆大学;2011年
5 王佳民;锂离子层状正极材料LiMO_2(M=Co,Ni,Mn)的第一性原理的研究[D];江西师范大学;2011年
6 曾祥明;锂离子电池电极材料黑磷与LiMn_2O_4的第一性原理研究[D];江西师范大学;2011年
7 左友翠;固体氧化物燃料电池负极材料Sr_(n+1)Ti_nO_(3n+1)(n=1,2,3,∞)的第一性原理研究[D];江西师范大学;2011年
8 陈红霞;非线性响应对巨磁电阻的影响[D];扬州大学;2002年
9 赵金刚;一些分段光滑经典系统及其中之一所对应的量子混沌系统的特性[D];扬州大学;2002年
10 巢小刚;分段连续系统的两种特征行为:V型阵发前奏锁相阶梯及半耗散性[D];扬州大学;2003年
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 姜辉,李洪祥,杨贤金,赵乃勤,刘永长,胡文平,朱道本;DNA电性能测定方法以及DNA分子器件的研究进展[J];自然科学进展;2005年07期
2 刘秉正;物理科学与生命科学的关系[J];吉林师范大学学报(自然科学版);1992年02期
3 陈叙龙,张清敏,张毓琪,张宝东,陈素平;鲤鱼肝胰脏线粒体DNA的分离、纯化方法[J];环境化学;1994年03期
4 周晓慧;DNA与免疫[J];承德医学院学报;1998年02期
5 张爱民,张建民;论基因组的分子进化[J];菏泽师范专科学校学报;1998年02期
6 房经贵,章镇,刘大钧,马正强,JossiHillel;一种从贮藏较久番茄叶中提取适于PCR扩增的DNA的方法[J];植物生理学通讯;2000年01期
7 朱长军,张利宁,马春红,曹英林,宋静;一种新型杆状病毒亲本株的鉴定及病毒DNA的纯化[J];山东医科大学学报;2000年01期
8 张秀花,弓巧娟;分子内电荷转移荧光探针DMAHF的介质效应及与DNA的作用[J];山西大学学报(自然科学版);2000年01期
9 宗仁鹤,白春礼,李振刚,汪新文,聂焰,龚为穗,杨安庆,龚立三;激光对DNA作用机理的AFM研究[J];激光生物学报;2001年01期
10 宗志新,龚国权;阿的平荧光猝灭法测定 DNA(英文)[J];兰州大学学报(自然科学版);2002年02期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 刘海英;陈刚;步宇翔;;碱基对的多铜修饰对DNA导电性的增强作用[A];中国化学会第28届学术年会第13分会场摘要集[C];2012年
2 邢永政;杨忠强;刘冬生;;一种配体结合调控的DNA链替换反应体系的构建[A];中国化学会第28届学术年会第3分会场摘要集[C];2012年
3 邢永政;刘冬生;;ATP诱导的DNA突环结构的打开及其对DNA链替换反应的调控[A];2011年全国高分子学术论文报告会论文摘要集[C];2011年
4 周涛;陈平;杨忠强;刘冬生;;树状DNA组装体的可控自组装及尺寸响应[A];中国化学会第28届学术年会第15分会场摘要集[C];2012年
5 赵宏远;李俊杰;桑润滋;;单细胞凝胶电泳技术检测不同处理山羊精子DNA损伤[A];中国畜牧兽医学会动物繁殖学分会第十五届学术研讨会论文集(下册)[C];2010年
6 刘玲;付强;朱化彬;彭秀丽;郝海生;杜卫华;赵学明;王栋;;牛毛囊基因组DNA制备方法的比较研究[A];中国畜牧兽医学会动物繁殖学分会第十五届学术研讨会论文集(上册)[C];2010年
7 梁春柳;;一个新的筛选化合物与DNA交互作用的简便方法[A];2010年全国药物毒理学学术会议论文集[C];2010年
8 张文众;李永宁;方瑾;梁春来;张倩男;;体外新评价方法——完整细胞核DNA检测板[A];全国生化/工业与卫生毒理学学术会议论文集[C];2010年
9 邹丹丹;汪海林;;基于DNA甲基化结合蛋白MBD的甲基化分析[A];中国化学会第28届学术年会第2分会场摘要集[C];2012年
10 张晔;杜智;杨斌;高英堂;;检测外周血中游离DNA的应用前景(综述)[A];天津市生物医学工程学会第29届学术年会暨首届生物医学工程前沿科学研讨会论文集[C];2009年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 陈杰;信息技术将重组汽车DNA[N];科技日报;2010年
2 刘霞;科学家研发出新型人工合成DNA载体[N];科技日报;2010年
3 南方;化危为机 企业需韧性生长的DNA[N];中国企业报;2009年
4 吴强;港大引新技术DNA辨食材[N];中国食品质量报;2010年
5 本报记者 施晓焰 通讯员 马丽娟;云南:DNA数据库成“打拐”得力帮手[N];人民公安报;2009年
6 张巍巍;垃圾DNA可促进癌症发展首获证实[N];科技日报;2010年
7 常丽君;虱子DNA表明人类17万年前首次穿衣[N];科技日报;2011年
8 记者 冯卫东;DNA碱基序列决定其光敏性假设获证实[N];科技日报;2008年
9 许文强;拆、装更便捷的DNA双螺栓结构模型[N];大众科技报;2008年
10 记者 常丽君;研究人员发现自组装DNA链的最佳长度[N];科技日报;2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 康大伟;DNA分子器件场效应理论研究[D];山东大学;2010年
2 郭晓兰;端粒功能异常诱导的DNA损伤反应及其在肿瘤发生中的作用与分子机制[D];重庆医科大学;2010年
3 陈志健;1.8 GHz微波对X射线和阿霉素致淋巴细胞DNA损伤修复及对蛋白表达的影响[D];浙江大学;2010年
4 朱慧芳;Y家族DNA聚合酶对化学致癌物MNNG应答的转录调控研究[D];浙江大学;2009年
5 万超;抗猪瘟嵌合DNA疫苗及TRIF的DNA疫苗佐剂效应研究[D];武汉大学;2009年
6 赵丽霞;克隆绵羊印记相关基因的DNA甲基化研究[D];内蒙古农业大学;2010年
7 沈美龙;基于DNA免疫的乙型肝炎病毒表面抗原大中小蛋白的免疫原性研究[D];南京医科大学;2010年
8 徐铁刚;细菌DNA磷硫酰化修饰与限制[D];上海交通大学;2008年
9 高鹏;特异性介导DNA转导的多结构域嵌合蛋白的构建、表达及鉴定[D];吉林大学;2011年
10 高天;基于寡核苷酸芯片的地中海贫血特异性DNA甲基化的研究[D];第三军医大学;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 李芳;基于磁性微粒的法医样本DNA纯化[D];西北大学;2011年
2 芦丽淦;柚皮素及聚乙二醇增强乙肝DNA疫苗免疫效果的研究[D];河南大学;2010年
3 杨锦艳;六种香豆素有效成分与DNA相互作用的研究[D];山西医科大学;2010年
4 林启凰;用于乳腺蛋白标志基因检测的DNA电化学生物传感器的研究[D];福建医科大学;2010年
5 于文静;亚麻韧皮部特异启动子克隆与26份种质DNA指纹图谱构建[D];中国农业科学院;2010年
6 Rebecca Simisola Agboola;硼(B)和氯化钠胁迫处理诱导高粱(Sorghum bicolor)自交系发生形态和DNA甲基化的变异[D];东北师范大学;2010年
7 石微;溴氰菊酯致大鼠DNA损伤及损伤后修复功能的影响[D];青岛大学;2010年
8 张诺;DNA-纳米羟基磷灰石修饰电极的制备及在生物分析中的应用[D];济南大学;2010年
9 郭珈辰;基于图形表示的DNA相似性分析及进化树构建算法研究[D];湖南大学;2010年
10 刘香港;基于功能材料的新型电化学DNA生物传感器的研制及应用研究[D];山东农业大学;2011年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026