收藏本站
《中国海洋大学》 2010年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

太平洋牡蛎分子标记的开发与应用研究

白洁  
【摘要】: 1.太平洋牡蛎EST-SSR标记分离及特性分析 太平洋牡蛎自上世纪80年代从日本引进至今,已为贝类养殖业创造出极为可观的经济效益,为保证牡蛎种质质量和牡蛎养殖业可持续发展,依靠分子生物学和生物信息学手段,从太平洋牡蛎的ESTs数据库查找了23,816条EST序列,进行聚类分析来筛选微卫星序列,分离得到了68个EST-SSR标记,采用群体多态性分析结果显示,位点的等位基因数平均值为4.9,观测杂合度和期望杂合度分别为从0.0333到0.9667,和从0.0655到0.9149。经Bonferroni校正后,22个位点仍偏离哈迪温伯格平衡,4个位点出现连锁不平衡。经基因型判定,32个位点在全同胞家系呈现分离,其中11个位点出现偏分离。通用性检测结果显示,在C. angulata中40个位点成功扩增,C. ariakensis中有45个位点成功扩增。这68个EST-SSR标记的开发,为家系鉴定、遗传多样性检测、遗传图谱的构建和系统发育分析等工作提供更丰富的遗传标记信息。 2.太平洋牡蛎SNP标记的分离及特性分析 SNP作为第三代分子标记在牡蛎中的开发起步较晚,本研究首次利用四引物ARMS-PCR方法,分离20个太平洋牡蛎SNP标记,并采用威海野生群体和连云港养殖群体进行遗传多样性评价。最小等位基因频率威海群体从0.033到0.467,连云港群体从0.033到0.367。在威海群体观测杂合度与期望杂合度范围分别从0.067到0.800和从0.064到0.500,连云港群体观测杂合度和期望杂合度分别从0.067到0.733和从0.064到0.464。两个位点显著偏离哈迪温伯格平衡(P0.05/20),未见有位点间连锁不平衡存在。太平洋牡蛎SNP标记的开发,是绘制SNP图谱,进行性状改良和遗传疾病诊断分析的基础和依据。 3.太平洋牡蛎EPIC标记的分离及特性分析 本章利用太平洋牡蛎的功能基因和EST序列,开发了12个EPIC-PCR位点。选用连云港养殖群体进行遗传多样性检测,结果显示平均等位基因数为7.3,观测杂合度和期望杂合度范围分别为从0.067到0.633、从0.098到0.853。6个位点经校正之后显著偏离哈迪温伯格平衡(P0.05/12)。随机选取两个位点Cglns和CgEF进行内含子多态性形成的序列分析,证实内含子多态性是由随机插入和缺失引起。采用一个全同胞家系进行遗传特性分析,除CgFMO在家系中为纯合子外,其余11个位点经X2检验均符合孟德尔遗传(P0.019)。选葡萄牙牡蛎、近江牡蛎、香港巨牡蛎和熊本牡蛎进行检测,9个位点得到成功扩增,说明了EPIC良好的种间通用性。由此可见,EPIC作为一种新型遗传标记具备极大的应用潜力。 4.不同类型标记在太平洋牡蛎群体遗传学研究中的比较分析 利用gSSR、EST-SS和SNP三种标记,通过对六个太平洋牡蛎群体的遗传学研究,来对这3种标记系统进行比较分析。遗传多样性gSSR标记平均观测杂合度0.612,平均期望杂合度0.852;EST-SSR标记平均观测杂合度0.630,平均期望杂合度0.763;SNP标记平均观测杂合度0.483,平均期望杂合度0.452。三种标记分析得出的遗传分化结果以及NJ树的分枝结构都表现出相关性。EMI值gSSR为0.6544,EST-SSR为0.5265,SNP为0.4482。gSSR由于PIC值高,是家系分析、种群遗传分析的良好标记;EST-SSR由于较gSSR序列保守,更适用于系统发育分析;SNP适合高密度图谱的构建。本研究得出这三种分子标记系统在牡蛎遗传学研究分别的适用领域,为在进行不同研究时选择适合的分子标记系统提供参考。 5.基于EST-SSR标记的牡蛎系统发生研究 利用第二章开发的10个EST-SSR标记,对熊本牡蛎、岩牡蛎、葡萄牙牡蛎、有明巨牡蛎、香港巨牡蛎和太平洋牡蛎进行系统发育分析。平均等位基因数依次是4.1、3.5、4.3、4.0、4.3和5.0,21.6%的位点观测杂合度高于期望杂合度。Cgl54, CgL40两位点在所有种群中符合哈迪温伯格平衡,其它8个位点,经过Bonferroni校正后,仍然在不同种中出现显著偏离。UPMGA树和NJ树结果均显示,有明巨牡蛎与香港巨牡蛎、熊本牡蛎与岩牡蛎分别存在较近的亲缘关系,太平洋牡蛎的节点线段最长。本研究初步探讨不同地理分布的牡蛎种系统发生关系。
【学位授予单位】:

知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 温文;值得养殖的优良贝类新品种 太平洋牡蛎[J];渔业致富指南;2003年19期
2 叶永健;;太平洋牡蛎育苗技术[J];科学养鱼;2006年09期
3 苏世革;邵雁群;;胶州湾筏式养殖太平洋牡蛎试验[J];河北渔业;2007年05期
4 方笑;张福崇;陈力;崔兆进;王六顺;;海湾扇贝养殖中预防太平洋牡蛎危害技术研究[J];河北渔业;2010年06期
5 王文雄,许振祖;太平洋牡蛎面盘幼虫的压力反应研究[J];厦门大学学报(自然科学版);1990年03期
6 姚振刚,刘颇贤;太平洋牡蛎单体笼养高产技术[J];中国水产;1998年11期
7 郑小东,王如才,王昭萍,张海滨;太平洋牡蛎二倍体与三倍体的核型研究[J];中国水产科学;2000年02期
8 李国平,崔绍岩;虾池浮筏垂下式养殖太平洋牡蛎技术[J];水产科学;1996年06期
9 黄敏;关于太平洋牡蛎的养殖技术之三:浅海平挂太平洋牡蛎养殖技术的改进[J];中国水产;2000年08期
10 ;温岭太平洋牡蛎滞销[J];北京水产;2001年05期
11 刘孙贵,俞裕同;太平洋牡蛎土池育苗[J];中国水产;1988年04期
12 李华琳,李文姬,李培军;太平洋牡蛎人工育苗[J];水产科学;1998年06期
13 王俊,姜祖辉,张波,孙耀,唐启升;太平洋牡蛎同化率的研究[J];应用生态学报;2000年03期
14 王在文;太平洋牡蛎养殖技术[J];中国水产;1996年09期
15 李琪,尾定诚,森胜义,王如才;三丁基氧化锡(TBTO)对太平洋牡蛎性成熟的影响[J];青岛海洋大学学报(自然科学版);2001年05期
16 徐桂仙,高允田;太平洋牡蛎人工育苗[J];中国水产;1986年05期
17 田传远,王如才,于瑞海,王昭萍,赵厚均;太平洋牡蛎多倍体研究[J];海洋科学进展;1999年02期
18 于瑞海,王昭萍,王如才,田传远,童伟,马强;太平洋牡蛎人工育苗稳产高产技术的探讨[J];齐鲁渔业;2001年05期
19 冷文,王秀华;崂山镇养殖太平洋牡蛎创高效[J];科学养鱼;1996年05期
20 郑小东,王昭萍,王如才,张海滨;太平洋牡蛎染色体G带和Ag-NORs研究[J];中国水产科学;1999年04期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 吴志宏;孙福新;王颖;刘天红;李晓;孙元芹;李红艳;;太平洋牡蛎对镉的富集与排出动力学研究[A];渔业科技创新与发展方式转变——2011年中国水产学会学术年会论文摘要集[C];2011年
2 钟幼平;纪荣兴;张雅芝;宋振荣;严正凛;;闽南地区太平洋牡蛎育苗技术探讨[A];中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学会分会第十四次学会研讨会论文摘要汇编[C];2009年
3 ;太平洋牡蛎健康生态养殖技术[A];第二届全国现代生态渔业可持续发展论文集[C];2010年
4 李康均;王昭萍;于瑞海;姜波;郑小东;王如才;;四倍体太平洋牡蛎的诱导研究[A];贝类学会第七次会员代表大会暨第十一次学术讨论会摘要[C];2003年
5 王昭萍;于瑞海;郑小东;田传远;王如才;;太平洋牡蛎人工培育群体的繁殖习性初探[A];贝类学会第七次会员代表大会暨第十一次学术讨论会摘要[C];2003年
6 姜明;汝少国;范瑞青;陶乃蓉;王如才;;太平洋牡蛎精子的超微形态研究[A];第二届全国扫描电子显微学会议论文集[C];2001年
7 袁媛;李琪;于瑞海;于红;;紫外线诱导太平洋牡蛎雄核发育的研究[A];贝类学会第七次会员代表大会暨第十一次学术讨论会摘要[C];2003年
8 姜明;汝少国;范瑞青;谢嘉琳;;太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)精子的超微形态研究[A];中国动物学会全国显微与亚显微形态科学分会第十次形态科学与显微注射技术学术研讨会论文摘要集[C];2000年
9 王艳红;任睿;喻子牛;;太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)的EST-SSR标记开发[A];中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学分会第八次会员代表大会暨第十三次全国贝类学术讨论会论文摘要集[C];2007年
10 黄勤;;福建太平洋牡蛎与近江牡蛎的微卫星鉴别[A];中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学分会第八次会员代表大会暨第十三次全国贝类学术讨论会论文摘要集[C];2007年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 温文;太平洋牡蛎[N];广东科技报;2000年
2 沈水科;太平洋牡蛎[N];江苏科技报;2001年
3 温文;海水养殖优良贝类——太平洋牡蛎[N];中国海洋报;2003年
4 钟光伟;太平洋牡蛎笼式养殖在玉环获得成功[N];农民日报;2000年
5 许国 吴俊峰;南澳建太平洋牡蛎养殖基地[N];中国渔业报;2006年
6 倪世俊;太平洋牡蛎人工育苗技术[N];中国海洋报;2004年
7 黄喜祖 陈张勇;牡蛎药膳补肾壮阳[N];中国医药报;2007年
8 姜守轩 杨化林;浅海牡蛎筏式育肥[N];中国渔业报;2006年
9 李敏;汕头致力打造蓝色“聚宝盆”[N];汕头日报;2008年
10 许国 吴俊峰;粤东南澳岛海养科教创新结硕果[N];中国特产报;2007年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 白洁;太平洋牡蛎分子标记的开发与应用研究[D];中国海洋大学;2010年
2 王超;浒苔(Ulva prolifera)绿潮危害效应与机制的基础研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2010年
3 陈桃英;亚历山大藻对海产贝类胚胎和蒙古裸腹溞的影响及致毒机制研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2006年
4 JIXIANG WU;[D];浙江大学;2001年
5 陆光远;甘蓝型油菜显性细胞核雄性不育基因和抑制基因的分子标记及其应用[D];华中农业大学;2004年
6 朱速松;栽培水稻杂种不育新基因的定位[D];南京农业大学;2005年
7 邢亚娟;中国山杨与美洲山杨杂交种新品系选育研究[D];东北林业大学;2005年
8 王忠卫;遗传标记在鱼类育种和生态研究中的应用[D];中国科学院研究生院(水生生物研究所);2005年
9 刘云国;三种重要海水养殖鱼类的分子遗传学研究[D];中国海洋大学;2005年
10 孙晓丽;小麦抗白粉病基因的分子标记及白粉菌引发的细胞程序性死亡的相关研究[D];中国农业科学院;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 刘剑;香港巨牡蛎♀×太平洋牡蛎♂杂交及三倍体的初步研究[D];中国海洋大学;2011年
2 李兴暖;有机锡污染对太平洋牡蛎生理生化特性的影响[D];汕头大学;2003年
3 高层;重金属Pb~(2+)和Cu~(2+)对太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)毒性效应的比较研究[D];中国海洋大学;2012年
4 田雨;太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)三倍体诱导剂6-DMAP的安全性评价[D];中国海洋大学;2008年
5 高荣祥;栉孔扇贝与太平洋牡蛎雌核发育二倍体的生物学特性研究[D];中国海洋大学;2008年
6 高咏卉;改性粘土治理有害赤潮对生态环境的影响初探[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2006年
7 冯金晓;富硒牡蛎蛋白固体饮料的研制[D];中国海洋大学;2009年
8 王绍宗;长牡蛎SNP标记的开发及多态性检测[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2009年
9 孔静;太平洋牡蛎三倍体培育及生长研究[D];中国海洋大学;2011年
10 王丹;发酵型牡蛎饮料的研制[D];中国海洋大学;2011年
中国知网广告投放
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978