收藏本站
《中国海洋大学》 2003年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

浮游细菌遗传多样性分析的T-RFLP方法研究

柳承璋  
【摘要】: 微生物群落是微食物环的重要组分,在自然水体的碳、氮、磷和硫的循环中具有重要的作用。早期的水体微生物多样性研究建立在传统的微生物培养技术的基础上,结果中存在较大的偏差。 为了克服传统方法的弊端,本论文对近年来在国外微生物遗传多样性研究中发展迅速的T-RFLP方法进行探索,目的在于掌握其原理、方法和应用,以及优缺点,以便应用到微生物分子生态学的研究中去。 本研究将T-RFLP方法应用于现场采样、液体和平板培养的细菌。对方法中各个步骤,包括DNA提取与纯化、PCR引物的选择和反应条件的确定、限制性酶切和产物的纯化,以及最终酶切片段的分离和检测进行了摸索。 研究结果表明:PCR引物的选择对实验成功具有决定性的作用,通常被认为是通用于细菌门的引物(S-D-Bact-8-a-S-20和S-D-Bact-1542-a-A-20,以及S-D-Bact-8-a-S-20和S-D-Bact-1492-b-A-16)并不能扩增试验水域细菌类群的16S rDNA,经比较确定适合于本试验水域细菌群落的引物为S-D-Bact-0011-a-S-17和S-D-Bact-1512-a-A-16;试验水域的细菌群落可能由特殊的细菌类群组成。DNA提取和PCR的空白试验表明,本方法容易受到污染的影响,对实验材料和无菌操作的要求必须严格。从平板培养样品的T-RFLP图谱判断它们属于至少3种不同的类群;湖水样品0.2μm膜样图谱表明湖水中自由的生活细菌至少包括22个不同的类群。湖水中吸附于颗粒的细菌至少有4个类群。自由生活和吸附于颗粒的细菌类群组成存在显著的差别。适合于在平板培养条件下生长的类群并非湖水中的优势类群,这一结果进一步证实了传统的培养方法在分析水体细菌群落生物多样性方面的不足。
【学位授予单位】:中国海洋大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2003
【分类号】:Q933

手机知网App
【引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 刘淼;新疆特殊地貌微生物多样性研究[D];石河子大学;2011年
2 庞观宏;湛江港网箱养殖海域环境因子与细菌数量的调查及弧菌属细菌的分布[D];广东海洋大学;2010年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前3条
1 李江涛;周怀阳;彭晓彤;吴自军;;海底热液活动区地微生物学研究中的分子生物学技术[J];地球科学进展;2009年09期
2 张健;赵阳国;李海艳;白洁;田伟君;;黄海西北近岸沉积物中细菌群落空间分布特征[J];海洋学报(中文版);2010年02期
3 杨桂梅;鲍宝龙;李会荣;唐文乔;任大明;;暗纹东方鲀几种组织中可培养细菌的组成分析(英文)[J];上海水产大学学报;2008年01期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 ;Does capillary racetrack-based enrichment reflect the diversity of uncultivated magnetotactic cocci in environmental samples?[A];中国科学院地质与地球物理研究所2008学术论文汇编[C];2009年
中国博士学位论文全文数据库 前8条
1 穆春华;西北太平洋深海沉积物微生物多态性分析[D];中国海洋大学;2005年
2 刘彬彬;高效废水处理生物反应器中优势功能菌的分子识别与鉴定[D];上海交通大学;2006年
3 陈悟;硫酸盐还原菌多相分类系统与综合防治方法研究[D];华中科技大学;2006年
4 丁颖;生物滤器处理恶臭气体及其微生物生态研究[D];浙江大学;2007年
5 杨金龙;小鹅瘟强毒在人工感染雏鹅体内侵染规律及对消化道菌群结构影响的分子解析[D];四川农业大学;2009年
6 马保国;硫酸盐还原菌与固体废物协同修复煤矸石污染的研究[D];中国矿业大学(北京);2009年
7 林惠荣;水稻土壤重金属和硫分子形态转化的功能微生物作用机制[D];浙江大学;2010年
8 阿亚兹(Ayaz Ahmed);牙菌斑的分子微生态结构分析以及乳酸杆菌抑制变异链球菌属形成生物膜的治疗作用[D];大连医科大学;2012年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 李正华;东平湖浮游细菌群落多样性分析[D];山东农业大学;2010年
2 和振花;北极海水中可培养寡营养细菌多样性研究[D];华中师范大学;2011年
3 孙丹鹏;济南市黑虎泉趋磁细菌的纯培养及多样性分析[D];山东大学;2011年
4 刘娜;黄瓜不同发育期土壤微生物分子生态研究[D];河南农业大学;2004年
5 张庆;硝基苯甲酸类废水污泥驯化及其微生物群落结构研究[D];西南农业大学;2004年
6 周宏霞;青岛近海岸特征环境中海洋异养细菌的鉴定及其分布特征的研究[D];中国海洋大学;2006年
7 谢新强;红树林土壤Streptomyces violaceoruber clade的选择性分离[D];华南热带农业大学;2007年
8 沈振国;红树林环境Micromonosporaceae的分离、初步鉴定及活性评价[D];华南热带农业大学;2007年
9 肖勇;16S rRNA/rDNA序列分析技术应用于环境微生物群落的初步研究[D];湖南大学;2007年
10 姜丽晶;珠江口沉积物微生物多样性及其与环境相互关系的研究[D];国家海洋局第三海洋研究所;2007年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 许褆森;;内生固氮菌研究进展[J];安徽农业科学;2008年12期
2 陈伟珍,林轩,杨桂珍,邓秀清;湛江港沙湾对虾养殖场虾池水质状况分析[J];水产科学;2004年10期
3 郭跃;试论生物对地貌的影响及其方式[J];重庆师范学院学报(自然科学版);1996年04期
4 史君贤,陈忠元,胡锡钢;浙江省海岛沿岸水域微生物生态分布[J];东海海洋;1996年02期
5 宁修仁;微型生物食物环[J];东海海洋;1997年01期
6 李华,邢殿楼,戴国庆;河蟹工厂化育苗期间水及蟹体中异养细菌的研究[J];大连水产学院学报;2002年02期
7 尹玉军,陈静生;一种利用岩石漆测定年龄和研究古气候的新方法[J];地球科学进展;1991年02期
8 潘耀谦,金春彬;聚合酶链反应(PCR)技术体系研究进展[J];动物医学进展;1999年04期
9 周本刚,柳覃卓,张裕明;天山北麓岩石漆显微层理层序的初步建立及其年代学意义[J];地震地质;1999年04期
10 许斌福,林能锋,杨金先,俞伏松,董传甫,林天龙;大黄鱼副溶血弧菌的分离、鉴定及致病力分析[J];福建农业学报;2002年03期
中国博士学位论文全文数据库 前3条
1 邹玉霞;大菱鲆致病菌的分离鉴定和鳗弧菌溶血素基因的克隆、突变和表达[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2004年
2 肖慧;渤海湾近岸海域的细菌学研究及其在海岸带环境质量评价中的应用[D];中国海洋大学;2005年
3 姜胜;广州海域主要污染物的分布与环境质量评价[D];暨南大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前3条
1 于德华;青岛近岸不同环境中海洋弧菌的检测及用PCR方法快速检测病原鳗弧菌[D];中国海洋大学;2003年
2 贾俊涛;T-RFLP分析在细菌调查方面的应用[D];中国海洋大学;2003年
3 谢立民;柘林湾细菌、弧菌和异养菌数量的时空分布和细菌生产力研究[D];暨南大学;2004年
【二级引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前3条
1 刘淼;新疆特殊地貌微生物多样性研究[D];石河子大学;2011年
2 邝英朋;湛江港网箱养殖海区水质因子与细菌数量的关系及弧菌属细菌的分布[D];广东海洋大学;2011年
3 薛娟;乌鲁木齐10号泉水体微生物对地震的响应[D];石河子大学;2013年
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 白洁,李岿然,李正炎,孙军,魏皓,刘素美,吴增茂;渤海春季浮游细菌分布与生态环境因子的关系[J];青岛海洋大学学报(自然科学版);2003年06期
2 冯胜;高光;秦伯强;陈默;;太湖北部湖区水体中浮游细菌的动态变化[J];湖泊科学;2006年06期
3 马继波;董巧香;黄长江;;粤东大规模海水增养殖区柘林湾浮游细菌的时空分布[J];生态学报;2007年02期
4 姜彩虹;张美玲;陶琰洁;禹娜;陈立侨;;上海市内不同水质的河道春季浮游细菌群落结构分析[J];微生物学通报;2009年04期
5 李洪波;崔向阳;林凤翱;樊景凤;;河北近岸海域浮游细菌与病毒的关系[J];海洋环境科学;2010年02期
6 刘国才,李德尚,董双林;对虾综合养殖围隔中浮游细菌生产力的研究[J];生态学报;2000年01期
7 肖天,李洪波,赵三军,岳海东;海洋浮游细菌在碳循环中的作用[J];海洋科学;2004年09期
8 肖慧;张喆;张艳;于庆云;唐学玺;;春秋季山东南部近岸浮游细菌生态分布[J];中国海洋大学学报(自然科学版);2009年04期
9 郭亮;邢鹏;蒋伟伟;刘正文;;沉积物再悬浮对浮游细菌群落结构的影响[J];环境科学;2010年08期
10 姜发军;胡章立;胡超群;;大鹏湾浮游细菌时空分布与环境因子的关系[J];热带海洋学报;2011年01期
中国重要会议论文全文数据库 前5条
1 王广华;谢练武;戴世鲲;李翔;;夏冬两季粤西-琼东南近海浮游细菌和病毒的空间分布[A];第十次全国环境微生物学术研讨会论文摘要集[C];2007年
2 张心齐;吴月红;许学伟;吴敏;;南海表层水浮游细菌的多样性研究[A];第四届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会论文集[C];2012年
3 肖天;孙晟;赵三军;岳海东;;中国近海浮游细菌的分布和作用[A];加入WTO和中国科技与可持续发展——挑战与机遇、责任和对策(上册)[C];2002年
4 肖天;李洪波;赵三军;岳海东;;海洋浮游细菌在碳循环中的作用[A];山东微生物学会第六次会员代表大会暨2004年学术年会论文集(上)[C];2004年
5 李洪波;肖天;刘桂梅;吕瑞华;丁涛;;南黄海潮汐锋对浮游细菌生物量分布的影响[A];山东微生物学会第六次会员代表大会暨2004年学术年会论文集(上)[C];2004年
中国博士学位论文全文数据库 前3条
1 张喆;山东近岸海域浮游细菌、病毒生态学调查及沉积物细菌多样性研究[D];中国海洋大学;2008年
2 李洪波;南黄海浮游细菌的分布特点与水文现象的影响研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2005年
3 曾永辉;典型海洋环境中浮游细菌多样性及环境适应机制的研究[D];厦门大学;2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 鲍素敏;巢湖水体浮游细菌群落结构时空差异的分子生态学研究[D];安徽农业大学;2008年
2 郭亮;干扰—沉积物再悬浮对浮游细菌群落结构和多样性的影响[D];华中农业大学;2010年
3 赵海萍;渤海湾浮游细菌及水层生态水动力学模拟[D];天津大学;2006年
4 李正华;东平湖浮游细菌群落多样性分析[D];山东农业大学;2010年
5 张昊飞;胶州湾无机营养盐对异养浮游细菌的影响研究[D];中国海洋大学;2004年
6 江晓亮;大亚湾海域浮游细菌群落结构的时空变化[D];暨南大学;2013年
7 黄瑾;太湖附着细菌与浮游细菌的群落结构及多样性研究[D];南京信息工程大学;2011年
8 毛杰;惠州西湖沉水植被修复对浮游细菌群落结构的影响[D];暨南大学;2011年
9 王娜;山东青岛近岸海域浮游细菌的生态学研究[D];中国海洋大学;2008年
10 刘妮;湿地溶源性浮游细菌的生态分布及其基因多样性[D];华中师范大学;2008年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026