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《中国海洋大学》 2006年
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东海原甲藻基因表达特征研究

张秀芳  
【摘要】: 尽管东海原甲藻(Prorocentrum donghaiense)的命名仍存在分歧,但它是我国特有的赤潮藻种,最近几年已在长江口和舟山群岛产生大规模的赤潮,造成了重大的经济损失和给生态带来了重大的影响,由此引起人们极大的关注。 进年来,有关它的生活史,生态,分类,形态等研究很多,但其分子生物学研究却非常少。为了在东海原甲藻中开展相关的分子遗传学研究,我们构建了人工培养状态下的东海原甲藻对数生长期细胞的cDNA文库。从随机选取的700个克隆获得了565条可用的序列。本论文报道了从这些序列中鉴定的功能基因,尤其是那些与细胞程序化死亡相关的基因。另外,我们还对线粒体细胞色素b基因及细胞色素氧化酶亚基I基因进行了克隆与分析。 在东海原甲藻的cDNA文库构建中,使用UNIQ-10 Trizol Total RNA Preparation Kit来进行总RNA的提取,将cDNA Synthesis Kit和PCR cDNA Library Kit组合使用进行cDNA的扩增,最后,将cDNA与pMD 18-T载体连接后转化到大肠杆菌JM109中。 鉴定功能基因的一个比较恰当的途径是表达序列标签分析。实际上,这样的分析已经在许多真核生物中进行,被认为在某中程度上发挥与全基因组测序相同的作用。表达序列标签就是一段cDNA序列,能定义这些cDNA,但因为是单方向测序产物,不仅节约成本,也能获得与全长基因相似的信息。它们除了作为基因标签,也能用来比较转录物集合,做DNA芯片,尤其是鉴定功能基因。我们从东海原甲藻的cDNA文库中随机挑取克隆进行测序,得到565条EST这些序列可分为272个单一序列和36个重叠群(308个EST组)。在蛋白数据库中比较发现23组与已知功能蛋白相似的克隆,其中的大部分与能量代谢、转录/翻译及光合作用有关。 有9组与甲藻中已知蛋白序列相匹配。另有14组与其它生物体中的已知蛋白序列相匹配。特别重要的是有两组EST分别与两个细胞程序化死亡的关键蛋白同缘,它们分别是半胱氨酰天冬氨酸特异蛋白酶(cysteine proteases)和分裂细胞
【学位授予单位】:中国海洋大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2006
【分类号】:Q943.2

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【引证文献】
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 赵丽媛;东海原甲藻增殖细胞核抗原基因表达量与生长关系的研究[D];中国海洋大学;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 宋淑华;大亚湾浮游植物群落结构与赤潮藻分子鉴定研究[D];暨南大学;2009年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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中国重要会议论文全文数据库 前10条
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中国博士学位论文全文数据库 前10条
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9 杨德周;东海陆架黑潮入侵及生态响应数值模拟研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2011年
10 张清春;东海大规模甲藻赤潮种吞噬特性及其在赤潮形成中的作用初探[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 魏礼玲;MYB转录因子家族相关EST干涉载体构建及遗传转化的研究[D];华中农业大学;2010年
2 万珊;柑橘粉虱对柑橘叶片挥发物的行为反应及其遗传分化研究[D];华中农业大学;2010年
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4 吕国峰;猪ACTN3基因功能的初步研究[D];华中农业大学;2010年
5 王亚男;与棕色棉纤维颜色性状紧密连锁的分子标记研究[D];安徽农业大学;2010年
6 陆景标;高丹草SSR引物电子PCR及遗传多态性分析[D];安徽农业大学;2010年
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10 周秦;山核桃果实成熟期间基因表达的初步分析[D];浙江农林大学;2010年
【同被引文献】
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中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 姜胜;广州海域主要污染物的分布与环境质量评价[D];暨南大学;2006年
【二级引证文献】
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1 刘云;不同营养环境下海洋微藻生化组成与分子生物学响应特征研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2012年
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2 仲洁;链状亚历山大藻生长衰亡相关基因的筛选及分析[D];中国海洋大学;2011年
3 康伟;广东典型海域表层沉积物中赤潮藻类休眠体的分布及赤潮发生潜势研究[D];暨南大学;2010年
4 王曲圆;增殖细胞核抗原基因作为东海原甲藻生长指标的现场实验研究[D];中国海洋大学;2012年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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7 郭彩华;刘静雯;卢珍华;詹玲玲;;东海原甲藻钙调蛋白的分离纯化及鉴定[J];集美大学学报(自然科学版)网络版(预印本);2009年01期
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10 王秀秀;黄邦钦;;中肋骨条藻在磷营养限制下的补偿生长效应[A];庆祝中国藻类学会成立30周年暨第十五次学术讨论会摘要集[C];2009年
中国重要报纸全文数据库 前9条
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2 记者 章建民 通讯员 昝爱宗;沿海赤潮近期仍将持续[N];浙江日报;2004年
3 周宽宏 赵小兰 董佩军;舟山赤潮趋稳 仍需警惕反复[N];中国气象报;2004年
4 记者 陈纪蔚 通讯员 黄渭;浙江海洋环境形势依然不容乐观[N];浙江日报;2004年
5 方芳;舟山附近海域发生特大赤潮[N];中国环境报;2004年
6 昝爱宗;浙江加强海洋环境监测和灾害预报[N];中国海洋报;2004年
7 张佩颖;浙江舟山附近海域发生特大赤潮灾害[N];中国企业报;2004年
8 本报记者 张斌键;我国海洋环境仍面临严峻挑战[N];中国海洋报;2011年
9 记者 牟永选;大陈海域发生赤潮[N];台州日报;2011年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 赵丽媛;东海原甲藻增殖细胞核抗原基因表达量与生长关系的研究[D];中国海洋大学;2009年
2 袁健;东海三种重要赤潮藻荧光定量PCR检测技术的建立和应用[D];中国海洋大学;2012年
3 刘永健;东海原甲藻磷胁迫响应基因的分析及细胞死亡相关基因的克隆与分析[D];中国海洋大学;2007年
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5 陈洋;DSP等赤潮藻毒素对哺乳类细胞的毒性效应及机制研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2008年
6 刘云;不同营养环境下海洋微藻生化组成与分子生物学响应特征研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2012年
7 王进河;两种赤潮微藻与两种轮虫相互作用对气候因子变化响应的实验生态学研究[D];中国海洋大学;2012年
8 张清春;东海大规模甲藻赤潮种吞噬特性及其在赤潮形成中的作用初探[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2011年
9 张秀芳;东海原甲藻基因表达特征研究[D];中国海洋大学;2006年
10 杨庶;长江口及邻近海域浮游植物生长温度效应研究[D];中国海洋大学;2013年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 孙树刚;东海原甲藻对尿素的吸收与利用特征[D];暨南大学;2010年
2 王曲圆;增殖细胞核抗原基因作为东海原甲藻生长指标的现场实验研究[D];中国海洋大学;2012年
3 王国善;东海原甲藻增殖细胞核抗原的体外表达和抗体制备[D];中国海洋大学;2011年
4 张德强;不同营养盐条件对东海原甲藻生化性质的影响研究[D];青岛科技大学;2011年
5 李慧;化感作用对中肋骨条藻和东海原甲藻种间竞争的影响[D];中国海洋大学;2011年
6 丁雁雁;温度、光照对东海几种典型赤潮藻生长及硝酸还原酶活性的影响[D];中国海洋大学;2012年
7 庞秋婷;富营养化对东海两种赤潮优势藻种演替及黄海海区浒苔生长的影响[D];中国海洋大学;2013年
8 陈翰林;东海赤潮的现场调查及赤潮原因种的相互作用效应研究[D];暨南大学;2006年
9 谢瑾;塔玛亚历山大藻化感作用研究[D];暨南大学;2006年
10 陈芝兰;凤眼莲根对赤潮藻生长的抑制作用及其机理研究[D];暨南大学;2005年
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