食源性致病菌快速检测方法的建立及其试剂盒的研制与应用
【摘要】:食源性致病菌是危害食品安全和人类健康的主要因素。近年来,食品安全事件频发,不仅影响到人们的生活、工作和健康,更是关系到国计民生的大事。随着经济的发展和人们生活水平的提高,食品安全问题越来越受到重视。我国流行的食源性疾病中,细菌性食物中毒居首位,因此,食品中食源性致病菌检测是食品卫生安全检测中一个重要的部分。常见的食源性致病菌包括沙门氏菌、致病性大肠杆菌、弯曲杆菌、副溶血性弧菌、葡萄球菌及毒素、蜡样芽胞杆菌、产气荚膜梭菌、变形杆菌属、阪崎肠杆菌、李斯特菌、结肠炎耶尔森氏菌、志贺氏菌等。面对日益增加的多重混合污染,目前的检测方法显得滞后,因此建立快速、高效、准确的食源性致病菌的检测方法已成当务之急。
多重PCR是在同一PCR反应体系中加入多对引物,同时扩增出多个核酸片段的PCR反应。克服了常规PCR方法单一、费时、繁琐等缺点,从而实现了多种食源性致病菌的快速同时检测,多重PCR检测方法有着更为广阔的发展空间。
本研究针对空肠弯曲杆菌(Campylobacter jejuni)、副溶血弧菌(Vibrioparahaemolyticus)、小肠结肠炎耶尔森菌(Yersinia enterocolitica)、阪崎肠杆菌(Enterobacter sakazakii)、产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)、奇异变形杆菌(Proteus mirabilis)6种食源性致病菌建立了多重PCR快速检测方法。分别根据空肠弯曲杆菌的马尿酸酶hipO基因、副溶血弧菌的不耐热溶血毒素tlh基因、小肠结肠炎耶尔森菌的粘附侵袭位点Ail基因以及阪崎肠杆菌的16S核糖体16SrRNA基因、产气荚膜梭菌的磷脂酶cpa基因、奇异变形杆菌的Tu延伸因子tuf基因设计6对特异性引物,PCR扩增的目的基因片段长度分别为1028bp、450bp、274bp、282bp、120bp、541bp。建立多重PCR检测方法,并研制出两套三重PCR试剂盒,实现了6种食源性致病菌的同时检测。
对多重PCR反应体系中引物添加量、镁离子浓度、dNTP mixture添加量及退火温度和循环数等影响要素通过L20(55)正交试验确定最佳反应体系,确定了适宜的多重PCR反应体系和扩增程序,即优化的三重PCR反应体系为:50μL反应体系中,10×PCR Buffer5μL,Mg~(2+)(25mM)3μL,dNTP mixture(25mM)4μL,Taq酶(5U)1μL,模板各2μL,hipO、tlh和Ail终摩尔量分别为15pmol、5pmol和7.5pmol,16S rRNA、cpa和tuf终摩尔量分别为5pmol、15pmol和5pmol,双蒸水补足至50μL;两套多重PCR试剂盒扩增循环参数为:多重PCR反应采用冷启动,94℃预变性5min;然后变性(94℃,30s),退火(57℃,40s),延伸(72℃,70s),35个循环,最后72℃延伸15min。
反应产物在2%的琼脂糖凝胶中进行电泳,凝胶成像系统观察结果。对多重PCR扩增产物胶回收后连接到pMD18-T载体上转化进大肠杆菌DH5α中,阳性克隆质粒进行DNA测序,登录Genebank将测序结果进行网上blast同源性比对,从而证实PCR扩增产物确为目的扩增产物。
试验中利用人工污染的肉及乳制品,对6种食源性致病菌的特异性、灵敏度进行同时检测。其中副溶血弧菌、阪崎肠杆菌和产气荚膜梭菌的多重PCR灵敏度与单重PCR相比,低一个梯度;而其他三种致病菌与单重相比灵敏度不变。空肠弯曲杆菌的检出极限为3.0×101cfu/ml,副溶血弧菌的检出极限为6.2×101cfu/ml,小肠结肠炎耶尔森菌的检出极限为1.5×101cfu/ml;阪崎肠杆菌的检出极限为1.9×101cfu/ml,产气荚膜梭菌的检出极限为5.8×101cfu/ml,奇异变形杆菌的检出极限为2.4×101cfu/ml。
应用本试验研制的两套三重试剂盒,对泰安地区食源性致病菌的流行情况进行实际样品检测。从泰安各农贸市场、家禽屠宰市场、家禽零售处、家禽交易市场等采集鸡的粪便、羽毛、新鲜鸡肉、冷冻鸡肉及其屠宰用水、屠宰用具等样品409份;从泰安某奶牛场和超市采集新鲜牛奶及奶粉样品392份。经检测,样本中85份检出空肠弯曲杆菌,阳性率20.8%,6份检出副溶血弧菌,阳性率1.5%,54份检出小肠结肠炎耶尔森菌,阳性率13.2%;1份检出阪崎肠杆菌,阳性率0.1%,48份检出产气荚膜梭菌,阳性率6.0%,48份检出奇异变形杆菌,阳性率6.0%。将多重PCR方法的检测结果与国标法进行比较,符合率为100%。
由试验结果得知:本研究建立的多重PCR方法具有操作简便,检测周期短,敏感度和特异性高等优点,可在5h内得到检测结果,能同时检测上述六种病原菌。为食品及其原料的生物安全监测提供了新的、更准确的技术手段,可用于动物细菌性疾病的临床诊断。
【关键词】:多重PCR试剂盒 空肠弯曲杆菌 副溶血弧菌 小肠结肠炎耶尔森菌 阪崎肠杆菌 产气荚膜梭菌 奇异变形杆菌 样品检测
【学位授予单位】:山东农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:S854.4
【目录】:
【学位授予单位】:山东农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:S854.4
【目录】:
- 中文摘要10-12
- Abstract12-15
- 前言15-31
- 1 食源性致病菌及其流行现状15-17
- 1.1 食品安全15-16
- 1.2 食源性疾病16
- 1.3 食源性疾病的流行情况16-17
- 1.4 食源性致病菌检测现状17
- 2 本研究所涉及的食源性致病菌及其危害17-22
- 2.1 空肠弯曲杆菌17-18
- 2.2 副溶血弧菌18-19
- 2.3 小肠结肠炎耶尔森菌19-20
- 2.4 阪崎肠杆菌20-21
- 2.5 产气荚膜梭菌21-22
- 2.6 奇异变形杆菌22
- 3 食源性致病菌快速检测方法22-29
- 3.1 传统检测方法23
- 3.2 免疫学方法23-25
- 3.2.1 酶联免疫吸附(ELISA)检测23-24
- 3.2.2 免疫荧光技术(IFT)24
- 3.2.3 乳胶凝集试验(RPLA)24
- 3.2.4 免疫胶体金技术24-25
- 3.2.5 免疫磁珠分离技术25
- 3.2.6 免疫印迹法25
- 3.3 生物传感技术25-26
- 3.4 分子生物学技术26-27
- 3.4.1 基因芯片技术26
- 3.4.2 核酸探针技术26-27
- 3.5 PCR 技术27-29
- 3.5.1 实时荧光定量 PCR 技术27-28
- 3.5.2 常规 PCR 检测技术28
- 3.5.3 多重 PCR 检测技术28-29
- 4 肉、乳及乳制品中食源性致病菌检测研究现状29-30
- 5 本研究的目的及意义30-31
- 引言31-32
- 1 材料32-37
- 1.1 菌株32
- 1.2 主要培养基32-35
- 1.3 主要试剂及其配方35-37
- 1.4 主要仪器37
- 2 方法37-67
- 2.1 六种食源性致病菌的培养、分离和鉴定37-55
- 2.1.1 空肠弯曲杆菌的培养、分离和鉴定38-41
- 2.1.2 副溶血弧菌的 、分离和鉴定41-46
- 2.1.3 小肠结肠炎耶尔森菌的培养、分离和鉴定46-48
- 2.1.4 阪崎肠杆菌的培养、分离和鉴定48-50
- 2.1.5 产气荚膜梭菌的培养、分离和鉴定50-53
- 2.1.6 奇异变形杆菌的培养、分离和鉴定53-55
- 2.2 致病菌 DNA 提取方法55-58
- 2.2.1 煮沸法55
- 2.2.2 CTAB/NaCl 法55-56
- 2.2.3 苯酚-氯仿法56
- 2.2.4 蛋白酶 K 法56-57
- 2.2.5 试剂盒法57
- 2.2.6 chelex-100 法57-58
- 2.2.7 FTA 滤膜法58
- 2.2.8 破碎法58
- 2.3 食源性致病菌 DNA 的验证58
- 2.4 目的基因的选择及引物设计58-59
- 2.5 阳性模板的制备59-63
- 2.5.1 单重 PCR 反应体系的建立59
- 2.5.2 PCR 产物的琼脂糖凝胶电泳鉴定59
- 2.5.3 PCR 产物的纯化及回收59-60
- 2.5.4 DH5α感受态细胞的制备60-61
- 2.5.5 PCR 产物与载体连接61
- 2.5.6 重组质粒转化感受态细胞61
- 2.5.7 重组质粒的鉴定61-62
- 2.5.8 序列测定62-63
- 2.5.9 质粒的定量63
- 2.6 单重 PCR 特异性和灵敏度63-64
- 2.6.1 特异性测定63
- 2.6.2 灵敏度测定63-64
- 2.7 多重 PCR 扩增条件的优化64
- 2.8 多重 PCR 的特异性检测64-65
- 2.8.1 空肠弯曲杆菌、副溶血弧菌、耶尔森菌三重 PCR 反应的特异性64-65
- 2.8.2 阪崎肠杆菌、产气荚膜梭菌、奇异变形杆菌三重 PCR 反应的特异性65
- 2.9 多重 PCR 的灵敏度检测65
- 2.10 模拟样品检测65
- 2.11 试剂盒的研制及其稳定性、重复性和保存期试验65-66
- 2.12 山东泰安地区该六种致病菌流行情况监测调查66-67
- 3 结果67-82
- 3.1 DNA 模板的提取方法的比较67
- 3.2 多重 PCR 引物设计结果67-68
- 3.3 单重 PCR 特异性和灵敏度分析68-71
- 3.3.1 单重 PCR 特异性的测定结果68-70
- 3.3.2 单重 PCR 灵敏度的测定结果70-71
- 3.4 多重 PCR 反应优化结果71-72
- 3.5 多重 PCR 体系特异性检测结果72-74
- 3.6 多重 PCR 反应的灵敏度74-77
- 3.7 人工污染模型样品检测结果77-79
- 3.8 试剂盒的研制及其稳定性、重复性和保存期试验79-80
- 3.8.1 试剂盒的组装79
- 3.8.2 试剂盒稳定性、重复性和保质期试验结果79-80
- 3.9 山东泰安地区该 6 种致病菌流行情况监测结果80-82
- 3.9.1 禽类样品检测结果80-81
- 3.9.2 乳及乳制品检测结果81-82
- 3.9.3 与国标检测方法比较82
- 4 讨论82-88
- 4.1 多重 PCR 的影响因素83-86
- 4.1.1 引物浓度与引物比例83-84
- 4.1.2 引物 Tm 值的影响84
- 4.1.3 Taq 酶、dNTP 和 Mg~(2+)浓度84-85
- 4.1.4 多重 PCR 反应条件的优化——正交试验85
- 4.1.5 多重 PCR 的特异性和灵敏度85-86
- 4.2 多重 PCR 反应污染的防控86
- 4.3 泰安地区样品检测86-87
- 4.4 与国标检测方法比较87
- 4.5 展望87-88
- 结论88-89
- 参考文献89-99
- 致谢99-100
- 攻读学位期间论文发表情况100
| 【参考文献】 | ||
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| 【共引文献】 | ||
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| 【二级参考文献】 | ||
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| 【相似文献】 | ||
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