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《山东农业大学》 2012年
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食源性致病菌快速检测方法的建立及其试剂盒的研制与应用

周明东  
【摘要】:食源性致病菌是危害食品安全和人类健康的主要因素。近年来,食品安全事件频发,不仅影响到人们的生活、工作和健康,更是关系到国计民生的大事。随着经济的发展和人们生活水平的提高,食品安全问题越来越受到重视。我国流行的食源性疾病中,细菌性食物中毒居首位,因此,食品中食源性致病菌检测是食品卫生安全检测中一个重要的部分。常见的食源性致病菌包括沙门氏菌、致病性大肠杆菌、弯曲杆菌、副溶血性弧菌、葡萄球菌及毒素、蜡样芽胞杆菌、产气荚膜梭菌、变形杆菌属、阪崎肠杆菌、李斯特菌、结肠炎耶尔森氏菌、志贺氏菌等。面对日益增加的多重混合污染,目前的检测方法显得滞后,因此建立快速、高效、准确的食源性致病菌的检测方法已成当务之急。 多重PCR是在同一PCR反应体系中加入多对引物,同时扩增出多个核酸片段的PCR反应。克服了常规PCR方法单一、费时、繁琐等缺点,从而实现了多种食源性致病菌的快速同时检测,多重PCR检测方法有着更为广阔的发展空间。 本研究针对空肠弯曲杆菌(Campylobacter jejuni)、副溶血弧菌(Vibrioparahaemolyticus)、小肠结肠炎耶尔森菌(Yersinia enterocolitica)、阪崎肠杆菌(Enterobacter sakazakii)、产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)、奇异变形杆菌(Proteus mirabilis)6种食源性致病菌建立了多重PCR快速检测方法。分别根据空肠弯曲杆菌的马尿酸酶hipO基因、副溶血弧菌的不耐热溶血毒素tlh基因、小肠结肠炎耶尔森菌的粘附侵袭位点Ail基因以及阪崎肠杆菌的16S核糖体16SrRNA基因、产气荚膜梭菌的磷脂酶cpa基因、奇异变形杆菌的Tu延伸因子tuf基因设计6对特异性引物,PCR扩增的目的基因片段长度分别为1028bp、450bp、274bp、282bp、120bp、541bp。建立多重PCR检测方法,并研制出两套三重PCR试剂盒,实现了6种食源性致病菌的同时检测。 对多重PCR反应体系中引物添加量、镁离子浓度、dNTP mixture添加量及退火温度和循环数等影响要素通过L20(55)正交试验确定最佳反应体系,确定了适宜的多重PCR反应体系和扩增程序,即优化的三重PCR反应体系为:50μL反应体系中,10×PCR Buffer5μL,Mg~(2+)(25mM)3μL,dNTP mixture(25mM)4μL,Taq酶(5U)1μL,模板各2μL,hipO、tlh和Ail终摩尔量分别为15pmol、5pmol和7.5pmol,16S rRNA、cpa和tuf终摩尔量分别为5pmol、15pmol和5pmol,双蒸水补足至50μL;两套多重PCR试剂盒扩增循环参数为:多重PCR反应采用冷启动,94℃预变性5min;然后变性(94℃,30s),退火(57℃,40s),延伸(72℃,70s),35个循环,最后72℃延伸15min。 反应产物在2%的琼脂糖凝胶中进行电泳,凝胶成像系统观察结果。对多重PCR扩增产物胶回收后连接到pMD18-T载体上转化进大肠杆菌DH5α中,阳性克隆质粒进行DNA测序,登录Genebank将测序结果进行网上blast同源性比对,从而证实PCR扩增产物确为目的扩增产物。 试验中利用人工污染的肉及乳制品,对6种食源性致病菌的特异性、灵敏度进行同时检测。其中副溶血弧菌、阪崎肠杆菌和产气荚膜梭菌的多重PCR灵敏度与单重PCR相比,低一个梯度;而其他三种致病菌与单重相比灵敏度不变。空肠弯曲杆菌的检出极限为3.0×101cfu/ml,副溶血弧菌的检出极限为6.2×101cfu/ml,小肠结肠炎耶尔森菌的检出极限为1.5×101cfu/ml;阪崎肠杆菌的检出极限为1.9×101cfu/ml,产气荚膜梭菌的检出极限为5.8×101cfu/ml,奇异变形杆菌的检出极限为2.4×101cfu/ml。 应用本试验研制的两套三重试剂盒,对泰安地区食源性致病菌的流行情况进行实际样品检测。从泰安各农贸市场、家禽屠宰市场、家禽零售处、家禽交易市场等采集鸡的粪便、羽毛、新鲜鸡肉、冷冻鸡肉及其屠宰用水、屠宰用具等样品409份;从泰安某奶牛场和超市采集新鲜牛奶及奶粉样品392份。经检测,样本中85份检出空肠弯曲杆菌,阳性率20.8%,6份检出副溶血弧菌,阳性率1.5%,54份检出小肠结肠炎耶尔森菌,阳性率13.2%;1份检出阪崎肠杆菌,阳性率0.1%,48份检出产气荚膜梭菌,阳性率6.0%,48份检出奇异变形杆菌,阳性率6.0%。将多重PCR方法的检测结果与国标法进行比较,符合率为100%。 由试验结果得知:本研究建立的多重PCR方法具有操作简便,检测周期短,敏感度和特异性高等优点,可在5h内得到检测结果,能同时检测上述六种病原菌。为食品及其原料的生物安全监测提供了新的、更准确的技术手段,可用于动物细菌性疾病的临床诊断。
【关键词】:多重PCR试剂盒 空肠弯曲杆菌 副溶血弧菌 小肠结肠炎耶尔森菌 阪崎肠杆菌 产气荚膜梭菌 奇异变形杆菌 样品检测
【学位授予单位】:山东农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:S854.4
【目录】:
  • 中文摘要10-12
  • Abstract12-15
  • 前言15-31
  • 1 食源性致病菌及其流行现状15-17
  • 1.1 食品安全15-16
  • 1.2 食源性疾病16
  • 1.3 食源性疾病的流行情况16-17
  • 1.4 食源性致病菌检测现状17
  • 2 本研究所涉及的食源性致病菌及其危害17-22
  • 2.1 空肠弯曲杆菌17-18
  • 2.2 副溶血弧菌18-19
  • 2.3 小肠结肠炎耶尔森菌19-20
  • 2.4 阪崎肠杆菌20-21
  • 2.5 产气荚膜梭菌21-22
  • 2.6 奇异变形杆菌22
  • 3 食源性致病菌快速检测方法22-29
  • 3.1 传统检测方法23
  • 3.2 免疫学方法23-25
  • 3.2.1 酶联免疫吸附(ELISA)检测23-24
  • 3.2.2 免疫荧光技术(IFT)24
  • 3.2.3 乳胶凝集试验(RPLA)24
  • 3.2.4 免疫胶体金技术24-25
  • 3.2.5 免疫磁珠分离技术25
  • 3.2.6 免疫印迹法25
  • 3.3 生物传感技术25-26
  • 3.4 分子生物学技术26-27
  • 3.4.1 基因芯片技术26
  • 3.4.2 核酸探针技术26-27
  • 3.5 PCR 技术27-29
  • 3.5.1 实时荧光定量 PCR 技术27-28
  • 3.5.2 常规 PCR 检测技术28
  • 3.5.3 多重 PCR 检测技术28-29
  • 4 肉、乳及乳制品中食源性致病菌检测研究现状29-30
  • 5 本研究的目的及意义30-31
  • 引言31-32
  • 1 材料32-37
  • 1.1 菌株32
  • 1.2 主要培养基32-35
  • 1.3 主要试剂及其配方35-37
  • 1.4 主要仪器37
  • 2 方法37-67
  • 2.1 六种食源性致病菌的培养、分离和鉴定37-55
  • 2.1.1 空肠弯曲杆菌的培养、分离和鉴定38-41
  • 2.1.2 副溶血弧菌的 、分离和鉴定41-46
  • 2.1.3 小肠结肠炎耶尔森菌的培养、分离和鉴定46-48
  • 2.1.4 阪崎肠杆菌的培养、分离和鉴定48-50
  • 2.1.5 产气荚膜梭菌的培养、分离和鉴定50-53
  • 2.1.6 奇异变形杆菌的培养、分离和鉴定53-55
  • 2.2 致病菌 DNA 提取方法55-58
  • 2.2.1 煮沸法55
  • 2.2.2 CTAB/NaCl 法55-56
  • 2.2.3 苯酚-氯仿法56
  • 2.2.4 蛋白酶 K 法56-57
  • 2.2.5 试剂盒法57
  • 2.2.6 chelex-100 法57-58
  • 2.2.7 FTA 滤膜法58
  • 2.2.8 破碎法58
  • 2.3 食源性致病菌 DNA 的验证58
  • 2.4 目的基因的选择及引物设计58-59
  • 2.5 阳性模板的制备59-63
  • 2.5.1 单重 PCR 反应体系的建立59
  • 2.5.2 PCR 产物的琼脂糖凝胶电泳鉴定59
  • 2.5.3 PCR 产物的纯化及回收59-60
  • 2.5.4 DH5α感受态细胞的制备60-61
  • 2.5.5 PCR 产物与载体连接61
  • 2.5.6 重组质粒转化感受态细胞61
  • 2.5.7 重组质粒的鉴定61-62
  • 2.5.8 序列测定62-63
  • 2.5.9 质粒的定量63
  • 2.6 单重 PCR 特异性和灵敏度63-64
  • 2.6.1 特异性测定63
  • 2.6.2 灵敏度测定63-64
  • 2.7 多重 PCR 扩增条件的优化64
  • 2.8 多重 PCR 的特异性检测64-65
  • 2.8.1 空肠弯曲杆菌、副溶血弧菌、耶尔森菌三重 PCR 反应的特异性64-65
  • 2.8.2 阪崎肠杆菌、产气荚膜梭菌、奇异变形杆菌三重 PCR 反应的特异性65
  • 2.9 多重 PCR 的灵敏度检测65
  • 2.10 模拟样品检测65
  • 2.11 试剂盒的研制及其稳定性、重复性和保存期试验65-66
  • 2.12 山东泰安地区该六种致病菌流行情况监测调查66-67
  • 3 结果67-82
  • 3.1 DNA 模板的提取方法的比较67
  • 3.2 多重 PCR 引物设计结果67-68
  • 3.3 单重 PCR 特异性和灵敏度分析68-71
  • 3.3.1 单重 PCR 特异性的测定结果68-70
  • 3.3.2 单重 PCR 灵敏度的测定结果70-71
  • 3.4 多重 PCR 反应优化结果71-72
  • 3.5 多重 PCR 体系特异性检测结果72-74
  • 3.6 多重 PCR 反应的灵敏度74-77
  • 3.7 人工污染模型样品检测结果77-79
  • 3.8 试剂盒的研制及其稳定性、重复性和保存期试验79-80
  • 3.8.1 试剂盒的组装79
  • 3.8.2 试剂盒稳定性、重复性和保质期试验结果79-80
  • 3.9 山东泰安地区该 6 种致病菌流行情况监测结果80-82
  • 3.9.1 禽类样品检测结果80-81
  • 3.9.2 乳及乳制品检测结果81-82
  • 3.9.3 与国标检测方法比较82
  • 4 讨论82-88
  • 4.1 多重 PCR 的影响因素83-86
  • 4.1.1 引物浓度与引物比例83-84
  • 4.1.2 引物 Tm 值的影响84
  • 4.1.3 Taq 酶、dNTP 和 Mg~(2+)浓度84-85
  • 4.1.4 多重 PCR 反应条件的优化——正交试验85
  • 4.1.5 多重 PCR 的特异性和灵敏度85-86
  • 4.2 多重 PCR 反应污染的防控86
  • 4.3 泰安地区样品检测86-87
  • 4.4 与国标检测方法比较87
  • 4.5 展望87-88
  • 结论88-89
  • 参考文献89-99
  • 致谢99-100
  • 攻读学位期间论文发表情况100

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10 宫彬彬;于师宇;孟宪梅;卢士英;任洪林;柳增善;王克坚;;食源性致病菌六联融合毒素的构建及免疫学特性研究[A];中国畜牧兽医学会兽医公共卫生学分会成立大会暨第一次学术研讨会论文集[C];2008年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 实习生 李玉洁;我市完成上半年食源性致病菌监测[N];张掖日报;2011年
2 记者 梁晓 通讯员 高世博 卢祎舟;我市完成食源性致病菌监测检验[N];郑州日报;2011年
3 魏小刚;我国食源性致病菌检测技术取得新突破[N];中国医药报;2005年
4 张若凡;广西7部门联手监测12类食品中污染物和有害因素[N];中国食品报;2011年
5 记者 张淑会 实习生 马虹;农田到餐桌将实施全程监测[N];河北日报;2010年
6 ;食品测试技术有新突破[N];中华工商时报;2005年
7 本报记者 胡应翔;贯彻新法 严格把关[N];中国食品报;2011年
8 记者 胡晓云;食品中57种化学物质受到监测[N];健康报;2009年
9 本报记者 郑俊彦;购买食品切勿“以貌取人”[N];东莞日报;2008年
10 王轲真;健康元食品检测技术获重大突破[N];深圳特区报;2005年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 余水静;食源性致病菌特异性靶点发掘系统及数据库的构建[D];上海交通大学;2012年
2 孙智勇;食源性致病菌高通量悬浮芯片检测技术研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2012年
3 邱驰;影响食品安全的食源性致病菌快速检测技术与风险分析研究[D];沈阳农业大学;2008年
4 卢行安;宫颈癌患者核糖核酸酶抑制因子基因突变分析和常见食源性致病菌快速检测技术体系的建立[D];大连医科大学;2007年
5 王耀;肉制品和乳制品中致病菌检测技术体系建立及李氏菌分型鉴定与溯源研究[D];沈阳农业大学;2011年
6 毕水莲;奇异变形杆菌可移动耐药基因岛研究[D];华南理工大学;2011年
7 蒋鲁岩;副溶血弧菌分子生物学检测方法的建立及其应用[D];南京农业大学;2007年
8 陈万义;副溶血弧菌高通量分子检测方法的建立与基因分型研究[D];上海交通大学;2011年
9 祝儒刚;海产品中致病性副溶血弧菌PCR快速检测体系建立及定量研究[D];沈阳农业大学;2011年
10 鲁曦;低剂量抗生素刺激条件下耐药基因水平传播的机制研究[D];华南理工大学;2012年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 周明东;食源性致病菌快速检测方法的建立及其试剂盒的研制与应用[D];山东农业大学;2012年
2 路春霞;应用红外光谱法区分常见食源性致病菌的研究[D];上海海洋大学;2011年
3 程晓艳;几种食源性致病菌快速检测技术的建立[D];中国海洋大学;2012年
4 张雅琪;基于傅里叶变换近红外光谱法的食源性致病菌的鉴别研究[D];河南科技大学;2011年
5 陈艳;纳米材料在食源性致病菌检测和生物成像中的应用研究[D];上海师范大学;2012年
6 李毅;温州地区食品中五种主要致病菌的调查分析[D];浙江大学;2010年
7 王静;基于傅立叶变换红外光谱和化学计量技术的致病微生物鉴别系统研究[D];山东大学;2012年
8 王文娟;食源性致病菌多重PCR检测试剂盒的研制与应用[D];山东农业大学;2011年
9 王如景;三种食源性致病菌多重PCR快速检测方法的研究[D];河北农业大学;2012年
10 刘旭;三种食源性致病菌的LAMP检测方法研究[D];中国计量学院;2012年
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