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《武汉大学》 2017年
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长链非编码RNA在肺鳞癌和肺腺癌中的变化及临床意义

刘冰  
【摘要】:目的:研究长链非编码RNA(lncRNA)在肺鳞癌和和肺腺癌中的变化,探讨在肺鳞癌以及肺腺癌患者中性别、年龄、种族、吸烟以及肿瘤分期对于长链非编码RNA的变化的影响,找出对于肺鳞癌以及肺腺癌患者预后判断有帮助的长链非编码RNA,并且阐明长链非编码RNA被调节的机制。方法:利用公共数据库美国癌症基因组文库以及在线网络工具cBioPortal分析长链非编码RNA在肺鳞癌以及肺腺癌患者中的变化,下载目前TCGA数据库中肺鳞癌和肺腺癌患者的临床数据以及长链非编码RNA变化的数据,并运用SPSS统计软件进行分析,找出变化有差异的长链非编码RNA。对于变化明显的长链非编码RNA,运用在线工具lncRNA2function进行分析其基因本体功能以及信号通路功能,在肺鳞癌与肺腺癌患者中,利用cBioPortal分析并找出对于总体生存率有影响的长链非编码RNA,并找出这些可以预测总体生存率的长链非编码RNA的共表达基因,通过分析与长链非编码RNA共表达基因的GO功能与信号通路,从而推断这些长链非编码RNA在肺鳞癌与肺腺癌中的作用机制。对于高表达的长链非编码RNA,利用ENCODE中的Chip-seq数据、基因保守性分析以及CpG岛的分析,以及双荧光素酶报告基因检测系统,阐明所研究的长链非编码RNA的调节机制。结果:在肺鳞癌肿,624个长链非编码RNA在肺鳞癌变化频率在1%以上,其中有64个长链非编码RNA具有10%以上的变化率。在肺腺癌中,有625个长链非编码RNA具有1%以上的变化率,其中36个长链非编码RNA的变化率在10%以上。在1%以上变化的长链非编码RNA中,620个在肺鳞癌和肺腺癌中均具有变化,而另外有22个长链非编码RNA是肺鳞癌所特异性变化,23个长链非编码RNA是肺腺癌所特异性变化。在具有10%以上的变化中,20个长链非编码RNA是肺鳞癌与肺腺癌公共变化的,44个长链非编码RNA是肺鳞癌特异性变化的,16个是肺腺癌特异性变化的。在肺鳞癌中,有22个长链非编码RNA在同一个染色体区带中(chr3:p26.3),在肺腺癌的标本中,染色体区带集中现象并没有发现。长链非编码RNA基因本体分析中,肺鳞癌与肺腺癌患者前十位的细胞成分中有五个是重叠的,前十位的分子功能分析表明,仅仅Retinoic acid receptor binding功能在肺鳞癌与肺腺癌中高度富集,两种疾病者变化的长链非编码RNA的前十位生物学功能是相同的。在肺鳞癌中,IGF2BP2-AS1与DGCR5的变化与较好的总体生存率相关,IGF2BP2-AS1与DGCR5联合应用能够提高预测总体生存率,在肺腺癌中,CDKN2A-AS1、MIR31HG和LINC01600的变化与较差的总体生存率相关,CDKN2A-AS1、MIR31HG和LINC01600三者联合应用可以提其对于总体生存率的预测价值。肺鳞癌中lncRNA与性别的关系研究发现,SNHG11、LINC00662在男性中的变化频率明显高于女性。肺腺癌中lncRNA与性别的关系研究发现,CASC8在男性中的变化频率明显高于女性。在肺鳞癌中,LINC00888、LINC00501、LINC00578、DUBR、LINC00879、DGCR5、SNHG10、LINC01192、SNHG15、LINC00634、LINC00880、LINC00636、LINC00881、LINC00901、DANCR、BAALC-AS2、PVT1、CASC8、LINC00603、MIR205HG、FAM167A-AS1、LINC00937可能参与了年龄变化导致肺鳞癌发病率升高的过程,在肺腺癌中,LINC00609、PTCSC3、LINC00517、SNHG20、LINC00957、SNHG17、LINC00265、SNHG15、ZFAS1、SNHG6、PVT1、HAR1A、IGF2BP2-AS1、MIR205HG、BAALC-AS2、LINC01600、CASC8有可能参与了年龄变化导致肺腺癌发病率升高的过程。肺鳞癌患者中,在白种人与黑人之间,变化差异明显的长链非编码RNA有PVT1、MIR205HG、SNHG17、CECR7、LINC00923、HCG18,肺腺癌患者中,变化差异明显的长链非编码 RNA 有 EXOC3-AS1、PVT1、LINC00467、LINC01194、LINC0095、LINC002657、SNHG17。在吸烟与肺癌关系研究中发现,LOH12CR2、DANCR、DANCR、HPYR1、FAM66C、DGCR5、LINC00636、LINC00901、DANCR、SNHG17、LINC00879、FAM66C、DGCR5、LINC00901、FAM66C、SNHG10、SNHG17 在在吸烟导致的肺鳞癌患者的发病过程中起了一定的作用,HAR1A、TP53TG1、IGF2BP2-AS1、EXOC3-AS1、LINC00603、CASC8、LINC01600、LINC00626、LINC00894、PVT1、HPYR1 在吸烟导致的肺腺癌患者的发病过程中起了一定的作用。在不同肿瘤分期进行比较的过程中发现,CDKN2A-AS1、GAS5、FAM74A3、DANCR、LINC01565、SNHG20、SNHG10、LINC00923、SNHG6、LINC00626 与BAALC-AS2在肺鳞癌中不同分期之间表达有差异,EXOC3-AS1、MIR31HG、LINC00609、PTCSC3、LINC00626、LINC00517、SNHG6、LINC00467、MIR31HG、CASC8、ZFAS1与MIR205HG在肺腺癌不同分期之间表达有差异。IGF2BP2-AS1、DGCR5、CDKN2A-AS1、MIR31HG 与 LINC01600 共表达的基因的基因本体、信号通路分析,对于这些长链非编码RNA在肺鳞癌与肺腺癌中的作用得到了认定。IGF2BP2-AS1、DGCR5和LINC01600的变化是由于高表达,利用ENCODE数据库以及IgV基因浏览器,我们推测出了这三个长链非编码RNA的潜在调控区域,并且应用双荧光素酶报告基因系统对于上述调控区域进行了验证。结论:1.长链非编码RNA在肺鳞癌与肺腺癌中均有变化,这些变化既有共同点,也在各自疾病中存在差异;2.通过对明显变化的长链非编码RNA的基因本体以及信号通路的分析,长链非编码RNA在肺鳞癌与肺腺癌中的作用进行了阐述;3.性别、年龄、种族、吸烟及肿瘤分期可以影响长链非编码RNA的变化;4.通过分析长链非编码RNA的与总体生存的关系,找出了可以预测肺鳞癌与肺腺癌总体生存相关的长链非编码RNA,通过分析这些长链非编码RNA的共表达基因,其在肺鳞癌或者肺腺癌中的作用机制得到了进一步的的探索:5.长链非编码RNA可以通过类似普通基因的方式,通过其启动子与增强子被调节。
【学位授予单位】:武汉大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2017
【分类号】:R734.2

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【参考文献】
中国期刊全文数据库 前2条
1 徐涛;李卫;胡泊;陈涛;刘冰;孙毅;王杨;;中国11省市成年人吸烟和被动吸烟情况调查[J];中国慢性病预防与控制;2010年03期
2 陈万青;张思维;邹小农;;中国肺癌发病死亡的估计和流行趋势研究[J];中国肺癌杂志;2010年05期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 姚尧;陈祥慧;郭亮;吴盛正;于帅;刘艳慧;王立波;乔璐;任柳琼;胡剑秋;单雪霞;张冰琦;焦子育;肖征;赵亚力;何耀;唐杰;张福;栾复新;吕发勤;;海南百岁老人甲状腺结节与生活方式相关性研究[J];中华超声影像学杂志;2018年07期
2 胡思颖;韩一平;;肺癌合并静脉血栓的研究进展[J];中华全科医师杂志;2018年04期
3 张峰;胡黎清;蒋志明;;益气健脾饮对肺癌化疗后患者免疫功能影响的研究[J];浙江临床医学;2018年03期
4 杨民从;陈魁;;25岁以下急性心肌梗死患者的临床特点及预后分析[J];中国实用医刊;2018年04期
5 陈钢;段静静;苏文;王艳峰;孙俊宁;杜小祥;李俊生;张沛刚;郭石平;;非小细胞肺癌患者外周血Th17淋巴细胞和白细胞介素17的表达及其意义[J];肿瘤研究与临床;2018年01期
6 邓丽娟;;实施家属健康教育提高肺癌病人生活质量的效果分析[J];医药前沿;2017年35期
7 郝云;陈萍;汪谨;;“知信行”健康教育对肺癌患者健康行为及生活质量的影响[J];国际护理学杂志;2017年14期
8 张晓琴;孙德俊;化晓宇;张若楠;;胸部低剂量螺旋CT在体检者肺癌筛查中的应用[J];肿瘤研究与临床;2017年05期
9 吴奕帆;侯黎莉;顾芬;俞瑛;;经皮穴位电刺激对肺癌患者化疗后癌因性疲乏的效果观察[J];中国实用护理杂志;2017年09期
10 叶胜兵;李锐;时姗姗;;肺腺癌患者表皮生长因子受体(EGFR)酪氨酸激酶抑制剂获得性耐药前后EGFR基因状态变化情况探讨[J];中华病理学杂志;2017年02期
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前9条
1 徐继英;李新建;姚海宏;顾凯;黎衍云;卢伟;;上海市居民吸烟、戒烟及被动吸烟现状[J];中国慢性病预防与控制;2009年03期
2 苏胜华;廖枝成;尹小蜂;陈建伟;秦祖国;邹向涛;汤捷;;广东省城市居民吸烟与被动吸烟现状及控烟态度调查[J];中国健康教育;2009年02期
3 陈万青;张思维;孔灵芝;李光琳;赵平;;中国部分市县2003年恶性肿瘤死亡年度报告[J];中国肿瘤;2007年08期
4 张思维;陈万青;孔灵芝;李光琳;赵平;;中国部分市县2003年恶性肿瘤发病年度报告[J];中国肿瘤;2007年07期
5 杨功焕,马杰民,刘娜,周灵妮;中国人群2002年吸烟和被动吸烟的现状调查[J];中华流行病学杂志;2005年02期
6 张维森,江朝强,Lam T.Hing,Ho S.Yin,陈清,刘薇薇,何健民,曹民;接尘、吸烟者死亡危险度比较的前瞻性队列研究[J];中华流行病学杂志;2004年09期
7 鲁凤珠,张思维,陈永红,邹小农,李连弟;中国肿瘤登记情况调查结果初步分析[J];中国肿瘤;2004年03期
8 Jay H.Lubin,王作元,John D.Boice Jr,徐肇翊,William J.Blot,王陇德,Ruth A.Kleinerman;肺癌危险度与室内氡关系研究:中国两项研究的汇总分析结果[J];中国辐射卫生;2003年04期
9 董志伟,乔友林,李连弟,陈育德,王润田,雷通海,饶克勤,王汝宽,赵平,游伟程,鲁凤珠,戴旭东,王国清,罗贤懋,周海城;中国癌症控制策略研究报告[J];中国肿瘤;2002年05期
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1 周鹏;张晗婕;刘向华;;长链非编码RNA:非小细胞肺癌研究的一个新领域[J];临床肿瘤学杂志;2015年03期
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3 穆银玉;谢服役;徐国栋;汪春年;方建晨;;肺腺癌患者外周血环状RNA差异表达谱研究[J];中国卫生检验杂志;2019年02期
4 方喜生;刘国龙;刘霞;;微小RNA在肺腺癌发生与发展中的研究进展[J];中华诊断学电子杂志;2014年03期
5 宋泉毅;张大昕;;微RNA与肺癌及人类表皮生长因子受体突变状态的研究进展[J];医学综述;2016年04期
6 李子祺;丁明霞;王剑松;;长链非编码RNA在膀胱肿瘤中的研究进展[J];医学综述;2015年04期
7 李婷婷;徐让;;长链非编码RNA在心脏发育中的作用[J];上海交通大学学报(医学版);2014年12期
8 孙燕;凌春华;;长链非编码RNA在非小细胞肺癌诊断、治疗中的应用进展[J];山东医药;2017年22期
9 李芬;王美英;张振;;长链非编码RNA与膀胱癌的研究进展[J];检验医学与临床;2016年05期
10 密玉帅;岑刚;张威浩;沈洋;温玉刚;;长链非编码RNA在胃癌中的研究进展[J];现代生物医学进展;2016年13期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 王瑜敏;许刚;潘钦石;张文辉;陈坚;丁鸿燕;周铁丽;余方友;黄卡特;;肺鳞癌差异性长链非编码RNA表达谱分析及初步验证[A];2014年浙江省检验医学学术年会论文汇编[C];2014年
2 李成云;梁戈玉;姚文卓;隋静;申娴;张艳秋;马书梅;尹立红;浦跃朴;;胃癌相关长链非编码RNA的鉴定及肿瘤标志物的筛选研究[A];中国毒理学会第七次全国毒理学大会暨第八届湖北科技论坛论文集[C];2015年
3 郭晓强;张巧霞;黄卫人;蔡志明;;长链非编码RNA与肾细胞癌发生[A];遗传多样性:前沿与挑战——中国的遗传学研究(2013-2015)——2015中国遗传学会大会论文摘要汇编[C];2015年
4 魏任雄;;长链非编码RNA与男性不育的研究进展[A];中华中医药学会第十四次男科学术大会论文集[C];2014年
5 张畅斌;尹爱华;何天文;王波;邓文喻;赖有行;;一种经济便捷的手足口病原RNA提取方法[A];广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会论文及摘要汇编[C];2014年
6 李园园;陆俊梅;程松;崔振玲;;RNA恒温扩增实时检测技术鉴定鸟分枝杆菌和胞内分枝杆菌[A];第四届中国临床微生物学大会暨微生物学与免疫学论坛论文汇编[C];2013年
7 Jingrong Wang;Junping Kou;Hilda Yau;Wanrong Zong;Tongmeng Yan;Zhi-Hong Jiang;;Protective Effect and Sequences of RNA Fragments from Ginseng's Larger RNAs against Myocardial Ischemia Injury in Mice[A];中国化学会第十一届全国天然有机化学学术会议论文集(第一册)[C];2016年
8 吴建军;李勋;黄锦坤;杨倜;徐益勤;杨巧媛;蒋义国;;环境化学物暴露血液非编码RNA标志物研究[A];中国毒理学会第七次全国毒理学大会暨第八届湖北科技论坛论文集[C];2015年
9 徐勇;张付全;张克让;Yin Yao Shugart;;精神分裂症中转录因子-微小RNA交互调控网络的异常[A];中华医学会第十三次全国精神医学学术会议论文汇编[C];2015年
10 韩艳华;陈红印;张礼生;;RNA干扰技术在昆虫滞育机制研究中的应用[A];植保科技创新与农业精准扶贫——中国植物保护学会2016年学术年会论文集[C];2016年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 中科院上海生科院上海植物生理生态所 毛颖波;寻找小RNA世界里的另一道风景[N];科学时报;2011年
2 记者 颜维琦;我科学家深度“解码”环形RNA[N];光明日报;2019年
3 本报记者 沈则瑾;破解环形RNA之谜[N];经济日报;2019年
4 记者 耿挺;RNA剪接基因编辑新方法[N];上海科技报;2018年
5 记者 聂翠蓉;基因检测“神探夏洛克”问世[N];科技日报;2017年
6 本报记者 聂翠蓉;让RNA处理器在活细胞中“奔腾”[N];科技日报;2017年
7 记者 毛黎;脂质分子可提高RNA干扰技术效率[N];科技日报;2009年
8 记者 张小军;RNA:被忽视的“遗传信使”[N];新华每日电讯;2002年
9 记者 陈勇;美科学家发现非典病毒特异RNA片段[N];新华每日电讯;2004年
10 王小京;HIV RNA在全脂母乳中含量最高[N];中国医药报;2004年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 刘冰;长链非编码RNA在肺鳞癌和肺腺癌中的变化及临床意义[D];武汉大学;2017年
2 王丽惠;长链非编码RNA在肺腺癌分子诊断/预后中的应用及功能研究[D];广西医科大学;2016年
3 程世钊;RNA编辑在肺腺癌中的临床意义及作用机制[D];天津医科大学;2016年
4 王铖;长链非编码RNA在脊柱转移瘤及肝细胞癌中的作用与临床意义研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2017年
5 杨世伟;长链非编码RNA在青少年特发性脊柱侧凸椎旁肌中的表达差异性研究[D];北京协和医学院;2014年
6 李耀明;前列腺癌进展相关长链非编码RNA的鉴定及其作用机制研究[D];第二军医大学;2016年
7 陈佳超;长链非编码RNA与醛固酮瘤发病机制相关性的研究[D];复旦大学;2014年
8 吴向嵩;胆囊癌差异表达长链非编码RNA筛选及功能研究[D];上海交通大学;2014年
9 梁效;长链非编码RNA在先天性脊柱侧凸中的表达研究[D];北京协和医学院;2016年
10 王雪;长链非编码RNA对肝癌干细胞的调控作用及分子机制[D];第二军医大学;2016年
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1 凌维俊;基于微阵列芯片鉴别缺血性脑卒中长链非编码RNA及mRNA表达谱[D];广西医科大学;2017年
2 程静;醛固酮瘤和正常肾上腺中长链非编码RNA表达谱差异的研究[D];复旦大学;2013年
3 李朋飞;电离辐射应答长链非编码RNA的研究[D];中国科学院研究生院(近代物理研究所);2015年
4 潘泽政;RNA干扰技术抑制非小细胞肺癌细胞表皮生长因子受体的表达[D];南昌大学;2006年
5 彭智勇;长链非编码RNA在胰腺导管腺癌表达谱分析[D];第二军医大学;2014年
6 宋皓军;胃癌相关长链非编码RNA的鉴定及其临床意义的分析[D];宁波大学;2013年
7 刘畅;长链非编码RNA在急性放射性肺损伤中的作用及机制的初步研究[D];苏州大学;2014年
8 孟亚琴;重性抑郁障碍长链非编码RNA的筛选及初步分析[D];山西医科大学;2013年
9 徐华栋;大肠癌相关长链非编码RNA的筛选及生物信息学分析[D];福建医科大学;2016年
10 杨自国;胃癌淋巴结转移相关长链非编码RNA的鉴定及验证研究[D];山东大学;2016年
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