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《华中科技大学》 2010年
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基于SNP-MaP慢性乙型肝炎不同临床转归全基因组关联研究和乙型重型肝炎预后模型的构建

姚津剑  
【摘要】: 目的:慢性乙型肝炎的临床转归包括乙肝病毒携带者肝、硬化、肝癌、乙型重型肝炎,它是一组有明确病因的复杂多基因疾病,应用SNP-MaP(snp microarray and pooling)完成全基因组扫描,寻找慢性乙型肝炎重症化的易感位点,并扩大样本验证其易感性位点。 方法:根据慢性乙型肝炎的临床转归的表型将样本分为乙肝病毒携带者,肝硬化,肝癌,乙型重型肝炎。应用affymatrix SNP 6.0扫描各组中100个样本随机挑选86个组成DNA pool,并完成3个生物学重复。分别运用两种不同的统计学方法进行分析,挑选差异性最强的SNP位点。在乙肝病毒携带者234例,肝硬化300例,肝癌300例,乙型重型肝炎171例进行个体验证。 结果:通过严格的统计学挑选,一共挑选7个SNP进行个体的基因分型。发现两个与肝硬化易感性的多态性位点分别是转录因子TBX5 SNP位点rs3825214在于对照组相比(共显性模型P=0.024,显性模型P=0.008 OR1.8(1.1-2.9))和膜蛋白SCUBE3 SNP位点rs 3800385在于对照组相比(显性模型P=0.0076 OR 1.6(1.1-2.32)).且SNP位点rs3800385在肝癌在于对照组相比较的共显性模型中具有统计学意义 结论:从分子流行病学的角度证明了TBX5和SCUBE3在肝硬化易感性中起重要作用。SCUBE3与肝癌的易感性相关。 目的:前瞻性随访乙型重型肝炎病人长期预后,并对影响乙型重型肝炎长期预的危险因素进行分析,从中筛选出对预后有明显影响的因素,构建预后模型并与现有的预后模型进行对比其预后判断效能,在一个独立回顾性的样本进行验证,判断对预后预测的准确性。 方法:从2007年6月到2008年12月前瞻性从4个医院进行样本收集254例乙型重型肝炎病人,同样的时间段内在回顾性中心收集乙型重型肝炎病例43例,记录所有的临床资料对上述病人情况进行随访。记录所有的住院期间临床资料。依据随访的结果,分析生化指标和并发症对死亡的影响,同时探讨肝硬化重型肝炎程与非肝硬化重型肝炎临床指标的差异。应用单因素分析和多元回归模型,建立预后模型,运用ROC曲线下面积比较本研究的模型与现有的重型肝炎预后模型预测能力。然后在回顾性的中心验证预后模型的预测效能。 结果:前瞻性中心平均年龄为40.58(14-69)肝硬化比例为27.16%,男性比例为88.89%,而回顾性中心平均年龄为43.3(20-66)肝硬化比例为27.9%,男性比例为90.7%。随访截止时间为2009年12月,平均随访时间为19.5(0-30)。总的生存率为34.68%,其中前瞻性中心的生存率为35.03%而回顾性的中心生存率为32.58%。分析发现生存组和死亡组中年龄、凝血酶原时间、凝血酶原活动度、纤维蛋白原、总胆红素、直接胆红素、血清γ谷氨酰转肽酶、乳酸脱氢酶、氯、肌酐、MELD评分、肝硬化、脾大、自发性腹膜炎、腹水、肝性脑病、肝肾综合症均有统计学差异(P0.05)。而在肝硬化组和非肝硬化组中年龄、感染周数、凝血酶原时间、国际化标准比值、凝血酶原活动度、谷丙转氨酶、谷草转氨酶、胆固醇、肌酐、尿酸、HBV-DNA.MELD评分、死亡率上均有统计学差异(P0.05),多因素回归分析构建预后模型P=eX/1+eX,X=(4.542+0.671*国际化标准比值+0.003*总胆红素mmol/L+0.034*肌酐mmol/L-0.025*氯mmol/L+0.445*肝硬化),在ROC曲线下面积比较,本研究模型ROC面积较MELD评分系统,Dhiman模型,Sun模型及西安标准曲线下面积显著性大于(P0.05),依次为(0.80,CI95%0.75-0.86),MELD(0.73,CI95%0.67-0.8),Sun(0.71,CI 95%0.64-0.7791,Dhiman模型(0.66,CI 95%0.61-0.71),西安标准(0.58,CI95%0.528-0.65)。重复在回顾性的中心进行验证发现本研究的模型ROC曲线下面积0.93大于MELD 0.87. 结论:本研究模型在乙型重型肝炎预后预测上优于MELD等预后模型,乙型重型肝炎并发症不能作为预后模型,由于并发症因其发生率较低且出现较晚。肝硬化乙型重型肝炎用于预后模型构建是可行的。
【学位授予单位】:华中科技大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2010
【分类号】:R512.62

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