红色红曲菌交替氧化酶基因Mraox1克隆与功能初步研究
【摘要】:
在高等植物,大部分真菌和一些原生动物中存在2条电子呼吸链:细胞色素途径和交替途径。交替途径对氰化物不敏感,因此该途径又被称为抗氰途径,交替氧化酶是交替途径的末端氧化酶。交替途径与细胞色素途径在泛醌处分支,由交替氧化酶催化,泛醌将电子直接传递给氧化生成水,释放热量,不产生ATP。
本研究从红色红曲菌(Monascus ruber) M-7中克隆得到了交替氧化酶基因(alternative oxidase from Monascus ruber, Mraoxl),及其上下游部分序列,构建了Mraoxl的敲除载体。通过农杆菌介导,将敲除载体转入红曲菌M-7,筛选得到一株△Mraoxl突变子,并对这一株突变子进行了抗逆性分析和表达调控的初步分析。具体结果如下:
1. Mraoxl基因的克隆及序列分析
根据已报道的aox基因的核酸序列和其编码的氨基酸序列,设计了简并引物,扩增得到了Mraoxl基因的一段DNA序列。在此基础上,采用SON-PCR获得了Mraoxl基因的编码区及其上游和下游部分序列共4223bp,包括开放读码框1198bp,5’非编码序列2329bp和3’非编码序列696bp。经软件分析和预测,Mraoxl基因的开放读码框包含3个外显子和2个内含子。预测编码序列上游含有一个CRE-like元件和两个锌指蛋白结合位点。Mraoxl基因共编码350个氨基酸。其氨基酸序列与其他丝状真菌的AOX序列有很高的相似性,含有与双铁中心形成有关的EXXH和EEE-Y保守域。软件预测Mraoxl基因的编码氨基酸序列的N端的59个氨基酸为线粒体转运肽。
2. Mraoxl基因的敲除
以潮霉素抗性基因(hph)为筛选标记,构建Mraoxl基因的敲除载体,采用农杆菌介导转化法(Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation, ATMT),对红曲菌M-7进行了两次转化,获得205株转化子。通过对140株转化子进行经PCR筛选和southern杂交验证,分离得到一株ΔMraoxl突变子。
3.Mraoxl功能的初步分析
3.1 H2O2、高温、pH值和渗透压对ΔMraoxl和M-7的孢子萌发率的影响
为分析Mraoxl是否参与环境应激过程,将105个/mL的ΔMraoxl和M-7的孢子液进行H2O2、高温、不同pH值和渗透压的处理,分析它们孢子萌发率的变化。
10、20和30mmol/L的H202水溶液处理5h后,ΔMraoxl的孢子萌发率较M-7分别低49%、42%和25%。40℃和50℃水浴处理1、2和3h后,ΔMraoxl的孢子萌发率均低于M-7,其中40℃处理2h时,差异值达到最大,为18%。经pH8.0的柠檬酸-磷酸氢二钠缓冲液处理2、4和6h后,ΔMraoxl突变子的孢子萌发率较M-7低,其中处理4h时,差异最大,为29%。经0.2、0.5和0.8mol/L的NaCl溶液处理之后24h后,ΔMraoxl与M-7的孢子萌发率无显著差异。综合以上实验结果,推测Mraoxl基因能够增强红曲菌的抗逆性。
3.2 cAMP和柠檬酸对ΔMraoxl与M-7生长的影响
在培养基中分别添加8mmol/L柠檬酸和2mmol/L的cAMP能够显著促进M-7在生长初期的生长,而对ΔMraoxl突变子则没有该现象,由此推测cAMP和柠檬酸能够提高Mraoxl的表达。
【关键词】:红色红曲菌 交替氧化酶 克隆 基因敲除 功能
【学位授予单位】:华中农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2010
【分类号】:Q93
【目录】:
【学位授予单位】:华中农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2010
【分类号】:Q93
【目录】:
- 摘要8-10
- ABSTRACT10-12
- 缩略语表12-13
- 第一章 文献综述13-24
- 1 红曲菌13-17
- 1.1 红曲菌的分类13
- 1.2 红曲菌的主要代谢产物13-15
- 1.2.1 色素13-14
- 1.2.2 莫呐可林K14
- 1.2.3 γ-氨基丁酸14
- 1.2.4 桔霉素14-15
- 1.3 红曲菌的分子生物学研究15-17
- 1.3.1 分子标记技术在红曲菌分类中应用15-16
- 1.3.2 红曲菌遗传转化方法的研究16
- 1.3.3 红曲菌功能基因的研究16-17
- 2 交替氧化酶17-21
- 2.1 AOX的结构18-19
- 2.2 交替氧化酶的功能19-20
- 2.2.1 生物产热19-20
- 2.2.2 清除活性氧和抑制细胞凋亡20
- 2.2.3 调节代谢平衡20
- 2.2.4 增强抗逆能力20
- 2.3 丝状真菌AOX的研究20-21
- 3 丝状真菌基因功能研究的方法21-23
- 3.1 随机插入突变21
- 3.2 基因敲除21-22
- 3.3 RNA干扰22
- 3.4 过表达22-23
- 4 研究目的与意义23-24
- 第二章 红色红曲菌M-7的Mraox1的克隆及其序列分析24-36
- 1 材料24-25
- 1.1 菌株24
- 1.2 培养基24
- 1.3 主要试剂24
- 1.4 主要仪器与设备24-25
- 2 方法25-28
- 2.1 红曲菌基因组DNA的提取25
- 2.2 红色红曲菌M-7交替氧化酶基因(Mraox1)片段的克隆25-26
- 2.2.1 简并引物的设计25
- 2.2.2 简并PCR的体系和程序25-26
- 2.2.3 PCR产物的检测26
- 2.2.4 PCR产物的回收、连接、转化和测序26
- 2.3 SON-PCR延伸Mraox1片段的侧翼序列26-27
- 2.4 序列的拼接和分析27-28
- 2.4.1 序列拼接27
- 2.4.2 Mraox1的结构分析27-28
- 2.4.3 氨基酸的分析28
- 3 结果28-33
- 3.1 Mraox1基因片段的克隆28-29
- 3.2 Mraox1基因片段的侧翼序列延伸29-30
- 3.3 序列拼接及分析30-31
- 3.4 Mraox1的氨基酸序列同源性与保守性分析31-32
- 3.5 Mraox1的转运肽预测32-33
- 4 小结与讨论33-36
- 4.1 小结33-34
- 4.2 讨论34-36
- 第三章 Mraox1基因的敲除36-48
- 1 材料36-37
- 1.1 菌株与质粒36
- 1.2 主要试剂36
- 1.3 农杆菌介导的转化所需试剂和培养基36-37
- 1.4 主要仪器与设备37
- 2 方法37-42
- 2.1 敲除载体的构建37-40
- 2.1.1 构建Mraox1的敲除盒38-39
- 2.1.2 构建Mraox1基因敲除载体39-40
- 2.2 敲除载体转化农杆菌40
- 2.2.1 农杆菌感受态的制备40
- 2.2.2 农杆菌的转化40
- 2.3 农杆菌介导的红曲菌转化40-41
- 2.3.1 红曲菌孢子的收集40-41
- 2.3.2 农杆菌的诱导41
- 2.3.3 红曲菌孢子与农杆菌共培养41
- 2.3.4 转化子的筛选41
- 2.4 敲除子的筛选和验证41-42
- 2.4.1 PCR方法筛选红曲菌△Mraox1突变子41-42
- 2.4.2 Southern杂交验证△Mraox1突变子42
- 3 结果42-46
- 3.1 敲除盒的构建42-43
- 3.2 Mraox1敲除载体的构建及验证43-44
- 3.3 敲除载体pKAOX1转化农杆菌44
- 3.4 红色红曲菌M7的△Mraox1突变子的PCR筛选与验证44
- 3.5 红色红曲菌M7的△Mraox1突变子的的Southern杂交验证44-46
- 4 小结与讨论46-48
- 4.1 小结46
- 4.2 讨论46-48
- 第四章 Mraox1功能的初步研究48-59
- 1 材料48
- 1.1 菌株48
- 1.2 主要试剂48
- 2 方法48-50
- 2.1 环境胁迫对M-7和△Mraox1突变子的孢子萌发率的影响48-49
- 2.1.1 双氧水对孢子萌发率的影响48-49
- 2.1.2 pH值对萌发率的影响49
- 2.1.3 温度对孢子萌发率的影响49
- 2.1.4 渗透压对孢子萌发率的影响49
- 2.2 cAMP和柠檬酸对M-7和△Mraox1突变子生长的影响49-50
- 2.2.1 柠檬酸对M-7和△Mraox1突变子生长的影响49-50
- 2.2.2 cAMP对M-7和△Mraox1突变子生长的影响50
- 3 结果与分析50-56
- 3.1 双氧水对孢子萌发率的影响50
- 3.2 pH值对孢子萌发率的影响50-51
- 3.3 高温对孢子萌发率的影响51-52
- 3.4 渗透压对孢子萌发率的影响52-53
- 3.5 cAMP对M-7和△Mraox1突变子生长的影响53
- 3.6 柠檬酸对M-7和△Mraox1突变子生长的影响53-56
- 4 小结与讨论56-59
- 4.1 小结56-57
- 4.2 讨论57-59
- 4.2.1 Mraox1在环境应激中的作用57-58
- 4.2.2 cAMP和柠檬酸对Mraox1基因的调控58-59
- 第五章 结论与展望59-61
- 1 结论59-60
- 2 展望60
- 3 创新点60-61
- 参考文献61-72
- 致谢72-73
- 附录1 Mraox1氨基酸序列的CLUSTAL W多重比对73-74
- 附录2 Mraox1的DNA序列74-76
- 附录3 Mraox1的编码氨基酸76
| 【引证文献】 | ||
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| 【参考文献】 | ||
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| 【共引文献】 | ||
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| 【同被引文献】 | ||
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| 【二级参考文献】 | ||
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| 【相似文献】 | ||
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