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《华中农业大学》 2010年
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红色红曲菌交替氧化酶基因Mraox1克隆与功能初步研究

李琦  
【摘要】: 在高等植物,大部分真菌和一些原生动物中存在2条电子呼吸链:细胞色素途径和交替途径。交替途径对氰化物不敏感,因此该途径又被称为抗氰途径,交替氧化酶是交替途径的末端氧化酶。交替途径与细胞色素途径在泛醌处分支,由交替氧化酶催化,泛醌将电子直接传递给氧化生成水,释放热量,不产生ATP。 本研究从红色红曲菌(Monascus ruber) M-7中克隆得到了交替氧化酶基因(alternative oxidase from Monascus ruber, Mraoxl),及其上下游部分序列,构建了Mraoxl的敲除载体。通过农杆菌介导,将敲除载体转入红曲菌M-7,筛选得到一株△Mraoxl突变子,并对这一株突变子进行了抗逆性分析和表达调控的初步分析。具体结果如下: 1. Mraoxl基因的克隆及序列分析 根据已报道的aox基因的核酸序列和其编码的氨基酸序列,设计了简并引物,扩增得到了Mraoxl基因的一段DNA序列。在此基础上,采用SON-PCR获得了Mraoxl基因的编码区及其上游和下游部分序列共4223bp,包括开放读码框1198bp,5’非编码序列2329bp和3’非编码序列696bp。经软件分析和预测,Mraoxl基因的开放读码框包含3个外显子和2个内含子。预测编码序列上游含有一个CRE-like元件和两个锌指蛋白结合位点。Mraoxl基因共编码350个氨基酸。其氨基酸序列与其他丝状真菌的AOX序列有很高的相似性,含有与双铁中心形成有关的EXXH和EEE-Y保守域。软件预测Mraoxl基因的编码氨基酸序列的N端的59个氨基酸为线粒体转运肽。 2. Mraoxl基因的敲除 以潮霉素抗性基因(hph)为筛选标记,构建Mraoxl基因的敲除载体,采用农杆菌介导转化法(Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation, ATMT),对红曲菌M-7进行了两次转化,获得205株转化子。通过对140株转化子进行经PCR筛选和southern杂交验证,分离得到一株ΔMraoxl突变子。 3.Mraoxl功能的初步分析 3.1 H2O2、高温、pH值和渗透压对ΔMraoxl和M-7的孢子萌发率的影响 为分析Mraoxl是否参与环境应激过程,将105个/mL的ΔMraoxl和M-7的孢子液进行H2O2、高温、不同pH值和渗透压的处理,分析它们孢子萌发率的变化。 10、20和30mmol/L的H202水溶液处理5h后,ΔMraoxl的孢子萌发率较M-7分别低49%、42%和25%。40℃和50℃水浴处理1、2和3h后,ΔMraoxl的孢子萌发率均低于M-7,其中40℃处理2h时,差异值达到最大,为18%。经pH8.0的柠檬酸-磷酸氢二钠缓冲液处理2、4和6h后,ΔMraoxl突变子的孢子萌发率较M-7低,其中处理4h时,差异最大,为29%。经0.2、0.5和0.8mol/L的NaCl溶液处理之后24h后,ΔMraoxl与M-7的孢子萌发率无显著差异。综合以上实验结果,推测Mraoxl基因能够增强红曲菌的抗逆性。 3.2 cAMP和柠檬酸对ΔMraoxl与M-7生长的影响 在培养基中分别添加8mmol/L柠檬酸和2mmol/L的cAMP能够显著促进M-7在生长初期的生长,而对ΔMraoxl突变子则没有该现象,由此推测cAMP和柠檬酸能够提高Mraoxl的表达。
【关键词】:红色红曲菌 交替氧化酶 克隆 基因敲除 功能
【学位授予单位】:华中农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2010
【分类号】:Q93
【目录】:
  • 摘要8-10
  • ABSTRACT10-12
  • 缩略语表12-13
  • 第一章 文献综述13-24
  • 1 红曲菌13-17
  • 1.1 红曲菌的分类13
  • 1.2 红曲菌的主要代谢产物13-15
  • 1.2.1 色素13-14
  • 1.2.2 莫呐可林K14
  • 1.2.3 γ-氨基丁酸14
  • 1.2.4 桔霉素14-15
  • 1.3 红曲菌的分子生物学研究15-17
  • 1.3.1 分子标记技术在红曲菌分类中应用15-16
  • 1.3.2 红曲菌遗传转化方法的研究16
  • 1.3.3 红曲菌功能基因的研究16-17
  • 2 交替氧化酶17-21
  • 2.1 AOX的结构18-19
  • 2.2 交替氧化酶的功能19-20
  • 2.2.1 生物产热19-20
  • 2.2.2 清除活性氧和抑制细胞凋亡20
  • 2.2.3 调节代谢平衡20
  • 2.2.4 增强抗逆能力20
  • 2.3 丝状真菌AOX的研究20-21
  • 3 丝状真菌基因功能研究的方法21-23
  • 3.1 随机插入突变21
  • 3.2 基因敲除21-22
  • 3.3 RNA干扰22
  • 3.4 过表达22-23
  • 4 研究目的与意义23-24
  • 第二章 红色红曲菌M-7的Mraox1的克隆及其序列分析24-36
  • 1 材料24-25
  • 1.1 菌株24
  • 1.2 培养基24
  • 1.3 主要试剂24
  • 1.4 主要仪器与设备24-25
  • 2 方法25-28
  • 2.1 红曲菌基因组DNA的提取25
  • 2.2 红色红曲菌M-7交替氧化酶基因(Mraox1)片段的克隆25-26
  • 2.2.1 简并引物的设计25
  • 2.2.2 简并PCR的体系和程序25-26
  • 2.2.3 PCR产物的检测26
  • 2.2.4 PCR产物的回收、连接、转化和测序26
  • 2.3 SON-PCR延伸Mraox1片段的侧翼序列26-27
  • 2.4 序列的拼接和分析27-28
  • 2.4.1 序列拼接27
  • 2.4.2 Mraox1的结构分析27-28
  • 2.4.3 氨基酸的分析28
  • 3 结果28-33
  • 3.1 Mraox1基因片段的克隆28-29
  • 3.2 Mraox1基因片段的侧翼序列延伸29-30
  • 3.3 序列拼接及分析30-31
  • 3.4 Mraox1的氨基酸序列同源性与保守性分析31-32
  • 3.5 Mraox1的转运肽预测32-33
  • 4 小结与讨论33-36
  • 4.1 小结33-34
  • 4.2 讨论34-36
  • 第三章 Mraox1基因的敲除36-48
  • 1 材料36-37
  • 1.1 菌株与质粒36
  • 1.2 主要试剂36
  • 1.3 农杆菌介导的转化所需试剂和培养基36-37
  • 1.4 主要仪器与设备37
  • 2 方法37-42
  • 2.1 敲除载体的构建37-40
  • 2.1.1 构建Mraox1的敲除盒38-39
  • 2.1.2 构建Mraox1基因敲除载体39-40
  • 2.2 敲除载体转化农杆菌40
  • 2.2.1 农杆菌感受态的制备40
  • 2.2.2 农杆菌的转化40
  • 2.3 农杆菌介导的红曲菌转化40-41
  • 2.3.1 红曲菌孢子的收集40-41
  • 2.3.2 农杆菌的诱导41
  • 2.3.3 红曲菌孢子与农杆菌共培养41
  • 2.3.4 转化子的筛选41
  • 2.4 敲除子的筛选和验证41-42
  • 2.4.1 PCR方法筛选红曲菌△Mraox1突变子41-42
  • 2.4.2 Southern杂交验证△Mraox1突变子42
  • 3 结果42-46
  • 3.1 敲除盒的构建42-43
  • 3.2 Mraox1敲除载体的构建及验证43-44
  • 3.3 敲除载体pKAOX1转化农杆菌44
  • 3.4 红色红曲菌M7的△Mraox1突变子的PCR筛选与验证44
  • 3.5 红色红曲菌M7的△Mraox1突变子的的Southern杂交验证44-46
  • 4 小结与讨论46-48
  • 4.1 小结46
  • 4.2 讨论46-48
  • 第四章 Mraox1功能的初步研究48-59
  • 1 材料48
  • 1.1 菌株48
  • 1.2 主要试剂48
  • 2 方法48-50
  • 2.1 环境胁迫对M-7和△Mraox1突变子的孢子萌发率的影响48-49
  • 2.1.1 双氧水对孢子萌发率的影响48-49
  • 2.1.2 pH值对萌发率的影响49
  • 2.1.3 温度对孢子萌发率的影响49
  • 2.1.4 渗透压对孢子萌发率的影响49
  • 2.2 cAMP和柠檬酸对M-7和△Mraox1突变子生长的影响49-50
  • 2.2.1 柠檬酸对M-7和△Mraox1突变子生长的影响49-50
  • 2.2.2 cAMP对M-7和△Mraox1突变子生长的影响50
  • 3 结果与分析50-56
  • 3.1 双氧水对孢子萌发率的影响50
  • 3.2 pH值对孢子萌发率的影响50-51
  • 3.3 高温对孢子萌发率的影响51-52
  • 3.4 渗透压对孢子萌发率的影响52-53
  • 3.5 cAMP对M-7和△Mraox1突变子生长的影响53
  • 3.6 柠檬酸对M-7和△Mraox1突变子生长的影响53-56
  • 4 小结与讨论56-59
  • 4.1 小结56-57
  • 4.2 讨论57-59
  • 4.2.1 Mraox1在环境应激中的作用57-58
  • 4.2.2 cAMP和柠檬酸对Mraox1基因的调控58-59
  • 第五章 结论与展望59-61
  • 1 结论59-60
  • 2 展望60
  • 3 创新点60-61
  • 参考文献61-72
  • 致谢72-73
  • 附录1 Mraox1氨基酸序列的CLUSTAL W多重比对73-74
  • 附录2 Mraox1的DNA序列74-76
  • 附录3 Mraox1的编码氨基酸76

【引证文献】
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6 刘龙涛;张文高;何煜;孟宪忠;郑广娟;殷镜海;蔚青;王显刚;王大智;韩宝刚;卢宁;吴玉生;;超微粉碎对降脂红曲降脂、抗氧化、血管内皮保护作用的影响[A];第四次全国中西医结合养生学与康复医学学术研讨会论文集[C];2004年
7 沃兴德;程东庆;卢德赵;窦晓兵;杨贞;沃立科;;利用微生物转化技术从姜黄素中获取高效调脂新型化合物的研究[A];第四届全国血脂分析与临床学术研讨会暨第九届全国脂蛋白学术会议论文汇编[C];2008年
8 张文高;刘龙涛;何煜;孟宪忠;郑广娟;殷镜海;蔚青;王显刚;王大智;韩宝刚;卢宁;吴玉生;;降脂红曲超微粉碎对高脂血症疗效影响的临床研究——中药超微粉碎对疗效影响的研究之二[A];中国生物医学工程学会第六次会员代表大会暨学术会议论文摘要汇编[C];2004年
9 秦人伟;王异静;董哲;王薇青;;红曲防腐剂——红曲红色素[A];中国生物工程学会第三次全国会员代表大会暨学术讨论会论文摘要集[C];2001年
10 张文高;吴玉生;刘龙涛;何煜;孟宪忠;曹炳振;;微粉中药临床疗效对比研究初步报告——水蛭微粉治疗早期脑梗死、降脂红曲微粉治疗高脂血症临床疗效对比研究[A];海峡两岸中西医结合学术研讨会论文集[C];2003年
中国重要报纸全文数据库 前6条
1 ;三大能力决定营销成败[N];医药经济报;2005年
2 ;细菌吃中药,心脑血管疾病的曙光[N];大众科技报;2007年
3 天宇;苗家博士谱天曲[N];中国航天报;2004年
4 张银霞;中医药为血管健康护航[N];人民政协报;2004年
5 卞敬洙;韩国mimi冰激凌甜透北京[N];市场报;2006年
6 苑宇;打造中国航天生物的健康旗舰[N];中国航天报;2005年
中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 许赣荣;红曲桔霉素的检测及发酵控制技术[D];江南大学;2005年
2 黄志兵;1、红曲菌两种新的荧光代谢产物的研究 2、脱氧雪腐镰刀菌烯醇胶体金免疫层析试纸条的研制[D];南昌大学;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 游向荣;红曲色素中桔霉素抑制条件的探讨[D];福建农林大学;2006年
2 许璐;分子标记技术在红曲菌菌种鉴别中的应用[D];华中农业大学;2007年
3 赵颖;红曲菌产GABA相关基因的初步研究[D];华中农业大学;2007年
4 徐驰;农杆菌介导的红曲菌M-7转化库中部分突变子的特性研究[D];华中农业大学;2008年
5 万成;1.红曲菌M22pksCT基因缺失株的构建 2.红色红曲菌蛋白质组学研究[D];南昌大学;2009年
6 万里;红色红曲菌M-7紫外诱变突变子特征分析[D];华中农业大学;2008年
7 杨莎;红色红曲菌mrr基因的克隆与功能初步研究[D];华中农业大学;2009年
8 朱效刚;红曲功能性成分分析及发酵法生产的研究[D];江南大学;2005年
9 涂追;橙色红曲菌(AS3.4384)SOD基因的克隆与功能分析[D];南昌大学;2007年
10 屈炯;红曲色素组分分离及其功能的初步研究[D];华中农业大学;2008年
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