收藏本站
《华中农业大学》 2015年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

蝇蛆转录组学分析及Zn~(2+)对其金属硫蛋白基因表达的影响

熊梅  
【摘要】:家蝇Musca domestica属于昆虫纲双翅目环裂亚目蝇科,既是一种重要的资源昆虫,也是一种重要的媒介昆虫。因幼虫具有腐蚀性且蛋白质含量高,已被广泛的应用于猪粪、鸡粪、餐厨垃圾等的转化,以及鸡、鱼、虾、蟹、蛙等的养殖。本研究拟通过转录组测序技术研究家蝇幼虫的基因转录情况,评价可用于后续分子生物学研究的内参基因,并筛选出金属硫蛋白基因,明确其对Zn2+胁迫的响应。该研究不仅可丰富家蝇基因资源的研究,对揭示幼虫响应重金属胁迫的机制也具有重要意义。主要研究结果如下:转录组测序共获得了33,810,314 clean reads,一共注释获得了20,073个unigene。在NR数据库中注释,获得了12,079个unigene;在NT数据库中注释,获得了3,727个unigene;在GO数据库中注释,获得了26030个unigene;在PFAM数据库中注释,获得了10,697个unigene;在KOG/COG数据库中注释获得了7,437个unigene;在KO数据库中注释了获得了3,245个unigene。对9个内参基因β-actin、GAPDH、RPS18、EF-1、18S、TUB、AK、HSP70、RPL8进行了不同实验条件下的稳定性评价。结果表明,在不同发育阶段这9个内参基因的稳定性排名为:RPL8ActinHSP70TUBRPS18GAPDHEF-118SAK;不同食物饲喂条件下这9个内参基因稳定性的综合排名为:RPL8AKRPS18ActinTUBGAPDHEF-118SHSP70;在不同饥饿条件下这9个内参基因稳定性的综合排名为:EF-1TUBRPS18HSP70RPL8ActinGAPDHAK18S;在不同温度条件下这9个内参基因稳定性的综合排名为:EF-1TUBActinGAPDHRPS18AK18SRPL8HSP70;在不同组织中这9个内参基因稳定性的综合排名为:EF-1TUBAKRPS18ActinHSP70RPL8GAPDH18S;Zn Cl2不同浓度处理条件下这9个内参基因稳定性的综合排名为:EF-1HSP70TUBRPL8Actin18SRPS18GAPDHAK.鉴定了3个金属硫蛋白基因,并获得了NCBI数据库的登录号KP783493、KP783494和KP783495。这三个金属硫蛋白序列均具有金属硫蛋白的典型特征,低分子量,高半胱氨酸含量(25%以上),不含或者极少的芳香族氨基酸,典型的半胱氨酸排列方式-C-X-C-,X是除半胱氨酸以外的氨基酸。以EF-1和TUB为内参基因,明确了5333.33 ug g-1 Zn2+胁迫下,金属硫蛋白基因的表达量显著高于对照组和10000 ug g-1 Zn2+胁迫组;10000 ug g-1 Zn2+胁迫下金属硫蛋白基因的表达量与对照组没有显著差异。通过本研究,获得了家蝇幼虫的转录组信息,为家蝇的进一步深入研究提供了基础。对家蝇9个内参基因在不同条件下的稳定性进行了评价,为基因定量分析中内参基因的选择提供了科学依据。本文鉴定了3个家蝇金属硫蛋白基因并分析了其中一个金属硫蛋白基因的表达受食物中Zn2+的影响,为进一步揭示家蝇金属硫蛋白对重金属的胁迫响应机制具有重要意义。
【学位授予单位】:华中农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:S186

手机知网App
【引证文献】
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 张美翠;尹姣;曹雅忠;仵均祥;李克斌;;转录组测序及其在昆虫研究中的应用[A];2014年中国植物保护学会学术年会论文集[C];2014年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前4条
1 梁露;毛雪;管德龙;张敏;;镉对果蝇寿命及生殖力的影响及其可遗传性分析[J];安全与环境学报;2013年06期
2 仪慧兰,李秀芬,刘晓玲;镉对果绳生长发育的影响研究[J];山西大学学报(自然科学版);2001年01期
3 陈晓玲;铜与衰老[J];微量元素与健康研究;2005年01期
4 贾广宁;重金属污染的危害与防治[J];有色矿冶;2004年01期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 张云显;刘发央;杨慧;赵丽;李鹏;李霞;;重金属镉螯合物人工抗原的合成与鉴定[J];安徽农业科学;2009年14期
2 车驰;齐伟;斯钧浪;李云强;闫勇;;黄河三角洲道路沿线土壤中重金属污染物的分布与评价[J];安徽农业科学;2009年21期
3 刘红英;;NaCl对果蝇生长发育的影响[J];安徽农业科学;2009年22期
4 刘红英;;激动素对果蝇生长发育过程中体重的影响[J];安徽农业科学;2009年24期
5 吴陆生,江红星,吴孝兵,张方;野生扬子鳄栖息地土壤金属元素含量初步研究[J];安徽师范大学学报(自然科学版);2003年03期
6 李东伟;徐中慧;肖祖菊;高先萍;;古冶炼废渣环境毒性鉴别[J];重庆大学学报;2010年11期
7 车晓青;郭明;;重金属残留的酶联免疫吸附检测技术研究进展[J];福建分析测试;2009年04期
8 王国红;耿俊丽;黄祥财;;9种金属离子对黄粉虫纤维素酶活性及其生长发育的影响[J];福建师范大学学报(自然科学版);2009年03期
9 秦益民;陈洁;;海丝纤维吸附铜和锌离子的性能[J];纺织学报;2011年09期
10 王春丽;王中琪;;蛭石处理含Cu~(2+)和Zn~(2+)废水的性能研究[J];广东化工;2009年03期
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 曾卫军;拟南芥(Arabidopsis thaliana)受胁迫因子诱导激活启动子的筛选及其应用研究[D];华东师范大学;2011年
2 安玲瑶;作物间作对重金属吸收的影响及其机制的研究[D];浙江大学;2012年
3 陈桂秋;褐腐菌生物吸附剂去除水体重金属的应用基础研究[D];湖南大学;2006年
4 王俊刚;大头金蝇Chrysomya megacephala(Fabricius)人工饲养技术及授粉行为学的研究[D];华中农业大学;2006年
5 孙波;聚天(门)冬氨酸材料的设计、合成与应用基础研究[D];天津大学;2006年
6 苏丽敏;部分取代芳烃与重金属对发光菌联合毒性及构效关系研究[D];东北师范大学;2008年
7 樊霆;真菌对重金属的抗性机制和富集特性研究[D];湖南大学;2009年
8 史贵涛;痕量有毒金属元素在农田土壤—作物系统中的生物地球化学循环[D];华东师范大学;2009年
9 冯宁川;橘子皮化学改性及其对重金属离子吸附行为的研究[D];中南大学;2009年
10 梁莎;化学改性生物吸附剂合成及其对重金属离子吸附行为研究[D];中南大学;2012年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 舒丽娜;锌胁迫下CO_2浓度升高对三种不同光合途径植物生长发育和锌积累的影响[D];华中农业大学;2010年
2 王今华;埃洛石改性及其对废水中重金属离子的吸附研究[D];郑州大学;2010年
3 李俊;不同营养条件对水生植物吸收重金属影响的研究[D];中南林业科技大学;2008年
4 纪智慧;湿地植物抗锌、镉离子毒性能力及其去污效果研究[D];中南林业科技大学;2009年
5 王慧萍;耐锌细菌的筛选、抗锌特性及其对苯酚的降解研究[D];东华大学;2011年
6 李慧;Leucobacter sp.N-4吸附金属及染料脱色特性研究[D];大连理工大学;2011年
7 郭常伟;重金属铜单克隆抗体的制备及免疫学检测方法的建立[D];暨南大学;2011年
8 梁丽萍;秸秆类生物吸附剂的制备及其对溶液中六价铬的吸附性能研究[D];兰州理工大学;2011年
9 杨舒;重金属Cu、Cd、Pb、Zn在人工湿地中的形态分布与转化[D];兰州大学;2011年
10 姜桂明;亚氨乙酸型复合螯合材料的制备及其对重金属与稀土离子吸附性能和吸附热力学研究[D];中北大学;2011年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 毛雪;郭欣欣;张敏;;锌对果蝇寿命及生殖力的影响及其可遗传性[J];安全与环境学报;2012年02期
2 杜瑞英;;镉胁迫对节杆菌(Arthrobacter sp.)和芽孢杆菌(Bacillus sp.)生理生化特性的影响[J];安全与环境学报;2012年06期
3 张天宝;钒及其化合物致突变、致癌及生殖毒性的研究现状[J];环境与健康杂志;1989年02期
4 况琪军,夏宜,惠阳;重金属对藻类的致毒效应[J];水生生物学报;1996年03期
5 吴思英;镉的生殖毒性流行病学研究进展[J];现代预防医学;2002年03期
6 刁书永,袁慧;镉对小鼠卵巢颗粒细胞凋亡的影响研究[J];畜牧兽医学报;2005年11期
7 陈壁锋,黄俊明,杨杏芬,李文立,胡少明;铅对果蝇性活力及寿命影响的实验研究[J];中国职业医学;2004年03期
8 赵红霞,蒙义文,蒲蔷;黄精多糖对果蝇寿命的影响[J];应用与环境生物学报;1995年01期
9 吴国星;叶恭银;胡萃;程家安;;重金属镉对棕尾别麻蝇亲代及子代生长发育与繁殖的影响[J];浙江大学学报(农业与生命科学版);2006年01期
10 张欣文;戴秋萍;王枫华;徐思红;;番茄红素对黑腹果蝇抗氧化能力和寿命的影响[J];中国老年学杂志;2006年10期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 常团结,朱祯;植物金属硫蛋白研究进展[J];商丘师范学院学报;2002年05期
2 黄仲贤,高原,余文浩,张素艳,杨芃原;猴金属硫蛋白突变体(N4C,T27C,N4C/T27C)的构建、表达与结构性质研究[J];高等学校化学学报;2002年09期
3 刘成梅,熊勇华,杨晓浪,吴广平;锌金属硫蛋白的初步研究[J];食品科学;2003年03期
4 ;第五届金属硫蛋白国际会议将于2004年10月10-13日在北京召开[J];中国生物化学与分子生物学报;2003年05期
5 安建平,王海娟,韩沛平,权永妮,刘海霞,张春成;金属硫蛋白生理功能的研究进展[J];天水师范学院学报;2005年02期
6 张桂春;金属硫蛋白的功能及应用前景[J];烟台师范学院学报(自然科学版);2005年02期
7 张艳;杨传平;;金属硫蛋白的研究进展[J];分子植物育种;2006年S1期
8 蔡震峰;任凤莲;;金属硫蛋白的研究进展[J];应用化工;2007年02期
9 蔡震峰;任凤莲;曹醴承;江冠群;;金属硫蛋白的分离与纯化[J];分析科学学报;2008年05期
10 徐振彪;王平翠;孙永乐;宋林霞;;植物金属硫蛋白的提取及检测[J];山东农业大学学报(自然科学版);2010年01期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 雍政;何冰;徐卓立;郭军华;;硒诱导金属硫蛋白的分离、纯化与鉴定[A];中国药理学会第八次全国代表大会论文摘要集(第一部分)[C];2002年
2 蒋与刚;郭长江;高兰兴;顾景范;;锌诱导金属硫蛋白合成及其对肝脏缺血再灌注损伤的保护作用[A];中国营养学会第八次全国营养学术会议论文摘要汇编[C];2000年
3 郭军华;徐卓立;刘颖;贺卫國;茹炳根;;探索一种有机硒诱导的新型金属硫蛋白[A];海峡两岸三地药理学学术报告会论文汇编[C];2001年
4 何冰;雍政;徐卓立;郭军华;;利用蛋白质芯片质谱分离纯化金属硫蛋白[A];中国药理学会第八次全国代表大会论文摘要集(第一部分)[C];2002年
5 刘林;王建秀;;金属硫蛋白与多肽相互作用的研究[A];中国化学会第26届学术年会分析化学分会场论文集[C];2008年
6 耿乃志;崔燕;;金属硫蛋白的研究进展[A];2009年全国基层优秀中医表彰大会暨全国第二次民间验方、诊疗技术学术研讨会会议论文集[C];2009年
7 刘树刚;孔祥英;;锌对幼鼠脑发育及金属硫蛋白表达影响的实验研究[A];四川省营养学会1997年学术会议暨妇幼营养保健学习班专题报告及论文摘要汇编[C];1997年
8 郝守进;茹炳根;;环境中铅的毒性及其解毒机理的研究[A];Risk Assessment of Toxic Chemicals--Proceedings of CCAST (World Laboratory) Workshop[C];2001年
9 应晨江;;金属硫蛋白促排铅作用及对微量元素的影响[A];中国营养学会第七届理事会青年工作委员会第三次学术会议暨微量营养素与慢性病青年学者高峰论坛论文集[C];2012年
10 张敬旭;符绍莲;;金属硫蛋白对铅致胚胎氧化损伤的保护作用[A];第六届全国优生科学大会论文汇编[C];2006年
中国重要报纸全文数据库 前4条
1 罗梅;适量饮用茅台酒有益于健康与金属硫蛋白有关[N];贵州日报;2005年
2 孙英威 呼涛;我国成功获取金属硫蛋白[N];中国乡镇企业报;2003年
3 孙国根王春;应对镉接触者“易感”筛选[N];科技日报;2008年
4 三水;“五元一次方程”解读茅台[N];中华工商时报;2004年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 陈伟强;心理应激条件下脑金属硫蛋白的表达及其调控机制研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2004年
2 杨丽芳;金属硫蛋白的心肌保护机制研究[D];第四军医大学;2014年
3 陈亮;金属硫蛋白,金属硫蛋白抗体与镉致肾功能损伤[D];复旦大学;2006年
4 于立博;新疆鹰嘴豆中金属硫蛋白对铅毒性作用的干预研究[D];新疆医科大学;2013年
5 帅怡;金属硫蛋白抗阿霉素心脏毒性作用的基因组学与蛋白质组学研究[D];四川大学;2007年
6 常秀丽;应答蛋白基因表达在镉接触中作为生物标志物的研究[D];复旦大学;2005年
7 刘秋菊;金属硫蛋白拮抗血管紧张素Ⅱ/p53通路诱导的心肌细胞凋亡的体内体外研究[D];吉林大学;2010年
8 谢东扬;灵芝中一种DNase的特征和MT基因序列分析[D];福建农林大学;2007年
9 黄国健;金属硫蛋白与铜抗肿瘤作用相互关系的实验研究[D];中国协和医科大学;1997年
10 何永辉;光谱与密度泛函研究金属硫蛋白的结构[D];中南大学;2012年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 王洋;金属硫蛋白检测方法的研究[D];吉林大学;2010年
2 何冰;蛋白质表达指纹图谱研究硒代金属硫蛋白对放射肺损伤的防护作用[D];中国人民解放军军事医学科学院;2003年
3 吴传松;类金属硫蛋白产生菌的分离培养及特性研究[D];华中科技大学;2009年
4 熊梅;蝇蛆转录组学分析及Zn~(2+)对其金属硫蛋白基因表达的影响[D];华中农业大学;2015年
5 苏郁洁;金属硫蛋白在原核生物中的表达及在环境治理中的应用[D];山东大学;2007年
6 王凯;蚯蚓金属硫蛋白的诱导、测定及硒对锑中毒的解毒机理[D];河北大学;2013年
7 艾丹丹;铜、锌、镉与金属硫蛋白的结合特性及其对植物中金属硫蛋白的胁迫效应研究[D];河北大学;2012年
8 王永松;金纳米—汞复合物检测汞和金属硫蛋白的新方法研究[D];南华大学;2013年
9 黄秋月;镉对稻苗生长影响初探及稻苗中金属硫蛋白的分离纯化[D];武汉轻工大学;2013年
10 周彦锋;水体中的重金属镉和锌对鲫鱼金属硫蛋白的诱导[D];南京农业大学;2008年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026