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《华中农业大学》 2018年
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甘蓝型油菜不同生态型分子预测模型的构建

陶雨婷  
【摘要】:根据从营养生长转向生殖生长的不同需求,甘蓝型油菜可以被分为三种生态型:冬性、半冬性和春性;其中冬性甘蓝型油菜主要分布在欧洲需要一个月以上的低温(小于4℃),我国主要种植的是半冬性和春性甘蓝型油菜,两者没有严格的界限,所以存在一些广适性品种。特定的地区只适宜特定生态型的生长,为了开发能检测不同生态型的标记,并为判定油菜适宜种植地区提供参考,本研究首先利用全基因组关联分析找到了与开花时间相关的位点,并结合已发表的标记,开发出了7个能为油菜生态型判定提供参考的PCR标记。主要试验结果如下:利用实验室收集的495份甘蓝型油菜自交系组成的自然群体,并结合先前提供的八个环境表型数据和郭亮老师课题组提供的基因型数据,我们成功检测到了166个与开花时间相关的SNP/InDel位点。其中,5个位点能在多个环境当中重复检测到,这些位点附近有拟南芥FLC、FRI、EMF2同源的油菜基因;另外,有21个由毗邻(物理距离小于150kb)的SNP组成的区段,其中也包括了许多与拟南芥开花基因同源的油菜基因。从495份甘蓝型油菜自交系材料中选出452份进行生态型分类,将全基因组关联分析得到的166个标记与前人研究中的标记转化成PCR标记,通过PCR检测找到能够区分冬性、半冬性、春性材料的标记,最终找到7个能够鉴定不同生态型的标记。其中,BnaA3-FRI-53-76和BnaA3-FRI-69-20分别有62%和46%的概率可以鉴定出冬油菜,BnaA3-FRI-53-78有92%的概率可以鉴定出冬油菜。7个标记根据关联到的基因不同分类组合形成不同的单倍型,位于在A3 FRI上的标记BnaA3-FRI-53-76、BnaA3-FRI-69-20和BnaA3-FRI-53-78共构成5种单倍型,Hap000是最有可能检测出春性油菜的单倍型。标记Bn-A10-p15106056和标记BnvaAnn_random28331198分别位于FLC和CDF1附近,所以将这两个标记组合形成了4种单倍型。其中,Hap00检测出半冬性油菜的概率最大。
【学位授予单位】:华中农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:S565.4

【参考文献】
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