收藏本站
《华中农业大学》 2003年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

用RAPD技术研究几种鲷科鱼类的遗传变异和系统进化

杨慧荣  
【摘要】: 用RAPD技术对取自福建和珠江口的2个天然群体黄鳍鲷和胶州湾(青岛)、台湾海峡(厦门)和北部湾(海南)的3个天然群体各24尾真鲷和黑鲷进行群体内与群体间的遗传变异和亲缘关系分析;同时用RAPD技术对鲷科鱼类的黑鲷、真鲷、二长棘鲷、平鲷和黄鳍鲷进行亲缘关系和系统进化的探讨。 通过梯度实验摸索RAPD-PCR的反应体系和循环参数。选用美国Operon公司试剂盒KitA、KitR与KitS共60个10bp的随机引物,在事先优化的反应条件下,筛选出清晰稳定的随机引物供扩增,其中无扩增产物、扩增带型模糊及不稳定的结果不作分析。研究结果如下: 在黄鳍鲷的群体研究中,使用的40个随机引物中有18个引物扩增出清晰稳定的片段,共计93条。福建和珠江口群体都有较高程度的遗传变异水平,但福建群体的遗传变异水平较珠江口群体有一定程度的降低。用UPGMA程序和NJ程序进行聚类分析,结果表明:福建和珠江口群体分别聚成一支,且两者的聚类结果一致。说明福建和珠江口群体已经出现了明显的遗传分化,分别属于2个不同的地理群体。 在真鲷和黑鲷的群体研究中,使用的60个随机引物中有31个引物扩增出清晰稳定的片段,真鲷和黑鲷各计219条和200条。其中,真鲷多态性片段176条,黑鲷多态性片段135条。真鲷和黑鲷群体间的遗传距离均为:厦门群体和海南群体间最小,青岛群体与厦门群体间次之,青岛群体与海南群体间最大。真鲷群体内的遗传距离为:厦门群体最小,海南群体次之,青岛群体最大;而黑鲷则是厦门群体最小,青岛群体次之,海南群体最大。用MEGA2.1软件的UPGMA程序和NJ程序进行聚类分析,厦门与海南群体首先聚在一起,其次是青岛群体,两者的结果相一致。研究结果与他们的地理分布、生态习性以及我国沿海的海况具有一致性。 在五种鲷科鱼类的RAPD分析中,使用的60个随机引物中有29个引物扩增出清晰稳定的片段,共计200条。五种鲷均有其特异性扩增片段,可作为种类鉴别的依据。根据MEGA2.1软件的UPGMA和NJ程序构建的分子系统树显示:同属鲷属的黄鳍鲷和黑鲷的亲缘关系最近,其次是二长棘鲷和真鲷,平鲷与二长棘鲷和真鲷的亲缘关系较近,与黄鳍鲷和黑鲷的较远,黑鲷和二长棘鲷的亲缘关系最远。研究结果与借助形态学和生化特征进行的传统系统分析具有一致性。在40个个体之间遗传距离矩阵中,最大值达0.8916。此外,多数的遗传距离指数在0.5000~0.8500之间。通过分析,认为RAPD技术对分析属级间的亲缘关系具有一定的适用性。
【学位授予单位】:华中农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2003
【分类号】:S917

【引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前3条
1 陈迪;长江刀鲚遗传多样性的细胞色素b基因序列分析[D];暨南大学;2006年
2 孔焰;长江上游两种铜鱼属鱼类种间特异性ISSR分子标记及遗传多样性研究[D];西南大学;2010年
3 胡建华;大鳞副泥鳅遗传多样性研究[D];安徽农业大学;2011年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 熊国强,邓思明,臧增嘉,许学龙;中国沿海日本鳗鲡幼苗群体鉴别研究[J];动物学报;1992年03期
2 冯亮,廖翔华;我国不同地域鲤鱼和草鱼寄生头槽绦虫的亲缘关系[J];动物学报;2000年04期
3 常重杰,周荣家,余其兴;两种泥鳅不同群体遗传变异的RAPD分析[J];动物学报;2001年01期
4 李思发,朱泽闻,邹曙明,赵金良,蔡完其;鲂属团头鲂、三角鲂及广东鲂种间遗传关系及种内遗传差异[J];动物学报;2002年03期
5 黄生民,秦长庚,潘淑英,王修勇,李晓辉,田树魁;滇池高背鲫和方正银鲫酯酶、乳酸脱氢酶同工酶的比较研究[J];动物学研究;1988年01期
6 陈自明,陈毅峰;用RAPD技术对特化等级裂腹鱼类亲缘关系的探讨[J];动物学研究;2000年04期
7 权洁霞,戴继勋;荧光原位杂交技术(FISH)在鱼类遗传学研究中的应用及前景[J];动物学研究;1999年03期
8 徐涤,宋林生,秦松,Alessandro Pala,费修绠,曾呈奎;五个紫菜品系间遗传差异的RAPD分析[J];高技术通讯;2001年12期
9 张其永;蔡泽平;;台湾海峡和北部湾二长棘鲷种群鉴别研究[J];海洋与湖沼;1983年06期
10 尤锋,王可玲,相建海,徐成,吴谡琦;山东近海牙鲆同工酶的生化遗传分析[J];海洋与湖沼;1999年02期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 张化东,傅蕙英;PCR技术在肿瘤检测及治疗中的应用[J];安徽教育学院学报;2001年06期
2 杨丽萍,张玉笙,高运东,仲跻峰,侯明海,姜文学;家兔RAPD分析反应体系的优化[J];山东农业科学;1999年05期
3 颜廷进,李群,李汝玉,谭振馨;RAPD技术在玉米品种纯度鉴定中的应用研究[J];山东农业科学;2003年01期
4 张晗;高永超;沙伟;李汝玉;戴双;;紫萼藓科植物DNA提取及遗传多样性的分析[J];山东农业科学;2006年01期
5 单雷,毕玉平,王兴军,徐平丽,李广存;双抗TMV和CMV转基因番茄后代的遗传分析[J];山东农业科学;1998年04期
6 李占东;童存铭;蒋美俊;张韬;林英任;;针叶树生散斑壳属部分种内及近似种间的RAPD分析[J];安徽农学通报;2006年12期
7 王庆;傅洪拓;;核rDNA ITS区序列在水产动物研究中的应用[J];安徽农学通报;2007年11期
8 曾兵,张新全,彭燕,马啸,兰英;鸭茅RAPD分子标记反应体系优化[J];安徽农业科学;2005年07期
9 裴国亮;李京敬;王长发;陶士珩;;冷暖型小麦基因差异的最佳RAPD反应体系研究[J];安徽农业科学;2006年13期
10 刘素霞;洪达;高武军;邓传良;卢龙斗;;石榴RAPD反应体系优化及亲缘关系研究[J];安徽农业科学;2007年36期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 戴恒鑫;李应森;王武;刘伟;张关海;;中华绒螯蟹蟹种优质高产生态培育模式的研究[A];第二届全国现代生态渔业可持续发展论文集[C];2010年
2 马爱军;陆丽君;陈超;王新安;孟雪松;;东方鲀属主要经济鱼种繁育养殖、育种和基因研究现状[A];第三届全国现代生态渔业管理与技术研究[C];2011年
3 吴谡琦;刘瑞玉;董金海;王可玲;;中国近海真鲷种群间的基因流及其分化[A];生命科学与生物技术:中国科协第三届青年学术年会论文集[C];1998年
4 马群群;马洪雨;马凌波;马春艳;崔海玉;;拟穴青蟹线粒体COI基因序列克隆及SNPs位点筛选[A];经济发展方式转变与自主创新——第十二届中国科学技术协会年会(第三卷)[C];2010年
5 王桂忠;谭树华;李少菁;艾春香;林琼武;;斑节对虾野生和养殖群体遗传多样性的同工酶分析[A];中国海洋学会2005年学术年会论文汇编[C];2005年
6 曹家树;;RAPD技术在蔬菜育种上的应用[A];中国园艺学会首届青年学术讨论会论文集[C];1994年
7 乔爱民;刘佩瑛;雷建军;;芥菜16个变种的RAPD研究[A];中国园艺学会成立70周年纪念优秀论文选编[C];1999年
8 张虎平;牛建新;王国安;虎海防;马兵钢;朱军;;适于核桃的RAPD-PCR反应体系的建立[A];第三届全国干果生产与科研进展学术研讨会论文集[C];2003年
9 易金鑫;侯喜林;;我国茄子主要地方品种与选育品种遗传多样性分析[A];蔬菜分子育种研讨会论文集[C];2004年
10 孙晋科;罗淑萍;曾斌;李疆;;巴旦杏RAPD-PCR反应体系的正交优化[A];第五届全国干果生产、科研进展学术研讨会论文集[C];2007年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 刘永刚;基于微卫星DNA标记的马铃薯桃蚜不同种群遗传分化研究[D];甘肃农业大学;2010年
2 刘名;太平洋鲱和大头鳕的群体遗传学研究[D];中国海洋大学;2010年
3 于海洋;牙鲆微卫星标记的筛选和美洲牡蛎抗病相关基因SNP的初步分析[D];中国海洋大学;2010年
4 张天时;中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)育种的模型分析与遗传参数评估[D];中国海洋大学;2010年
5 张立楠;鲢遗传连锁图谱的构建及精子竞争对性别间重组率差异的影响[D];中国海洋大学;2010年
6 苗贵东;半滑舌鳎微卫星标记开发、应用及遗传连锁图谱的构建[D];中国海洋大学;2010年
7 孟宪红;中国对虾“黄海2号”对WSSV的抗病性分析[D];中国海洋大学;2010年
8 郝振林;金乌贼繁殖、发育及荧光标志技术的研究[D];中国海洋大学;2010年
9 郭新军;拟黑多刺蚁肌细胞增强因子2与肌钙蛋白Ⅰ亚基基因的克隆及其在发育中的表达研究[D];陕西师范大学;2010年
10 刘成;多年生簇毛麦基因组新重复序列的分离及其在小麦抗病新种质鉴定中的应用[D];电子科技大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 李良;湖北省油茶优良单株遗传多样性及品质初步分析[D];华中农业大学;2010年
2 张燕;长江草鱼群体MHC Class Ⅱ B基因的克隆、表达及多态性分析[D];华中农业大学;2010年
3 郭一鸣;全球白菜型油菜遗传多样性分析[D];华中农业大学;2010年
4 郑瑜;银杏核心种质构建初探[D];华中农业大学;2010年
5 胡佳;鲟形目部分种类基于线粒体COⅠ基因的分子进化研究[D];华中农业大学;2010年
6 呼光富;颖鲤杂种优势及其相关分子生物学初步研究[D];华中农业大学;2010年
7 金占宝;赤拟谷盗不同地理种群差异性比较研究[D];华中农业大学;2010年
8 高伟;四倍体棉种的遗传多样性分析[D];华中农业大学;2010年
9 李文娟;皖河滩地杨树造林模式及其修枝短期效应研究[D];安徽农业大学;2010年
10 王京梅;叶籽银杏叶生雌性生殖器官发育相关基因的克隆与序列分析[D];山东农业大学;2010年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 底晓丹;伊西庆;章群;;海鲢细胞色素b基因的序列分析[J];安徽农业科学;2008年27期
2 熊国强,邓思明,臧增嘉,许学龙;中国沿海日本鳗鲡幼苗群体鉴别研究[J];动物学报;1992年03期
3 李明,王小明,盛和林,玉手英利,增田隆一,永田纯子,大泰司纪之;四种鹿属动物的线粒体DNA差异和系统进化关系研究[J];动物学报;1999年01期
4 常重杰,周荣家,余其兴;两种泥鳅不同群体遗传变异的RAPD分析[J];动物学报;2001年01期
5 李思发,朱泽闻,邹曙明,赵金良,蔡完其;鲂属团头鲂、三角鲂及广东鲂种间遗传关系及种内遗传差异[J];动物学报;2002年03期
6 赵金良;李思发;蔡完其;王伟伟;;基于细胞色素b基因序列的东亚鳜类系统发育关系[J];动物学报;2006年04期
7 李思发,吕国庆,L.贝纳切兹;长江中下游鲢鳙草青四大家鱼线粒体DNA多样性分析[J];动物学报;1998年01期
8 李思发,李晨虹,李家乐;尼罗罗非鱼品系间形态差异分析[J];动物学报;1998年04期
9 袁传宓;长江中下游刀鲚资源和种群组成变动状况及其原因[J];动物学杂志;1988年03期
10 桂建芳;脊椎动物线粒体DNA的进化遗传学[J];动物学杂志;1990年01期
中国博士学位论文全文数据库 前9条
1 尤锋;牙鲆群体遗传多样性及鲽形目鱼类分子系统学初步研究[D];中国科学院海洋研究所;2001年
2 曲桂芹;白桦热激反应的分子生态学研究[D];东北林业大学;2001年
3 张淑萍;芦苇分子生态学研究[D];东北林业大学;2001年
4 蒙子宁;中国近海小黄鱼、带鱼和小带鱼的遗传多样性以及八种石首鱼类的分子系统进化[D];厦门大学;2003年
5 孙玉华;中国胭脂鱼遗传多样性及亚口鱼科分子系统学研究[D];武汉大学;2004年
6 刘云国;三种重要海水养殖鱼类的分子遗传学研究[D];中国海洋大学;2005年
7 张文静;微卫星DNA及ISSR技术在原生动物中的应用研究[D];中国科学院研究生院(水生生物研究所);2006年
8 袁万安;法医鱼类学种属鉴别初步研究[D];四川大学;2006年
9 高欣;长江珍稀及特有鱼类保护生物学研究[D];中国科学院研究生院(水生生物研究所);2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 王希道;不同鳗鱼种群遗传结构和种质鉴定分子遗传标记研究[D];南京农业大学;2000年
2 王戌梅;新疆阜康绿洲沙漠过渡带碱蓬种群分子生态学初步研究——基于RAPD分析[D];西北大学;2002年
3 彭作刚;中国鲇形目鱼类和相关类群细胞色素b基因序列变异及其科间系统发育关系研究[D];西南师范大学;2002年
4 郭天慧;我国东黄海鳀鱼自然群体的遗传多样性研究[D];中国海洋大学;2002年
5 曾祥波;鲢、鳙和草鱼仔幼鱼耳石形态及种类鉴别中的应用[D];华中农业大学;2001年
6 贺培建;藏羚羊遗传多样性研究[D];浙江大学;2004年
7 张芹;浙闽大黄鱼群体RAPD遗传学研究[D];浙江大学;2005年
8 周立石;鳎亚目鱼类系统学关系及带纹条鳎线粒体DNA控制区结构的初步研究[D];中国海洋大学;2005年
9 房新英;RAPD和ISSR技术在牙鲆遗传多样性研究中的应用[D];中国海洋大学;2005年
10 严莉;长江铜鱼种群生物学及遗传多样性分析[D];华中农业大学;2005年
【二级引证文献】
中国期刊全文数据库 前4条
1 杨博;陈小勇;杨君兴;;白鱼线粒体DNA控制区结构和种群遗传多样性分析[J];动物学研究;2008年04期
2 孙超;刘洪波;姜涛;杨健;;凤鲚ITS1与Cyt b基因序列的比较研究[J];水产科学;2013年09期
3 孙超;刘洪波;姜涛;杨健;;分子生物学方法在鲚属鱼类遗传学研究中的应用[J];江苏农业科学;2013年01期
4 肖明松;崔峰;康健;张晓红;;淮河乌鳢线粒体DNA控制区结构分析及遗传多样性研究[J];华中师范大学学报(自然科学版);2013年01期
中国硕士学位论文全文数据库 前4条
1 余帆洋;长江鳜和大眼鳜复合种的遗传多样性研究[D];暨南大学;2011年
2 段辛斌;长江上游鱼类资源现状及早期资源调查研究[D];华中农业大学;2008年
3 孙超;几种鲚属的鱼类分子遗传特征研究[D];南京农业大学;2012年
4 马云霞;信阳南湾水库翘嘴红鲌和青梢红鲌遗传多样性研究[D];河南师范大学;2013年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 成庆泰,王存信,田明诚,李春生,王玉纲,王奇;中国东方鲀属鱼类分类研究[J];动物学报;1975年04期
2 韦晟,周彬彬;渤、黄海蓝点马鲛种群鉴别的研究[J];动物学报;1988年01期
3 李思忠,方芳;鲢、鳙、青、草鱼地理分布的研究[J];动物学报;1990年03期
4 熊国强,邓思明,臧增嘉,许学龙;中国沿海日本鳗鲡幼苗群体鉴别研究[J];动物学报;1992年03期
5 王义权,周开亚,秦树臻;用RAPD标记检测六种蛇基因组DNA多态性[J];动物学报;1996年02期
6 沈曦,周开亚,王义权;中国蝮属蛇类的RAPD分析[J];动物学报;1999年01期
7 张四明,晏勇,邓怀,汪登强,危起伟,吴清江;几种鲟鱼基因组大小、倍体的特性及鲟形目细胞进化的探讨[J];动物学报;1999年02期
8 李思发,吕国庆,L.贝纳切兹;长江中下游鲢鳙草青四大家鱼线粒体DNA多样性分析[J];动物学报;1998年01期
9 宋林生,相建海,李晨曦,周令华,刘瑞玉,樊拥军;用RAPD标记研究对虾属六个种间的亲缘关系[J];动物学报;1998年03期
10 张中英,杨永铨,林克宏;鱼类性别的人工控制研究介绍[J];动物学杂志;1983年05期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前6条
1 杨太有;李仲辉;;二长棘鲷和黄鳍鲷骨骼系统的比较[J];广东海洋大学学报;2008年03期
2 黄克佳;日本的海水养殖[J];中国水产;1983年09期
3 汪学杰;览山;;水族新贵红菠萝[J];水族世界;2005年05期
4 陈国宝;李永振;赵宪勇;陈毓桢;金显仕;;南海5类重要经济鱼类资源声学评估[J];海洋学报(中文版);2006年02期
5 梁军;曹伏君;李长玲;;星斑裸颊鲷的核型研究[J];湛江海洋大学学报;2006年06期
6 陈亚琴;;水质硬度和pH值对神仙鱼繁殖的影响[J];水利渔业;2006年04期
中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 龚金波;中国近海两种鲷科鱼类遗传结构及遗传多样性分析[D];华中农业大学;2006年
中国知网广告投放
相关机构
>华中农业大学
相关作者
>龚金波
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026